BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166N19
Chromosome12 (Build37)
Map Location 43,621,187 - 43,755,583
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneImmp2l, EG638533
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166N19.bB6Ng01-166N19.g
ACCDH958514DH958515
length1,1481,155
definitionDH958514|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166N19, 5' end.DH958515|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166N19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,754,428 - 43,755,583)(43,621,187 - 43,622,335)
sequence
gaattcacatgaatatctatctagaaataaataatacatctctaagtaaa
tctgccattgttgtttcaagtggggcaaaagtttagtatagtatgatctc
ttcaaatctatttgattttatagaagggctgtaattatcagctttaatgc
acattaacaatatcttctggtatcacagtattatcaaaactttagttgaa
atgtagccatccctgtggtacctgctactgccaatcatttcatcctacag
catattcataaaaagttgcaatgttgcacaaaagactagaatactaaact
ttactaccaagactttgcaaagttgctatttgattttttgaaaatgatat
ataatacccttaatgagtatccgtagatatcctaaaatttcattctgctt
gaatttaaaaatctccagggcatgctgtcgagggaatgatatgtattctc
aagcttcccagcttacagcactgtctcccaacagtctactgacaaacata
tgccgatagtagtacatgtgttacaacttcataatgtggcatatcacttg
ttagcctaattgatgacatgttttgttggcttttaccacacatgtgggat
tttgtaggccttcagagcagactttaagtaatgatataataagctgagag
actttataatatctaataggaaaatagccattaaacagataatcacacaa
ttacttaattttgatagccctaagtaataattaatacaaagaaatgttta
gagcaagctctgtccatggaattatcagggcaaggagcgaaacatgcaga
tatttcccactccctacatcctttgggattacctagcatgaggcctcatg
tagtgacagctacaacactttcagtcactgggggagacttctgttaactt
atttgaatttgaatattttcctaattgagtaattgttatggatgaatagg
gagaagtattcttcctggacccaggaggcattgtgtcattaaaataatct
gtataaagtgaaaatgatttattataatcttgcaacagcagaaaaaaaaa
aactactgaacatctggcatccttcaggttttatcagaaaggtagccaat
tatcaagactgtagtaagagattggaataaattccactgctcaggttc
gaattccatgaatagtgaaggctgttgtgtttttatgatgatactcatct
cctggtctgtgtcctcacaaggtagaatggatagaggaagaacagtgcct
agctatattacttcataactttggaagatattgaacttatccattagata
aatacaatttcccaggataggagctatctctttgcactgctgaaattggg
atagaacattcaaaggttacagacatcaaggcactgtcaggtctatgtct
tcggccagactaaacaatgaacaaacactgtgatctaggatgaagaggag
atatttttgagacaaatcttcaaagaagtgaggtatgaaggagaagaaac
acttctacataatcataatagaagcctccagtaaccacatggagcaccct
gagctggtaacattcttgaactgtgccattttgaattcatatagtcagtt
gaggctccctagtactatttatcatgagggttcatagttggttttgagaa
taactcaaattgtttggtagtcactaagcaccataaaatatacaattaga
atacaagtgttctttttaaaattcaacttctaatagtttggttttatgga
caccaaggaagaacactaaacaaagaatggagctgaccccctatttcagt
cataacaatcctatacattatttagaacctcttcatttctgctgattatt
atctaacatagaacatattatatagcacggtttaatttaaaagccagata
aaaacgtgtatgctgagggtgggagcaatggtaagtgtagcagaagcttg
ccaaagcactgaattttttccacaggtcaattaactggctttgatttact
tctaatgaatacagtattttaacagcattttcaagaaactgtttggcttc
agtgaaacacctcaaaataatctatgaaagacatagtataagcactagtt
aatgatatcctggcaacaaataataaaaaaatttctgaaaatttctatag
ccttattcactaagtcattcagcgttatttttagacacctatcaagccca
tcctgcttttgtatccttccttctgaagtaatatgggctactataatcct
ttaatgaagctattagaacccacggtagccatgattattttttcacttct
ttttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_43754428_43755583
seq2: B6Ng01-166N19.b_46_1193 (reverse)

seq1  GAACACTGAGCAGTG--ATTTAATCAAATCTCTAACTACAAGTCTTGATT  48
      |||| ||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| 
seq2  GAAC-CTGAGCAGTGGAATTTATTCCAATCTCTTACTAC-AGTCTTGAT-  47

seq1  AATTTTGCTACTTTCTTGATAAAACTGGAAGGATGCCAGATGTTCAGTAG  98
       | || ||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||
seq2  -AATTGGCTACCTTTCTGATAAAACCTGAAGGATGCCAGATGTTCAGTAG  96

seq1  TTTTTTTTTTTCTGCTTGTTTGCAAGATTATAATAAATCATTTTTCACTT  148
      ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  TTTTTTTTTTTCTGCT--GTTGCAAGATTATAATAAATCA-TTTTCAC-T  142

seq1  TTATAACAGATTATTTTAATGACACAATGCCTCCTGGGTCCAGGAAGAAT  198
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAT-ACAGATTATTTTAATGACACAATGCCTCCTGGGTCCAGGAAGAAT  191

seq1  ACTTCTCCCTATTCATCCATAAACAATTACTCAATTAGGAAAATATTCAA  248
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCCCTATTCATCCAT-AACAATTACTCAATTAGGAAAATATTCAA  240

seq1  ATTCAAATAAGTTAACAGAAGTCTCCCCCAGTGACTGAAAGTGTTGTAGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAATAAGTTAACAGAAGTCTCCCCCAGTGACTGAAAGTGTTGTAGC  290

seq1  TGTCACTACATGAGGCCTCATGCTAGGTAATCCCAAAGGATGTAGGGAGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTACATGAGGCCTCATGCTAGGTAATCCCAAAGGATGTAGGGAGT  340

seq1  GGGAAATATCTGCATGTTTCGCTCCTTGCCCTGATAATTCCATGGACAGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATATCTGCATGTTTCGCTCCTTGCCCTGATAATTCCATGGACAGA  390

seq1  GCTTGCTCTAAACATTTCTTTGTATTAATTATTACTTAGGGCTATCAAAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTCTAAACATTTCTTTGTATTAATTATTACTTAGGGCTATCAAAA  440

seq1  TTAAGTAATTGTGTGATTATCTGTTTAATGGCTATTTTCCTATTAGATAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTAATTGTGTGATTATCTGTTTAATGGCTATTTTCCTATTAGATAT  490

seq1  TATAAAGTCTCTCAGCTTATTATATCATTACTTAAAGTCTGCTCTGAAGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAGTCTCTCAGCTTATTATATCATTACTTAAAGTCTGCTCTGAAGG  540

seq1  CCTACAAAATCCCACATGTGTGGTAAAAGCCAACAAAACATGTCATCAAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACAAAATCCCACATGTGTGGTAAAAGCCAACAAAACATGTCATCAAT  590

seq1  TAGGCTAACAAGTGATATGCCACATTATGAAGTTGTAACACATGTACTAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTAACAAGTGATATGCCACATTATGAAGTTGTAACACATGTACTAC  640

seq1  TATCGGCATATGTTTGTCAGTAGACTGTTGGGAGACAGTGCTGTAAGCTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCGGCATATGTTTGTCAGTAGACTGTTGGGAGACAGTGCTGTAAGCTG  690

seq1  GGAAGCTTGAGAATACATATCATTCCCTCGACAGCATGCCCTGGAGATTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTTGAGAATACATATCATTCCCTCGACAGCATGCCCTGGAGATTT  740

seq1  TTAAATTCAAGCAGAATGAAATTTTAGGATATCTACGGATACTCATTAAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTCAAGCAGAATGAAATTTTAGGATATCTACGGATACTCATTAAG  790

seq1  GGTATTATATATCATTTTCAAAAAATCAAATAGCAACTTTGCAAAGTCTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTATATATCATTTTCAAAAAATCAAATAGCAACTTTGCAAAGTCTT  840

seq1  GGTAGTAAAGTTTAGTATTCTAGTCTTTTGTGCAACATTGCAACTTTTTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTAAAGTTTAGTATTCTAGTCTTTTGTGCAACATTGCAACTTTTTA  890

seq1  TGAATATGCTGTAGGATGAAATGATTGGCAGTAGCAGGTACCACAGGGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATGCTGTAGGATGAAATGATTGGCAGTAGCAGGTACCACAGGGAT  940

seq1  GGCTACATTTCAACTAAAGTTTTGATAATACTGTGATACCAGAAGATATT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACATTTCAACTAAAGTTTTGATAATACTGTGATACCAGAAGATATT  990

seq1  GTTAATGTGCATTAAAGCTGATAATTACAGCCCTTCTATAAAATCAAATA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTGCATTAAAGCTGATAATTACAGCCCTTCTATAAAATCAAATA  1040

seq1  GATTTGAAGAGATCATACTATACTAAACTTTTGCCCCACTTGAAACAACA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGAAGAGATCATACTATACTAAACTTTTGCCCCACTTGAAACAACA  1090

seq1  ATGGCAGATTTACTTAGAGATGTATTATTTATTTCTAGATAGATATTCAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGATTTACTTAGAGATGTATTATTTATTTCTAGATAGATATTCAT  1140

seq1  GTGAATTC  1156
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1148

seq1: chr12_43621187_43622335
seq2: B6Ng01-166N19.g_68_1222

seq1  GAATTCCATGAATAGTGAAGGCTGTTGTGTTTTTATGATGATACTCATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGAATAGTGAAGGCTGTTGTGTTTTTATGATGATACTCATCT  50

seq1  CCTGGTCTGTGTCCTCACAAGGTAGAATGGATAGAGGAAGAACAGTGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCTGTGTCCTCACAAGGTAGAATGGATAGAGGAAGAACAGTGCCT  100

seq1  AGCTATATTACTTCATAACTTTGGAAGATATTGAACTTATCCATTAGATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATATTACTTCATAACTTTGGAAGATATTGAACTTATCCATTAGATA  150

seq1  AATACAATTTCCCAGGATAGGAGCTATCTCTTTGCACTGCTGAAATTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAATTTCCCAGGATAGGAGCTATCTCTTTGCACTGCTGAAATTGGG  200

seq1  ATAGAACATTCAAAGGTTACAGACATCAAGGCACTGTCAGGTCTATGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACATTCAAAGGTTACAGACATCAAGGCACTGTCAGGTCTATGTCT  250

seq1  TCGGCCAGACTAAACAATGAACAAACACTGTGATCTAGGATGAAGAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCCAGACTAAACAATGAACAAACACTGTGATCTAGGATGAAGAGGAG  300

seq1  ATATTTTTGAGACAAATCTTCAAAGAAGTGAGGTATGAAGGAGAAGAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTTGAGACAAATCTTCAAAGAAGTGAGGTATGAAGGAGAAGAAAC  350

seq1  ACTTCTACATAATCATAATAGAAGCCTCCAGTAACCACATGGAGCACCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTACATAATCATAATAGAAGCCTCCAGTAACCACATGGAGCACCCT  400

seq1  GAGCTGGTAACATTCTTGAACTGTGCCATTTTGAATTCATATAGTCAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGTAACATTCTTGAACTGTGCCATTTTGAATTCATATAGTCAGTT  450

seq1  GAGGCTCCCTAGTACTATTTATCATGAGGGTTCATAGTTGGTTTTGAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTCCCTAGTACTATTTATCATGAGGGTTCATAGTTGGTTTTGAGAA  500

seq1  TAACTCAAATTGTTTGGTAGTCACTAAGCACCATAAAATATACAATTAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCAAATTGTTTGGTAGTCACTAAGCACCATAAAATATACAATTAGA  550

seq1  ATACAAGTGTTCTTTTTAAAATTCAACTTCTAATAGTTTGGTTTTATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAGTGTTCTTTTTAAAATTCAACTTCTAATAGTTTGGTTTTATGGA  600

seq1  CACCAAGGAAGAACACTAAACAAAGAATGGAGCTGACCCCCTATTTCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAGGAAGAACACTAAACAAAGAATGGAGCTGACCCCCTATTTCAGT  650

seq1  CATAACAATCCTATACATTATTTAGAACCTCTTCATTTCTGCTGATTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACAATCCTATACATTATTTAGAACCTCTTCATTTCTGCTGATTATT  700

seq1  ATCTAACATAGAACATATTATATAGCACGGTTTAATTTAAAAGCCAGATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAACATAGAACATATTATATAGCACGGTTTAATTTAAAAGCCAGATA  750

seq1  AAAACGTGTATGCTGAGGGTGGGAGCAATGGTAAGTGTAGCAGAAGCTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACGTGTATGCTGAGGGTGGGAGCAATGGTAAGTGTAGCAGAAGCTTG  800

seq1  CCAAAGCACTGAATTTTTTCCACAGGTCAATTAACTGGCTTTGATTTACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCACTGAATTTTTTCCACAGGTCAATTAACTGGCTTTGATTTACT  850

seq1  TCTAATGAATACAGTATTTTAACAGCATTTTCAAGAAACTGTTTGGCTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGAATACAGTATTTTAACAGCATTTTCAAGAAACTGTTTGGCTTC  900

seq1  AGGTGAAACACCTCAAAATAATCTATGAAAGACATAGTATAAGCACTAGT  950
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GTGAAACACCTCAAAATAATCTATGAAAGACATAGTATAAGCACTAGT  949

seq1  TAATGATATCCTGGCAACAAATAATAAAAAAATTTCTGAAAATTTCTATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGATATCCTGGCAACAAATAATAAAAAAATTTCTGAAAATTTCTATA  999

seq1  GCCTTATTCACTAAGTCATTCAGCGTTTATTCTAGACA-CTATCAAGCCC  1049
      |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||
seq2  GCCTTATTCACTAAGTCATTCAGCGTTATTTTTAGACACCTATCAAGCCC  1049

seq1  ATCCTTGCTTTTGTAT-CTTC--TCTG-AGT-ATAT-GGCTACTATAATC  1093
      |||| ||||||||||| ||||  |||| ||| |||| |||||||||||||
seq2  ATCC-TGCTTTTGTATCCTTCCTTCTGAAGTAATATGGGCTACTATAATC  1098

seq1  CCTTAATGAAAGCCTATAGAA--CACAGTAG-CATGAATTATTTTTTCAC  1140
      | |||||| ||||   |||||  ||| |||| |||| |||||||||||||
seq2  CTTTAATG-AAGCTATTAGAACCCACGGTAGCCATG-ATTATTTTTTCAC  1146

seq1  TTCTTTTTT  1149
      |||||||||
seq2  TTCTTTTTT  1155