BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096H18
Chromosome12 (Build37)
Map Location 114,432,008 - 114,540,737
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIgh, Igh-2, Gm900, Igh-1b
Upstream geneA730018C14Rik, A530016L24Rik, Tmem179, 2610204M08Rik, Adssl1, Siva1, Akt1, EG382639, AW555464, LOC382640, Pld4, AI450948, LOC100041194, BC022687, Cdca4, Gpr132, Jag2, Nudt14, Brf1, Btbd6, Pacs2, Tex22, Mta1, Crip2, Crip1, 4930427A07Rik, LOC676349, Tmem121
Downstream geneIgh-3, Ighg1, AI324046, LOC668370, LOC668375, EG382645, Igh-5, Igh-6, Ighj4, Ighj3, Ighj2, Ighj1, Ighd4-1, Ighd3-2, Ighd5-6, Ighd2-8, Ighd5-5, Ighd2-7, Ighd5-8, Ighd5-4, Ighd2-6, Ighd5-7, Ighd5-3, Ighd2-5, Ighd5-2, Ighd2-4, Ighd6-2, Ighd2-3, Ighd6-1, Ighd1-1, 4930523C11Rik, Ighd3-1, Ighd5-1, Adam6, Ighv5-1, Ighv2-1, Ighv5-2, Ighv2-2, Ighv5-3, Ighv5-4, Ighv6-1, Ighv2-3, Ighv5-5, Ighv5-6, Ankrd12-like, Ighv5-7, EG668389, Ighv5-8, Ighv5-9, Ighv5-10, Ighv2-5, Ighv5-11, Ighv5-12, Ighv2-6, Ighv5-9-1, EG628098, Ighv2-9-1, Ighv5-13, Ighv2-6-8, EG629785, Ighv2-7, LOC668405, Ighv5-15, Ighv5-16, Ighv5-17, Ighv5-18, Ighv2-8, Ighv2-9, Ighv5-19, Ighv7-1, Ighv7-2, Ighv14-1, Ighv4-1, Ighv3-1, Ighv11-1, Ighv14-2, Ighv4-2, Ighv3-2, Ighv11-2, Ighv14-3, EG629812, Ighv6-2, Ighv9-1, Ighv12-1, EG629818, Ighv12-2, Ighv9-3, Ighv7-3, Ighv15-1, Ighv14-4, EG668438, Ighv7-4, EG629833, EG633457, Ighv13-1, Ighv3-6, EG636260
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096H18.bB6Ng01-096H18.g
ACCDH907121DH907122
length1,1271,115
definitionDH907121|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096H18, 5' end.DH907122|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096H18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,539,611 - 114,540,737)(114,432,008 - 114,433,118)
sequence
gaattctcagtcatgcttttcttacctgttaggtgccttctcccccatgg
cacatcgtaggctctccatctgtatgtgtctgcgtcctgatctcttctca
taagtacacagtcaggctggaatgggtacaccctggccctcattataact
taccagtttatgatcctgtctgcaaaggcaggctcagtctgaggtcctgg
tggcttaaatttcaattggtgagacttgtagaaacagaatttagtccaca
ttagcttgccctgtagaccaaaaagattcatgtcctttgtacatagaatg
cctacccccccccatgcccacatcccaaggtctcacccatccagcatcag
ctgtcccaagtctcctccaaagctctgctagttaggtaagggtgagatgt
gtgtgtgactcattcaggagctagctcactttgtatagaccatggctgtc
aagaaagtttttaagctgtcagaacagagcagataattattccaggatga
tcagagcagatggcaaggttcaaaggcagttatagagaagttatattcct
tgctatagagaagatagtccactgtgatcctcttgcactaccttatgata
acaacattgctatggaaaagtgaagaaatacgaaagagaagaaatactct
agagaaagattatacaggggctgccaagtgtctctgttctgctgggtctg
tctgtgtcctaccagggttggattctgtcttctcatgtagatcagaagac
tcgggatccatagcctgagatagcacagagaggctcagaaaaatgcttct
ggaatgtaggagtgttagcatcaatggagagctaaggtacacaatctaag
gcctcctaagcaaacacctaaaacaggagccaggtgctagctgggcagtg
agttctcagatggaatttagatgtcttaagatatattcctgactgtttag
agacttgttcaagtctatattctcttctagttggtagcttattgagaaac
tcacggggcttggaacagtcagagaagatcctgtcagcacagctacagaa
gagaggagaggggggcgattacaaactggtcagtactttcacagccttct
ggtgtggtactgcatgcttacctagac
gaattcctgacaggaactcacatcagggtaggaacctgggggcaggagct
gttgcagaggccatggacggtgctccttgctggcttgctcctcatggctt
gctcagcctgctttcttatagagcgcaggaccaccagtccagggatggca
ccacccacaatgggctgagccctctcccatcaatcagtaattaaaaaaaa
aattccttaagagtcttgcatacagcccaatcttatagagacattttctt
ttctttttcctttttttccttcagtttttggaaacagggtttttctgtgt
agccctggctgtcctggatctcactctgtagaccaggctggcctcgaact
cagaaatccacctgcctctgcctcccgagtgctgggattaaaggcgtgca
ccaccactgcctggctggagacattttttaattgaggttcccctgtttca
gttgacataaaattagccagcgaacgggcccagagcctccctctccaggt
gaagagactccagtctgtcactgagaactccctggtgtcaggttgactta
tgggctctctgttttacttaagctgggtttggcatggtcgagccagctaa
ggcacatataacttctcactaggatataaaactcaagctagctctatggc
tttgacagtctgtgtccttctaaaatctgtgttgaccctttaaacccaaa
gcaacctagttgaaggctgtgccctttaaaagggctttaatgtggggagc
ctgccatttgctctccttttgatgacccagtaggaggatgaagcgggcat
cgttcttggcagcagagagcaacgctcactgtgcacaaccctgctgccaa
cgtgaccttggacctccagctttggaaacatgagaggtaattttttgttg
ctgatcagtttcccagcttgcagcatgttgtgactgcagcacagacatgg
gggagaatatgttgcggaatatgtgcagcccgtggggactcgtttcttct
cctctgtaaatcttgccagtggtagttggtcaggctgcacttccccagct
gatggaacccagggtctctccgatctcattttccttggtgtgagtctgct
atgaactgcagctgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_114539611_114540737
seq2: B6Ng01-096H18.b_49_1175 (reverse)

seq1  GTCTAGGTTAGCATGCCTTTCCCAACACCAG-AGGCTGTGATAGTACTGA  49
      |||||||| |||||||  | ||  ||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  GTCTAGGTAAGCATGCAGTACC--ACACCAGAAGGCTGTGAAAGTACTGA  48

seq1  CCAGTTTGTAATCTGCCCCCTCTTCCTCTC-TCTGTAGCTGTGCTGACAG  98
      |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTGTAATCGCCCCCCTC-TCCTCTCTTCTGTAGCTGTGCTGACAG  97

seq1  GATCTTCTCTTGACCTGTTCC-AGCCCCGTTGAGTTTTCTCAATTAGCTA  147
      ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||
seq2  GATCTTCTC-TGA-CTGTTCCAAGCCCCG-TGAG-TTTCTCAATAAGCTA  143

seq1  CC-ACTAG-AGAGAATATAGACTTGAAC-AGTCTCT-AACAGTCAAGGAT  193
      || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||
seq2  CCAACTAGAAGAGAATATAGACTTGAACAAGTCTCTAAACAGTCAGGAAT  193

seq1  ATATCTTAAGACATCTAAATTCCATCTGAGAACTCACTGCCCAGCTAGCA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTTAAGACATCTAAATTCCATCTGAGAACTCACTGCCCAGCTAGCA  243

seq1  CCTGGCTCCTGTTTTAGGTGTTTGCTTAGGAGGCCTTAGATTGTGTACCT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCCTGTTTTAGGTGTTTGCTTAGGAGGCCTTAGATTGTGTACCT  293

seq1  TAGCTCTCCATTGATGCTAACACTCCTACATTCCAGAAGCATTTTTCTGA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCTCCATTGATGCTAACACTCCTACATTCCAGAAGCATTTTTCTGA  343

seq1  GCCTCTCTGTGCTATCTCAGGCTATGGATCCCGAGTCTTCTGATCTACAT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCTGTGCTATCTCAGGCTATGGATCCCGAGTCTTCTGATCTACAT  393

seq1  GAGAAGACAGAATCCAACCCTGGTAGGACACAGACAGACCCAGCAGAACA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGACAGAATCCAACCCTGGTAGGACACAGACAGACCCAGCAGAACA  443

seq1  GAGACACTTGGCAGCCCCTGTATAATCTTTCTCTAGAGTATTTCTTCTCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACACTTGGCAGCCCCTGTATAATCTTTCTCTAGAGTATTTCTTCTCT  493

seq1  TTCGTATTTCTTCACTTTTCCATAGCAATGTTGTTATCATAAGGTAGTGC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTATTTCTTCACTTTTCCATAGCAATGTTGTTATCATAAGGTAGTGC  543

seq1  AAGAGGATCACAGTGGACTATCTTCTCTATAGCAAGGAATATAACTTCTC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGATCACAGTGGACTATCTTCTCTATAGCAAGGAATATAACTTCTC  593

seq1  TATAACTGCCTTTGAACCTTGCCATCTGCTCTGATCATCCTGGAATAATT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACTGCCTTTGAACCTTGCCATCTGCTCTGATCATCCTGGAATAATT  643

seq1  ATCTGCTCTGTTCTGACAGCTTAAAAACTTTCTTGACAGCCATGGTCTAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTCTGTTCTGACAGCTTAAAAACTTTCTTGACAGCCATGGTCTAT  693

seq1  ACAAAGTGAGCTAGCTCCTGAATGAGTCACACACACATCTCACCCTTACC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGTGAGCTAGCTCCTGAATGAGTCACACACACATCTCACCCTTACC  743

seq1  TAACTAGCAGAGCTTTGGAGGAGACTTGGGACAGCTGATGCTGGATGGGT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGCAGAGCTTTGGAGGAGACTTGGGACAGCTGATGCTGGATGGGT  793

seq1  GAGACCTTGGGATGTGGGCATGGGGGGGGGTAGGCATTCTATGTACAAAG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCTTGGGATGTGGGCATGGGGGGGGGTAGGCATTCTATGTACAAAG  843

seq1  GACATGAATCTTTTTGGTCTACAGGGCAAGCTAATGTGGACTAAATTCTG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGAATCTTTTTGGTCTACAGGGCAAGCTAATGTGGACTAAATTCTG  893

seq1  TTTCTACAAGTCTCACCAATTGAAATTTAAGCCACCAGGACCTCAGACTG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTACAAGTCTCACCAATTGAAATTTAAGCCACCAGGACCTCAGACTG  943

seq1  AGCCTGCCTTTGCAGACAGGATCATAAACTGGTAAGTTATAATGAGGGCC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCCTTTGCAGACAGGATCATAAACTGGTAAGTTATAATGAGGGCC  993

seq1  AGGGTGTACCCATTCCAGCCTGACTGTGTACTTATGAGAAGAGATCAGGA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTACCCATTCCAGCCTGACTGTGTACTTATGAGAAGAGATCAGGA  1043

seq1  CGCAGACACATACAGATGGAGAGCCTACGATGTGCCATGGGGGAGAAGGC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGACACATACAGATGGAGAGCCTACGATGTGCCATGGGGGAGAAGGC  1093

seq1  ACCTAACAGGTAAGAAAAGCATGACTGAGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAACAGGTAAGAAAAGCATGACTGAGAATTC  1127

seq1: chr12_114432008_114433118
seq2: B6Ng01-096H18.g_70_1184

seq1  GAATTCCTGACAGGAACTCACATCAGGGTAGGAACCTGGGGGCAGGAGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGACAGGAACTCACATCAGGGTAGGAACCTGGGGGCAGGAGCT  50

seq1  GTTGCAGAGGCCATGGACGGTGCTCCTTGCTGGCTTGCTCCTCATGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAGAGGCCATGGACGGTGCTCCTTGCTGGCTTGCTCCTCATGGCTT  100

seq1  GCTCAGCCTGCTTTCTTATAGAGCGCAGGACCACCAGTCCAGGGATGGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCCTGCTTTCTTATAGAGCGCAGGACCACCAGTCCAGGGATGGCA  150

seq1  CCACCCACAATGGGCTGAGCCCTCTCCCATCAATCAGTAATTAAAAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCACAATGGGCTGAGCCCTCTCCCATCAATCAGTAATTAAAAAAAA  200

seq1  AATTCCTTAAGAGTCTTGCATACAGCCCAATCTTATAGAGACATTTTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCTTAAGAGTCTTGCATACAGCCCAATCTTATAGAGACATTTTCTT  250

seq1  TTCTTTTTCCTTTTTTTCCTTCAGTTTTTGGAAACAGGGTTTTTCTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTTCCTTTTTTTCCTTCAGTTTTTGGAAACAGGGTTTTTCTGTGT  300

seq1  AGCCCTGGCTGTCCTGGATCTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGGCTGTCCTGGATCTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACT  350

seq1  CAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCA  400

seq1  CCACCACTGCCTGGCTGGAGACATTTTTTAATTGAGGTTCCCCTGTTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACTGCCTGGCTGGAGACATTTTTTAATTGAGGTTCCCCTGTTTCA  450

seq1  GTTGACATAAAATTAGCCAGCGAACGGGCCCAGAGCCTCCCTCTCCAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACATAAAATTAGCCAGCGAACGGGCCCAGAGCCTCCCTCTCCAGGT  500

seq1  GAAGAGACTCCAGTCTGTCACTGAGAACTCCCTGGTGTCAGGTTGACTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGACTCCAGTCTGTCACTGAGAACTCCCTGGTGTCAGGTTGACTTA  550

seq1  TGGGCTCTCTGTTTTACTTAAGCTGGGTTTGGCATGGTCGAGCCAGCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTCTCTGTTTTACTTAAGCTGGGTTTGGCATGGTCGAGCCAGCTAA  600

seq1  GGCACATATAACTTCTCACTAGGATATAAAACTCAAGCTAGCTCTATGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACATATAACTTCTCACTAGGATATAAAACTCAAGCTAGCTCTATGGC  650

seq1  -TTGACAGTCTGTGTCCTTCTAAAATCTGTGTTGACCCTTTAAACCCAAA  699
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAGTCTGTGTCCTTCTAAAATCTGTGTTGACCCTTTAAACCCAAA  700

seq1  GCAACCTAGTTGAAGGCTGTGCCCTTTAAAAGGGCTTTAATGTGGGGAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCTAGTTGAAGGCTGTGCCCTTTAAAAGGGCTTTAATGTGGGGAGC  750

seq1  CTGCCA-TTGCTCTCC-TTTGATGACCCAGTAGGAGGATGAAGCGGGCAT  797
      |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCATTTGCTCTCCTTTTGATGACCCAGTAGGAGGATGAAGCGGGCAT  800

seq1  CG-TCTTGGCAGCAGAGAGCAACGCTCACTGTGCACAA-CCTGCTGCCAA  845
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CGTTCTTGGCAGCAGAGAGCAACGCTCACTGTGCACAACCCTGCTGCCAA  850

seq1  CGTGACCTTGGACCTCCAGCTTTTGGAAACATGAGAGGTAAATTTTTGTT  895
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CGTGACCTTGGACCTCCAGC-TTTGGAAACATGAGAGGTAATTTTTTGTT  899

seq1  GCTGATCAGTTTCCCAGCTTGCAGCATGTTGTGACTGCAGCACAGACAT-  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTGATCAGTTTCCCAGCTTGCAGCATGTTGTGACTGCAGCACAGACATG  949

seq1  GGGGAGAATATG-TGCGGAATATGTGCAGCCCGTGTGGACTTCGTTTC-T  992
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
seq2  GGGGAGAATATGTTGCGGAATATGTGCAGCCCGTGGGGAC-TCGTTTCTT  998

seq1  CTTCTCTGTAAATC-TGCCAGTGTAAGTGGTCCAGGCTGCCACTTCCCCA  1041
      || ||||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||| ||||||||||
seq2  CTCCTCTGTAAATCTTGCCAGTGGTAGTTGGTCAGGCTG-CACTTCCCCA  1047

seq1  GCTGATGGAACCCA-CGTCTCTCCGATCTCATTTTCTTTGGTGTGAGTTC  1090
      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  GCTGATGGAACCCAGGGTCTCTCCGATCTCATTTTCCTTGGTGTGAG-TC  1096

seq1  TGCTATTGAAACTGCAGCTGC  1111
      ||||||   ||||||||||||
seq2  TGCTAT--GAACTGCAGCTGC  1115