BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-085O23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 98,125,102 - 98,266,160
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG628277
Upstream gene1700019M22Rik, LOC100039664
Downstream geneLOC382626, LOC100039743, LOC667732, LOC628351, LOC100039770
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-085O23.bB6Ng01-085O23.g
ACCDH899470DH899471
length1,0401,028
definitionDH899470|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085O23, 5' end.DH899471|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085O23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,265,116 - 98,266,160)(98,125,102 - 98,126,134)
sequence
gaattctttccctgaaggggattacaacaatttttagagtacataacatc
ttcagctgtcaactggacacatgcgtggattaacctgaaaagagggaacc
acaactgaaaaatttcttagatcacactggcctgtgaccatattgtgagg
tatttttttttttaatttttaactggtgtaggagttttcagacactttga
ggggtgccattgctgggcagtgggcctgagatgtttaagaaaggtgtctg
agcaagccagaggaagcatgctagtaagtagtgtccctctggtctctgcc
tttcctcttgtctccatgtttctgattgaatttctgttctcatttctttg
atgatggataataacctgtaaattggaacttcttccctcttaaggttagg
ctacacagaattatataacccaaatctctcaaaacaaacaaaacaaaaca
aaaccaaaaactaaaaaccaaccaaccaaacaaacaaacagaaaaaaaac
cttcaacaaaatctttggagttatttttgcctcattatgttatgtttgga
ctttaaaaatatcttatttatctcttttttaccctatacatgtaagaccc
cctttcagggaccccccactctagtctcgggagtgagagagcaccctaag
aaacacgataatccattgctgtaatcacatgaggcagtttaatgaaggag
ctccagatctacatgtatcccacacaggagataatggatgtcggccacga
ggctcgaaagctagggatttttatggggtaaggggcttagaggtgtggaa
ttcagcatagcgacacactattggcttattcaaacattagcagaaaaatt
acatgtacgtgcagggtgtcagagttctgtgagttgttgctcagttcaga
tagccctgttatgtcctcacattcctctttatcttttaagtaggctgttc
ctaggaatgttttactatggggcatatccaggttttgttttctttttctt
agcccaggcagcatctagctcacaaaacaaccagcatttc
gaattccatccagctattaatcaaaacattagttaagtcaatacgtgaat
actctctttccattaactaataacaatagttttccatgaataaaaattta
tatgcttaaatgtctatgctatgtgtatttaaaaattgtactcagtgtta
ttgtaagtcttttacaaccagaagaattaacatattctaatcaagtatgc
tccctaaaaataattactgaggaacaccaatcagtatttcctaacagtgt
tttccaagttctgtactagctcttacctgatgcgtaattatgattgaata
aatgacattgagtctttggatatggttatatccaaccaatccataatact
tgaatcattcattataatatctaagaatactataattaggtccacttttg
tcattctgttattttacaaatgtttgaagaactagtatcaagatatttaa
cattttcttagagctacaactactcaatgaacataatttacagtgaaaaa
atatgaacaattctcagtcaaaccagaattagttggtagcctcatctact
aggtgaatgtcacccattccaaaagattacattctacaagagcatgtgtt
catggaagcagacagtgtgctgattcatgtagaaacactaggtatgaata
aaatatgtgaaaataatttgttttaagttggatcagtatagtgaggaaat
actcagtgaggaaaaataattaagaaaataatggagtccatgtgttgata
tcttggctttaaagttaaaagacagaaacagtgacacagggggtgtggga
tgagggcgtccatgtgcattctaatcattagagggggtacatttcagtga
tccaaattactgtgacaaattcatccaataatgcattcagacaaataaac
aggctcacagagtctcaagtatttagacatagtgaaattttggtttagac
ctttaagctaaataaaaatacactttcacctacttttagctattgtgcag
ccctgtctagaattatcatgatgacact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_98265116_98266160
seq2: B6Ng01-085O23.b_47_1086 (reverse)

seq1  GAAATTGCTGGTTG-TTTGTGAGCCTAGATGCTGCCTGGGGCTGAGAAAA  49
      |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||
seq2  GAAA-TGCTGGTTGTTTTGTGAG-CTAGATGCTGCCT-GGGCTAAG-AAA  46

seq1  AAGAAAAACAAACCTGGATATGCCCCATAGTTAAAACATTCCTAGGAACA  99
      |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAACAAAACCTGGATATGCCCCATAG-TAAAACATTCCTAGGAACA  95

seq1  GCCTAACCTTAAAGATAAAGAGGAATGTGAGGACATAACAGGGCTATCTG  149
      |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCT-ACTTAAAAGATAAAGAGGAATGTGAGGACATAACAGGGCTATCTG  144

seq1  AACTGAGCAACAACTCACAGAACTCTGACACCCTGCACGTACATGTAATT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGCAACAACTCACAGAACTCTGACACCCTGCACGTACATGTAATT  194

seq1  TTTCTGCTAATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGCTAATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTCC  244

seq1  ACACCTCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAATCCCTAGCTTTCGAGCCTCGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAATCCCTAGCTTTCGAGCCTCGT  294

seq1  GGCCGACATCCATTATCTCCTGTGTGGGATACATGTAGATCTGGAGCTCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCGACATCCATTATCTCCTGTGTGGGATACATGTAGATCTGGAGCTCC  344

seq1  TTCATTAAACTGCCTCATGTGATTACAGCAATGGATTATCGTGTTTCTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTAAACTGCCTCATGTGATTACAGCAATGGATTATCGTGTTTCTTA  394

seq1  GGGTGCTCTCTCACTCCCGAGACTAGAGTGGGGGGTCCCTGAAAGGGGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTCTCTCACTCCCGAGACTAGAGTGGGGGGTCCCTGAAAGGGGGT  444

seq1  CTTACATGTATAGGGTAAAAAAGAGATAAATAAGATATTTTTAAAGTCCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACATGTATAGGGTAAAAAAGAGATAAATAAGATATTTTTAAAGTCCA  494

seq1  AACATAACATAATGAGGCAAAAATAACTCCAAAGATTTTGTTGAAGGTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAACATAATGAGGCAAAAATAACTCCAAAGATTTTGTTGAAGGTTT  544

seq1  TTTTTCTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTTTTAGTTTTTGGTTTTGTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTTTTAGTTTTTGGTTTTGTT  594

seq1  TTGTTTTGTTTGTTTTGAGAGATTTGGGTTATATAATTCTGTGTAGCCTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGTTTGTTTTGAGAGATTTGGGTTATATAATTCTGTGTAGCCTA  644

seq1  ACCTTAAGAGGGAAGAAGTTCCAATTTACAGGTTATTATCCATCATCAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAAGAGGGAAGAAGTTCCAATTTACAGGTTATTATCCATCATCAAA  694

seq1  GAAATGAGAACAGAAATTCAATCAGAAACATGGAGACAAGAGGAAAGGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGAGAACAGAAATTCAATCAGAAACATGGAGACAAGAGGAAAGGCA  744

seq1  GAGACCAGAGGGACACTACTTACTAGCATGCTTCCTCTGGCTTGCTCAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCAGAGGGACACTACTTACTAGCATGCTTCCTCTGGCTTGCTCAGA  794

seq1  CACCTTTCTTAAACATCTCAGGCCCACTGCCCAGCAATGGCACCCCTCAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTTCTTAAACATCTCAGGCCCACTGCCCAGCAATGGCACCCCTCAA  844

seq1  AGTGTCTGAAAACTCCTACACCAGTTAAAAATTAAAAAAAAAAATACCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTGAAAACTCCTACACCAGTTAAAAATTAAAAAAAAAAATACCTC  894

seq1  ACAATATGGTCACAGGCCAGTGTGATCTAAGAAATTTTTCAGTTGTGGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATGGTCACAGGCCAGTGTGATCTAAGAAATTTTTCAGTTGTGGTT  944

seq1  CCCTCTTTTCAGGTTAATCCACGCATGTGTCCAGTTGACAGCTGAAGATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTTTCAGGTTAATCCACGCATGTGTCCAGTTGACAGCTGAAGATG  994

seq1  TTATGTACTCTAAAAATTGTTGTAATCCCCTTCAGGGAAAGAATTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTACTCTAAAAATTGTTGTAATCCCCTTCAGGGAAAGAATTC  1040

seq1: chr12_98125102_98126134
seq2: B6Ng01-085O23.g_69_1096

seq1  GAATTCCATCCAGCTATTAATCAAAACATTAGTTAAGTCAATACGTGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCCAGCTATTAATCAAAACATTAGTTAAGTCAATACGTGAAT  50

seq1  ACTCTCTTTCCATTAACTAATAACAATAGTTTTCCATGAATAAAAATTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCTTTCCATTAACTAATAACAATAGTTTTCCATGAATAAAAATTTA  100

seq1  TATGCTTAAATGTCTATGCTATGTGTATTTAAAAATTGTACTCAGTGTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTAAATGTCTATGCTATGTGTATTTAAAAATTGTACTCAGTGTTA  150

seq1  TTGTAAGTCTTTTACAACCAGAAGAATTAACATATTCTAATCAAGTATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGTCTTTTACAACCAGAAGAATTAACATATTCTAATCAAGTATGC  200

seq1  TCCCTAAAAATAATTACTGAGGAACACCAATCAGTATTTCCTAACAGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAAAAATAATTACTGAGGAACACCAATCAGTATTTCCTAACAGTGT  250

seq1  TTTCCAAGTTCTGTACTAGCTCTTACCTGATGCGTAATTATGATTGAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAAGTTCTGTACTAGCTCTTACCTGATGCGTAATTATGATTGAATA  300

seq1  AATGACATTGAGTCTTTGGATATGGTTATATCCAACCAATCCATAATACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACATTGAGTCTTTGGATATGGTTATATCCAACCAATCCATAATACT  350

seq1  TGAATCATTCATTATAATATCTAAGAATACTATAATTAGGTCCACTTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCATTCATTATAATATCTAAGAATACTATAATTAGGTCCACTTTTG  400

seq1  TCATTCTGTTATTTTACAAATGTTTGAAGAACTAGTATCAAGATATTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTGTTATTTTACAAATGTTTGAAGAACTAGTATCAAGATATTTAA  450

seq1  CATTTTCTTAGAGCTACAACTACTCAATGAACATAATTTACAGTGAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTCTTAGAGCTACAACTACTCAATGAACATAATTTACAGTGAAAAA  500

seq1  ATATGAACAATTCTCAGTCAAACCAGAATTAGTTGGTAGCCTCATCTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAACAATTCTCAGTCAAACCAGAATTAGTTGGTAGCCTCATCTACT  550

seq1  AGGTGAATGTCACCCATTCCAAAAGATTACATTCTACAAGAGCATGTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAATGTCACCCATTCCAAAAGATTACATTCTACAAGAGCATGTGTT  600

seq1  CATGGAAGCAGACAGTGTGCTGATTCATGTAGAAACACTAGGTATGAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAAGCAGACAGTGTGCTGATTCATGTAGAAACACTAGGTATGAATA  650

seq1  AAATATGTGAAAATAA-TTGTTTTAAGTTGGATCAGTATAGTGAGGAAAT  699
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGTGAAAATAATTTGTTTTAAGTTGGATCAGTATAGTGAGGAAAT  700

seq1  ACTCAGTGAGGAAAAATAATTAAGAAAATAATGGAGTCCATGTGTTGATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTGAGGAAAAATAATTAAGAAAATAATGGAGTCCATGTGTTGATA  750

seq1  TC-TGGCTTTAAAGTTAAAAGACAGAAACAGTGACACAGGGGGTGTGGGA  798
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGCTTTAAAGTTAAAAGACAGAAACAGTGACACAGGGGGTGTGGGA  800

seq1  TGAGGGCGTCCATGTGCATTCTAATCATTAGAGGGGGTACATTTCAGTGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGCGTCCATGTGCATTCTAATCATTAGAGGGGGTACATTTCAGTGA  850

seq1  TCCAAATTACTGTGACAAATTCATCCAATAATGCATTCAGACAAATAAAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAATTACTGTGACAAATTCATCCAATAATGCATTCAGACAAATAAAC  900

seq1  AGGCTCACAGAGTCTCAAGTATTTAAGACATAGTGAAATTTTTGGTTTTA  948
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||
seq2  AGGCTCACAGAGTCTCAAGTATTT-AGACATAGTGAAATTTT--GGTTTA  947

seq1  GAACCTTTAAGCTAAAATAAAATACACTTTCACCTACTTTTAGGCTTATT  998
      | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  G-ACCTTTAAGCTAAATAAAAATACACTTTCACCTACTTTTAG--CTATT  994

seq1  GTGCAGCCCTGTCTAGAATTATCAAGGATGACACT  1033
      ||||||||||||||||||||||| | |||||||||
seq2  GTGCAGCCCTGTCTAGAATTATC-ATGATGACACT  1028