BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-110H06
Chromosome12 (Build37)
Map Location 69,610,990 - 69,758,499
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040745, LOC100040681
Downstream geneLOC100040696, LOC665967, LOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2, Klhdc1, Klhdc2, Sdccag1, Arf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71, Sos2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-110H06.bB6Ng01-110H06.g
ACCDH917071DH917072
length7991,130
definitionDH917071|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110H06, 5' end.DH917072|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110H06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,757,701 - 69,758,499)(69,610,990 - 69,612,143)
sequence
gaattctcattctggatatcacagactgacaagaggacaggaagctacat
ctgtgttgtcaccttctgggtcagcctttcctggagatgtccccctcagt
ataccttaacacctgagataagaagatggctgtatatcttaattttattc
agtcatccccacccttccttttcttactccttccactcccacaaccacca
agggtgtggctttaccaacaaatgtccctgggactagattacagcagtct
gcctcccagaagctagttgggagcccttactcatagtttccttttaattc
agttgatgatgcccgtaaaaactcttaatgtgttaaaatgactaagggat
gatgaataagtgaatcttctacctgtatccaccaggcagccacttacctg
ctatatggtttcagaatcttggtctttatctaaagaatgacatggatgtt
tctgactctaacctagacttctttagttgctggtaccaatctacagccaa
ccagtctggatccagacctatcttgattctgtgtacagatccaaggcaaa
tcatttggcaaactctggaccttgcaaatagcaaatagagaatgttaagg
cagtttctatatttcctgatgaaaaagctaattttcaatatggggcagtg
aaaggaatgtactaagctctctatttaaaaactgtgcggcactaagtatg
ttaagggatctctctgaactttggagttcttgtttataaaaatagaaaaa
atgcctcataggcctgtggttttatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcccagacaaaggaaggtgtatgggacaaaacctaaaagtgtaaaa
gaaaaaaaaatacattgaaaaatatatggccgatctatacaggacacaga
catcttacttagtgatggtcccttaacaactaagttatttaaaaatattt
gtccttgatccttctccctggaagatgatggggtcattcacatgcttatg
tgcacagatactattgtcacttgtggttttgacagcatcaaaaaacatag
ggaaaccagcagtctcaactaagctggacccctgggagctctcatagact
gagcatacactggatgatcaacagcccctgacacatatatagcagagggc
tgcctggtgtggcctcagagggagaagatatactaatccttgagagactt
gaggccccaaggaaggcccctgttctgggggaagcacattctcagagaca
agggggaagaagggtagggggcaatggctagagtgtaaataataataaat
aaaagccaacattttcccaatgaaagctacacagaacactgtgctataca
gtatcagtcaatggccattacttatgccattatgtcatagttcccagtta
gtgatttttttcttgaataatctttaggctaagtacactctacaaaatac
atgtatgttgctatggcctttctttcttcagtcactgctatatgttgaca
attagcatccatcatggatgtcaagagataataccactggacctgcagct
aaaatgattcaataaaggtctcagtcccaggttctggaatttcaatgtct
ttactatataatggcatggcatgtttttgagaaaaaaaaaaaacaatggt
gtaaatattaaagcacagaggctgtagccatttgctttagagaaaattac
caaggaaaccatgagatcactagatcacgtgaatcacttgactgactaag
gaccagaaataaagactaagtagactactttcaacacccaaggagtgggt
taagagatctgaggaagtgtagattaggatcagatcagtgacttcacctg
atttattggcaattaactctgaactcattgtggcttaatcacaatcttgg
gtgatcaccagcatggaagtttaaaagtca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_69757701_69758499
seq2: B6Ng01-110H06.b_42_840 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACATATATAAAACCACAGGCCTATGAGGCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACATATATAAAACCACAGGCCTATGAGGCATT  50

seq1  TTTTCTATTTTTATAAACAAGAACTCCAAAGTTCAGAGAGATCCCTTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTATTTTTATAAACAAGAACTCCAAAGTTCAGAGAGATCCCTTAAC  100

seq1  ATACTTAGTGCCGCACAGTTTTTAAATAGAGAGCTTAGTACATTCCTTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTAGTGCCGCACAGTTTTTAAATAGAGAGCTTAGTACATTCCTTTC  150

seq1  ACTGCCCCATATTGAAAATTAGCTTTTTCATCAGGAAATATAGAAACTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCCATATTGAAAATTAGCTTTTTCATCAGGAAATATAGAAACTGC  200

seq1  CTTAACATTCTCTATTTGCTATTTGCAAGGTCCAGAGTTTGCCAAATGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACATTCTCTATTTGCTATTTGCAAGGTCCAGAGTTTGCCAAATGAT  250

seq1  TTGCCTTGGATCTGTACACAGAATCAAGATAGGTCTGGATCCAGACTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTGGATCTGTACACAGAATCAAGATAGGTCTGGATCCAGACTGGT  300

seq1  TGGCTGTAGATTGGTACCAGCAACTAAAGAAGTCTAGGTTAGAGTCAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTAGATTGGTACCAGCAACTAAAGAAGTCTAGGTTAGAGTCAGAA  350

seq1  ACATCCATGTCATTCTTTAGATAAAGACCAAGATTCTGAAACCATATAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCATGTCATTCTTTAGATAAAGACCAAGATTCTGAAACCATATAGC  400

seq1  AGGTAAGTGGCTGCCTGGTGGATACAGGTAGAAGATTCACTTATTCATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGTGGCTGCCTGGTGGATACAGGTAGAAGATTCACTTATTCATCA  450

seq1  TCCCTTAGTCATTTTAACACATTAAGAGTTTTTACGGGCATCATCAACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTAGTCATTTTAACACATTAAGAGTTTTTACGGGCATCATCAACTG  500

seq1  AATTAAAAGGAAACTATGAGTAAGGGCTCCCAACTAGCTTCTGGGAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAAGGAAACTATGAGTAAGGGCTCCCAACTAGCTTCTGGGAGGCA  550

seq1  GACTGCTGTAATCTAGTCCCAGGGACATTTGTTGGTAAAGCCACACCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTGTAATCTAGTCCCAGGGACATTTGTTGGTAAAGCCACACCCTT  600

seq1  GGTGGTTGTGGGAGTGGAAGGAGTAAGAAAAGGAAGGGTGGGGATGACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTTGTGGGAGTGGAAGGAGTAAGAAAAGGAAGGGTGGGGATGACTG  650

seq1  AATAAAATTAAGATATACAGCCATCTTCTTATCTCAGGTGTTAAGGTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATTAAGATATACAGCCATCTTCTTATCTCAGGTGTTAAGGTATA  700

seq1  CTGAGGGGGACATCTCCAGGAAAGGCTGACCCAGAAGGTGACAACACAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGGGGACATCTCCAGGAAAGGCTGACCCAGAAGGTGACAACACAGA  750

seq1  TGTAGCTTCCTGTCCTCTTGTCAGTCTGTGATATCCAGAATGAGAATTC  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTCCTGTCCTCTTGTCAGTCTGTGATATCCAGAATGAGAATTC  799

seq1: chr12_69610990_69612143
seq2: B6Ng01-110H06.g_69_1198

seq1  GAATTCCCAGACAAAGGAAGGTGTATGGGACAAAACCTAAAAGTGTAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGACAAAGGAAGGTGTATGGGACAAAACCTAAAAGTGTAAAA  50

seq1  GAAAAAAAAATACATTGAAAAATATATGGCCGATCTATACAGGACACAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAAAATACATTGAAAAATATATGGCCGATCTATACAGGACACAGA  100

seq1  CATCTTACTTAGTGATGGTCCCTTAACAACTAAGTTATTTAAAAATATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTACTTAGTGATGGTCCCTTAACAACTAAGTTATTTAAAAATATTT  150

seq1  GTCCTTGATCCTTCTCCCTGGAAGATGATGGGGTCATTCACATGCTTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGATCCTTCTCCCTGGAAGATGATGGGGTCATTCACATGCTTATG  200

seq1  TGCACAGATACTATTGTCACTTGTGGTTTTGACAGCATCAAAAAACATAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGATACTATTGTCACTTGTGGTTTTGACAGCATCAAAAAACATAG  250

seq1  GGAAACCAGCAGTCTCAACTAAGCTGGACCCCTGGGAGCTCTCATAGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACCAGCAGTCTCAACTAAGCTGGACCCCTGGGAGCTCTCATAGACT  300

seq1  GAGCATACACTGGATGATCAACAGCCCCTGACACATATATAGCAGAGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATACACTGGATGATCAACAGCCCCTGACACATATATAGCAGAGGGC  350

seq1  TGCCTGGTGTGGCCTCAGAGGGAGAAGATATACTAATCCTTGAGAGACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGTGTGGCCTCAGAGGGAGAAGATATACTAATCCTTGAGAGACTT  400

seq1  GAGGCCCCAAGGAAGGCCCCTGTTCTGGGGGAAGCACATTCTCAGAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCCCAAGGAAGGCCCCTGTTCTGGGGGAAGCACATTCTCAGAGACA  450

seq1  AGGGGGAAGAAGGGTAGGGGGCAATGGCTAGAGTGTAAATAATAATAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGAAGAAGGGTAGGGGGCAATGGCTAGAGTGTAAATAATAATAAAT  500

seq1  AAAAGCCAACATTTTCCCAATGAAAGCTACACAGAACACTGTGCTATACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCAACATTTTCCCAATGAAAGCTACACAGAACACTGTGCTATACA  550

seq1  GTATCAGTCAATGGCCATTACTTATGCCATTATGTCATAGTTCCCAGTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAGTCAATGGCCATTACTTATGCCATTATGTCATAGTTCCCAGTTA  600

seq1  GTGATTTTTTTCTTGAATAATCTTTAGGCTAAGTACACTCTACAAAATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTTTTTCTTGAATAATCTTTAGGCTAAGTACACTCTACAAAATAC  650

seq1  ATGTATGTTGCTATGGCCTTTCTTTCTTCAGTCACTGCTATATGTTGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTTGCTATGGCCTTTCTTTCTTCAGTCACTGCTATATGTTGACA  700

seq1  ATTAGCATCCATCATGGATGTCAAGAGATAATACCACTGGACCTGCAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCATCCATCATGGATGTCAAGAGATAATACCACTGGACCTGCAGCT  750

seq1  AAAATGATTCAAT-AAGGTCTCAGGTCCCAGGTTCTGGAATTTCAATGTC  799
      ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGATTCAATAAAGGTCTCA-GTCCCAGGTTCTGGAATTTCAATGTC  799

seq1  TTTACTATATAATGGCATGGCATGTTTTTGAGAAAAAAAAAAAAACAATG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTACTATATAATGGCATGGCATGTTTTTGAG-AAAAAAAAAAAACAATG  848

seq1  GTGTAAATATTAAAGCACAGAGGCTGTAGCCATTTGCTTTAGAGAAAATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAAATATTAAAGCACAGAGGCTGTAGCCATTTGCTTTAGAGAAAATT  898

seq1  ACCAAGGAAACCATGAGAATCACTAGATCACGTGAATCACTTGACTGACT  949
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGAAACCATGAG-ATCACTAGATCACGTGAATCACTTGACTGACT  947

seq1  AAGGGACCAGAAATAAAAGACTAAGTAGACTAACTTTCAAACAACCCCAA  999
      || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||
seq2  AA-GGACCAGAAAT-AAAGACTAAGTAGACT-ACTTTC-AACA--CCCAA  991

seq1  GGAGTGGGTTAAAGAGAATCTGAAGGAAGTGTAGGATTAGGATCAGATTC  1049
      |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  
seq2  GGAGTGGGTT-AAGAG-ATCTG-AGGAAGTGTA-GATTAGGATCAGAT--  1035

seq1  CAGTGACTTCAACCTGATTTATTTGCCACAAATTTAACTCTAGACTCCAT  1099
      |||||||||| |||||||||||| ||     | ||||||||  ||| |||
seq2  CAGTGACTTC-ACCTGATTTATTGGC-----AATTAACTCTGAACT-CAT  1078

seq1  TGTGGCTGAATCACAATCTTGGGTGAATCACCAGCATGGAGGTTTTAAAA  1149
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||
seq2  TGTGGCTTAATCACAATCTTGGGTG-ATCACCAGCATGGAAGTTT--AAA  1125

seq1  AGTCA  1154
      |||||
seq2  AGTCA  1130