BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118A05
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,788,844 - 22,905,731
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668662
Upstream gene6030426L16Rik, LOC434693, EG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660
Downstream geneLOC668664, 2410018L13Rik, LOC77114, EG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118A05.bB6Ng01-118A05.g
ACCDH922605DH922606
length1,1191,094
definitionDH922605|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118A05, 5' end.DH922606|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118A05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,904,602 - 22,905,731)(22,788,844 - 22,789,955)
sequence
gaattctaagcattaggtgctaggtcctgttaaggaagatgagacatgca
ctcagtattacctgctatcgcccctgtcttcttcacttcttttccaggct
gttaacgttctaagtacatattttatttacttatctagatgactaggaga
tatttaaagttccttgtccaacacagacatatggcagcttgatattgcct
ttcaaagcacacatttacttatctaaacacgttctcccctgtagaaacaa
ccaactcaattgtccacagcatcttgatcagaaataaccatcaactgagc
tagcctggtgccacacatctgtaactccagaaccagagggtgggggcagg
attatcttggagttcaaggtcatctaagactatatagcaattcaggacta
gcctgggctacactagaccctgtctccaaaaaaattatattaaaagaaag
agaacaagcaggcaagtagtggtgcatgcctttaactctaacactcattg
acagaagcagacagataggaattcaaggaaggctagcctgggctacagag
caagttctaggatagtcaggactacacaaagaccccctcccctctctctc
acacacacacacacaaacacacacacacacatggggtggagaagggagag
agagagagatctaccaatggaagaagatcttgcacaagggcacgtgatgg
caggtgccatctttgagaaaaggtcagatggctttgtctgtggaggcctc
ctctggaagaacttacagaaaatggtaaagttgagtgaagaagggaattg
gctggatggtcagggaccttggaggcccttttgtcgtgttttcctttgta
attttatttgtttatttgttttctgagatagggtctcatgtagctcagct
ggcttcaaacttactatgtagctgaggacgacctgtacccttaccttcct
gcctcccctgtctagcagtcacagctgtgatccaccgggctggatcattt
acagttttagatattgaaatgtggaagcagagcagcagatttctgagttc
aagccagcctggtctacaaatgagttcaggacagccaggctacacaaaga
aacctgtctggaccgcccc
gaattcatcaggtagactgaagtggaagttagccctagtggatgaaagat
tggatggcttctgttaagcacagaagaccatgtggtaatctgggttcaag
gaattttttttttttttggtttttgttttctcgagacagagtctcactat
gtagccctggcttacctggaactcactatggagatcaggctggcctcaaa
ctcacagagatctacctgctcctgcctctcaagtgctaggattcaaggca
tgtaccactatgcctggatttcaatatgttctttcattcccaatcaggga
gatactttgaaaatgcaaatcttcttgaagtggtttggtgactttccatg
agcagacaataggagtttgatcctgtgacctaaatcatgggaagatacaa
caaccaattcctgcatgttgccctctgacctcatgctagggctaatgcac
actcccttatatgtatgctccagtccccgcccccaacactaattgtgtaa
tgataaataaagcaggaactggggctggagagatggctcagcgattaagg
gcactgactgctcttccaggggtcctgagttcaatttccagcaaccacat
ggtggctcacaaccacctgtaatggggtctgatgccctcttctagtgtgt
ctgaagacagctacattgtactcatatacatacaataaatagacacacct
ttaaaaagaaataaagcaggaactgaatgaggaaatgcctgagtcaatag
actatggttcaatctctgggtacaagcaaggttggaggagaagtgaggca
gcacagtcaggcattctgggccatgaaaggatctcttagagcatattgaa
gaatttagggtttattcatagactttaggaagaccctgggaagatactga
gccacttaaactacatttgcttttagagatcactatgggaagagtctggc
acccagtaagagggtgattggaaagtgattacccaagatgggagattatt
ataaatacactttctgaatgaggaagacctaatggataagccattggaaa
tgaggcccaggaccactgtgccctggatactaaaggtgaatatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_22904602_22905731
seq2: B6Ng01-118A05.b_43_1161 (reverse)

seq1  GGGGCGGTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAAC  50
      ||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||
seq2  GGGGCGG-TCCAGACA-GGTTTCTTTGTGTAG-CCTGGCTGTCCT-GAAC  46

seq1  TCATTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTG  100
      ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  TCA-TTTGTAGACCAGGCTGG-CTTGAACTCAGAAATCTG-CTG-CTCTG  92

seq1  CCTCCACATTTCAATATCTTAAAACTGTAAATGATCCAAGCCCGGTGGAT  150
      | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTTCCACATTTCAATATC-TAAAACTGTAAATGATCC-AGCCCGGTGGAT  140

seq1  CACAGCTGTGACTGCTAGACAGGGGAGGCAGGAAGGTAAGGGTACAGGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGTGACTGCTAGACAGGGGAGGCAGGAAGGTAAGGGTACAGGTC  190

seq1  GTCCTCAGCTACATAGTAAGTTTGAAGCCAGCCTGAGCTACATGAGACCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCAGCTACATAGTAAGTTTGAAGCCAG-CTGAGCTACATGAGACCC  239

seq1  TATCTCAGAAAACAAATAAACAAATAAAATTACAAAGGAAAACACGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCAGAAAACAAATAAACAAATAAAATTACAAAGGAAAACACGACAA  289

seq1  AAGGGCCTCCAAGGTCCCTGACCATCCAGCCAATTCCCTTCTTCACTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCCTCCAAGGTCCCTGACCATCCAGCCAATTCCCTTCTTCACTCAA  339

seq1  CTTTACCATTTTCTGTAAGTTCTTCCAGAGGAGGCCTCCACAGACAAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACCATTTTCTGTAAGTTCTTCCAGAGGAGGCCTCCACAGACAAAGC  389

seq1  CATCTGACCTTTTCTCAAAGATGGCACCTGCCATCACGTGCCCTTGTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGACCTTTTCTCAAAGATGGCACCTGCCATCACGTGCCCTTGTGCA  439

seq1  AGATCTTCTTCCATTGGTAGATCTCTCTCTCTCTCCCTTCTCCACCCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTCTTCCATTGGTAGATCTCTCTCTCTCTCCCTTCTCCACCCCAT  489

seq1  GTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGGGGAGGGGGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGGGGAGGGGGTC  539

seq1  TTTGTGTAGTCCTGACTATCCTAGAACTTGCTCTGTAGCCCAGGCTAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGTAGTCCTGACTATCCTAGAACTTGCTCTGTAGCCCAGGCTAGCC  589

seq1  TTCCTTGAATTCCTATCTGTCTGCTTCTGTCAATGAGTGTTAGAGTTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTGAATTCCTATCTGTCTGCTTCTGTCAATGAGTGTTAGAGTTAAA  639

seq1  GGCATGCACCACTACTTGCCTGCTTGTTCTCTTTCTTTTAATATAATTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGCACCACTACTTGCCTGCTTGTTCTCTTTCTTTTAATATAATTTT  689

seq1  TTTGGAGACAGGGTCTAGTGTAGCCCAGGCTAGTCCTGAATTGCTATATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGACAGGGTCTAGTGTAGCCCAGGCTAGTCCTGAATTGCTATATA  739

seq1  GTCTTAGATGACCTTGAACTCCAAGATAATCCTGCCCCCACCCTCTGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAGATGACCTTGAACTCCAAGATAATCCTGCCCCCACCCTCTGGTT  789

seq1  CTGGAGTTACAGATGTGTGGCACCAGGCTAGCTCAGTTGATGGTTATTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTTACAGATGTGTGGCACCAGGCTAGCTCAGTTGATGGTTATTTC  839

seq1  TGATCAAGATGCTGTGGACAATTGAGTTGGTTGTTTCTACAGGGGAGAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCAAGATGCTGTGGACAATTGAGTTGGTTGTTTCTACAGGGGAGAAC  889

seq1  GTGTTTAGATAAGTAAATGTGTGCTTTGAAAGGCAATATCAAGCTGCCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTAGATAAGTAAATGTGTGCTTTGAAAGGCAATATCAAGCTGCCAT  939

seq1  ATGTCTGTGTTGGACAAGGAACTTTAAATATCTCCTAGTCATCTAGATAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGTGTTGGACAAGGAACTTTAAATATCTCCTAGTCATCTAGATAA  989

seq1  GTAAATAAAATATGTACTTAGAACGTTAACAGCCTGGAAAAGAAGTGAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATAAAATATGTACTTAGAACGTTAACAGCCTGGAAAAGAAGTGAAG  1039

seq1  AAGACAGGGGCGATAGCAGGTAATACTGAGTGCATGTCTCATCTTCCTTA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGGGGCGATAGCAGGTAATACTGAGTGCATGTCTCATCTTCCTTA  1089

seq1  ACAGGACCTAGCACCTAATGCTTAGAATTC  1130
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACCTAGCACCTAATGCTTAGAATTC  1119

seq1: chr12_22788844_22789955
seq2: B6Ng01-118A05.g_69_1162

seq1  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTTAGCCCTAGTGGATGAAAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTTAGCCCTAGTGGATGAAAGAT  50

seq1  TGGATGGCTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGGCTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100

seq1  GAATTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTAT  150

seq1  GTAGCCCTGGCTTACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCCTGGCTTACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAA  200

seq1  CTCACAGAGATCTACCTGCTCCTGCCTCTCAAGTGCTAGGATTCAAGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGAGATCTACCTGCTCCTGCCTCTCAAGTGCTAGGATTCAAGGCA  250

seq1  TGTACCACTATGCCTGGATTTCAATATGTTCTTTCATTCCCAATCAGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCACTATGCCTGGATTTCAATATGTTCTTTCATTCCCAATCAGGGA  300

seq1  GATACTTTGAAAATGCAAATCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTTTGAAAATGCAAATCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATG  350

seq1  AGCAGACAATAGGAGTTTGATCCTGTGACCTAAATCATGGGAAGATACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACAATAGGAGTTTGATCCTGTGACCTAAATCATGGGAAGATACAA  400

seq1  CAACCAATTCCTGCATGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCTAATGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAATTCCTGCATGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCTAATGCAC  450

seq1  ACTCCCTTATATGTATGCTCCAGTCCCCGCCCCCAACACTAATTGTGTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCTTATATGTATGCTCCAGTCCCCGCCCCCAACACTAATTGTGTAA  500

seq1  TGATAAATAAAGCAGGAACTGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGATTAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAATAAAGCAGGAACTGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGATTAAGG  550

seq1  GCACTGACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACAT  600

seq1  GGTGGCTCACAACCACCTGTAATGGGGTCTGATGCCCTCTTCTAGTGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTCACAACCACCTGTAATGGGGTCTGATGCCCTCTTCTAGTGTGT  650

seq1  CTGAAGACAGCTACATTGTACTCATATACATACAATAAATAGACACACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGACAGCTACATTGTACTCATATACATACAATAAATAGACACACCT  700

seq1  TTAAAAAGAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAG  750

seq1  ACTATGGTTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGTTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCA  800

seq1  GCACAGTCAGGCATTCTGGGCCATG-AAGGATCTCTTAGAGCATATTGAA  849
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTCAGGCATTCTGGGCCATGAAAGGATCTCTTAGAGCATATTGAA  850

seq1  GAATTTAGGGTTTATTCATAGACTTTAGGAAGACCCT-GGAAGATACTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAATTTAGGGTTTATTCATAGACTTTAGGAAGACCCTGGGAAGATACTGA  900

seq1  GCCACTTAAAACTACATTTGCTTTTTAGAAGGATCACTATGGGAAAGAGT  948
      ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||
seq2  GCCACTT-AAACTACATTTGC-TTTTAGA--GATCACTATGGG-AAGAGT  945

seq1  CTGGCACCCAGTAAAGAGGGTGATTGGAAAGTTGATTAACCCAGAGATGG  998
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
seq2  CTGGCACCCAGT-AAGAGGGTGATTGGAAAG-TGATT-ACCCA-AGATGG  991

seq1  GAAGATTTATTATAAAATAACACTTTCTG-ATGAGGAGAGACCTAAATGG  1047
      | ||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||| |||||
seq2  G-AGA-TTATTATAAA--TACACTTTCTGAATGAGGA-AGACCT-AATGG  1035

seq1  ATAAGGGCACAGTGGGAAATGAGGGCTCAGGACCACAGTGCCCGTGGATA  1097
      |||||    |  | |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||
seq2  ATAAG----CCATTGGAAATGA-GGCCCAGGACCACTGTGCCC-TGGATA  1079

seq1  CTAAAGTGAAATATC  1112
      ||||||   ||||||
seq2  CTAAAGGTGAATATC  1094