BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166I08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 14,200,151 - 14,331,333
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDdx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481, AW125753
Downstream geneLOC100043256, Map1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166I08.bB6Ng01-166I08.g
ACCDH958280DH958281
length1,1681,151
definitionDH958280|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166I08, 5' end.DH958281|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166I08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,200,151 - 14,201,316)(14,330,161 - 14,331,333)
sequence
gaattctgtgttttgtcttcttttgttcttctagtatgttccttgggcct
tactttgatggctgctgagagtcatatttctcttccttatacaccaatca
attaaagggagactaggggcttaaaaaaatacttacccactgtcccctgg
cagcaagtagctggtgagtgggtcagaaacggtaagagagtgtatgtata
gaccttgatacaataaggaacatgggaagctcatccattgattctccagt
ctgagtaatattcttcaaattgggttttatcaggaaaccccaggtgactg
gttcttatacaatttctaagaatagtaacgatgtcacattcacccttctg
attaccctatcttgagattactttcaaggttaaaactcggtgggtagaag
agagatttcttagctcctgccagccttagtgacacctgggacaaaattac
aatgattttaaagagaggcatgcagatggtgttaaaacactttccctgtt
ttaccacacctgtgacctgtgttactagccataccttctcacatatgcat
gcatgcatgcatgtttctggagtaaatgctggcatcttttagcacaatat
tcaacaaaaaattattgggtttctgtgaagtcggtcacttgtgccacagt
atatatatggcaatcgggggccacggtttgaagctctttctctccttctc
cctttatggaggtttagagctcaaactcaggtcaccaggctggtgcaggg
agtactttattttagtccatctcctcagccagttaaagctgagtgcttca
tcattataatcttcaaccaaaggagataacaacaatgtgcttcccccccc
atgtttaaaataagctttaaattcttgtcaggaagccagccagcctaatg
agatctttaaagatctggattataatcttgagatgttgtggtgaagagtt
gggccaatagattgctaaatggtctaagcagccaggagtctcttaaacac
caacttaaatcttaccattacactaaaatcttaccaatgtcactgagata
cattttgacatatgttactattcttctaaatatttcttatttacaatgat
tttagttcgttaaaggacccacaatccaagggaactgcctgctgataatt
tgtgttgttttgcctcgg
gaattccacccatttgtaagtctttgtgtgtgtatttagctgagggcact
ggagaagctgtaaactgtcaagaacgaggaaatactatagtcaaaggtgg
tggagtaggcatggtgatcttcaccttcatcagtgtatcccatgggcaat
atcttacaaatgcaaaaatctgctggcccatccagatatactcaatttct
agctccataagaataagtaggtaaaatgagattattttgtgaattgtctt
ctcccatggacacttaataattagttcctttttgttgttttgttttgttt
ttcaagacaaggtttctctgtatagccctggctgtcctggaactcacttt
gtagaccaggctggcctcgaactcagaaatctgcctgcctctgcctcccg
agtgctgggattaaaagtgtgcaatctaaagtatatttagatttacaaat
tttaaataattccttctatgcatctatcatattctcagcaaatctcaata
atctcagaaataatcactaggttccctgtaactgcatggctgactgcatg
tatgaagcttggactcctggaatgatacccctagcagtccccataggtat
ctgtgtgctttcttccctgttctttaaaagttccactcacatgttctctc
ttgcttctctctcactctgtctctctctctctgtgtgtctctctatctgt
ctatcttttctcttatacacacacacacaaacacacacacacacacacac
acacacagagagagagagagagagagaggctggaggctggaggctggaga
tgcatacactacctgtgagaagattcattctttttttttttttaatgaaa
aaccacataccctgaatgctggaactgaatgactccaagagagatgcgaa
ggggaacatgcatttggttgaactctcagcccaagctgttcttaaactca
aatgtctcaacttatggatatatatttttaaggtgaatatgtgtaccaga
aatatacactgagttcttaacacacagcacttatgattatgacttctggg
aataagacagtgtacatatactgtgcattatattcagtaggataggcctt
atcatatgactggcatcctcatatgaaatcagccttgaaatagacatgca
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_14200151_14201316
seq2: B6Ng01-166I08.b_43_1210

seq1  GAATTCTGTGTTTTGTCTTCTTTTGTTCTTCTAGTATGTTCCTTGGGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGTTTTGTCTTCTTTTGTTCTTCTAGTATGTTCCTTGGGCCT  50

seq1  TACTTTGATGGCTGCTGAGAGTCATATTTCTCTTCCTTATACACCAATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTGATGGCTGCTGAGAGTCATATTTCTCTTCCTTATACACCAATCA  100

seq1  ATTAAAGGGAGACTAGGGGCTTAAAAAAATACTTACCCACTGTCCCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGGGAGACTAGGGGCTTAAAAAAATACTTACCCACTGTCCCCTGG  150

seq1  CAGCAAGTAGCTGGTGAGTGGGTCAGAAACGGTAAGAGAGTGTATGTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGTAGCTGGTGAGTGGGTCAGAAACGGTAAGAGAGTGTATGTATA  200

seq1  GACCTTGATACAATAAGGAACATGGGAAGCTCATCCATTGATTCTCCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTGATACAATAAGGAACATGGGAAGCTCATCCATTGATTCTCCAGT  250

seq1  CTGAGTAATATTCTTCAAATTGGGTTTTATCAGGAAACCCCAGGTGACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTAATATTCTTCAAATTGGGTTTTATCAGGAAACCCCAGGTGACTG  300

seq1  GTTCTTATACAATTTCTAAGAATAGTAACGATGTCACATTCACCCTTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTATACAATTTCTAAGAATAGTAACGATGTCACATTCACCCTTCTG  350

seq1  ATTACCCTATCTTGAGATTACTTTCAAGGTTAAAACTCGGTGGGTAGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCCTATCTTGAGATTACTTTCAAGGTTAAAACTCGGTGGGTAGAAG  400

seq1  AGAGATTTCTTAGCTCCTGCCAGCCTTAGTGACACCTGGGACAAAATTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTTCTTAGCTCCTGCCAGCCTTAGTGACACCTGGGACAAAATTAC  450

seq1  AATGATTTTAAAGAGAGGCATGCAGATGGTGTTAAAACACTTTCCCTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATTTTAAAGAGAGGCATGCAGATGGTGTTAAAACACTTTCCCTGTT  500

seq1  TTACCACACCTGTGACCTGTGTTACTAGCCATACCTTCTCACATATGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCACACCTGTGACCTGTGTTACTAGCCATACCTTCTCACATATGCAT  550

seq1  GCATGCATGCATGTTTCTGGAGTAAATGCTGGCATCTTTTAGCACAATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCATGCATGTTTCTGGAGTAAATGCTGGCATCTTTTAGCACAATAT  600

seq1  TCAACAAAAAATTATTGGGTTTCTGTGAAGTCGGTCACTTGTGCCACAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAAAAAATTATTGGGTTTCTGTGAAGTCGGTCACTTGTGCCACAGT  650

seq1  ATATATATGGCAATCGGGGGCCACGGTTTGAAGCTCTTTCTCTCCTTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATGGCAATCGGGGGCCACGGTTTGAAGCTCTTTCTCTCCTTCTC  700

seq1  CCTTTATGGAGGTTTAGAGCTCAAACTCAGGTCACCAGGCTGGTGCAGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATGGAGGTTTAGAGCTCAAACTCAGGTCACCAGGCTGGTGCAGGG  750

seq1  AGTACTTTATTTTAGTCCATCTCCTCAGCCAGTTAAAGCTGAGTGCTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTTATTTTAGTCCATCTCCTCAGCCAGTTAAAGCTGAGTGCTTCA  800

seq1  TCATTATAATCTTCAACCAAAGGAGATAACAACAATGTGCTTCCCCCCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATAATCTTCAACCAAAGGAGATAACAACAATGTGCTTCCCCCCCC  850

seq1  ATGTTTAAAATAAGCTTTAAATTCTTGTCAGGAAGCCAGCCAGCCTAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAAAATAAGCTTTAAATTCTTGTCAGGAAGCCAGCCAGCCTAATG  900

seq1  AGATCTTTAAAGATCTGGATTATAATCTTGAGATGTTGTGGTGAAGAGTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTTAAAGATCTGGATTATAATCTTGAGATGTTGTGGTGAAGAGTT  950

seq1  GGGCCAATAGATTGCTAAATGGTCTAAGCAGGCCAGGAGTCTCTTAAACA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGGCCAATAGATTGCTAAATGGTCTAAGCA-GCCAGGAGTCTCTTAAACA  999

seq1  CCAAACTTAAATCTTACCAATTACACTAAAATCTTACCAATGTCACTGAG  1050
      || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CC-AACTTAAATCTTACC-ATTACACTAAAATCTTACCAATGTCACTGAG  1047

seq1  ATACATTTTGACATATGTTACTA-TCTTCTACATATTTCTTA-TTACAAT  1098
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||
seq2  ATACATTTTGACATATGTTACTATTCTTCTAAATATTTCTTATTTACAAT  1097

seq1  GATTTTAGTTCGTTAAAGGACCCACAAT-CAAAGGAACTG-CTGCTGATA  1146
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||
seq2  GATTTTAGTTCGTTAAAGGACCCACAATCCAAGGGAACTGCCTGCTGATA  1147

seq1  A-TTGTGTTGTTATGCCTCGG  1166
      | |||||||||| ||||||||
seq2  ATTTGTGTTGTTTTGCCTCGG  1168

seq1: chr12_14330161_14331333
seq2: B6Ng01-166I08.g_66_1216 (reverse)

seq1  CTGCATGTCTATTTTCAAAGAGTCTTTGATTTTCCTAATGAGAATGCCAG  50
      ||||||||||| |||||| |      ||||||  |  ||||| |||||||
seq2  CTGCATGTCTA-TTTCAAGG-----CTGATTT--CATATGAGGATGCCAG  42

seq1  TCATATTGGATTAAGGGCTATCCTACTGAATTATAATGCCACAAGTAATA  100
      ||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||
seq2  TCATAT--GA-TAAGGCCTATCCTACTGAA-TATAATG-CAC-AGT-ATA  85

seq1  TGTACACTGTCTTATTTCCCAGGAAGGTCATAATCATAGGTGCTGTGTGT  150
      |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||
seq2  TGTACACTGTCTTA-TTCCCAG--AAGTCATAATCATAAGTGCTGTGTGT  132

seq1  TAGGACTTCAGTGTATATTTCTGGTACACATAATTCAACCTTAAAATATA  200
      || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||
seq2  TAAGAACTCAGTGTATATTTCTGGTACACAT-ATTCACCTTAAAAATATA  181

seq1  TATCCATTAAGTTTGAGACATTTGGAGTTTAAGAACAGCTTGGGCTTGAG  250
      |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TATCCA-TAAG-TTGAGACATTT-GAGTTTAAGAACAGCTTGGGC-TGAG  227

seq1  AGTTCAACCAAATGCATGTTCCCCTTCGCATCTCTCTTGGAGTCATTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAACCAAATGCATGTTCCCCTTCGCATCTCTCTTGGAGTCATTCAG  277

seq1  TTCCAGCATTCAGGGTATGTGGTTTTTCATTAAAAAAAAAAAAAGAATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCATTCAGGGTATGTGGTTTTTCATTAAAAAAAAAAAAAGAATGA  327

seq1  ATCTTCTCACAGGTAGTGTATGCATCTCCAGCCTCCAGCCTCCAGCCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTCACAGGTAGTGTATGCATCTCCAGCCTCCAGCCTCCAGCCTCT  377

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGT  427

seq1  GTGTGTGTATAAGAG-AAAGATAGACAGATAGAGAGACACACAGAGAGAG  499
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTATAAGAGAAAAGATAGACAGATAGAGAGACACACAGAGAGAG  477

seq1  AGAGACAGAGTGAGAGAGAAGCAAGAGAGAACATGTGAGTGGAACTTTTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGAGTGAGAGAGAAGCAAGAGAGAACATGTGAGTGGAACTTTTA  527

seq1  AAGAACAGGGAAGAAAGCACACAGATACCTATGGGGACTGCTAGGGGTAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACAGGGAAGAAAGCACACAGATACCTATGGGGACTGCTAGGGGTAT  577

seq1  CATTCCAGGAGTCCAAGCTTCATACATGCAGTCAGCCATGCAGTTACAGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCAGGAGTCCAAGCTTCATACATGCAGTCAGCCATGCAGTTACAGG  627

seq1  GAACCTAGTGATTATTTCTGAGATTATTGAGATTTGCTGAGAATATGATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTAGTGATTATTTCTGAGATTATTGAGATTTGCTGAGAATATGATA  677

seq1  GATGCATAGAAGGAATTATTTAAAATTTGTAAATCTAAATATACTTTAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCATAGAAGGAATTATTTAAAATTTGTAAATCTAAATATACTTTAGA  727

seq1  TTGCACACTTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACACTTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCT  777

seq1  GAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGC  827

seq1  TATACAGAGAAACCTTGTCTTGAAAAACAAAACAAAACAACAAAAAGGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGAGAAACCTTGTCTTGAAAAACAAAACAAAACAACAAAAAGGAA  877

seq1  CTAATTATTAAGTGTCCATGGGAGAAGACAATTCACAAAATAATCTCATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTATTAAGTGTCCATGGGAGAAGACAATTCACAAAATAATCTCATT  927

seq1  TTACCTACTTATTCTTATGGAGCTAGAAATTGAGTATATCTGGATGGGCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTACTTATTCTTATGGAGCTAGAAATTGAGTATATCTGGATGGGCC  977

seq1  AGCAGATTTTTGCATTTGTAAGATATTGCCCATGGGATACACTGATGAAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATTTTTGCATTTGTAAGATATTGCCCATGGGATACACTGATGAAG  1027

seq1  GTGAAGATCACCATGCCTACTCCACCACCTTTGACTATAGTATTTCCTCG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGATCACCATGCCTACTCCACCACCTTTGACTATAGTATTTCCTCG  1077

seq1  TTCTTGACAGTTTACAGCTTCTCCAGTGCCCTCAGCTAAATACACACACA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGACAGTTTACAGCTTCTCCAGTGCCCTCAGCTAAATACACACACA  1127

seq1  AAGACTTACAAATGGGTGGAATTC  1173
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTACAAATGGGTGGAATTC  1151