BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153I22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 15,564,488 - 15,698,696
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMap1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
Downstream geneLOC217409, Trib2, LOC100043268, EG432636, LOC100043273, Lpin1, Ntsr2, Greb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153I22.bB6Ng01-153I22.g
ACCDH948836DH948837
length1,069184
definitionDH948836|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153I22, 5' end.DH948837|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153I22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,697,632 - 15,698,696)(15,564,488 - 15,564,671)
sequence
gaattcaaatcaatatgttgggtgccattttgttgcggcaaatctccgca
tcccatatatgtcccggcaatgaaaacacaacacagctaatattatatgc
tgtgtacctagattgggcagatctaccgctgcactatcatcttccacagc
ttatgagaccccttagaacttgcagtttctccaggccatgtgcttctgct
caggttttctccttcttccttctcctctgtgttctctccctcttccattt
tctccttcttctccccccacttcacttctgctccaacttcccttttatct
gccaaaccatcagctctcccttatttttataaattaaggtgggaagcagg
tttacctgaaattacctgagtgctgactcattccttgttcacaaccactc
ataggagaatggaattaacatcaaatataattagccccagggctatccac
aacagggctgtaggtccttgtgttagtggcttgttgctctgttagcaaca
aacagctctgtaggaaagggtcttataatgctgggttccagaagcttcat
cagggaaatatgctgatgttccagctcctgggtgggtgttgggatcctcc
agtactacagaggctagggttgtgctattggagctatggtaggatgttgg
gaccttcatttcttgtcagtggctcatgatatggagaagtctgacacaag
ctgattgaggcatttatggctagtgttgattcctctggagtcagagctat
gttcaggaagtagatgtaatattactacaactttttcaggatgttagtgg
tgttttttcagaacagcaaggctaacatgggggacagtctaaccagctgt
cttaagaggggctgcatgactgatgatcttttcactcagggcaagtaggc
atcagtaaagagctcatcaactgttaatgaggaagtcagttttcctagct
ctcagaatcttaacatggccatactggaatagtacctgatatggggctgt
ccctagccaaaaagaaccaacctttacatgtgaaattaaaaaactttgcc
tcttctccccgtcctttct
aatacactagtgagagtctaaagacatgtgtgtgcatggcacgggatggg
gggcatgttatagtatctatactttggtagtgtagagcctatagtatgta
atgtgtatggtgtaacttctatgtggtgtgggctatatgatatggtctat
acggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_15697632_15698696
seq2: B6Ng01-153I22.b_42_1110 (reverse)

seq1  AGAAAGGACGGGGAG-AGAGGAGAAGTTATCTATACTACA-GTGTAAA-G  47
      ||||||||||||||| |||||  ||||| | || | | ||  |||||| |
seq2  AGAAAGGACGGGGAGAAGAGGCAAAGTTTTTTA-ATTTCACATGTAAAGG  49

seq1  CTGGTTCATCTTTGGCTAAGATCAGCACACTATCAGGTACTATTACAGTA  97
       |||||| | |||||||| |  |||| |  |||||||||||||| |||||
seq2  TTGGTTC-TTTTTGGCTAGGGACAGCCCCATATCAGGTACTATTCCAGTA  98

seq1  TGGCCATGTTAAGATTCTGAGAGCTAGGAAAACTTGACTTCCTCATTAAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGGCCATGTTAAGATTCTGAGAGCTAGGAAAAC-TGACTTCCTCATTAAC  147

seq1  AGTTGTTGAGCTCTTTACTGATGCCTACTTGCCCTGAGTG-AAAGATCAT  196
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGTTGATGAGCTCTTTACTGATGCCTACTTGCCCTGAGTGAAAAGATCAT  197

seq1  CAGTCATGCAGCCCCTCTT-AGACAGCTGGTTAGACTGT-CCCCATGTTA  244
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAGTCATGCAGCCCCTCTTAAGACAGCTGGTTAGACTGTCCCCCATGTTA  247

seq1  GCCTTGCTGTTCTG-AAAAACACCACTAACATCCTGAAAAAGTTGTAGTA  293
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCTGTTCTGAAAAAACACCACTAACATCCTGAAAAAGTTGTAGTA  297

seq1  ATATTACATCTACTTCCTGAACATAGCTCTGACTCCAGAGGGATCAACAC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATATTACATCTACTTCCTGAACATAGCTCTGACTCCAGAGGAATCAACAC  347

seq1  TAGCCATAAATGCCTCAATCAGCTTGTGTCAGACTTCTCCATATCATGAG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATAAATGCCTCAATCAGCTTGTGTCAGACTTCTCCATATCATGAG  397

seq1  CCACTGACAAGAAATGAAGGTCCCAACATCCTACCATAGCTCCAATAGCA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGACAAGAAATGAAGGTCCCAACATCCTACCATAGCTCCAATAGCA  447

seq1  CAACCCTAGCCTCTGTAGTACTGGAGGATCCCAACACCCACCCAGGAGCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCTAGCCTCTGTAGTACTGGAGGATCCCAACACCCACCCAGGAGCT  497

seq1  GGAACATCAGCATATTTCCCTGATGAAGCTTCTGGAACCCAGCATTATAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATCAGCATATTTCCCTGATGAAGCTTCTGGAACCCAGCATTATAA  547

seq1  GACCCTTTCCTACAGAGCTGTTTGTTGCTAACAGAGCAACAAGCCACTAA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCTTTCCTACAGAGCTGTTTGTTGCTAACAGAGCAACAAGCCACTAA  597

seq1  CACAAGGACCTACAGCCCTGTTGTGGATAGCCCTGGGGCTAATTATATTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGGACCTACAGCCCTGTTGTGGATAGCCCTGGGGCTAATTATATTT  647

seq1  GATGTTAATTCCATTCTCCTATGAGTGGTTGTGAACAAGGAATGAGTCAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTAATTCCATTCTCCTATGAGTGGTTGTGAACAAGGAATGAGTCAG  697

seq1  CACTCAGGTAATTTCAGGTAAACCTGCTTCCCACCTTAATTTATAAAAAT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGGTAATTTCAGGTAAACCTGCTTCCCACCTTAATTTATAAAAAT  747

seq1  AAGGGAGAGCTGATGGTTTGGCAGATAAAAGGGAAGTTGGAGCAGAAGTG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAGAGCTGATGGTTTGGCAGATAAAAGGGAAGTTGGAGCAGAAGTG  797

seq1  AAGTGGGGGGAGAAGAAGGAGAAAATGGAAGAGGGAGAGAACACAGAGGA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGGGGGAGAAGAAGGAGAAAATGGAAGAGGGAGAGAACACAGAGGA  847

seq1  GAAGGAAGAAGGAGAAAACCTGAGCAGAAGCACATGGCCTGGAGAAACTG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGAAGGAGAAAACCTGAGCAGAAGCACATGGCCTGGAGAAACTG  897

seq1  CAAGTTCTAAGGGGTCTCATAAGCTGTGGAAGATGATAGTGCAGCGGTAG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCTAAGGGGTCTCATAAGCTGTGGAAGATGATAGTGCAGCGGTAG  947

seq1  ATCTGCCCAATCTAGGTACACAGCATATAATATTAGCTGTGTTGTGTTTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCCCAATCTAGGTACACAGCATATAATATTAGCTGTGTTGTGTTTT  997

seq1  CATTGCCGGGACATATATGGGATGCGGAGATTTGCCGCAACAAAATGGCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCCGGGACATATATGGGATGCGGAGATTTGCCGCAACAAAATGGCA  1047

seq1  CCCAACATATTGATTTGAATTC  1065
      ||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACATATTGATTTGAATTC  1069

seq1: chr12_15564488_15564671
seq2: B6Ng01-153I22.g_77_260

seq1  AATACACTAGTGAGAGTCTAAAGACATGTGTGTGCATGGCACGGGATGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACACTAGTGAGAGTCTAAAGACATGTGTGTGCATGGCACGGGATGGG  50

seq1  GGGCATGTTATAGTATCTATACTTTGGTAGTGTAGAGCCTATAGTATGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGTTATAGTATCTATACTTTGGTAGTGTAGAGCCTATAGTATGTA  100

seq1  ATGTGTATGGTGTAACTTCTATGTGGTGTGGGCTATATGATATGGTCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTATGGTGTAACTTCTATGTGGTGTGGGCTATATGATATGGTCTAT  150

seq1  ACGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  184