BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094K14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 64,725,944 - 64,854,320
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700047L15Rik, Tspyl-ps, EG665741, EG382606
Downstream geneLOC435302, EG623046
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094K14.bB6Ng01-094K14.g
ACCDH905822DH905823
length1,1301,087
definitionDH905822|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094K14, 5' end.DH905823|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,853,171 - 64,854,320)(64,725,944 - 64,727,039)
sequence
gaattctacgattttttctttctccaaggcacatatttgggctgttttca
ataggaaggaacaatttgccaagacttttgaatttatcaccagtgacctc
tgggaggaactgaacaacttctgtttctgggtctaaattacccagcattt
ctcatataacacaaaccagccaattgtaaaagacagggggaagctctgtg
tttgtgtgtatgtaacttggattcagctctgtgtgtataaaacttggatt
caactcttattttttaaaactatgtttagtaagaaaacagatatttttga
atagcaaccatgttcctcttctccatcttgattgtgatctcatcaggatg
taagcattcccatggctggcaaccatatttacaaaggtttaaagagtgta
caccatgtgaattcaccatcttaagatgacaacatgggataatgcaacaa
ctgtaaaacttttagtcctaatgagttctctgtttatcattgcatttcct
atttagactaaagaagcaacaagtctcaaacattttggattgacattgat
ttttgtacaatgataaaaatttaaaattatatacacactacgtatatgat
ccaactgtgatttggaatatactatatataatgataacattttaagctta
taaaggtatattcagactaacagaacctgatttaaggtatatgtctaact
acttatatctttgctaactggttaacaccaactctaaaaaatttagatga
gtagcactatgtttatttagtaaggcatatttgttaatcaagacataaat
ccctagagtgtcatcaagttcatattattttttaaggttaacactaatag
gcatgcaatgtaaagacatagtcttataaaaccactaacttattgtaaat
tgttaagtataattaggacttgcaagtaatggtaatccatcttataaatg
atcaaattttatgtgtcagactaatgatatataagaataatcttatttag
ctctaattatgttttaaatgttaagctaaaagaaatactagaaacaagca
aaatctcctcttgctaaaatatactatagatactggttctaatcttcaga
tctgctgaatacttttaagaagttctattt
gaattcatatcaatggtatggtataagaaaaaaacaagcattttttttaa
tgcaacttgcatctattctttgatttttctgagtagtttttacttgttat
cctcattggcctctttactgactttaccatgtaacctgatttttagtttt
aaggtaatgttaacccccccaagactatctgacatttatgtgtaaacgat
cagcttattacatacattctcttagtgtgttaatatttttaccctagtgg
ttttttggttgacacaggcaacaaaccaacaattattcatccatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatgatcttaaggcaatggat
aaagacatgaaggcttacataaaggtacgctggctgaatgtgtactctgg
aaatggacaaagtcgtgacaaaattccccgactcgtggaaaattggcaaa
gatttcctcatacttgtcaggctcaaaattaacgagttttttctattggc
caaaatataagtggctacagacaattgttcaatttgtacgtatctaacaa
taaggtctcacctgcattgactgcttaaacctgagctgaacaaaggcaat
agctatgctaagcagaccgatgaaagcccaagaggcctcaagtctttgca
aagaaccagaggaaactacaaaattctgagaactctgctaatagtctaat
aactgtgctcaaagaatcacatccaaatcacatgtcaaatgattggccct
aaacacataactacaaacaacacatacaacctaaacctgctctatttatg
tatttaggaatatatatactcatatacacatatataaatatataggtttg
taaaagcagagaaaacaggccatattttgagagagatacaggaggattaa
aggaggatttgtactgtggaacagaagggtaaatgatgtaaatatgttat
aatctcaaaagaataattttaaaatcaactagtaactacaaatgaaatta
aagatttctaataaaccggacttaaaataagatcactcaaggttatcatg
ggtgactaatgacataacatgcttggaattaaaaata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_64853171_64854320
seq2: B6Ng01-094K14.b_49_1178 (reverse)

seq1  AAATAG-ACATCTTAAACACTATATTCAGCAGATCTCTGAAGAGTTTTAG  49
      |||||| || |||||||     |||||||||||  ||||||||   ||||
seq2  AAATAGAACTTCTTAAA---AGTATTCAGCAGA--TCTGAAGA---TTAG  42

seq1  GACCAGTATCTATTAAGTATATTTAAGCAAGA-GAGATTTTGCTTGTTTC  98
       ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  AACCAGTATCTAT--AGTATATTTTAGCAAGAGGAGATTTTGCTTGTTTC  90

seq1  TAGTTATTTCTTTTAGGCTTAACATTTAAAACATATATAGGAGGCTAAAT  148
      ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||
seq2  TAG-TATTTCTTTTA-GCTTAACATTTAAAACATAATTAG--AGCTAAAT  136

seq1  AAAGATTATTCTTATAATTAATCAATTAGTCTGAACACATAAAATTTGAT  198
       |||||||||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||
seq2  -AAGATTATTCTTATA---TATC-ATTAGTCTG-ACACATAAAATTTGAT  180

seq1  CATTTATAAGATGGATTACCATTAACTTGCAAGTCCTAATTATACTTAAC  248
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTATAAGATGGATTACCATT-ACTTGCAAGTCCTAATTATACTTAAC  229

seq1  AATTTACAATAAGTTAGTGGTTTTTATAAGACTATGTCTTTACATTGCAT  298
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTACAATAAGTTAGTGG-TTTTATAAGACTATGTCTTTACATTGCAT  278

seq1  GCCTATTAGTGTTAACCTTAAAAAATAATATGAACTTGATGACACTCTAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATTAGTGTTAACCTTAAAAAATAATATGAACTTGATGACACTCTAG  328

seq1  GGATTTATGTCTTGATTAACAAATATGCCTTACTAAATAAACATAGTGCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTATGTCTTGATTAACAAATATGCCTTACTAAATAAACATAGTGCT  378

seq1  ACTCATCTAAATTTTTTAGAGTTGGTGTTAACCAGTTAGCAAAGATATAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATCTAAATTTTTTAGAGTTGGTGTTAACCAGTTAGCAAAGATATAA  428

seq1  GTAGTTAGACATATACCTTAAATCAGGTTCTGTTAGTCTGAATATACCTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTAGACATATACCTTAAATCAGGTTCTGTTAGTCTGAATATACCTT  478

seq1  TATAAGCTTAAAATGTTATCATTATATATAGTATATTCCAAATCACAGTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGCTTAAAATGTTATCATTATATATAGTATATTCCAAATCACAGTT  528

seq1  GGATCATATACGTAGTGTGTATATAATTTTAAATTTTTATCATTGTACAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCATATACGTAGTGTGTATATAATTTTAAATTTTTATCATTGTACAA  578

seq1  AAATCAATGTCAATCCAAAATGTTTGAGACTTGTTGCTTCTTTAGTCTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAATGTCAATCCAAAATGTTTGAGACTTGTTGCTTCTTTAGTCTAA  628

seq1  ATAGGAAATGCAATGATAAACAGAGAACTCATTAGGACTAAAAGTTTTAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAAATGCAATGATAAACAGAGAACTCATTAGGACTAAAAGTTTTAC  678

seq1  AGTTGTTGCATTATCCCATGTTGTCATCTTAAGATGGTGAATTCACATGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTTGCATTATCCCATGTTGTCATCTTAAGATGGTGAATTCACATGG  728

seq1  TGTACACTCTTTAAACCTTTGTAAATATGGTTGCCAGCCATGGGAATGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACACTCTTTAAACCTTTGTAAATATGGTTGCCAGCCATGGGAATGCT  778

seq1  TACATCCTGATGAGATCACAATCAAGATGGAGAAGAGGAACATGGTTGCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCCTGATGAGATCACAATCAAGATGGAGAAGAGGAACATGGTTGCT  828

seq1  ATTCAAAAATATCTGTTTTCTTACTAAACATAGTTTTAAAAAATAAGAGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAAAATATCTGTTTTCTTACTAAACATAGTTTTAAAAAATAAGAGT  878

seq1  TGAATCCAAGTTTTATACACACAGAGCTGAATCCAAGTTACATACACACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCCAAGTTTTATACACACAGAGCTGAATCCAAGTTACATACACACA  928

seq1  AACACAGAGCTTCCCCCTGTCTTTTACAATTGGCTGGTTTGTGTTATATG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGAGCTTCCCCCTGTCTTTTACAATTGGCTGGTTTGTGTTATATG  978

seq1  AGAAATGCTGGGTAATTTAGACCCAGAAACAGAAGTTGTTCAGTTCCTCC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGCTGGGTAATTTAGACCCAGAAACAGAAGTTGTTCAGTTCCTCC  1028

seq1  CAGAGGTCACTGGTGATAAATTCAAAAGTCTTGGCAAATTGTTCCTTCCT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTCACTGGTGATAAATTCAAAAGTCTTGGCAAATTGTTCCTTCCT  1078

seq1  ATTGAAAACAGCCCAAATATGTGCCTTGGAGAAAGAAAAAATCGTAGAAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAAACAGCCCAAATATGTGCCTTGGAGAAAGAAAAAATCGTAGAAT  1128

seq1  TC  1150
      ||
seq2  TC  1130

seq1: chr12_64725944_64727039
seq2: B6Ng01-094K14.g_68_1154

seq1  GAATTCATATCAATGGTATGGTATAAGAAAAAAACAAGCATTTTTTTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATCAATGGTATGGTATAAGAAAAAAACAAGCATTTTTTTTAA  50

seq1  TGCAACTTGCATCTATTCTTTGATTTTTCTGAGTAGTTTTTACTTGTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTTGCATCTATTCTTTGATTTTTCTGAGTAGTTTTTACTTGTTAT  100

seq1  CCTCATTGGCCTCTTTACTGACTTTACCATGTAACCTGATTTTTAGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATTGGCCTCTTTACTGACTTTACCATGTAACCTGATTTTTAGTTTT  150

seq1  AAGGTAATGTTAACCCCCCCAAGACTATCTGACATTTATGTGTAAACGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAATGTTAACCCCCCCAAGACTATCTGACATTTATGTGTAAACGAT  200

seq1  CAGCTTATTACATACATTCTCTTAGTGTGTTAATATTTTTACCCTAGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTATTACATACATTCTCTTAGTGTGTTAATATTTTTACCCTAGTGG  250

seq1  TTTTTTGGTTGACACAGGCAACAAACCAACAATTATTCATCCATATATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGGTTGACACAGGCAACAAACCAACAATTATTCATCCATATATAT  300

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATGATCTTAAGGCAATGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATGATCTTAAGGCAATGGAT  350

seq1  AAAGACATGAAGGCTTACATAAAGGTACGCTGGCTGAATGTGTACTCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACATGAAGGCTTACATAAAGGTACGCTGGCTGAATGTGTACTCTGG  400

seq1  AAATGGACAAAGTCGTGACAAAATTCCCCGACTCGTGGAAAATTGGCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGACAAAGTCGTGACAAAATTCCCCGACTCGTGGAAAATTGGCAAA  450

seq1  GATTTCCTCATACTTGTCAGGCTCAAAATTAACGAGTTTTTTCTATTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCCTCATACTTGTCAGGCTCAAAATTAACGAGTTTTTTCTATTGGC  500

seq1  CAAAATATAAGTGGCTACAGACAATTGTTCAATTTGTACGTATCTAACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATATAAGTGGCTACAGACAATTGTTCAATTTGTACGTATCTAACAA  550

seq1  TAAGGTCTCACCTGCATTGACTGCTTAAACCTGAGCTGAACAAAGGCAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTCTCACCTGCATTGACTGCTTAAACCTGAGCTGAACAAAGGCAAT  600

seq1  AGCTATGCTAAGCAGACCGATGAAAGCCCAAGAGGCCTCAAGTCTTTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGCTAAGCAGACCGATGAAAGCCCAAGAGGCCTCAAGTCTTTGCA  650

seq1  AAGAACCAGAGGAAACTACAAAATTCTGAGAACTCTGCTAATAGTCTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACCAGAGGAAACTACAAAATTCTGAGAACTCTGCTAATAGTCTAAT  700

seq1  AACTGTGCTCAAAGAATCACATCCAAATCACATGTCAAATGATTGGCCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTGCTCAAAGAATCACATCCAAATCACATGTCAAATGATTGGCCCT  750

seq1  AAACACATAACTACAAACAACACATACAACCTAAACCTGCTCTATTTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACATAACTACAAACAACACATACAACCTAAACCTGCTCTATTTATG  800

seq1  TATTTAGGAATATATATACTCATATACACATATATAAATATATAGGTTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGGAATATATATACTCATATACACATATATAAATATATAGGTTTG  850

seq1  TAAAAGCAGAGAAAACAGGCCATATTTTGAGAGAGATAACAGGAGGATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  TAAAAGCAGAGAAAACAGGCCATATTTTGAGAGAGAT-ACAGGAGGA-TT  898

seq1  AAAGGAGGATTTGTACTGTGGAACAGAAGGGGTAAATGATGTAAATATGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGGATTTGTACTGTGGAACAGAA-GGGTAAATGATGTAAATATGT  947

seq1  TATAATCTCAAAAAGATACATTTTAAAATCAACTAGTAACTACAAATGAA  1000
      |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCTCAAAAGAATA-ATTTTAAAATCAACTAGTAACTACAAATGAA  996

seq1  ATTAAAGATTTCTAATAAACCGGACTTAAAATAAGATCACTCAGGGTTAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATTAAAGATTTCTAATAAACCGGACTTAAAATAAGATCACTCAAGGTTAT  1046

seq1  CATGGTGGACCTAATGACATAACAATGCCCTTTGAAATTAAAAATA  1096
      |||||  || ||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||
seq2  CATGGGTGA-CTAATGACATAAC-ATGC---TTGGAATTAAAAATA  1087