BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096D23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 44,900,610 - 45,105,049
singlet/doubletdoublet
Overlap geneENSMUSG00000066507
Upstream geneLOC100039059
Downstream geneLOC100039081, LOC664854, Dnajb9, LOC100039062, Pnpla8, Nrcam, EG620025, Stxbp6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096D23.bB6Ng01-096D23.g
ACCDH906961DH906962
length1,1101,004
definitionDH906961|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096D23, 5' end.DH906962|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096D23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,900,610 - 44,901,724)(45,104,048 - 45,105,049)
sequence
gaattccatttttacttcctctgcggaaagctagtgttctgttgggggca
gggaggctttcttaattcaagaggatggagggcaaaaccatttaaatttc
aatatgaataaaagctaagcaataccagagtatttttatgtgtgggagta
tgtgtgcctaatgcttgtggaggtctaaagatgctgtaaggttcccactg
tccccagaactggagttatatattggttgtcactactatatgagtgctgg
caaccaaagtggggtcttagcagcaggtactattaacagcagaacaatct
ttccagaaaagggcagagtttgttgttgttttttttttaacatttggcaa
aaactaaaatattataaaggaaagatcttctgtgcactctacaaggccca
acttgggatccttatgtcactagataagtccagttattatgcatttgaag
aacatattcacttcccagaccagaagacacaatcaagaattcaatcaatg
agcatttaaccaaagtttcctctgccctggttaccacatctcatggtcta
gagaacaatcataaacctgctttatgtgcagattatctttaaaagtagag
gaaacagaatgtgtacatttgctaaggataatttcaggcataactaatct
ttgtactcactgaatattctgaacattaagtaatattactgttaaaactt
aaaaataggaatttttgttccagttattttctgaatcattttaacaagga
aagaagtcatcattagcccactgttacccatcttatgctttaagcaagca
gtctgtctgatttagagttcaactccttccttgtagagaaaaataaggag
aattcataaaggttaaatgtattgtagaaagttagccttgtctgacaaga
tgtgattattccccctcagacgatcttatttttgtagcctttgggctttg
taatccattcttaaccttgaactggatttagtctaatttattttttcagc
tatctcagtagtggttagtatggcataagattccacattgctagtgaaaa
aggtacaatcacaatcagcatacttgtagaaaccacctctgtcctatctc
agctatttcc
gaattctctatccattggtatgctgagctttaacacagaggtcaagttaa
ggttgcactaattgacttctgtaggattgttcaattttgaaaatttatga
tcactaaaagtagttttagtggatgatccatctgcatatgttattaacat
acaagatgctctatactgtgtttccaagcaatctctagctgttttctcta
aaatggccttaccttgtttgctttaaattgcctcttccattctatgcact
tgaagacactgtgcagggtcataggaattggcatagtcatatgtgtttgt
ctgccttagtgacactgacaagaggatccaactatcctgatgtttaagaa
taaatgatgtagcatagtaaatggattgaaaataatgtgtggtaggtttc
ctggtttcctatggttctgaggaagtggaagctaggagacaagtttccca
tgacatactttattgatggactaatctatttgtagaattggagtcctcat
tgttccaattactaaatcagttgttccaccctggatattgcttttgggac
caaggattacacacatgagcttctgaaggatgttccagattcaaaccata
aactctctgtacgttttcctctttcacttcccatttatactgactattct
gggattatttttgcctatgggtagattttgaatgtctgagttaaaaaaaa
tagtccattttataaaaacaaatccacagaataatgggttcaataattag
tcatgttaatttttttacacatgtcaatatattaaagatattaagatata
tgtgtatcttaaaatatatatttaagatatactttaacattgtaataata
tgatatacatactatatatacataaatatagaatgtatattatatataca
tatgtatctatctccaaattaatctcaaaacctaaggatgtatataccac
attttgggtaagattttggtgacttccattcctaatctacctggagctca
gctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_44900610_44901724
seq2: B6Ng01-096D23.b_47_1156

seq1  GAATTCCATTTTTACTTCCTCTGCGGAAAGCTAGTGTTCTGTTGGGGGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTTTACTTCCTCTGCGGAAAGCTAGTGTTCTGTTGGGGGCA  50

seq1  GGGAGGCTTTCTTAATTCAAGAGGATGGAGGGCAAAACCATTTAAATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGCTTTCTTAATTCAAGAGGATGGAGGGCAAAACCATTTAAATTTC  100

seq1  AATATGAATAAAAGCTAAGCAATACCAGAGTATTTTTATGTGTGGGAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGAATAAAAGCTAAGCAATACCAGAGTATTTTTATGTGTGGGAGTA  150

seq1  TGTGTGCCTAATGCTTGTGGAGGTCTAAAGATGCTGTAAGGTTCCCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCCTAATGCTTGTGGAGGTCTAAAGATGCTGTAAGGTTCCCACTG  200

seq1  TCCCCAGAACTGGAGTTATATATTGGTTGTCACTACTATATGAGTGCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGAACTGGAGTTATATATTGGTTGTCACTACTATATGAGTGCTGG  250

seq1  CAACCAAAGTGGGGTCTTAGCAGCAGGTACTATTAACAGCAGAACAATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAAAGTGGGGTCTTAGCAGCAGGTACTATTAACAGCAGAACAATCT  300

seq1  TTCCAGAAAAGGGCAGAGTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTAACATTTGGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAAAAGGGCAGAGTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTAACATTTGGCAA  350

seq1  AAACTAAAATATTATAAAGGAAAGATCTTCTGTGCACTCTACAAGGCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAAATATTATAAAGGAAAGATCTTCTGTGCACTCTACAAGGCCCA  400

seq1  ACTTGGGATCCTTATGTCACTAGATAAGTCCAGTTATTATGCATTTGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGATCCTTATGTCACTAGATAAGTCCAGTTATTATGCATTTGAAG  450

seq1  AACATATTCACTTCCCAGACCAGAAGACACAATCAAGAATTCAATCAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATATTCACTTCCCAGACCAGAAGACACAATCAAGAATTCAATCAATG  500

seq1  AGCATTTAACCAAAGTTTCCTCTGCCCTGGTTACCACATCTCATGGTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTAACCAAAGTTTCCTCTGCCCTGGTTACCACATCTCATGGTCTA  550

seq1  GAGAACAATCATAAACCTGCTTTATGTGCAGATTATCTTTAAAAGTAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACAATCATAAACCTGCTTTATGTGCAGATTATCTTTAAAAGTAGAG  600

seq1  GAAACAGAATGTGTACATTTGCTAAGGATAATTTCAGGCATAACTAATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGAATGTGTACATTTGCTAAGGATAATTTCAGGCATAACTAATCT  650

seq1  TTGTACTCACTGAATATTCTGAACATTAAGTAATATTACTGTTAAAACTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACTCACTGAATATTCTGAACATTAAGTAATATTACTGTTAAAACTT  700

seq1  AAAAATAGGAATTTTTGTTCCAGTTATTTTCTGAATCATTTTAACAAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGGAATTTTTGTTCCAGTTATTTTCTGAATCATTTTAACAAGGA  750

seq1  AAGAAGTCATCATTAGCCCACTGTTACCCATCTTATGCTTTAAGCAAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGTCATCATTAGCCCACTGTTACCCATCTTATGCTTTAAGCAAGCA  800

seq1  GTCTGTCTGATTTAGAGTTCAACTCCTTCCTTGTAGAGAAAAATAAGGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTCTGATTTAGAGTTCAACTCCTTCCTTGTAGAGAAAAATAAGGAG  850

seq1  AATTCATAAAGGTTAAATGTATTGTAGAAAGTTAGCCTTGTCTGACAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATAAAGGTTAAATGTATTGTAGAAAGTTAGCCTTGTCTGACAAGA  900

seq1  TGTGATTATTCCCCCTCAAGACGATCTTATTTTTGTAGCCTTT-GGCTTT  949
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGTGATTATTCCCCCTC-AGACGATCTTATTTTTGTAGCCTTTGGGCTTT  949

seq1  GTAATCCATTCTTAACCTTGAAACTGGATTTAGTCT-ATTTA-TTTTTCA  997
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  GTAATCCATTCTTAACCTTG-AACTGGATTTAGTCTAATTTATTTTTTCA  998

seq1  GCTATCTCAGTAGTGG-TAGTAATGGCATAAGATTCCACATTGCCTAGTG  1046
      |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GCTATCTCAGTAGTGGTTAGT-ATGGCATAAGATTCCACATTG-CTAGTG  1046

seq1  GAAAA-GTACCATCACAATCAGCATAACTTGGTAAGAAACCACCTTCTTG  1095
       |||| |||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||   ||
seq2  AAAAAGGTACAATCACAATCAGCAT-ACTTG--TAGAAACCACCT--CTG  1091

seq1  TCCCTATCTCAGCTATTTCC  1115
      | ||||||||||||||||||
seq2  T-CCTATCTCAGCTATTTCC  1110

seq1: chr12_45104048_45105049
seq2: B6Ng01-096D23.g_67_1070 (reverse)

seq1  AAGCTGAGCTCCAGGTAGATTAGGAATGGAAGTCACCAAAATCTTACCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAGCTCCAGGTAGATTAGGAATGGAAGTCACCAAAATCTTACCCA  50

seq1  AAATGTGGTATATACATCC-TAGGTTTTGAGATTAATTTGGAGATAGATA  99
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGGTATATACATCCTTAGGTTTTGAGATTAATTTGGAGATAGATA  100

seq1  CATATGTATATATAATATACATTCTATATTTATGTATATATAGTATGTAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTATATATAATATACATTCTATATTTATGTATATATAGTATGTAT  150

seq1  ATCATATTATTACAATGTTAAAGTATATCTTAAATATATATTTTAAGATA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATATTATTACAATGTTAAAGTATATCTTAAATATATATTTTAAGATA  200

seq1  CACATATATCTTAATATCTTTAATATATTGACATGTGT-AAAAAATTAAC  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CACATATATCTTAATATCTTTAATATATTGACATGTGTAAAAAAATTAAC  250

seq1  ATGACTAATTATTGAACCCATTATTCTGTGGATTTGTTTTTATAAAATGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTAATTATTGAACCCATTATTCTGTGGATTTGTTTTTATAAAATGG  300

seq1  ACTATTTTTTTTAACTCAGACATTCAAAATCTACCCATAGGCAAAAATAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTTTTTTAACTCAGACATTCAAAATCTACCCATAGGCAAAAATAA  350

seq1  TCCCAGAATAGTCAGTATAAATGGGAAGTGAAAGAGGAAAACGTACAGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGAATAGTCAGTATAAATGGGAAGTGAAAGAGGAAAACGTACAGAG  400

seq1  AGTTTATGGTTTGAATCTGGAACATCCTTCAGAAGCTCATGTGTGTAATC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTATGGTTTGAATCTGGAACATCCTTCAGAAGCTCATGTGTGTAATC  450

seq1  CTTGGTCCCAAAAGCAATATCCAGGGTGGAACAACTGATTTAGTAATTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTCCCAAAAGCAATATCCAGGGTGGAACAACTGATTTAGTAATTGG  500

seq1  AACAATGAGGACTCCAATTCTACAAATAGATTAGTCCATCAATAAAGTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGAGGACTCCAATTCTACAAATAGATTAGTCCATCAATAAAGTAT  550

seq1  GTCATGGGAAACTTGTCTCCTAGCTTCCACTTCCTCAGAACCATAGGAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGGGAAACTTGTCTCCTAGCTTCCACTTCCTCAGAACCATAGGAAA  600

seq1  CCAGGAAACCTACCACACATTATTTTCAATCCATTTACTATGCTACATCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAACCTACCACACATTATTTTCAATCCATTTACTATGCTACATCA  650

seq1  TTTATTCTTAAACATCAGGATAGTTGGATCCTCTTGTCAGTGTCACTAAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCTTAAACATCAGGATAGTTGGATCCTCTTGTCAGTGTCACTAAG  700

seq1  GCAGACAAACACATATGACTATGCCAATTCCTATGACCCTGCACAGTGTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACAAACACATATGACTATGCCAATTCCTATGACCCTGCACAGTGTC  750

seq1  TTCAAGTGCATAGAATGGAAGAGGCAATTTAAAGCAAACAAGGTAAGGCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTGCATAGAATGGAAGAGGCAATTTAAAGCAAACAAGGTAAGGCC  800

seq1  ATTTTAGAGAAAACAGCTAGAGATTGCTTGGAAACACAGTATAGAGCATC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAGAGAAAACAGCTAGAGATTGCTTGGAAACACAGTATAGAGCATC  850

seq1  TTGTATGTTAATAACATATGCAGATGGATCATCCACTAAAACTACTTTTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATGTTAATAACATATGCAGATGGATCATCCACTAAAACTACTTTTA  900

seq1  GTGATCATAAATTTTCAAAATTGAACAATCCTACAGAAGTCAATTAGTGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCATAAATTTTCAAAATTGAACAATCCTACAGAAGTCAATTAGTGC  950

seq1  AACCTTAACTTGACCTCTGTGTTAAAGCTCAGCATACCAATGGATAGAGA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTAACTTGACCTCTGTGTTAAAGCTCAGCATACCAATGGATAGAGA  1000

seq1  ATTC  1002
      ||||
seq2  ATTC  1004