BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103M14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 81,077,479 - 81,245,729
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666754, Zfp36l1
Upstream gene6330442E10Rik, Plekhh1, Pigh, LOC666722, Arg2, Vti1b, Rdh11, Rdh12, Zfyve26, Rad51l1, LOC100041968, LOC435309, LOC100041674
Downstream geneActn1, Wdr22, Exdl2, 2310002D06Rik, Galntl1, LOC100041715, Erh, Slc39a9, 3830431G21Rik, Gm1568, 4933426M11Rik, Sfrs5, Slc10a1, Smoc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103M14.bB6Ng01-103M14.g
ACCDH912270DH912271
length1,1541,123
definitionDH912270|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103M14, 5' end.DH912271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103M14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,077,479 - 81,078,637)(81,244,591 - 81,245,729)
sequence
gaattcctggatctcacaggaaagtttcatgaaatagatgtcccaccaga
aggacatgcatggcctcagtcatatgcactgagggctgggttggagggtg
ctgtagtttatagatccctcatgtttccttaagaatcgtatgttgaagat
tttggtccttggctgttctgcactgcccagagaatgacctacagtagcac
acgtcaagttgtgaatgagggtgtctattaagaatgcaacaggccaaagt
aagggcctgagagatggctcagtggttaagatcactgactgctcttccag
aggttctgagttcaattcccagcaaccacatgatggctcacaaccatctg
tcatgggatctgatgccctcttctggcgtgtctaaagagagcaacagtgt
actcataataagataaataaatctttaaaaaaaaacccaagaaaaagtca
aagaggaagagagagagacagagatgtagagacagagagacatcttcaga
tctacaacatcttcagatctttgaaggcactcaagcatcccacagaaact
ggggaagttgaggcagttcactacggttctcagctaagctctctccatac
acgagttccttctccttctgcactgtaggcacttttaatatcgtgggatc
aacaatgttggaaccaaccctctgttggaactgacttaccttctagctgc
tttcaaggacacagcttttatagtttggcctgttagccattctcttccct
cgctgttgcagagttaagcagccaaccctgagacaagggcattattggag
gacactttgaggcaaacatgcttgggtttgaaatgagatgagggaccacc
atgcatccagaaccaaatgaaaatttacccagtataatgcacccgtccat
agcattactgggagaaggtaaaatgttgaagaggtgggggcctagggctg
gaatatagctgtatggagaaaatgcctccctagccctagcatgcagaagc
cctggttggatcatcagcacaagcaaaagagtgtggtgcctttcccagtg
gtttcagcactcagaatatgaaacaagaggatcagaagttcagccaagct
tgctatattggagatcctgctttaagttattaactagaatgaagaaagaa
agcc
gaattccagcactctttagtcagagacaggcaaatctttgggttcaaggc
cagcctgatctgatccacacagtgaggttccaggtaagcaaaaactacac
agtgcgtccttgtctcaagcaaacaacaacaaaacccacagaaagatcca
ttagttagctgggtagtggtggcacaaacttttaagcctagtacttggga
ggcagaggtaagcagatctctgtgagttcaaggccagctctagtgtacag
attgagttccaggacagttagagctacacagatacaccctggttggaaaa
tccaagcaggggagaagatagttatagttttaaatttgctgaggcttaat
ttaggtgtggcctagttggagcctaagaaggcatgcagcaagaagagagt
gacagctgactatgggtctagatgttgtaaagactggtgcctccttccat
acagggctggtgtgaatcgtctggtgtgaagaagtggctggtgtaaagtg
tcgatgggacagtacaggcaaaataaagaaagcttctcattgacccaata
atcataaggacagggtccacgttcctgcctctttcagtacgacagtaact
atggggacaggtgacaagaggcagatgtcccctctgaccggagagagtct
ctcttgtagagtcttggcagcagaagcaggtgcccggaaaacgacacgaa
tttgagattgcggctgagttgaaacccaaggtgtgcgcatttgtctctgc
tccaaagagagtttccctttcatttggggaagtagtaatgctgtatagat
gaagtaggtgactctcgttgacaccatctcattgacaccgtcattattat
caggagagagccaaggtacaaaggctggggctgtgctgaatagctacagt
gtcttgttgtcagaatgatctaatgaggtatttttcactcactcggtgac
aatttcatatgtgtaacattacatcttgacatacaccccactccctgcct
cagtctcccggacatcccgcagatcctctcctgctcatgaccacttgtgg
tatttcccccatcgagtacaatttgaattgttctaaattgaacacctgtg
ttaacacccgtggtgttcattgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_81077479_81078637
seq2: B6Ng01-103M14.b_48_1201

seq1  GAATTCCTGGATCTCACAGGAAAGTTTCATGAAATAGATGTCCCACCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGATCTCACAGGAAAGTTTCATGAAATAGATGTCCCACCAGA  50

seq1  AGGACATGCATGGCCTCAGTCATATGCACTGAGGGCTGGGTTGGAGGGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACATGCATGGCCTCAGTCATATGCACTGAGGGCTGGGTTGGAGGGTG  100

seq1  CTGTAGTTTATAGATCCCTCATGTTTCCTTAAGAATCGTATGTTGAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGTTTATAGATCCCTCATGTTTCCTTAAGAATCGTATGTTGAAGAT  150

seq1  TTTGGTCCTTGGCTGTTCTGCACTGCCCAGAGAATGACCTACAGTAGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCCTTGGCTGTTCTGCACTGCCCAGAGAATGACCTACAGTAGCAC  200

seq1  ACGTCAAGTTGTGAATGAGGGTGTCTATTAAGAATGCAACAGGCCAAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCAAGTTGTGAATGAGGGTGTCTATTAAGAATGCAACAGGCCAAAGT  250

seq1  AAGGGCCTGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGATCACTGACTGCTCTTCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCCTGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGATCACTGACTGCTCTTCCAG  300

seq1  AGGTTCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGATGGCTCACAACCATCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGATGGCTCACAACCATCTG  350

seq1  TCATGGGATCTGATGCCCTCTTCTGGCGTGTCTAAAGAGAGCAACAGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGGATCTGATGCCCTCTTCTGGCGTGTCTAAAGAGAGCAACAGTGT  400

seq1  ACTCATAATAAGATAAATAAATCTTTAAAAAAAAACCCAAGAAAAAGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATAATAAGATAAATAAATCTTTAAAAAAAAACCCAAGAAAAAGTCA  450

seq1  AAGAGGAAGAGAGAGAGACAGAGATGTAGAGACAGAGAGACATCTTCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAAGAGAGAGAGACAGAGATGTAGAGACAGAGAGACATCTTCAGA  500

seq1  TCTACAACATCTTCAGATCTTTGAAGGCACTCAAGCATCCCACAGAAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACAACATCTTCAGATCTTTGAAGGCACTCAAGCATCCCACAGAAACT  550

seq1  GGGGAAGTTGAGGCAGTTCACTACGGTTCTCAGCTAAGCTCTCTCCATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGTTGAGGCAGTTCACTACGGTTCTCAGCTAAGCTCTCTCCATAC  600

seq1  ACGAGTTCCTTCTCCTTCTGCACTGTAGGCACTTTTAATATCGTGGGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGTTCCTTCTCCTTCTGCACTGTAGGCACTTTTAATATCGTGGGATC  650

seq1  AACAATGTTGGAACCAACCCTCTGTTGGAACTGACTTACCTTCTAGCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGTTGGAACCAACCCTCTGTTGGAACTGACTTACCTTCTAGCTGC  700

seq1  TTTCAAGGACACAGCTTTTATAGTTTTGGCCTGTTAGCCATTCTCTTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGGACACAGCTTTTATAG-TTTGGCCTGTTAGCCATTCTCTTCCC  749

seq1  TCGCTGTCGCAGAGTTAAGCAGCCAACCCTGAGACAAGGGCATTATTGGA  800
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTGTTGCAGAGTTAAGCAGCCAACCCTGAGACAAGGGCATTATTGGA  799

seq1  GGACACTTTGAGGCAAACATGCTTGGGTTTGAAATGAGATGAGGGACCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACTTTGAGGCAAACATGCTTGGGTTTGAAATGAGATGAGGGACCAC  849

seq1  CATGCATCCAGAACCAAATGAAAATTTA-CCAGTATAATGCACCCGTCCA  899
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CATGCATCCAGAACCAAATGAAAATTTACCCAGTATAATGCACCCGTCCA  899

seq1  TAGCATTACTGGGAGAAGGTAAAATGTTGAAGAGGT-GGGGCCTAGGGCT  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAGCATTACTGGGAGAAGGTAAAATGTTGAAGAGGTGGGGGCCTAGGGCT  949

seq1  GGAATATAGCTGTATGGAGAGAATGCCTCCCTAGCCCTAGCATGCAGGAA  998
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGAATATAGCTGTATGGAGAAAATGCCTCCCTAGCCCTAGCATGCA-GAA  998

seq1  GCCCTGGGTTGGATCATCAGCAC-AGCAAAAGAAGTGTGGTGGCCTTTCC  1047
      ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||
seq2  GCCCT-GGTTGGATCATCAGCACAAGCAAAAG-AGTGTGGT-GCCTTTCC  1045

seq1  CAGTGGTTTCAGCACTCAGAATATTGAAACAAGAGGATCAGAAGTTCAAG  1097
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CAGTGGTTTCAGCACTCAGAATA-TGAAACAAGAGGATCAGAAGTTC-AG  1093

seq1  GCAAGCTGTGGCTATAT--GAGATCCTGCTTTAAG-TATTAGACTAGAAT  1144
       |||||  | |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  CCAAGC--TTGCTATATTGGAGATCCTGCTTTAAGTTATTA-ACTAGAAT  1140

seq1  AGAAGAAAGAAAGCC  1159
       ||||||||||||||
seq2  -GAAGAAAGAAAGCC  1154

seq1: chr12_81244591_81245729
seq2: B6Ng01-103M14.g_72_1194 (reverse)

seq1  ACAATGAACACACACGTGCGT--ACACAGGTGTACAATTTAGGACATATT  48
      ||||||||||| |||| | ||  |||||||||| |||||||| ||| |||
seq2  ACAATGAACAC-CACGGGTGTTAACACAGGTGTTCAATTTAGAACA-ATT  48

seq1  CAAATTGTACTCGATGGGGGGGAAATAACCCACAAGTGGTCATGAAGCAG  98
      |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| 
seq2  CAAATTGTACTCGAT--GGGGGAAATA--CCACAAGTGGTCATG-AGCA-  92

seq1  GGAGAGGATCTGCCGGGGATGTTCCGGGGAGACTGAGGGCAGGGAGTGGG  148
      |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||
seq2  GGAGAGGATCTGC--GGGATGT--CCGGGAGACTGA-GGCAGGGAGTGGG  137

seq1  GTGGTTATGGTCAAGATGTATTGTTTACACATATGGAATTGTCACCGAGT  198
      |||  ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTG--TAT-GTCAAGATGTAATG-TTACACATATGAAATTGTCACCGAGT  183

seq1  GAGTGAAAAATACCTCATTAGATCATTCTGACAACAAGGCACTTGTAGCT  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
seq2  GAGTGAAAAATACCTCATTAGATCATTCTGACAACAAGACAC-TGTAGCT  232

seq1  ATTCAGCACAGCCCCAGCCTTTGTACCTTGGCTCTCTCCTGATAATAATG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGCACAGCCCCAGCCTTTGTACCTTGGCTCTCTCCTGATAATAATG  282

seq1  ACGGTGTCAATGAGATGGTGTCAACGAGAGTCACCTACTTCATCTATACA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTGTCAATGAGATGGTGTCAACGAGAGTCACCTACTTCATCTATACA  332

seq1  GCATTACTACTTCCCCAAATGAAAGGGAAACTCTCTTTGGAGCAGAGACA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTACTACTTCCCCAAATGAAAGGGAAACTCTCTTTGGAGCAGAGACA  382

seq1  AATGCGCACACCTTGGGTTTCAACTCAGCCGCAATCTCAAATTCGTGTCG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCGCACACCTTGGGTTTCAACTCAGCCGCAATCTCAAATTCGTGTCG  432

seq1  TTTTCCGGGCACCTGCTTCTGCTGCCAAGACTCTACAAGAGAGACTCTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCGGGCACCTGCTTCTGCTGCCAAGACTCTACAAGAGAGACTCTCT  482

seq1  CCGGTCAGAGGGGACATCTGCCTCTTGTCACCTGTCCCCATAGTTACTGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTCAGAGGGGACATCTGCCTCTTGTCACCTGTCCCCATAGTTACTGT  532

seq1  CGTACTGAAAGAGGCAGGAACGTGGACCCTGTCCTTATGATTATTGGGTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACTGAAAGAGGCAGGAACGTGGACCCTGTCCTTATGATTATTGGGTC  582

seq1  AATGAGAAGCTTTCTTTATTTTGCCTGTACTGTCCCATCGACACTTTACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGAAGCTTTCTTTATTTTGCCTGTACTGTCCCATCGACACTTTACA  632

seq1  CCAGCCACTTCTTCACACCAGACGATTCACACCAGCCCTGTATGGAAGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCACTTCTTCACACCAGACGATTCACACCAGCCCTGTATGGAAGGA  682

seq1  GGCACCAGTCTTTACAACATCTAGACCCATAGTCAGCTGTCACTCTCTTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCAGTCTTTACAACATCTAGACCCATAGTCAGCTGTCACTCTCTTC  732

seq1  TTGCTGCATGCCTTCTTAGGCTCCAACTAGGCCACACCTAAATTAAGCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGCATGCCTTCTTAGGCTCCAACTAGGCCACACCTAAATTAAGCCT  782

seq1  CAGCAAATTTAAAACTATAACTATCTTCTCCCCTGCTTGGATTTTCCAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAATTTAAAACTATAACTATCTTCTCCCCTGCTTGGATTTTCCAAC  832

seq1  CAGGGTGTATCTGTGTAGCTCTAACTGTCCTGGAACTCAATCTGTACACT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTGTATCTGTGTAGCTCTAACTGTCCTGGAACTCAATCTGTACACT  882

seq1  AGAGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCTGCTTACCTCTGCCTCCCAAGTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCTGCTTACCTCTGCCTCCCAAGTA  932

seq1  CTAGGCTTAAAAGTTTGTGCCACCACTACCCAGCTAACTAATGGATCTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTTAAAAGTTTGTGCCACCACTACCCAGCTAACTAATGGATCTTT  982

seq1  CTGTGGGTTTTGTTGTTGTTTGCTTGAGACAAGGACGCACTGTGTAGTTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGTTTTGTTGTTGTTTGCTTGAGACAAGGACGCACTGTGTAGTTT  1032

seq1  TTGCTTACCTGGAACCTCACTGTGTGGATCAGATCAGGCTGGCCTTGAAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTACCTGGAACCTCACTGTGTGGATCAGATCAGGCTGGCCTTGAAC  1082

seq1  CCAAAGATTTGCCTGTCTCTGACTAAAGAGTGCTGGAATTC  1139
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGATTTGCCTGTCTCTGACTAAAGAGTGCTGGAATTC  1123