BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-160I18
Chromosome12 (Build37)
Map Location 77,479,919 - 77,637,950
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZbtb1, Hspa2, Gm70, LOC100041694, Plekhg3
Upstream geneRhoj, Gphb5, Ppp2r5e, Wdr89, LOC665931, Sgpp1, Syne2, Esr2, LOC665957, Tex21, Mthfd1, Akap5, Zbtb25
Downstream geneSpnb1, Churc1, Gpx2, Rab15, Fntb, Max, LOC100041765, LOC100041772, Fut8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-160I18.bB6Ng01-160I18.g
ACCDH953891DH953892
length1,0701,025
definitionDH953891|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160I18, 5' end.DH953892|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160I18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,479,919 - 77,480,997)(77,636,917 - 77,637,950)
sequence
gaattcaggacccagtccttagttgatgatctttgccgaagaccacacta
gaaagtaccaagacggttttagtgccatctgaggtacataggaatacttg
tctatagtcccagcacctagtttacctcagttagctacatcctgatagaa
tgtttgacagtcctacatgtttgatttctataagactcttgaacttagat
taagatctgttctctataggtttatggctgtctgaattgcttactacagc
tgatgagtttcttgagcattttgacatttaaaataagctggtaaacattt
tcaaagtaagtttcagttgtagtgtcaaatgcactggctctctgcctcct
taatgctggtactgacctgggtatcagacctttgagtgacagttgagggt
ttgactttctgtcccagcccaactgacagctctgataaacatgttcttcc
agtgatagctggtaacgcaaacaagtagtaacagattttaatcacaaaaa
tcagagcaggtaaaatataaggactgtttatgtaaataaacttctggaaa
gttggctcagtggataagagcactgactgctcttgcagaggtcctgagtt
caattcccagcaaccacatggtggctcacaaccatctgatgccctctttg
gtgtgtctgaagaccggacagtacactcatatacataaaataattccttt
taaaaaaaaaaagacttcatgataagctacataataaaaacttactaaat
tctggtgactttgttgtttgtttgtttgacaaaacaaagcaggtctcact
gtgtagcctttgactggcctggaactcactatgtaggcctttgtctggta
ctcatgaatctttccatctgcctcccagcagtgggataaagtgacactca
ggaatgtttcttgggaatctgttgattttatatttgtgtgcatgatgttt
ccctctgtgaatgttgatgcatgtggtgcctgttgccacctgaggcctga
agagggcatcagagccctagaactgcgtaccaggcagtgtgtatctgcct
gtgagtggttaggagtgagt
gaattccaaagccaggcaggccagggctgccctaggtcaccctgtctatc
tgagggacagtggccagcacacatctgggagtcctgaatcctcaaccagc
tacaatccagggtagcatggagaggctcactcactaccagacagacagaa
gccttctagcggccctccttttgaattccctgctccttcccaatacttca
aaaatgcctctcacccagagtcctggctagcacttggcaggacatatcta
tcccctgccgcctctggagaaagaattcactgtggcgcgcagctctgtgg
ggcttggtaagcgctgtagatgctctatctctttgttcactctcacaagg
ccacaccacatgcagtaggcccggatgactagctccactcttccaggtaa
gaaatagacatgaaggagtcaacaaatggctgcagggctaggaagttgtc
aagtcgagatttaaacctagggctgtgcaactccaaaccctgctcctaaa
atcacatcagaatgctgacctgggtctcaagggatccagagctcaaagaa
aatatctcatgatcaacaccaaagtcccttccttaggggacagctgtcac
ctcctcccgtcctcaaccattcatattgaccttctctggcatgccttcct
gataactttaaactcgctttcaatgacctgtcttgttttccgtccacttc
ccccagtagaattccactctgccaggtcaacaattgctaaaaaaaaaaaa
aaaaactatatttcagtcactgccgtgttccctggtgccctgtattcata
catagacgctgctagataaaaatggatgaataaattaaatagatctaaga
tgcatggatgtagaagaggagggatagaggacaacagagatggtatgtac
cggcagtactggaggcctcgggatgagcctcccgggtctgtcggacctgg
ggctccagagagcctttcctcatctgtagtatgccaagccctgttctgag
gagaggtaatgagatagggagggct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_77479919_77480997
seq2: B6Ng01-160I18.b_44_1113

seq1  GAATTCAGGACCCAGTCCTTAGTTGATGATCTTTGCCGAAGACCACACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGACCCAGTCCTTAGTTGATGATCTTTGCCGAAGACCACACTA  50

seq1  GAAAGTACCAAGACGGTTTTAGTGCCATCTGAGGTACATAGGAATACTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTACCAAGACGGTTTTAGTGCCATCTGAGGTACATAGGAATACTTG  100

seq1  TCTATAGTCCCAGCACCTAGTTTACCTCAGTTAGCTACATCCTGATAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGTCCCAGCACCTAGTTTACCTCAGTTAGCTACATCCTGATAGAA  150

seq1  TGTTTGACAGTCCTACATGTTTGATTTCTATAAGACTCTTGAACTTAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGACAGTCCTACATGTTTGATTTCTATAAGACTCTTGAACTTAGAT  200

seq1  TAAGATCTGTTCTCTATAGGTTTATGGCTGTCTGAATTGCTTACTACAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATCTGTTCTCTATAGGTTTATGGCTGTCTGAATTGCTTACTACAGC  250

seq1  TGATGAGTTTCTTGAGCATTTTGACATTTAAAATAAGCTGGTAAACATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAGTTTCTTGAGCATTTTGACATTTAAAATAAGCTGGTAAACATTT  300

seq1  TCAAAGTAAGTTTCAGTTGTAGTGTCAAATGCACTGGCTCTCTGCCTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGTAAGTTTCAGTTGTAGTGTCAAATGCACTGGCTCTCTGCCTCCT  350

seq1  TAATGCTGGTACTGACCTGGGTATCAGACCTTTGAGTGACAGTTGAGGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCTGGTACTGACCTGGGTATCAGACCTTTGAGTGACAGTTGAGGGT  400

seq1  TTGACTTTCTGTCCCAGCCCAACTGACAGCTCTGATAAACATGTTCTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTTCTGTCCCAGCCCAACTGACAGCTCTGATAAACATGTTCTTCC  450

seq1  AGTGATAGCTGGTAACGCAAACAAGTAGTAACAGATTTTAATCACAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATAGCTGGTAACGCAAACAAGTAGTAACAGATTTTAATCACAAAAA  500

seq1  TCAGAGCAGGTAAAATATAAGGACTGTTTATGTAAATAAACTTCTGGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGCAGGTAAAATATAAGGACTGTTTATGTAAATAAACTTCTGGAAA  550

seq1  GTTGGCTCAGTGGATAAGAGCACTGACTGCTCTTGCAGAGGTCCTGAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCTCAGTGGATAAGAGCACTGACTGCTCTTGCAGAGGTCCTGAGTT  600

seq1  CAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGATGCCCTCTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGATGCCCTCTTTG  650

seq1  GTGTGTCTGAAGACCGGACAGTACACTCATATACATAAAATAATTCCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCTGAAGACCGGACAGTACACTCATATACATAAAATAATTCCTTT  700

seq1  TAAAAAAAAAAAGACTTCATGATAAGCTACATAATAAAAACTTACTAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAAAAAAAGACTTCATGATAAGCTACATAATAAAAACTTACTAAAT  750

seq1  TCTGGTGACTTTGTTGTTTGTTTGTTTGACAAAACAAAGCAGGGTCTCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCTGGTGACTTTGTTGTTTGTTTGTTTGACAAAACAAAGCA-GGTCTCAC  799

seq1  TGTGTAGCCCTTGACTGGCCTGGAACTCACTATGTAGGCCTTTGTCTGGT  850
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGCCTTTGACTGGCCTGGAACTCACTATGTAGGCCTTTGTCTGGT  849

seq1  ACTCATGAATCTTTCCATCTGCCTCCCAGCAGTGGGATTAAAGTGACACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACTCATGAATCTTTCCATCTGCCTCCCAGCAGTGGGA-TAAAGTGACACT  898

seq1  CAGGAATGTTTCCTTGGGATCTGTTGATTTTATTATTTTGTGTGCATGAG  950
      |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||| 
seq2  CAGGAATGTTTCTTGGGAATCTGTTGATTTTAT--ATTTGTGTGCATGA-  945

seq1  TGTTTTCCCTCTGTGTATGTTGGATGCATGT-GTGCCTGTTGCCCACTGA  999
      || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||
seq2  TG-TTTCCCTCTGTGAATGTT-GATGCATGTGGTGCCTGTTGCCACCTGA  993

seq1  GGTCTGAAGAGGGCATCAGAGCCCCTAGAACTGCAGTTACAGGCAGTTGT  1049
      || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||
seq2  GGCCTGAAGAGGGCATCAGAG-CCCTAGAACTGC-GTACCAGGCAG-TGT  1040

seq1  GAATCGCCATGTGAGT-GCTAGGAGTTGAGT  1079
      | |||  | ||||||| | |||||| |||||
seq2  GTATCTGCCTGTGAGTGGTTAGGAG-TGAGT  1070

seq1: chr12_77636917_77637950
seq2: B6Ng01-160I18.g_67_1091 (reverse)

seq1  AGCCCTCCCTA-CTCATTACCCTCCTTCCCCAGGACAGGGCTTGGCATTA  49
      ||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||
seq2  AGCCCTCCCTATCTCATTA-CCTC--TCCTCAGAACAGGGCTTGGCA-TA  46

seq1  CTACAGACTGAAGGAAAGCTCTTCTGGAGCCCCCAGGTCCGACAGACCCG  99
      ||||||| ||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGA-TGAGGAAAGGCTC-TCTGGAG-CCCCAGGTCCGACAGACCCG  93

seq1  GGAGGCTCATCCCGAGGCCTCCAGTACTGCCGGGTACATACCATCTCTGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTCATCCCGAGGCCTCCAGTACTGCC-GGTACATACCATCTCTGT  142

seq1  TGTCCTCTTTCCCTCCTCCTTCCTACATCCATGCATCTTAGATCTATTTT  199
      |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTCCTCTATCCCTCCTC--TTCTACATCCATGCATCTTAGATCTATTTA  190

seq1  ATTTATTCATCCATTTTTATCTAGCAGCGTCTATGTATGAATACAGGGCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTCATCCATTTTTATCTAGCAGCGTCTATGTATGAATACAGGGCA  240

seq1  CCAGGGAACACGGCAGTGACTGAAATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAACACGGCAGTGACTGAAATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAGC  290

seq1  AATTGTTGACCTGGCAGAGTGGAATTCTACTGGGGGAAGTGGACGGAAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTTGACCTGGCAGAGTGGAATTCTACTGGGGGAAGTGGACGGAAAA  340

seq1  CAAGACAGGTCATTGAAAGCGAGTTTAAAGTTATCAGGAAGGCATGCCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACAGGTCATTGAAAGCGAGTTTAAAGTTATCAGGAAGGCATGCCAG  390

seq1  AGAAGGTCAATATGAATGGTTGAGGACGGGAGGAGGTGACAGCTGTCCCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTCAATATGAATGGTTGAGGACGGGAGGAGGTGACAGCTGTCCCC  440

seq1  TAAGGAAGGGACTTTGGTGTTGATCATGAGATATTTTCTTTGAGCTCTGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAAGGGACTTTGGTGTTGATCATGAGATATTTTCTTTGAGCTCTGG  490

seq1  ATCCCTTGAGACCCAGGTCAGCATTCTGATGTGATTTTAGGAGCAGGGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTTGAGACCCAGGTCAGCATTCTGATGTGATTTTAGGAGCAGGGTT  540

seq1  TGGAGTTGCACAGCCCTAGGTTTAAATCTCGACTTGACAACTTCCTAGCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTGCACAGCCCTAGGTTTAAATCTCGACTTGACAACTTCCTAGCC  590

seq1  CTGCAGCCATTTGTTGACTCCTTCATGTCTATTTCTTACCTGGAAGAGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCCATTTGTTGACTCCTTCATGTCTATTTCTTACCTGGAAGAGTG  640

seq1  GAGCTAGTCATCCGGGCCTACTGCATGTGGTGTGGCCTTGTGAGAGTGAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAGTCATCCGGGCCTACTGCATGTGGTGTGGCCTTGTGAGAGTGAA  690

seq1  CAAAGAGATAGAGCATCTACAGCGCTTACCAAGCCCCACAGAGCTGCGCG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGATAGAGCATCTACAGCGCTTACCAAGCCCCACAGAGCTGCGCG  740

seq1  CCACAGTGAATTCTTTCTCCAGAGGCGGCAGGGGATAGATATGTCCTGCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGTGAATTCTTTCTCCAGAGGCGGCAGGGGATAGATATGTCCTGCC  790

seq1  AAGTGCTAGCCAGGACTCTGGGTGAGAGGCATTTTTGAAGTATTGGGAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTAGCCAGGACTCTGGGTGAGAGGCATTTTTGAAGTATTGGGAAG  840

seq1  GAGCAGGGAATTCAAAAGGAGGGCCGCTAGAAGGCTTCTGTCTGTCTGGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGGAATTCAAAAGGAGGGCCGCTAGAAGGCTTCTGTCTGTCTGGT  890

seq1  AGTGAGTGAGCCTCTCCATGCTACCCTGGATTGTAGCTGGTTGAGGATTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTGAGCCTCTCCATGCTACCCTGGATTGTAGCTGGTTGAGGATTC  940

seq1  AGGACTCCCAGATGTGTGCTGGCCACTGTCCCTCAGATAGACAGGGTGAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTCCCAGATGTGTGCTGGCCACTGTCCCTCAGATAGACAGGGTGAC  990

seq1  CTAGGGCAGCCCTGGCCTGCCTGGCTTTGGAATTC  1034
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGCAGCCCTGGCCTGCCTGGCTTTGGAATTC  1025