BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146D11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 12,715,426 - 12,861,702
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC628327, LOC627110, LOC100043209, D12Ertd553e
Downstream geneLOC100043215, Mycn, EG668473, LOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146D11.bB6Ng01-146D11.g
ACCDH943418DH943419
length8021,010
definitionDH943418|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146D11, 5' end.DH943419|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146D11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,860,902 - 12,861,702)(12,715,426 - 12,716,435)
sequence
gaattcagtgtagaccgaggaaggttggggagatgtctggagtgggcatg
gatatggcctttgaaacttcatgaaatctttggctgggagatgctttcca
ggatgatgatagtgcaaggaaggtaagcacagaggcagggagcaagctag
tgggtaaggtgatggggacccatattcaaaaccaaactagtgctctccaa
gggaaatagatccccgaacaaacatgacacaaatgactcttgaatgggtg
aataagcactcatgtgatatctactacatagtcttcaacattatagtgtg
ttttttattacatgatggcccacttgccatggagtttagaggtgtgtatg
tgtgagtgcgtttatgtatgtgttacaacaagtccaagaatagaggccat
atgactggtatctgttcttacactggtcaccatagctcttgctttatttt
taatgatttatctatctttaatttatgtgtatgtttataagccaacaaga
atttatgtctactctgtacatgtgacattcagtgatgacctcaagaggca
gttggatcttctggaacagaaattgcaggtgtttgagagctgctgtgtga
gtgctgggaatggaacctgggttttacacaagtgtagtaaatagttgtaa
acgctgagcagtctcgcactcccccacccgttgattcttactattttttt
aaggtttaaataaaaatttctttcaatctgggcagaggtggtacatgcct
ttaattctagcacttggatgcatgcaggagcaggcaaatgtctgagttct
ag
gaattcagagcccagaaggctgaaacaggaccaccattggcttgaggcca
gcctgggcaacatagcaacttccaggtcacctttgactacataatgagac
ctcatagcaaagcaatacagaaacaaaaaaaccacacagagaacaaagaa
caagattaaagagcaaactacagagcagtagacagctcgagtcagccagc
gagatgaacaaattaacctgtagcctgtgtaaagttataaagaaatggtc
tccgactcgttcttcagtttctcaatcagcaaagtatgtggaagaatgca
tgggtcaaaacagagtcgaggcaactttggaaaatgaatacacacagaag
gctggctattgtttccatggttatggcggtgctgatccagggctttgtcc
tgcaaacgaggggaaatctctgggagaggtggctgaagacctgcttcttc
gcagtaaaggctgtagaaggttaatcagatggtgagcccagtcaccaaga
ttaagagaaagaaaatccctccaaccgcctttgaattccagttatgtgta
cgttttctttgaactggcgattcgactctctctctctcttggagagagaa
caaagcgggtggtgtggaactcaaatctcatttacaacttaattttgaaa
ctgaggagatttgcaatgttggaaaggcagggagcaggaaatcaacttca
gagtaattgctccgtcgttttttaaacataaggcggtgcactgctatttt
tgctgatgtatttcaaatgagaggatgccacagctgcggggtgtctaggg
atcagggatggcaccgcctgcagactgggaggaatcgtgggccaaagtga
gtctgtctctcaactccagcaagctagaggccagagaaagagtgagattt
ccccagcttcctgtcacacgctgcagaatgccagggagcacagagtagat
taatgactcagagcatgttcttgcttcacaacttcacattgtgttacaga
ggcacaaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_12860902_12861702
seq2: B6Ng01-146D11.b_48_849 (reverse)

seq1  CTAGAACTCAGACATTTGCCTGCTCCTGCATGCATCCAAGTGCTAGAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACTCAGACATTTGCCTGCTCCTGCATGCATCCAAGTGCTAGAATT  50

seq1  AAAGGCATGTACCACCTCTGCCCAGATTGAAAGAAATTTTTATTTAAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCATGTACCACCTCTGCCCAGATTGAAAGAAATTTTTATTTAAACC  100

seq1  TTAAAAAAATAGTAAGAATCAACGGGT-GGGGAGTGCGAGACTGCTCAGC  149
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAAATAGTAAGAATCAACGGGTGGGGGAGTGCGAGACTGCTCAGC  150

seq1  GTTTACAACTATTTACTACACTTGTGTAAAACCCAGGTTCCATTCCCAGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACAACTATTTACTACACTTGTGTAAAACCCAGGTTCCATTCCCAGC  200

seq1  ACTCACACAGCAGCTCTCAAACACCTGCAATTTCTGTTCCAGAAGATCCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACACAGCAGCTCTCAAACACCTGCAATTTCTGTTCCAGAAGATCCA  250

seq1  ACTGCCTCTTGAGGTCATCACTGAATGTCACATGTACAGAGTAGACATAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTCTTGAGGTCATCACTGAATGTCACATGTACAGAGTAGACATAA  300

seq1  ATTCTTGTTGGCTTATAAACATACACATAAATTAAAGATAGATAAATCAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTGTTGGCTTATAAACATACACATAAATTAAAGATAGATAAATCAT  350

seq1  TAAAAATAAAGCAAGAGCTATGGTGACCAGTGTAAGAACAGATACCAGTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATAAAGCAAGAGCTATGGTGACCAGTGTAAGAACAGATACCAGTC  400

seq1  ATATGGCCTCTATTCTTGGACTTGTTGTAACACATACATAAACGCACTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGCCTCTATTCTTGGACTTGTTGTAACACATACATAAACGCACTCA  450

seq1  CACATACACACCTCTAAACTCCATGGCAAGTGGGCCATCATGTAATAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACACACCTCTAAACTCCATGGCAAGTGGGCCATCATGTAATAAAA  500

seq1  AACACACTATAATGTTGAAGACTATGTAGTAGATATCACATGAGTGCTTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACTATAATGTTGAAGACTATGTAGTAGATATCACATGAGTGCTTA  550

seq1  TTCACCCATTCAAGAGTCATTTGTGTCATGTTTGTTCGGGGATCTATTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCCATTCAAGAGTCATTTGTGTCATGTTTGTTCGGGGATCTATTTC  600

seq1  CCTTGGAGAGCACTAGTTTGGTTTTGAATATGGGTCCCCATCACCTTACC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGAGAGCACTAGTTTGGTTTTGAATATGGGTCCCCATCACCTTACC  650

seq1  CACTAGCTTGCTCCCTGCCTCTGTGCTTACCTTCCTTGCACTATCATCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGCTTGCTCCCTGCCTCTGTGCTTACCTTCCTTGCACTATCATCAT  700

seq1  CCTGGAAAGCATCTCCCAGCCAAAGATTTCATGAAGTTTCAAAGGCCATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAAAGCATCTCCCAGCCAAAGATTTCATGAAGTTTCAAAGGCCATA  750

seq1  TCCATGCCCACTCCAGACATCTCCCCAACCTTCCTCGGTCTACACTGAAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCCCACTCCAGACATCTCCCCAACCTTCCTCGGTCTACACTGAAT  800

seq1  TC  801
      ||
seq2  TC  802

seq1: chr12_12715426_12716435
seq2: B6Ng01-146D11.g_71_1080

seq1  GAATTCAGAGCCCAGAAGGCTGAAACAGGACCACCATTGGCTTGAGGCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGCCCAGAAGGCTGAAACAGGACCACCATTGGCTTGAGGCCA  50

seq1  GCCTGGGCAACATAGCAACTTCCAGGTCACCTTTGACTACATAATGAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGCAACATAGCAACTTCCAGGTCACCTTTGACTACATAATGAGAC  100

seq1  CTCATAGCAAAGCAATACAGAAACAAAAAAACCACACAGAGAACAAAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAGCAAAGCAATACAGAAACAAAAAAACCACACAGAGAACAAAGAA  150

seq1  CAAGATTAAAGAGCAAACTACAGAGCAGTAGACAGCTCGAGTCAGCCAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATTAAAGAGCAAACTACAGAGCAGTAGACAGCTCGAGTCAGCCAGC  200

seq1  GAGATGAACAAATTAACCTGTAGCCTGTGTAAAGTTATAAAGAAATGGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGAACAAATTAACCTGTAGCCTGTGTAAAGTTATAAAGAAATGGTC  250

seq1  TCCGACTCGTTCTTCAGTTTCTCAATCAGCAAAGTATGTGGAAGAATGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGACTCGTTCTTCAGTTTCTCAATCAGCAAAGTATGTGGAAGAATGCA  300

seq1  TGGGTCAAAACAGAGTCGAGGCAACTTTGGAAAATGAATACACACAGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCAAAACAGAGTCGAGGCAACTTTGGAAAATGAATACACACAGAAG  350

seq1  GCTGGCTATTGTTTCCATGGTTATGGCGGTGCTGATCCAGGGCTTTGTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCTATTGTTTCCATGGTTATGGCGGTGCTGATCCAGGGCTTTGTCC  400

seq1  TGCAAACGAGGGGAAATCTCTGGGAGAGGTGGCTGAAGACCTGCTTCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACGAGGGGAAATCTCTGGGAGAGGTGGCTGAAGACCTGCTTCTTC  450

seq1  GCAGTAAAGGCTGTAGAAGGTTAATCAGATGGTGAGCCCAGTCACCAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTAAAGGCTGTAGAAGGTTAATCAGATGGTGAGCCCAGTCACCAAGA  500

seq1  TTAAGAGAAAGAAAATCCCTCCAACCGCCTTTGAATTCCAGTTATGTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGAAAGAAAATCCCTCCAACCGCCTTTGAATTCCAGTTATGTGTA  550

seq1  CGTTTTCTTTGAACTGGCGATTCGACTCTCTCTCTCTCTTGGAGAGAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTTCTTTGAACTGGCGATTCGACTCTCTCTCTCTCTTGGAGAGAGAA  600

seq1  CAAAGCGGGTGGTGTGGAACTCAAATCTCATTTACAACTTAATTTTGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCGGGTGGTGTGGAACTCAAATCTCATTTACAACTTAATTTTGAAA  650

seq1  CTGAGGAGATTTGCAATGTTGGAAAGGCAGGGAGCAGGAAATCAACTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGAGATTTGCAATGTTGGAAAGGCAGGGAGCAGGAAATCAACTTCA  700

seq1  GAGTAATTGCTCCGTCGTCTTTTAAACATAAGGCGGTGCACTGCTATTTT  750
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAATTGCTCCGTCGTTTTTTAAACATAAGGCGGTGCACTGCTATTTT  750

seq1  TGCTGATGTA-TTCAAATGAGAGGATGCCACAGCTGCGGGGTGTCTAAGG  799
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGCTGATGTATTTCAAATGAGAGGATGCCACAGCTGCGGGGTGTCT-AGG  799

seq1  GATCAGGGATGGCACCGCCTGCAGACTGGGAGGAAATCGTGGGCCAAAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GATCAGGGATGGCACCGCCTGCAGACTGGGAGG-AATCGTGGGCCAAAGT  848

seq1  GAGTCTGTCTCCCAACTCCAGCAAGCTAGAGGCCAGAG-AAGAGTGAGAT  898
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GAGTCTGTCTCTCAACTCCAGCAAGCTAGAGGCCAGAGAAAGAGTGAGAT  898

seq1  TTCCCCAGC-TCCTGTCACACGCTGCAGAATGCCAGGGAGCACAGAGTAG  947
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAGCTTCCTGTCACACGCTGCAGAATGCCAGGGAGCACAGAGTAG  948

seq1  AATAATGACTCAGAGCATGTTCTTGCTTCACAACTCCACATTGTGTTTAC  997
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  ATTAATGACTCAGAGCATGTTCTTGCTTCACAACTTCACATTGTG-TTAC  997

seq1  AGAGGCACAAAGG  1010
      |||||||||||||
seq2  AGAGGCACAAAGG  1010