BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-107C10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 96,981,699 - 97,129,205
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667688, Flrt2
Upstream geneLOC217786, LOC100039603
Downstream gene1700019M22Rik, LOC100039664
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-107C10.bB6Ng01-107C10.g
ACCDH914700DH914701
length1,151994
definitionDH914700|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107C10, 5' end.DH914701|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107C10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,981,699 - 96,982,853)(97,128,181 - 97,129,205)
sequence
gaattccaatgtgggttagtgcaaagaattttaggagtgtagctctagtt
tggcagcaggtgcttaaagccacaagtacttccagattcaggcccctatg
cctgagtgccctatcccggaactcttcctacagggtcagggctcctgacc
ccattcaggaagatagtttcaaggtattgttaaagaaagaaatattgttc
actttatagtcagtaagtgcataaagttgactgtcatactctagagagca
gagagctgtctctggaccagctaggagaacaaggaccttcttaagcgaat
cagaatctggccacgggtgtatggacggtgtgagaacagaatgtgattgg
cattggcttcttgttattgactggcccttatgtgtgaactacctttagca
ttgcagtcggatttatttatgttgcaggggatgtgggctcctgcgctcta
ttgctgcggagttcgaaaggctgtggaaggccctccaattaaattgctct
gttgtcttaacctccgtaagtactgctgaactaggtcttcttagatactt
acctcattacatcaacgggggagatgattaatgtttgcataagacttgag
acgcctgttcctcatagaatgtgcacataccaggttgtggaatattgact
cgagacgtgatactgatttctttgtttaaataattagtagagatatttca
tgaccaaaccattgaaaagtataactgagaaaaatgtagaggccaataaa
agatgcacaaaactatttttttaaaactctgtatgttcattttgaatatc
tgtaaagcagcagatattgggcacctaggctgggggacatagtgggtctg
aggatcttccattgacagtgtttggctgcctttcctcttcctgtctttca
gcatgtgacatacaccctccagagccacagagggtggacattcttctctg
gctcccaggcccttttctctgctcacacacaggcagcctgcctgagttca
gcagagaatcgctcactgtgcagtgtctggctcctgctgcagatgcacac
ctcacacaggtgctagtgctgctgaaagctgctttatgagcctgcagggc
ggtgtgcatgtctgccagccgcacttctgtgaaatgctcctgccctactg
g
gaattcagtcttcatatccttgctttgcaggcaagcacattaagtgtctt
gttgaagggtacgctgcaaccaataagtcacttaggaaattgatccaaga
aattctcatttccgatcctttgttccggtaccttagcaaaactgttttcc
aaagatagaaacatattgctctgaagctaaacagcaaattaaagacatgc
tgtctcatgtaatcttataaatatggtttaaaagccaccagtacccctga
gagagttgccatctggttcccatggtcaaaaaagaaatgagccaagcatg
ggaggaaaacagccttctacagtctgggtaaatttctacattgcttaggc
ttccaaaaatcaaatttctagaatgtctttgggaaggtgaagctaactct
tcctgagtcccttgtgaaaatgaccagatttgacccggagattataaagg
tgggatattccttagtaaaacatgattagcagatcaagttttataagtgt
tgagtgttgagagtttccttcttgtagtagcagatcttcagtatgtcagc
cagcactaagccttaattccatggccttgtaacatgcaaccccacatcaa
atcaagactgactcataatagatattacaatcatcacttcagtgtcttgg
gtctttcccactagagaaacccagctactatgctggaagaaactccagga
agagtggtggaatgggaccattaagaagtaagagttcttgtcaattagca
acactagcttcatcttgagttatcttgaccatgcatattgacgtttcagc
atcccttcagcaaactgctgccccatgtggatcctcagaaaataattttc
tgtcagatccctcctcacatagtgttactattttaaaacgctgatacaca
gaaagatgactagtacatttgctagcataggtatgaagatcccttctttc
tcctctcttcttgtagtattctcttaagagtgctcactgcaccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_96981699_96982853
seq2: B6Ng01-107C10.b_47_1197

seq1  GAATTCCAATGTGGGTTAGTGCAAAGAATTTTAGGAGTGTAGCTCTAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATGTGGGTTAGTGCAAAGAATTTTAGGAGTGTAGCTCTAGTT  50

seq1  TGGCAGCAGGTGCTTAAAGCCACAAGTACTTCCAGATTCAGGCCCCTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCAGGTGCTTAAAGCCACAAGTACTTCCAGATTCAGGCCCCTATG  100

seq1  CCTGAGTGCCCTATCCCGGAACTCTTCCTACAGGGTCAGGGCTCCTGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGTGCCCTATCCCGGAACTCTTCCTACAGGGTCAGGGCTCCTGACC  150

seq1  CCATTCAGGAAGATAGTTTCAAGGTATTGTTAAAGAAAGAAATATTGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCAGGAAGATAGTTTCAAGGTATTGTTAAAGAAAGAAATATTGTTC  200

seq1  ACTTTATAGTCAGTAAGTGCATAAAGTTGACTGTCATACTCTAGAGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTATAGTCAGTAAGTGCATAAAGTTGACTGTCATACTCTAGAGAGCA  250

seq1  GAGAGCTGTCTCTGGACCAGCTAGGAGAACAAGGACCTTCTTAAGCGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCTGTCTCTGGACCAGCTAGGAGAACAAGGACCTTCTTAAGCGAAT  300

seq1  CAGAATCTGGCCACGGGTGTATGGACGGTGTGAGAACAGAATGTGATTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATCTGGCCACGGGTGTATGGACGGTGTGAGAACAGAATGTGATTGG  350

seq1  CATTGGCTTCTTGTTATTGACTGGCCCTTATGTGTGAACTACCTTTAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGCTTCTTGTTATTGACTGGCCCTTATGTGTGAACTACCTTTAGCA  400

seq1  TTGCAGTCGGATTTATTTATGTTGCAGGGGATGTGGGCTCCTGCGCTCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGTCGGATTTATTTATGTTGCAGGGGATGTGGGCTCCTGCGCTCTA  450

seq1  TTGCTGCGGAGTTCGAAAGGCTGTGGAAGGCCCTCCAATTAAATTGCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGCGGAGTTCGAAAGGCTGTGGAAGGCCCTCCAATTAAATTGCTCT  500

seq1  GTTGTCTTAACCTCCGTAAGTACTGCTGAACTAGGTCTTCTTAGATACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCTTAACCTCCGTAAGTACTGCTGAACTAGGTCTTCTTAGATACTT  550

seq1  ACCTCATTACATCAACGGGGGAGATGATTAATGTTTGCATAAGACTTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATTACATCAACGGGGGAGATGATTAATGTTTGCATAAGACTTGAG  600

seq1  ACGCCTGTTCCTCATAGAATGTGCACATACCAGGTTGTGGAATATTGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTGTTCCTCATAGAATGTGCACATACCAGGTTGTGGAATATTGACT  650

seq1  CGAGACGTGATACTGATTTCTTTGTTTAAATAATTAGTAGAGATATTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGACGTGATACTGATTTCTTTGTTTAAATAATTAGTAGAGATATTTCA  700

seq1  TGACCAAACCATTGAAAAGTATAACTGAGAAAAATGTAGAGGCCAATAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAACCATTGAAAAGTATAACTGAGAAAAATGTAGAGGCCAATAAA  750

seq1  AGATGCACAAAACTATTTTTTTAAAACTCTGTATGTTCATTTTGAATATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCACAAAACTATTTTTTTAAAACTCTGTATGTTCATTTTGAATATC  800

seq1  TGTAAAGCAGCAGATATTGGGCACCTAGGCTGGGGGACATAGTGGGTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGCAGCAGATATTGGGCACCTAGGCTGGGGGACATAGTGGGTCTG  850

seq1  AGGATCTTCCATTGACAGTGTTTGGCTGCCTTTCCTCTTCCTGTCTTTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTTCCATTGACAGTGTTTGGCTGCCTTTCCTCTTCCTGTCTTTCA  900

seq1  GCATGTGACAATACACCCTCCAGAGCCACAGAGGGTGGACATTCTTCTCT  950
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGAC-ATACACCCTCCAGAGCCACAGAGGGTGGACATTCTTCTCT  949

seq1  GGCTCCCAGGCCCTTTTCTCTGCTCACACACAGGCAGGCCTGCCTGAGTT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGCTCCCAGGCCCTTTTCTCTGCTCACACACAGGCA-GCCTGCCTGAGTT  998

seq1  CAGCAGAGAATCGCTCACTGTGCAGTGTCTGGCTCCTGCTGCAGATGCAC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAGAATCGCTCACTGTGCAGTGTCTGGCTCCTGCTGCAGATGCAC  1048

seq1  A-CTCACACAGGGTGCTAAGTGCTGCTGAAAGCTGCTTTATGAGCCTTGC  1099
      | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACCTCACACA-GGTGCT-AGTGCTGCTGAAAGCTGCTTTATGAGCC-TGC  1095

seq1  AGAGCCGGTGTGCATGTCTG-CAGCTGCACTTCTGTGAGAATGCTCCTG-  1147
      || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| 
seq2  AG-GGCGGTGTGCATGTCTGCCAGCCGCACTTCTGTGA-AATGCTCCTGC  1143

seq1  CCTACTGG  1155
      ||||||||
seq2  CCTACTGG  1151

seq1: chr12_97128181_97129205
seq2: B6Ng01-107C10.g_68_1061 (reverse)

seq1  GGGTGCAGTGAGCACTCTGTAAAGAGAATACCTAACAGAGAGAGAGAGAG  50
      |||||||||||||||||  | ||||||||| |||  |||           
seq2  GGGTGCAGTGAGCACTC--TTAAGAGAATA-CTACAAGA-----------  36

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATTCTCTCATACTTAATGGCTAAGCAAAT  100
      |||||| |||| ||| || ||  ||| |||||| ||   ||| |||||||
seq2  AGAGAG-GAGAAAGA-AGGGA--TCT-TCATACCTA--TGCT-AGCAAAT  78

seq1  GGTAACTATGTCATCTTTTCCTTGTGTATCAGCGTTTTTAAAATAGTAAC  150
      |   |||| |||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  G--TACTA-GTCATCTTT---CTGTGTATCAGCG-TTTTAAAATAGTAAC  121

seq1  ACTATGTGAGGAGGGATCTGACAGAAAATTTATTTTCTGAGGATCCACAT  200
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGTGAGGAGGGATCTGACAGAAAA-TTATTTTCTGAGGATCCACAT  170

seq1  GGGGCAGCAGTTTGCTGAAGGGATGCCTGAAACGTCAATATGCATGGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGCAGTTTGCTGAAGGGATG-CTGAAACGTCAATATGCATGGTCA  219

seq1  AGATAACTCAAGATGAAGCTAGTGTTGCTAATTGACAAGAACTCTTACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAACTCAAGATGAAGCTAGTGTTGCTAATTGACAAGAACTCTTACTT  269

seq1  CTTAATGGTCCCATTCCACCACTCTTCCTGGAGTTTCTTCCAGCATAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATGGTCCCATTCCACCACTCTTCCTGGAGTTTCTTCCAGCATAGTA  319

seq1  GCTGGGTTTCTCTAGTGGGAAAGACCCAAGACACTGAAGTGATGATTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTTTCTCTAGTGGGAAAGACCCAAGACACTGAAGTGATGATTGTA  369

seq1  ATATCTATTATGAGTCAGTCTTGATTTGATGTGGGGTTGCATGTTACAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTATTATGAGTCAGTCTTGATTTGATGTGGGGTTGCATGTTACAAG  419

seq1  GCCATGGAATTAAGGCTTAGTGCTGGCTGACATACTGAAGATCTGCTACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGAATTAAGGCTTAGTGCTGGCTGACATACTGAAGATCTGCTACT  469

seq1  ACAAGAAGGAAACTCTCAACACTCAACACTTATAAAACTTGATCTGCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAAGGAAACTCTCAACACTCAACACTTATAAAACTTGATCTGCTAA  519

seq1  TCATGTTTTACTAAGGAATATCCCACCTTTATAATCTCCGGGTCAAATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTTTTACTAAGGAATATCCCACCTTTATAATCTCCGGGTCAAATCT  569

seq1  GGTCATTTTCACAAGGGACTCAGGAAGAGTTAGCTTCACCTTCCCAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATTTTCACAAGGGACTCAGGAAGAGTTAGCTTCACCTTCCCAAAGA  619

seq1  CATTCTAGAAATTTGATTTTTGGAAGCCTAAGCAATGTAGAAATTTACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTAGAAATTTGATTTTTGGAAGCCTAAGCAATGTAGAAATTTACCC  669

seq1  AGACTGTAGAAGGCTGTTTTCCTCCCATGCTTGGCTCATTTCTTTTTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGTAGAAGGCTGTTTTCCTCCCATGCTTGGCTCATTTCTTTTTTGA  719

seq1  CCATGGGAACCAGATGGCAACTCTCTCAGGGGTACTGGTGGCTTTTAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGGAACCAGATGGCAACTCTCTCAGGGGTACTGGTGGCTTTTAAAC  769

seq1  CATATTTATAAGATTACATGAGACAGCATGTCTTTAATTTGCTGTTTAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTTATAAGATTACATGAGACAGCATGTCTTTAATTTGCTGTTTAGC  819

seq1  TTCAGAGCAATATGTTTCTATCTTTGGAAAACAGTTTTGCTAAGGTACCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGCAATATGTTTCTATCTTTGGAAAACAGTTTTGCTAAGGTACCG  869

seq1  GAACAAAGGATCGGAAATGAGAATTTCTTGGATCAATTTCCTAAGTGACT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAAGGATCGGAAATGAGAATTTCTTGGATCAATTTCCTAAGTGACT  919

seq1  TATTGGTTGCAGCGTACCCTTCAACAAGACACTTAATGTGCTTGCCTGCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGTTGCAGCGTACCCTTCAACAAGACACTTAATGTGCTTGCCTGCA  969

seq1  AAGCAAGGATATGAAGACTGAATTC  1025
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGGATATGAAGACTGAATTC  994