BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137G15
Chromosome12 (Build37)
Map Location 98,044,373 - 98,169,826
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG628277
Upstream gene1700019M22Rik, LOC100039664
Downstream geneLOC382626, LOC100039743, LOC667732, LOC628351, LOC100039770
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137G15.bB6Ng01-137G15.g
ACCDH936937DH936938
length1,177894
definitionDH936937|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137G15, 5' end.DH936938|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137G15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,044,373 - 98,045,564)(98,168,929 - 98,169,826)
sequence
gaattcagatgccctggtgttgggtaacttaccatacaagggatgtttca
ctttacagcagataacaaaagcaagtgattttccattaaatgagtggttt
cctgaaaagtttcagccattatgttaaaatatcaaggtaatattttaaac
ccaagtatttggatatattatcaataaataaatatcatctaaatatatat
tattctctgaaggcatgggaagccttttatgtatacattaggctctcaat
ggcaagtcctggttccacatgctctgccgtgaaaagtgaggatagactaa
actaatcctgtagtttctggcagacttagttgcaattttgttatatattc
tgttttctattacatattataagcattggattcagagtaaagagcctgag
aagttgcttaatagcataggtctttcaagcattatacatttagactctga
gttcaagccagagcatgaaactattatcttatacacacaactataaagac
ctattttataaactattacagttaccagaagaaaatgcattatgcatgtg
tgtttctcttgtccactgaacatgtaggaaaacattcatttaatgcttgt
cacatctctgttcctgcaattcatactatcctttaccaggtctaaaggtt
tttgattccttaatgaacatgatacctgtatttgtcaagattcttcaaag
aaacaagtctgtctctacatagctcattggacacataaaatacataaata
tgatataaatatgtatatatgtgtgtgcatgaatatatttaggaaataat
atgatatggaaattgataagatttgtctgacataattacagacatatgag
acgaccattaagatgtaacatgcaaactggagaaactttaactactttat
taatagaatccatcttgaaactaaaagactaaaaactttcagcatagttg
tacaaggtagagaaagatggttgtccatcaaacaggaaatattttcattc
tttctctgcatttgtctgacccttgaagaaatattgatgacaattatgtt
cattggatgaaactatttattgatttggttctttaatgaaatccacaata
cagttgtggtcgatggtttttatttttcttttaagatagtttttctcttt
acattgaaatgctatcccggaaggtcc
gaattcactcttgcacctgcgtacaaggcttgtttactagttaggcacag
cggaggcccgcgccatcttataatggcgattgctcgctgcacacacggct
ctcctcagagattactggcggcacgcacacgattgctcgcagcacgtact
ggctctccacaaccaagtactgacactgccattcagacttgacctattgt
atcgagagtagatatagttaaaactaataattatggttaaaataataaat
tgtaaatataaatcataatgtcttaaatttatttatcctaagtcatatac
cctatatcatattacatactatccttaatccatttctgttattactagca
ttgataatcatatatgactatggaccttactacattatcattatatatgt
acataatatattttgatcatacttactccataaacttctctcttttctcc
cagttcctgtaaggtcacttaaattctttttcccaatgtgtatccttttt
cattcctatctttttttgccatagatggggacagactggtggaatcctac
cacttactgaacatttgttgccaggtgatgattgatggaggagggaggga
tgatttttttcagtggtgcagccaaacagtaaagtatacctattgacttt
ttaaaaaaacacacattcatgctacaatgcactgtagtaatttaaattaa
taaaaccatacattttaatatgtgttataacacttgcttttatagtatcc
atgagtgagattactgttcattataagcatacattcattaagaagaatat
acactttcttttctgcatcagtgttaggggtactgtgtgtgactcctcaa
ctgtgacactcttaagatctttctgtgtctaatcacttcttctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_98044373_98045564
seq2: B6Ng01-137G15.b_45_1221

seq1  GAATTCAGATGCCCTGGTGTTGGGTAACTTACCATACAAGGGATGTTTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATGCCCTGGTGTTGGGTAACTTACCATACAAGGGATGTTTCA  50

seq1  CTTTACAGCAGATAACAAAAGCAAGTGATTTTCCATTAAATGAGTGGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACAGCAGATAACAAAAGCAAGTGATTTTCCATTAAATGAGTGGTTT  100

seq1  CCTGAAAAGTTTCAGCCATTATGTTAAAATATCAAGGTAATATTTTAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAAGTTTCAGCCATTATGTTAAAATATCAAGGTAATATTTTAAAC  150

seq1  CCAAGTATTTGGATATATTATCAATAAATAAATATCATCTAAATATATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTATTTGGATATATTATCAATAAATAAATATCATCTAAATATATAT  200

seq1  TATTCTCTGAAGGCATGGGAAGCCTTTTATGTATACATTAGGCTCTCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTCTGAAGGCATGGGAAGCCTTTTATGTATACATTAGGCTCTCAAT  250

seq1  GGCAAGTCCTGGTTCCACATGCTCTGCCGTGAAAAGTGAGGATAGACTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGTCCTGGTTCCACATGCTCTGCCGTGAAAAGTGAGGATAGACTAA  300

seq1  ACTAATCCTGTAGTTTCTGGCAGACTTAGTTGCAATTTTGTTATATATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATCCTGTAGTTTCTGGCAGACTTAGTTGCAATTTTGTTATATATTC  350

seq1  TGTTTTCTATTACATATTATAAGCATTGGATTCAGAGTAAAGAGCCTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCTATTACATATTATAAGCATTGGATTCAGAGTAAAGAGCCTGAG  400

seq1  AAGTTGCTTAATAGCATAGGTCTTTCAAGCATTATACATTTAGACTCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCTTAATAGCATAGGTCTTTCAAGCATTATACATTTAGACTCTGA  450

seq1  GTTCAAGCCAGAGCATGAAACTATTATCTTATACACACAACTATAAAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGCCAGAGCATGAAACTATTATCTTATACACACAACTATAAAGAC  500

seq1  CTATTTTATAAACTATTACAGTTACCAGAAGAAAATGCATTATGCATGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTTATAAACTATTACAGTTACCAGAAGAAAATGCATTATGCATGTG  550

seq1  TGTTTCTCTTGTCCACTGAACATGTAGGAAAACATTCATTTAATGCTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCTTGTCCACTGAACATGTAGGAAAACATTCATTTAATGCTTGT  600

seq1  CACATCTCTGTTCCTGCAATTCATACTATCCTTTACCAGGTCTAAAGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTCTGTTCCTGCAATTCATACTATCCTTTACCAGGTCTAAAGGTT  650

seq1  TTTGATTCCTTAATGAACATGATACCTGTATTTGTCAAGATTCTTCAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTCCTTAATGAACATGATACCTGTATTTGTCAAGATTCTTCAAAG  700

seq1  AAACAAGTCTGTCTCTACATAGCTCATTGGACACATAAAATACATAAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGTCTGTCTCTACATAGCTCATTGGACACATAAAATACATAAATA  750

seq1  TGATATAAATATGTATATATGTGTGTGCATGAATATATTTAGGAAATAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATAAATATGTATATATGTGTGTGCATGAATATATTTAGGAAATAAT  800

seq1  ATGATATGGAAATTGATAAGATTTGTCTGACATAATTACAGACATATGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATGGAAATTGATAAGATTTGTCTGACATAATTACAGACATATGAG  850

seq1  ACGACCATTAAGATGTAACATGCAAACTGGAGAAACTTTAACTACTTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACCATTAAGATGTAACATGCAAACTGGAGAAACTTTAACTACTTTAT  900

seq1  TAATAGAATCCATCTTGAAACTAAAAGACTAAAAAC-TTCAGCATAG-TG  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  TAATAGAATCCATCTTGAAACTAAAAGACTAAAAACTTTCAGCATAGTTG  950

seq1  TACAAGGGCAGAG-AAGATGGTTGTTCCATCAAACAGGAAATA-TTTCAT  996
      ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2  TACAA-GGTAGAGAAAGATGGTTG-TCCATCAAACAGGAAATATTTTCAT  998

seq1  TCTTTCTCTGCCATTTGTCTGACCCTTGAAGAAATTATTGATGACCAATT  1046
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  TCTTTCTCTG-CATTTGTCTGACCCTTGAAGAAA-TATTGATGA-CAATT  1045

seq1  ATGTTCATTTGGATGAAACTATTTATTGATTTTGGTTTCTTTAATGGTAT  1096
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  | 
seq2  ATGTTCA-TTGGATGAAACTATTTATTGATTT--GGTTCTTTAATG--AA  1090

seq1  ATCCACAATACAGTTGTGTCAGATGGTTTTTTATTTTCTTTTTTAAAAAT  1146
      ||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||        |
seq2  ATCCACAATACAGTTGTGGTCGATGGTTTTTATTTTTCTTT--------T  1132

seq1  TAGATATTTTCTTCCTTTACATTTAAAATGCTATCCCGGAAAGTCC  1192
       ||||| ||| |  ||||||| || |||||||||||||||| ||||
seq2  AAGATAGTTTTTCTCTTTACA-TTGAAATGCTATCCCGGAAGGTCC  1177

seq1: chr12_98168929_98169826
seq2: B6Ng01-137G15.g_67_960 (reverse)

seq1  AAGAAGAAGTGATTAGAACACAGAGAGATCTTAAGAGTGTCACAAGTTTG  50
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||
seq2  AAGAAGAAGTGATTAG-ACACAGAAAGATCTTAAGAGTGTCACA--GTTG  47

seq1  AGGAGTCACAACACAGTACCCCTAACACTGATGCAGAAAAGAAAGTGTAT  100
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTCAC-ACACAGTACCCCTAACACTGATGCAGAAAAGAAAGTGTAT  96

seq1  ATTCTTCTTAATGAATTGTATGCTTATAATGAACAGTGATTCTCACTCAT  150
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||
seq2  ATTCTTCTTAATGAA-TGTATGCTTATAATGAACAGT-AATCTCACTCAT  144

seq1  GGATACTAT-AAAGCAAGTGTTATAACACATATTAAAATGTATGGTTTTA  199
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACTATAAAAGCAAGTGTTATAACACATATTAAAATGTATGGTTTTA  194

seq1  TTAATTT-AATTACTACAGTGCATTGTAGCATGAATGTGTGTTTTTTTAA  248
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTAAATTACTACAGTGCATTGTAGCATGAATGTGTGTTTTTTTAA  244

seq1  AAAGTCAATAGGTATACTTTACTGTTTGGCTGCACCACTGAAAAAAATCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAATAGGTATACTTTACTGTTTGGCTGCACCACTGAAAAAAATCA  294

seq1  TCCCTCCCTCCTCCATCAATCATCACCTGGCAACAAATGTTCAGTAAGTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCCTCCTCCATCAATCATCACCTGGCAACAAATGTTCAGTAAGTG  344

seq1  GTAGGATTCCACCAGTCTGTCCCCATCTATGGCAAAAAAAGATAGGAATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGATTCCACCAGTCTGTCCCCATCTATGGCAAAAAAAGATAGGAATG  394

seq1  AAAAAGGATACACATTGGGAAAAAGAATTTAAGTGACCTTACAGGAACTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGATACACATTGGGAAAAAGAATTTAAGTGACCTTACAGGAACTG  444

seq1  GGAGAAAAGAGAGAAGTTTATGGAGTAAGTATGATCAAAATATATTATGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAAGAGAGAAGTTTATGGAGTAAGTATGATCAAAATATATTATGT  494

seq1  ACATATATAATGATAATGTAGTAAGGTCCATAGTCATATATGATTATCAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATAATGATAATGTAGTAAGGTCCATAGTCATATATGATTATCAA  544

seq1  TGCTAGTAATAACAGAAATGGATTAAGGATAGTATGTAATATGATATAGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGTAATAACAGAAATGGATTAAGGATAGTATGTAATATGATATAGG  594

seq1  GTATATGACTTAGGATAAATAAATTTAAGACATTATGATTTATATTTACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGACTTAGGATAAATAAATTTAAGACATTATGATTTATATTTACA  644

seq1  ATTTATTATTTTAACCATAATTATTAGTTTTAACTATATCTACTCTCGAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTATTTTAACCATAATTATTAGTTTTAACTATATCTACTCTCGAT  694

seq1  ACAATAGGTCAAGTCTGAATGGCAGTGTCAGTACTTGGTTGTGGAGAGCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAGGTCAAGTCTGAATGGCAGTGTCAGTACTTGGTTGTGGAGAGCC  744

seq1  AGTACGTGCTGCGAGCAATCGTGTGCGTGCCGCCAGTAATCTCTGAGGAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACGTGCTGCGAGCAATCGTGTGCGTGCCGCCAGTAATCTCTGAGGAG  794

seq1  AGCCGTGTGTGCAGCGAGCAATCGCCATTATAAGATGGCGCGGGCCTCCG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGTGTGTGCAGCGAGCAATCGCCATTATAAGATGGCGCGGGCCTCCG  844

seq1  CTGTGCCTAACTAGTAAACAAGCCTTGTACGCAGGTGCAAGAGTGAATTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTAACTAGTAAACAAGCCTTGTACGCAGGTGCAAGAGTGAATTC  894