BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-126L17
Chromosome12 (Build37)
Map Location 90,413,507 - 90,536,976
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrxn3
Upstream geneLOC100039315, EG638008, EG666862, EG435337, LOC100039154, LOC633093, LOC667440, LOC100039383, EG266459, LOC667475, LOC620915, LOC435314, Adck1, LOC100039261, EG666915
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-126L17.bB6Ng01-126L17.g
ACCDH929024DH929025
length1,1641,083
definitionDH929024|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126L17, 5' end.DH929025|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126L17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,535,808 - 90,536,976)(90,413,507 - 90,414,598)
sequence
gaattctcctttacatccacaggggcaggagggaatagattgaatcgtct
taaaagccttttcaggtaacatatcttatggtaaaggtgacaacagcccg
agccacaaaggaagagaagagatgctctaaatagcccaaagcctgagcag
tgtcaatgcatgtgaaataaaggacacagcaggagaaaccattgaggtcc
caacccccaagctctaaagttaagctccggagaggtgctgtgcaccactt
tctcccagtacttgcagggttacctgggaattgtcactgctggttcagca
agaatgaatactcaccaatgtcactgtggtcagttggacttggagataat
tcacagcctgtcacccaaatcccagtcttctgcttctccttggtgtttgt
ttgtttgtttgtttgtttgttttttggtttttttctctttttctcttgga
tattttctttatttacatttcaaatgttatcctctttcctggtttcccct
ccgaaaactccctccccctaaccccttccctctccccctgctcaccatcc
cacccccttccacttcctggccctggcattcccctacactggggcataga
gccttcacaggaccaacggcctctcctcccattgatgtccgactatgcca
tcttctgctacatatgcagctggagccatgagtccctccatgtgtgctct
atggttggtggtttagtccctgggagttctgggtgtactggttagttcat
atagttgttcctcctatagggttacaaaccccttcagctccctaggtcct
ttctttagctcctttattgaggaccctatgctcagtccaatggatggctt
tgagcatccattttctgtatttgtcaggcactggcagggtctctcatata
caatcaccaaacccagacacttgtggatgccaccaagtgcttgctgacag
gagcctgatatagctgtctcctggagagctctcctaactacctacttccc
tgtaatgcttggaaaggattcatgctctgcatgctatccctgatgcctgg
accagaagttctgaacaaatagtatctaatcatggcaattttttccttgc
tttcttcactaccccctttaggaagtgaaatcgaagcaggtgcacactat
ggagacatcctagg
gaattcaactgcatttctgtataattccctataactttagccctttgggg
cctacatggaagatttgtaaaagcgtggaaaattgatactcacagcatat
gactgatacattcacaccatgtgcaaaatagccagataatcatccaagat
ctgataagagaagtgattaggtgttttattagaatagtctgcacacattt
taacttttaaaaaatggaatactccagtcattaagaagaatataattata
gtaaaagttattactgacattggaatttaaccctagattgaagacatttt
aatacccccaccttgtttgctttgtgtcttttcataaagactgtgtttgg
ctgggatggtaatataggggcaatgtatttcctcattctagcatttatga
ggataagggaagaggctggaggagcttgggatgtataggataaacctgtt
ttacaaggaagactcagtcttggtcccactattttctccctcctcagaag
tattcactacataaaattaatgagcatatctatacatatctctacttatt
actagaaataatacaacagttagccactactatgtattgaagctgcatta
tttatttttaccctcctatagtttatattcattactttctatatgttctg
gccttcataaaggaaacattgagcccactgtaagtattcttagtgcttgt
gctttctcagtggtccctcaataatcctgctacctcacttttttcttcca
tgatatgaatttttaacttctaaaatgtgttaacttcttacaacacctca
tttactctggatacttactgagtttggttttctgttgctatgaagagacc
ctatgaccacagcagctcttataaaggacaacatttaattggggactggc
ttacatatcaaaggtttagtccagtatcatcaggcgggaagcatggtagc
gtgcagcagaaatgtgatgagaaggagctgagagctcttcatctggatct
gcatgcaacaaggaagagacagtgggtagccactaggcttgcgccttctg
aactcaaggcctctcatgacatgtcttactcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_90535808_90536976
seq2: B6Ng01-126L17.b_50_1213 (reverse)

seq1  CCTAAGATGTCTCATTAGTGTGCACTTGCCTCGATTTCCACCTCCTAAAG  50
      |||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||
seq2  CCTAGGATGTCTCCATAGTGTGCACCTGCTTCGATTT-CACTTCCTAAAG  49

seq1  GGGTGTTAGTGAAGAAAGGAAAGAGAAAAATGGCATGATTAGATAACTAT  100
      ||  | |||||||||||| || || |||| || ||||||||||| |||||
seq2  GG--GGTAGTGAAGAAAGCAAGGAAAAAATTGCCATGATTAGAT-ACTAT  96

seq1  TTGTTCAGAACTTCTGTGTCAGGCATCAGGGATAGCATGCAGAGCATGAA  150
      ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTGTTCAGAACTTCTGGTCCAGGCATCAGGGATAGCATGCAGAGCATG-A  145

seq1  ATCCTTTCCAAGCATTTACAGGGAAGTAGGTAGTTAGGAGAGCCTCT-CA  199
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
seq2  ATCCTTTCCAAGCA-TTACAGGGAAGTAGGTAGTTAGGAGAG-CTCTCCA  193

seq1  GGAGACAGCTATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCACTTGGTGGCATCCACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACAGCTATATCAGGCTCCTGTCAGCAAGCACTTGGTGGCATCCACA  243

seq1  AGTGTCTGGGTTTGGTGATTGTATATGAGAGACCCTGCCAGTGCCTGACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTGGGTTTGGTGATTGTATATGAGAGACCCTGCCAGTGCCTGACA  293

seq1  AATACAG-AAATGGATGCTCAAAGCCATCCATTGGACTGAGCATAGGGTC  348
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGAAAATGGATGCTCAAAGCCATCCATTGGACTGAGCATAGGGTC  343

seq1  CTCAATAAAGGAGCTAAAGAAAGGACCTAGGGAGCTGAAGGGGTTTGTAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATAAAGGAGCTAAAGAAAGGACCTAGGGAGCTGAAGGGGTTTGTAA  393

seq1  CCCTATAGGAGGAACAACTATATGAACTAACCAGTACACCCAGAACTCCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATAGGAGGAACAACTATATGAACTAACCAGTACACCCAGAACTCCC  443

seq1  AGGGACTAAACCACCAACCATAGAGCACACATGGAGGGACTCATGGCTCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACTAAACCACCAACCATAGAGCACACATGGAGGGACTCATGGCTCC  493

seq1  AGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCATAGTCGGACATCAATGGGAGGAGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCATAGTCGGACATCAATGGGAGGAGA  543

seq1  GGCCGTTGGTCCTGTGAAGGCTCTATGCCCCAGTGTAGGGGAATGCCAGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCGTTGGTCCTGTGAAGGCTCTATGCCCCAGTGTAGGGGAATGCCAGG  593

seq1  GCCAGGAAGTGGAAGGGGGTGGGATGGTGAGCAGGGGGAGAGGGAAGGGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGAAGTGGAAGGGGGTGGGATGGTGAGCAGGGGGAGAGGGAAGGGG  643

seq1  TTAGGGGGAGGGAGTTTTCGGAGGGGAAACCAGGAAAGAGGATAACATTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGGAGGGAGTTTTCGGAGGGGAAACCAGGAAAGAGGATAACATTT  693

seq1  GAAATGTAAATAAAGAAAATATCCAAGAGAAAAAGAGAAAAAAACCAAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTAAATAAAGAAAATATCCAAGAGAAAAAGAGAAAAAAACCAAAA  743

seq1  AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACACCAAGGAGAAGCAGAAGACTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACACCAAGGAGAAGCAGAAGACTGG  793

seq1  GATTTGGGTGACAGGCTGTGAATTATCTCCAAGTCCAACTGACCACAGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGGTGACAGGCTGTGAATTATCTCCAAGTCCAACTGACCACAGTG  843

seq1  ACATTGGTGAGTATTCATTCTTGCTGAACCAGCAGTGACAATTCCCAGGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGTGAGTATTCATTCTTGCTGAACCAGCAGTGACAATTCCCAGGT  893

seq1  AACCCTGCAAGTACTGGGAGAAAGTGGTGCACAGCACCTCTCCGGAGCTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGCAAGTACTGGGAGAAAGTGGTGCACAGCACCTCTCCGGAGCTT  943

seq1  AACTTTAGAGCTTGGGGGTTGGGACCTCAATGGTTTCTCCTGCTGTGTCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTAGAGCTTGGGGGTTGGGACCTCAATGGTTTCTCCTGCTGTGTCC  993

seq1  TTTATTTCACATGCATTGACACTGCTCAGGCTTTGGGCTATTTAGAGCAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTCACATGCATTGACACTGCTCAGGCTTTGGGCTATTTAGAGCAT  1043

seq1  CTCTTCTCTTCCTTTGTGGCTCGGGCTGTTGTCACCTTTACCATAAGATA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTCTTCCTTTGTGGCTCGGGCTGTTGTCACCTTTACCATAAGATA  1093

seq1  TGTTACCTGAAAAGGCTTTTAAGACGATTCAATCTATTCCCTCCTGCCCC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACCTGAAAAGGCTTTTAAGACGATTCAATCTATTCCCTCCTGCCCC  1143

seq1  TGTGGATGTAAAGGAGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATGTAAAGGAGAATTC  1164

seq1: chr12_90413507_90414598
seq2: B6Ng01-126L17.g_68_1150

seq1  GAATTCAACTGCATTTCTGTATAATTCCCTATAACTTTAGCCCTTTGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTGCATTTCTGTATAATTCCCTATAACTTTAGCCCTTTGGGG  50

seq1  CCTACATGGAAGATTTGTAAAAGCGTGGAAAATTGATACTCACAGCATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATGGAAGATTTGTAAAAGCGTGGAAAATTGATACTCACAGCATAT  100

seq1  GACTGATACATTCACACCATGTGCAAAATAGCCAGATAATCATCCAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGATACATTCACACCATGTGCAAAATAGCCAGATAATCATCCAAGAT  150

seq1  CTGATAAGAGAAGTGATTAGGTGTTTTATTAGAATAGTCTGCACACATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAAGAGAAGTGATTAGGTGTTTTATTAGAATAGTCTGCACACATTT  200

seq1  TAACTTTTAAAAAATGGAATACTCCAGTCATTAAGAAGAATATAATTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTTAAAAAATGGAATACTCCAGTCATTAAGAAGAATATAATTATA  250

seq1  GTAAAAGTTATTACTGACATTGGAATTTAACCCTAGATTGAAGACATTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGTTATTACTGACATTGGAATTTAACCCTAGATTGAAGACATTTT  300

seq1  AATACCCCCACCTTGTTTGCTTTGTGTCTTTTCATAAAGACTGTGTTTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCCCCACCTTGTTTGCTTTGTGTCTTTTCATAAAGACTGTGTTTGG  350

seq1  CTGGGATGGTAATATAGGGGCAATGTATTTCCTCATTCTAGCATTTATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATGGTAATATAGGGGCAATGTATTTCCTCATTCTAGCATTTATGA  400

seq1  GGATAAGGGAAGAGGCTGGAGGAGCTTGGGATGTATAGGATAAACCTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAAGGGAAGAGGCTGGAGGAGCTTGGGATGTATAGGATAAACCTGTT  450

seq1  TTACAAGGAAGACTCAGTCTTGGTCCCACTATTTTCTCCCTCCTCAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGGAAGACTCAGTCTTGGTCCCACTATTTTCTCCCTCCTCAGAAG  500

seq1  TATTCACTACATAAAATTAATGAGCATATCTATACATATCTCTACTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCACTACATAAAATTAATGAGCATATCTATACATATCTCTACTTATT  550

seq1  ACTAGAAATAATACAACAGTTAGCCACTACTATGTATTGAAGCTGCATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGAAATAATACAACAGTTAGCCACTACTATGTATTGAAGCTGCATTA  600

seq1  TTTATTTTTACCCTCCTATAGTTTATATTCATTACTTTCTATATGTTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTTACCCTCCTATAGTTTATATTCATTACTTTCTATATGTTCTG  650

seq1  GCCTTCATAAAGGAAACATTGAGCCCACTGTAAGTATTCTTAGTGCTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCATAAAGGAAACATTGAGCCCACTGTAAGTATTCTTAGTGCTTGT  700

seq1  GCTTTCTCAGTGGTCCCTCAATAATCCTGCTACCTCACTTTTTTCTTCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTCAGTGGTCCCTCAATAATCCTGCTACCTCACTTTTTTCTTCCA  750

seq1  TGATATGAATTTTTAACTTCTAAAATGTGTTAACTTCTTACAACACCTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGAATTTTTAACTTCTAAAATGTGTTAACTTCTTACAACACCTCA  800

seq1  TTTACTCTGGATACTTACTGAGTTTGGTTTTCTGTTGCTATGAAGAGACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCTGGATACTTACTGAGTTTGGTTTTCTGTTGCTATGAAGAGACC  850

seq1  CTATGACCACAGCAGCTCTTATAAAGGACAACATTTAATT-GGGACTGGC  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTATGACCACAGCAGCTCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGGGACTGGC  900

seq1  TTACATATCAAAGGTTTAGTCCAGTATCATCAGGGCGGGAAGCATGGTAG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTACATATCAAAGGTTTAGTCCAGTATCATCA-GGCGGGAAGCATGGTAG  949

seq1  CGTGCAGGCAGACATGGTGATGGAGAAGGAGCTGAGAGCTCTTCATCTGG  999
      |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCA-GCAGAAAT-GTGAT-GAGAAGGAGCTGAGAGCTCTTCATCTGG  996

seq1  ATCTGCAGGCAAC-AGGGAGAGACAGTGGGTAAGCCACTAGGCTTGCG-C  1047
      ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  ATCTGCATGCAACAAGGAAGAGACAGTGGGT-AGCCACTAGGCTTGCGCC  1045

seq1  TTCTGAAACCTCAAAGCCTTCTCCCAATGACATGTCTTTACTCCA  1092
      |||||||  ||||| ||| ||||   |||||||||| ||||||||
seq2  TTCTGAA--CTCAAGGCC-TCTC---ATGACATGTC-TTACTCCA  1083