BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124C02
Chromosome12 (Build37)
Map Location 72,455,901 - 72,613,691
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041190
Upstream geneTxndc1, LOC100040965, LOC100041061, Frmd6, Actr10, Psma3, 3110056K07Rik, Arid4a, Timm9, LOC100041035, 2700049A03Rik, LOC666162, Dact1
Downstream geneDaam1, LOC666213, LOC666220, Gpr135, LOC100041239, 2810055F11Rik, 1200003C05Rik, 4930403N07Rik, Rtn1, Lrrc9
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124C02.bB6Ng01-124C02.g
ACCDH927117DH927118
length927930
definitionDH927117|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124C02, 5' end.DH927118|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124C02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,455,901 - 72,456,825)(72,612,757 - 72,613,691)
sequence
gaattctcttgctgccattcgatgtcccagcggtgagcccactgagtgct
ttgtcacatgctccctagctgctactcagttcggtgatttttacatctgt
ggtcacactcgttgggcagctaatcccaagatgtttcacggtggatgctg
attttaggtccccaggggatatggaaaacaaaataacattgtttctcttt
ttcagtggcttgccctccttccttagaaactgttttggtaccttcccagg
gctatcaagtgtcagcatttagaggcaaacatgatttgtttaataaatag
gacttcgcagagcttcaggtggccttggcaggctacggtgctgaccaagg
ttttaattactcagtggccagtaaaccctgctgagtcttacatgctgtca
cagggtcagtggaaaaccaaggtcaccagagtaaagtgcttagctgtcat
tggggttttgtctaatcaataaccaaagcaaacagtttacacacatgcaa
tcaaagtacaaccggcagacatttctcaagcatttagcattggacatcat
gctagcctctggggacagagagttacacaaaatatgactctcacctttaa
aagatcatagtctttctggaggtgtggaaactatgagcagagagatagta
atgccagggacagcatcagaatttgtagaactctgtcttatctgggtgca
ggtaggagtttatttctaaaactgtgggttcaaaaggaaatgtttggatt
cttgagagcacacaaggggcctgttgtgggtaaactatgatgtatcggtg
tgggtgaaaacctcagaggtaggagaggagttttggtattctggacagtg
aagggatgctttccttggagcagcttgggtattacaggggaggagactga
tgtaataggtgttttgtggggttgggg
gaattctttcccaatgagggggaaggggtgggcaaagagacttgatgacc
ttcttttcagacaaatagatctgtacctataacttttctggagccaaaaa
ggtcaagggtgaaagacccagaggaacagatcaaatcaaggggtatagac
taattaaagactacagcaatgtgcatgctgtatagacactattgtttcca
agacataagaaacagcattatatgtgacatcaaaggaagccagatttctg
tgtgttattttgttgctgaaggatgtttttgaaacaaagggttaacagcc
gcatggcccagcctaattttctgagggttgcctttaaaacatttatctct
gcctcttaaagattcatcatattaaaggacccaacggacaaacaggcaac
gtaaagttcacgagcaaagcattcctaaatatggtcatgtaattaattct
taagttttgtgaaatctctgcataaaacacagaattctgagactttagag
attaaccagtcaaacgattcttaagtagtaatgctcaaattcttttccac
taaaaataaaaaaacatgcatcaattgtgatgccaacatttatgaggtcc
tgggttcaatctcaaacaacaggtgaagcattcatcctctaaaagcctcg
ggtgaagagaaacattctggacaggaaagttgacttcactggcaacatct
gtaggctgttaatgtcttagttactccttcattgctatgaagaaacatct
tgaccaagataactcttataaaagaaagatttaatttaattgggagtctt
gcttaacttttagaggactagtccatgaacatcaaggtgggatgcagaca
ggaatggtgctggatcatagctgagagccttacatactgatccgcagcag
caggaggaaagagagaggggggaaggaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_72455901_72456825
seq2: B6Ng01-124C02.b_43_969

seq1  GAATTCTCTTGCTGCCATTCGATGTCCCAGCGGTGAGCCCACTGAGTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTGCTGCCATTCGATGTCCCAGCGGTGAGCCCACTGAGTGCT  50

seq1  TTGTCACATGCTCCCTAGCTGCTACTCAGTTCGGTGATTTTTACATCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCACATGCTCCCTAGCTGCTACTCAGTTCGGTGATTTTTACATCTGT  100

seq1  GGTCACACTCGTTGGGCAGCTAATCCCAAGATGTTTCACGGTGGATGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACACTCGTTGGGCAGCTAATCCCAAGATGTTTCACGGTGGATGCTG  150

seq1  ATTTTAGGTCCCCAGGGGATATGGAAAACAAAATAACATTGTTTCTCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAGGTCCCCAGGGGATATGGAAAACAAAATAACATTGTTTCTCTTT  200

seq1  TTCAGTGGCTTGCCCTCCTTCCTTAGAAACTGTTTTGGTACCTTCCCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTGGCTTGCCCTCCTTCCTTAGAAACTGTTTTGGTACCTTCCCAGG  250

seq1  GCTATCAAGTGTCAGCATTTAGAGGCAAACATGATTTGTTTAATAAATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCAAGTGTCAGCATTTAGAGGCAAACATGATTTGTTTAATAAATAG  300

seq1  GACTTCGCAGAGCTTCAGGTGGCCTTGGCAGGCTACGGTGCTGACCAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCGCAGAGCTTCAGGTGGCCTTGGCAGGCTACGGTGCTGACCAAGG  350

seq1  TTTTAATTACTCAGTGGCCAGTAAACCCTGCTGAGTCTTACATGCTGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATTACTCAGTGGCCAGTAAACCCTGCTGAGTCTTACATGCTGTCA  400

seq1  CAGGGTCAGTGGAAAACCAAGGTCACCAGAGTAAAGTGCTTAGCTGTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTCAGTGGAAAACCAAGGTCACCAGAGTAAAGTGCTTAGCTGTCAT  450

seq1  TGGGGTTTTGTCTAATCAATAACCAAAGCAAACAGTTTACACACATGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTTTTGTCTAATCAATAACCAAAGCAAACAGTTTACACACATGCAA  500

seq1  TCAAAGTACAACCGGCAGACATTTCTCAAGCATTTAGCATTGGACATCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGTACAACCGGCAGACATTTCTCAAGCATTTAGCATTGGACATCAT  550

seq1  GCTAGCCTCTGGGGACAGAGAGTTACACAAAATATGACTCTCACCTTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCTCTGGGGACAGAGAGTTACACAAAATATGACTCTCACCTTTAA  600

seq1  AAGATCATAGTCTTTCTGGAGGTGTGGAAACTATGAGCAGAGAGATAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCATAGTCTTTCTGGAGGTGTGGAAACTATGAGCAGAGAGATAGTA  650

seq1  ATGCCAGGGACAGCATCAGAATTTGTAGAACTCTGTCTTATCTGGGTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGGGACAGCATCAGAATTTGTAGAACTCTGTCTTATCTGGGTGCA  700

seq1  GGTAGGAGTTTATTTCTAAAACTGTGGGTTCAAAAGGAAATGTTTGGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGAGTTTATTTCTAAAACTGTGGGTTCAAAAGGAAATGTTTGGATT  750

seq1  CTTGAGAGCACACAAGGGGCCTGTTGTGGGTAAACTATGATGTATCGGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGAGCACACAAGGGGCCTGTTGTGGGTAAACTATGATGTATCGGTG  800

seq1  TGGGTGAAAACCTCAGAGGTAGGAGAGGAGTTTTGGTATTCTGGACAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGAAAACCTCAGAGGTAGGAGAGGAGTTTTGGTATTCTGGACAGTG  850

seq1  AAGGGATGC-TTCCTTGGAGCAGCTTGGGTATTACAGGGGAGGAGACTGA  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGATGCTTTCCTTGGAGCAGCTTGGGTATTACAGGGGAGGAGACTGA  900

seq1  TGTAATAGGTG-TTTGTGGGGTTGGGG  925
      ||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGTAATAGGTGTTTTGTGGGGTTGGGG  927

seq1: chr12_72612757_72613691
seq2: B6Ng01-124C02.g_66_995 (reverse)

seq1  TCTTCCCTCCCCCCTCTCTCTTTCCCTCCCTGCTGCCTGCGGATCAGTAT  50
      |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||
seq2  TCTTCCTTCCCCCCTCTCTCTTTCC--TCCTGCTG-CTGCGGATCAGTAT  47

seq1  GTAAGGCTCTCAGCTATTGATCCAGCACCATTCCTGTCTGCATCCCACCT  100
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGCTCTCAGCTA-TGATCCAGCACCATTCCTGTCTGCATCCCACCT  96

seq1  TGATGTTCATGGACTAGTCCTCTAAAAGTTTAAGCAAGACTCCCAATTAA  150
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTCATGGACTAGTCCTCTAAAAG-TTAAGCAAGACTCCCAATTAA  145

seq1  ATTAAATCTTTCTTTTATAAGAGTTATCTTGGTCAAGATGTTTCTTCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATCTTTCTTTTATAAGAGTTATCTTGGTCAAGATGTTTCTTCATA  195

seq1  GCAATGAAGGAGTAACTAAGACATTAACAGCCTACAGATGTTGCCAGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGAAGGAGTAACTAAGACATTAACAGCCTACAGATGTTGCCAGTGA  245

seq1  AGTCAACTTTCCTGTCCAGAATGTTTCTCTTCACCCGAGGCTTTTAGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAACTTTCCTGTCCAGAATGTTTCTCTTCACCCGAGGCTTTTAGAGG  295

seq1  ATGAATGCTTCACCTGTTGTTTGAGATTGAACCCAGGACCTCATAAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGCTTCACCTGTTGTTTGAGATTGAACCCAGGACCTCATAAATGT  345

seq1  TGGCATCACAATTGATGCATGTTTTTTTATTTTTAGTGGAAAAGAATTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCACAATTGATGCATGTTTTTTTATTTTTAGTGGAAAAGAATTTG  395

seq1  AGCATTACTACTTAAGAATCGTTTGACTGGTTAATCTCTAAAGTCTCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTACTACTTAAGAATCGTTTGACTGGTTAATCTCTAAAGTCTCAGA  445

seq1  ATTCTGTGTTTTATGCAGAGATTTCACAAAACTTAAGAATTAATTACATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTGTTTTATGCAGAGATTTCACAAAACTTAAGAATTAATTACATG  495

seq1  ACCATATTTAGGAATGCTTTGCTCGTGAACTTTACGTTGCCTGTTTGTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATATTTAGGAATGCTTTGCTCGTGAACTTTACGTTGCCTGTTTGTCC  545

seq1  GTTGGGTCCTTTAATATGATGAATCTTTAAGAGGCAGAGATAAATGTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGTCCTTTAATATGATGAATCTTTAAGAGGCAGAGATAAATGTTTT  595

seq1  AAAGGCAACCCTCAGAAAATTAGGCTGGGCCATGCGGCTGTTAACCCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAACCCTCAGAAAATTAGGCTGGGCCATGCGGCTGTTAACCCTTT  645

seq1  GTTTCAAAAACATCCTTCAGCAACAAAATAACACACAGAAATCTGGCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAAAAACATCCTTCAGCAACAAAATAACACACAGAAATCTGGCTTC  695

seq1  CTTTGATGTCACATATAATGCTGTTTCTTATGTCTTGGAAACAATAGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGATGTCACATATAATGCTGTTTCTTATGTCTTGGAAACAATAGTGT  745

seq1  CTATACAGCATGCACATTGCTGTAGTCTTTAATTAGTCTATACCCCTTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACAGCATGCACATTGCTGTAGTCTTTAATTAGTCTATACCCCTTGA  795

seq1  TTTGATCTGTTCCTCTGGGTCTTTCACCCTTGACCTTTTTGGCTCCAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATCTGTTCCTCTGGGTCTTTCACCCTTGACCTTTTTGGCTCCAGAA  845

seq1  AAGTTATAGGTACAGATCTATTTGTCTGAAAAGAAGGTCATCAAGTCTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATAGGTACAGATCTATTTGTCTGAAAAGAAGGTCATCAAGTCTCT  895

seq1  TTGCCCACCCCTTCCCCCTCATTGGGAAAGAATTC  935
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCACCCCTTCCCCCTCATTGGGAAAGAATTC  930