BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159P14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 7,909,931 - 8,034,934
singlet/doubletdoublet
Overlap geneApob
Upstream geneLOC668380, EG668388
Downstream gene1110057K04Rik, Gdf7, Hs1bp3, BC106175, Rhob, Slc7a15, LOC100043154, Pum2, F730043H23, Sdc1, Laptm4a, Matn3, Wdr35
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159P14.bB6Ng01-159P14.g
ACCDH953482DH953483
length1,228909
definitionDH953482|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159P14, 5' end.DH953483|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159P14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,909,931 - 7,911,169)(8,034,032 - 8,034,934)
sequence
gaattcttgttttctctggaaaccctagaaaaagtaagaatactgtggtc
atccatctctttgatgacttttcgagccaatacaatatgcctgagggata
gctctggtatagaaaacccaagaatgtaggcaaatgatttaagagaagga
gtacctgattttatatagcatatataccccaacttagtgattgtgtacaa
atgaacactacaaaataaggtgtataaacttattatacccaagatctgat
tgttgccactgtctacctgttaaaaaaattgctaactatatgttgcagat
gaatgaactatagtgtgtgatgtcatataatcactgaaataaaaagtctt
ggggaaagcatatggaaaataatagtatatttctgcatatatctattaaa
taaggcacttgtataaagggtaaaacatgcaatttgttaatttttttaag
ctttttaggaattaagaaaatgggtaagctagtgtctaagtaaaaattta
tttttcaaggcaagtagtctaattttagtacttaaaaaaaaaaggtccaa
gtatctgggtgacccatccatcaatcattagagatatgagaatttaagga
tcactaaattcaatcatgccttcttaccttaacagtgtctctcacctgtg
ataacaagtagggacatgattattgttattaatttatgtttgtttctcca
acacgatttatggaaacaatgccaaacacattgtctatcctcagtgaatc
caaatgagtgattgaagaggcaaatgtacgcatgcataggttgtatttgg
agttctgagagttctggtctaccaaggcacagagcaggaaaggagctatg
acagtggatgggcagcgtgctggcgaccacaggtgttccttgggtttgca
ggttgtctcctctctcttttcctccattttcttcaagttatgttttataa
acataaaaataaatataaaccttaactgagactataacacagagcatctg
actgctgtacccacattcttctcaagggcaatgatttttctagcacacaa
ttttggtagtaggtaagttccttcattctcagtaacaatgaagaaacagc
acacaagctctttctcagagcccaccaatgggaacataatttttctttct
ggtggcccacctaaatttactctaactgttccattccaacgttacaactt
tggtcacagctcaaaggcatttctctcc
gaattcattcatatctatccttggtcttcatgtggaacacaagttgggcg
caccttctagacactgagagggagaggacaagtagagaatgttctgtctt
ggaatccacaacccctctactgtgcaagattcccatctctgcttttgaga
gaagacaagtgtccagggtgactctttagtcattcaccttgtcccagtaa
aataacttgaatatcttgttaaacagagtctgtaaaaatcatggtagggg
gaatcattgtccccattttatttgtaaaatgagggagaattgtttttaat
gatgcctgtagttaggactggttagcttaccggaaggacaaatgtttaca
aattggataactgctttgatttttctgaagggttacagctgcaccgtgga
tgttctaccattatcccatgtgccactcacatgagagtgctgtggccaca
gatttcaattcatcccacagtgatggtggcttctcatactttgtagggaa
gactgggttgggggtggggggcaagttgaaagaaaatagaaagagataca
gagatgggaacagatggctcacagggacaggcatgttgtaggaatgtcca
gaaaacttcagggatgtgtgtgagatgaggcttaatggatccatctatat
gttaaagagggcatggctggacaactctgcagactcaggcagccagcatt
taggaacagcaacttctgtgcttataagtcctgatgcttggatttgctta
aaacagggcatactattgtataactcaaaagctcaggatgtcagatcata
agattgctgacttaaaaagttgtgggttcttgtcagaggtaacacagcct
gtggtaagcagccctacagactgctactgcttctggtataagaaacctgt
tttataaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_7909931_7911169
seq2: B6Ng01-159P14.b_48_1275

seq1  GAATTCTTGTTTTCTCTGGAAACCCTAGAAAAAGTAAGAATACTGTGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTTTTCTCTGGAAACCCTAGAAAAAGTAAGAATACTGTGGTC  50

seq1  ATCCATCTCTTTGATGACTTTTCGAGCCAATACAATATGCCTGAGGGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCTCTTTGATGACTTTTCGAGCCAATACAATATGCCTGAGGGATA  100

seq1  GCTCTGGTATAGAAAACCCAAGAATGTAGGCAAATGATTTAAGAGAAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGGTATAGAAAACCCAAGAATGTAGGCAAATGATTTAAGAGAAGGA  150

seq1  GTACCTGATTTTATATAGCATATATACCCCAACTTAGTGATTGTGTACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTGATTTTATATAGCATATATACCCCAACTTAGTGATTGTGTACAA  200

seq1  ATGAACACTACAAAATAAGGTGTATAAACTTATTATACCCAAGATCTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACACTACAAAATAAGGTGTATAAACTTATTATACCCAAGATCTGAT  250

seq1  TGTTGCCACTGTCTACCTGTTAAAAAAATTGCTAACTATATGTTGCAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCACTGTCTACCTGTTAAAAAAATTGCTAACTATATGTTGCAGAT  300

seq1  GAATGAACTATAGTGTGTGATGTCATATAATCACTGAAATAAAAAGTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAACTATAGTGTGTGATGTCATATAATCACTGAAATAAAAAGTCTT  350

seq1  GGGGAAAGCATATGGAAAATAATAGTATATTTCTGCATATATCTATTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAGCATATGGAAAATAATAGTATATTTCTGCATATATCTATTAAA  400

seq1  TAAGGCACTTGTATAAAGGGTAAAACATGCAATTTGTTAATTTTTTTAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCACTTGTATAAAGGGTAAAACATGCAATTTGTTAATTTTTTTAAG  450

seq1  CTTTTTAGGAATTAAGAAAATGGGTAAGCTAGTGTCTAAGTAAAAATTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAGGAATTAAGAAAATGGGTAAGCTAGTGTCTAAGTAAAAATTTA  500

seq1  TTTTTCAAGGCAAGTAGTCTAATTTTAGTACTTAAAAAAAAAAGGTCCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCAAGGCAAGTAGTCTAATTTTAGTACTTAAAAAAAAAAGGTCCAA  550

seq1  GTATCTGGGTGACCCATCCATCAATCATTAGAGATATGAGAATTTAAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTGGGTGACCCATCCATCAATCATTAGAGATATGAGAATTTAAGGA  600

seq1  TCACTAAATTCAATCATGCCTTCTTACCTTAACAGTGTCTCTCACCTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAAATTCAATCATGCCTTCTTACCTTAACAGTGTCTCTCACCTGTG  650

seq1  ATAACAAGTAGGGACATGATTATTGTTATTAATTTATGTTTGTTTCTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAGTAGGGACATGATTATTGTTATTAATTTATGTTTGTTTCTCCA  700

seq1  ACACGATTTATGGAAACAATGCCAAACACATTGTCTATCCTCAGTGAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGATTTATGGAAACAATGCCAAACACATTGTCTATCCTCAGTGAATC  750

seq1  CAAATGAGTGATTGAAGAGGCAAATGTACGCATGCATAGGTTGTATTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAGTGATTGAAGAGGCAAATGTACGCATGCATAGGTTGTATTTGG  800

seq1  AGTTCTGAGAGTTCTGGTCTACCAAGGCACAGAGCAGGGAAGGAGCTATG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGTTCTGAGAGTTCTGGTCTACCAAGGCACAGAGCAGGAAAGGAGCTATG  850

seq1  ACAGTGGATGGGCAGCGTGCTGGCGACCACAGGTGTTCCTTGGGTTTGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGGATGGGCAGCGTGCTGGCGACCACAGGTGTTCCTTGGGTTTGCA  900

seq1  GGTTGTCTCCTCTCTCTTTTCCTCCATTTTCTCCAAGGTTATGTTTTATA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  GGTTGTCTCCTCTCTCTTTTCCTCCATTTTCTTCAA-GTTATGTTTTATA  949

seq1  AACATAAAAATAAATATAAACCTTAACTGAGACTATAACACAGAGCATCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAAAAATAAATATAAACCTTAACTGAGACTATAACACAGAGCATCT  999

seq1  GACTGCTGTTACCCACATTCTTCTCAGGGGCAATGATTTTCTTAGCACAC  1050
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||
seq2  GACTGCTG-TACCCACATTCTTCTCAAGGGCAATGATTTTTCTAGCACAC  1048

seq1  AAATTTTTGGTAGTAGGTAAGTTCCTTCA-TCTCAGTAACCAATG-AGAA  1098
      ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||
seq2  AA--TTTTGGTAGTAGGTAAGTTCCTTCATTCTCAGTAA-CAATGAAGAA  1095

seq1  ACAGCCAACACAGCTC-TTCTCAGAGCCCACC-ATTGAAACATTAATTTT  1146
      |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||
seq2  ACAGCACACA-AGCTCTTTCTCAGAGCCCACCAATGGGAACA-TAATTTT  1143

seq1  CTTTTCTTGTTGCCCAGCTTAATATTTCATCTAACTGTTCCACATCCAAC  1196
        ||||| || ||||| ||  | ||||  |||||||||||||  ||||||
seq2  TCTTTCTGGTGGCCCACCT--AAATTTACTCTAACTGTTCCA-TTCCAAC  1190

seq1  ATGTTACATACTTTGGTCACAGCTACAAATGCATTTCCTCTCC  1239
        |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||
seq2  --GTTACA-ACTTTGGTCACAGCT-CAAAGGCATTT-CTCTCC  1228

seq1: chr12_8034032_8034934
seq2: B6Ng01-159P14.g_69_977 (reverse)

seq1  TTTTAT-AAACAGGTTTC-TCTACCAGAAGCAGTAGCAGTCTGTA-GGCT  47
      |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTTTATAAAACAGGTTTCTTATACCAGAAGCAGTAGCAGTCTGTAGGGCT  50

seq1  GC-TACCACAGGCTGTGTGACCTCTGACAAG-ACCCACAAC-TTCTAAGT  94
      || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||
seq2  GCTTACCACAGGCTGTGTTACCTCTGACAAGAACCCACAACTTTTTAAGT  100

seq1  CAGCATTCTTATGATCTGACATCCTGAGC-TTTGAGTTATACAATAGTAT  143
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATCTTATGATCTGACATCCTGAGCTTTTGAGTTATACAATAGTAT  150

seq1  GCCCTGTTTTAAGCAAATCCAAAGCATCAGGACTTATAAGCACAGAAGTT  193
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGTTTTAAGCAAATCC-AAGCATCAGGACTTATAAGCACAGAAGTT  199

seq1  GCTGTTCCTAAATGCTGGCTGCCTGAGTCTGCAGAGTTGTCCAGCCATGC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTCCTAAATGCTGGCTGCCTGAGTCTGCAGAGTTGTCCAGCCATGC  249

seq1  CCTCTTTAACATATAGATGGATCCATTAAGCCTCATCTCACACACATCCC  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTTAACATATAGATGGATCCATTAAGCCTCATCTCACACACATCCC  299

seq1  TGAAGTTTTCTGGACATTCCTACAACATGCCTGTCCCTGTGAGCCATCTG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTTTCTGGACATTCCTACAACATGCCTGTCCCTGTGAGCCATCTG  349

seq1  TTCCCATCTCTGTATCTCTTTCTATTTTCTTTCAACTTGCCCCCCACCCC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATCTCTGTATCTCTTTCTATTTTCTTTCAACTTGCCCCCCACCCC  399

seq1  CAACCCAGTCTTCCCTACAAAGTATGAGAAGCCACCATCACTGTGGGATG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCAGTCTTCCCTACAAAGTATGAGAAGCCACCATCACTGTGGGATG  449

seq1  AATTGAAATCTGTGGCCACAGCACTCTCATGTGAGTGGCACATGGGATAA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAAATCTGTGGCCACAGCACTCTCATGTGAGTGGCACATGGGATAA  499

seq1  TGGTAGAACATCCACGGTGCAGCTGTAACCCTTCAGAAAAATCAAAGCAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGAACATCCACGGTGCAGCTGTAACCCTTCAGAAAAATCAAAGCAG  549

seq1  TTATCCAATTTGTAAACATTTGTCCTTCCGGTAAGCTAACCAGTCCTAAC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCAATTTGTAAACATTTGTCCTTCCGGTAAGCTAACCAGTCCTAAC  599

seq1  TACAGGCATCATTAAAAACAATTCTCCCTCATTTTACAAATAAAATGGGG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGCATCATTAAAAACAATTCTCCCTCATTTTACAAATAAAATGGGG  649

seq1  ACAATGATTCCCCCTACCATGATTTTTACAGACTCTGTTTAACAAGATAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGATTCCCCCTACCATGATTTTTACAGACTCTGTTTAACAAGATAT  699

seq1  TCAAGTTATTTTACTGGGACAAGGTGAATGACTAAAGAGTCACCCTGGAC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTATTTTACTGGGACAAGGTGAATGACTAAAGAGTCACCCTGGAC  749

seq1  ACTTGTCTTCTCTCAAAAGCAGAGATGGGAATCTTGCACAGTAGAGGGGT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTCTTCTCTCAAAAGCAGAGATGGGAATCTTGCACAGTAGAGGGGT  799

seq1  TGTGGATTCCAAGACAGAACATTCTCTACTTGTCCTCTCCCTCTCAGTGT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATTCCAAGACAGAACATTCTCTACTTGTCCTCTCCCTCTCAGTGT  849

seq1  CTAGAAGGTGCGCCCAACTTGTGTTCCACATGAAGACCAAGGATAGATAT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGGTGCGCCCAACTTGTGTTCCACATGAAGACCAAGGATAGATAT  899

seq1  GAATGAATTC  903
      ||||||||||
seq2  GAATGAATTC  909