BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128N14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 69,934,818 - 70,069,093
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040681
Downstream geneLOC100040696, LOC665967, LOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2, Klhdc1, Klhdc2, Sdccag1, Arf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71, Sos2, LOC100040879, L2hgdh, Atp5s, Cdkl1, Map4k5, Spg3a, EG622339, Sav1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128N14.bB6Ng01-128N14.g
ACCDH930591DH930592
length3331,049
definitionDH930591|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128N14, 5' end.DH930592|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128N14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,934,818 - 69,935,150)(70,068,036 - 70,069,093)
sequence
tgcctgcaaaacctgcccagatcctcctgggccacagagagtgattccaa
aatggaaaaaaaaagagaggggggggggggagagagacagataccgagac
agagacagggagaaagttaaataattaagagaataaaccacagcaatacc
ttctctttcatcactaaggacttagtttgttcatagactccccagttctc
aagcagctctgaggcacacagtaaaactgtagccatgtggagccagtctc
ccactgtttcggctctgcaaatactccctaatatgactcatcatgtcatt
tgtggaacaactgaacagggagctgcagggccc
gaattcactaagctttggagatgtcagttaaagcctactaatgattacgg
ttgataatgaactatgcccttatgtaattactacaacatcaactactctc
tttgttttggatcaggttacctatttgtttattagtttgtgaagacaagg
tctacagctcaggctggcttggtactgactgtgtagctcaggtttgctct
ggacccacattaatcctccttctccagcctgagtgttgggattacaggtg
tgaatcatcacccaggtggctcatggcatttgctaatgatagggatgccc
agccatgaatataaaaatctttccttttgggagatagtatggaagctcat
gacaattctgtctcacaggtggcatctgcagtcattgaactctgattttt
tttgttaattccattgtttcctaatcagatgatgttctctgtcaggagag
aagtgacagtgggacatggcaaatatgcagaaatatggtttagatcttaa
gtggtatatacatacaattacacttcagtataatgactataatttatgaa
actggttattgaagttgtaggacctgagaagactattcaggcaaggacat
gaccactcatatattttccaatccaggtatggccgacattatttagatgt
ccttatcacatgcttggagcactcctatacattcctacacactagcttat
ttaatttacatcctctcccaagggtgttagctctctattgctgctacaat
gaataatcactaatattggttaaacatacacacaccatcaagttgtggat
gccagaactcctctaggttggtcttgctaaaagtcaaggatttttgtgat
tatactgagcccatccaggtgatccaggatatccctattttaagatcagc
cagttagcacattaattgcacccatgacgtaatttaccttttatcatgtg
agatataacagttaccagtttaggaattaggatgtggatatatatctagg
tgtgttattctaccacagtaatagcagggtggtctttttttttattagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_69934818_69935150
seq2: B6Ng01-128N14.b_53_385

seq1  TGCCTGCAAAACCTGCCCAGATCCTCCTGGGCCACAGAGAGTGATTCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCAAAACCTGCCCAGATCCTCCTGGGCCACAGAGAGTGATTCCAA  50

seq1  AATGGAAAAAAAAAGAGAGGGGGGGGGGGGAGAGAGACAGAGACCGAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AATGGAAAAAAAAAGAGAGGGGGGGGGGGGAGAGAGACAGATACCGAGAC  100

seq1  AGAGACAGGGAGAAAGTTAAATAATTAAGAGAATAAACCACAGCAATACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGGGAGAAAGTTAAATAATTAAGAGAATAAACCACAGCAATACC  150

seq1  TTCTCTTTCATCACTAAGGACTTAGTTTGTTCAGAGACTCCCCAGTTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTTCATCACTAAGGACTTAGTTTGTTCATAGACTCCCCAGTTCTC  200

seq1  AAGCAGCTCTGAGGCACACAGTAAAACTGCAGCCATGTGGAGCCAGTCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCTCTGAGGCACACAGTAAAACTGTAGCCATGTGGAGCCAGTCTC  250

seq1  CCACTGTTTCGGCTCTGCAAAGACTCCCTAATATGACTCATCATGTCATT  300
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTTTCGGCTCTGCAAATACTCCCTAATATGACTCATCATGTCATT  300

seq1  TGTGGAACAACTGAACAGGGAGCTGCAGGGCCC  333
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAACAACTGAACAGGGAGCTGCAGGGCCC  333

seq1: chr12_70068036_70069093
seq2: B6Ng01-128N14.g_67_1115 (reverse)

seq1  CCTAATAAAAAAAAAAAGAAACCACACTGCTTATTACTGTGGTAGAATAA  50
      ||||||||||||||    | ||||| |||| |||||||||||||||||||
seq2  CCTAATAAAAAAAA----AGACCACCCTGC-TATTACTGTGGTAGAATAA  45

seq1  CACACCTAGATATATATCCACATCCTAATTCCTTAAACTGGTAACTGTTA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CACACCTAGATATATATCCACATCCTAATTCC-TAAACTGGTAACTGTTA  94

seq1  TATCTCACATGAT-AAAGGTAAATTAACGTCATGGGTGCAATTAATGTTG  149
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
seq2  TATCTCACATGATAAAAGGTAAATT-ACGTCATGGGTGCAATTAATG-TG  142

seq1  CTAACTGGCTGATCTTAAAATAGGGGATTATCCTGGATCACCTGGATGGG  199
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTGGCTGATCTTAAAATAGGG--ATATCCTGGATCACCTGGATGGG  190

seq1  CTCAGTATAATCACAAAAATCCTTGACTTTTAGCAAGACCAACCTAGAGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTATAATCACAAAAATCCTTGACTTTTAGCAAGACCAACCTAGAGG  240

seq1  AGTTCTGGCATCCACAACTTGATGGTGTGTGTATGTTTAACCAATATTAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTGGCATCCACAACTTGATGGTGTGTGTATGTTTAACCAATATTAG  290

seq1  TGATTATTCATTGTAGCAGCAATAGAGAGCTAACACCCTTGGGAGAGGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTATTCATTGTAGCAGCAATAGAGAGCTAACACCCTTGGGAGAGGAT  340

seq1  GTAAATTAAATAAGCTAGTGTGTAGGAATGTATAGGAGTGCTCCAAGCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTAAATAAGCTAGTGTGTAGGAATGTATAGGAGTGCTCCAAGCAT  390

seq1  GTGATAAGGACATCTAAATAATGTCGGCCATACCTGGATTGGAAAATATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAAGGACATCTAAATAATGTCGGCCATACCTGGATTGGAAAATATA  440

seq1  TGAGTGGTCATGTCCTTGCCTGAATAGTCTTCTCAGGTCCTACAACTTCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGGTCATGTCCTTGCCTGAATAGTCTTCTCAGGTCCTACAACTTCA  490

seq1  ATAACCAGTTTCATAAATTATAGTCATTATACTGAAGTGTAATTGTATGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCAGTTTCATAAATTATAGTCATTATACTGAAGTGTAATTGTATGT  540

seq1  ATATACCACTTAAGATCTAAACCATATTTCTGCATATTTGCCATGTCCCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACCACTTAAGATCTAAACCATATTTCTGCATATTTGCCATGTCCCA  590

seq1  CTGTCACTTCTCTCCTGACAGAGAACATCATCTGATTAGGAAACAATGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACTTCTCTCCTGACAGAGAACATCATCTGATTAGGAAACAATGGA  640

seq1  ATTAACAAAAAAAATCAGAGTTCAATGACTGCAGATGCCACCTGTGAGAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACAAAAAAAATCAGAGTTCAATGACTGCAGATGCCACCTGTGAGAC  690

seq1  AGAATTGTCATGAGCTTCCATACTATCTCCCAAAAGGAAAGATTTTTATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTCATGAGCTTCCATACTATCTCCCAAAAGGAAAGATTTTTATA  740

seq1  TTCATGGCTGGGCATCCCTATCATTAGCAAATGCCATGAGCCACCTGGGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGGCTGGGCATCCCTATCATTAGCAAATGCCATGAGCCACCTGGGT  790

seq1  GATGATTCACACCTGTAATCCCAACACTCAGGCTGGAGAAGGAGGATTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATTCACACCTGTAATCCCAACACTCAGGCTGGAGAAGGAGGATTAA  840

seq1  TGTGGGTCCAGAGCAAACCTGAGCTACACAGTCAGTACCAAGCCAGCCTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTCCAGAGCAAACCTGAGCTACACAGTCAGTACCAAGCCAGCCTG  890

seq1  AGCTGTAGACCTTGTCTTCACAAACTAATAAACAAATAGGTAACCTGATC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTAGACCTTGTCTTCACAAACTAATAAACAAATAGGTAACCTGATC  940

seq1  CAAAACAAAGAGAGTAGTTGATGTTGTAGTAATTACATAAGGGCATAGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAGAGAGTAGTTGATGTTGTAGTAATTACATAAGGGCATAGTT  990

seq1  CATTATCAACCGTAATCATTAGTAGGCTTTAACTGACATCTCCAAAGCTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATCAACCGTAATCATTAGTAGGCTTTAACTGACATCTCCAAAGCTT  1040

seq1  AGTGAATTC  1058
      |||||||||
seq2  AGTGAATTC  1049