BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170M10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 113,189,621 - 113,378,056
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2010107E04Rik, BC048943, Tdrd9, A530050D06Rik
Upstream gene4930573I19Rik, Ankrd9, 6030440G07Rik, Rcor1, 4930595D18Rik, Traf3, Amn, Cdc42bpb, A230065H16Rik, 1200009I06Rik, Tnfaip2, Gm266, Eif5, Mark3, Ckb, 6720458F09Rik, Bag5, 2810002N01Rik, Klc1, Xrcc3, Zfyve21, Ppp1r13b, LOC100041886
Downstream geneKif26a, A730018C14Rik, A530016L24Rik, Tmem179, 2610204M08Rik, Adssl1, Siva1, Akt1, EG382639, AW555464, LOC382640, Pld4, AI450948, LOC100041194, BC022687, Cdca4, Gpr132, Jag2, Nudt14, Brf1, Btbd6, Pacs2, Tex22, Mta1
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170M10.bB6Ng01-170M10.g
ACCDH961403DH961404
length1,0091,021
definitionDH961403|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170M10, 5' end.DH961404|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,377,047 - 113,378,056)(113,189,621 - 113,190,641)
sequence
gaattcctagcacagatgtgtcacccaaagaactcagcactgagcctact
gttccctacagcaccctactgggtgccactacttcagggagctctctatg
gctaggtgtgaaggcagccttgaaactgtgactttgagtatgggcgtttg
gtggtatcagtgttctagagagtggcgggagcctgagctgatggctgcat
gggtaaaagtggactgagggatccaggcagcaccactgatcacatcgagg
gtaatcagacccctgggggctgggattccccgtggctccaccagctagtc
ctggatgaagccgtgatgctggactccatcaatgtaaacacagacacaat
tcacagagcaagtacaatgcatctggctaataaatatacaatagcagagg
tgagggagaagagagggagccctcttccaacctgtgtgaatatgtgtgta
tcacatacagacatgcaggtaaaacattcatacacaaaaagtaaattaat
gttaattaacaaataagatcaaagagatttcccaaaaggtaaaggaagaa
taattgaaaacggagaaggaagaaaggttcgagcaatggctcagtggtta
agggcactagctgctcttccagaggaccagggttcaggtcccaagaccct
cggtcagctcatacctgcctataattccagttccaggagacccaatgccc
tctttttggcccctgtgaacaccacacatatgtggcactcacacacacgt
aaaagttagaaaggaagaggacctgccatattagaacaggaaggaaacag
ttgctgagcaagaagatgcccatacatatacatacatacatatatacata
cacacatacatacacacatacatacatacatacacacatacatacataca
catacatgcatgcatacatacatacacacatacatacacacatacataca
tacatatatacacaccatacatacatacaccatacatacatacatataca
tactcatac
gaattctaggctggggcccagaatagatgtgcttaaacagagctctctca
gagtcttggcggagcagccaaggctgagcgctgggacattgagagacccc
aggggaggtggaagagatgagtttacctggatccgttaaaggacactggt
atctttcctccaagttccttccagagaatcagctgctccagacagggacg
aatccccctaatgtccccttccctacctcctcttatagggtcttggcagg
aagagagcaatgccttcctgtctccttgatgacgtatcagccgtgtcagc
cccccaccagtgagagaaaaggcctgtgggatatacccatctgcaagggt
taactgagacaccatgaggataaatgttccctaggcctcagccagctgga
tcccgtgatccagagcctggtgctggcacagccagcaaacaaagatgctt
tgttcatgtacgagaataaacacttcccctggatatttactcccgggctc
aagtgtaatatggggtgtaagttactctttaacaggcaattggatactgg
ctgttgagttctgaactaatttcctggagggaagggatggctacatctgc
ccaggggatgaccagcctcaggagcgcctatggctggccattaccagaat
ctgagaacagacacagtggccactgcaggcttctccaagaggcaggggaa
gcggaatgaaatggaggcccagcaaaggggatgtttattttgccaaggca
aggaacctgcctgtccattcccctgcatccacaccagctgcttgggagaa
ggcagtcatcgtgtgctttgggtgggaataagctgtcagtgccacggtgc
tcagccccaagctccattcccaccattactgttgctactccagttctaag
cctagtcttctagatctgaggcaatggctgacttatcatgatctgtcagt
ttttagaacttaagtaaacctgcacggagtaagccgtggtgatgctggca
aggtttctttgtctggcatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_113377047_113378056
seq2: B6Ng01-170M10.b_47_1055 (reverse)

seq1  GTATGTGTATGTATATGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTGTGT  50
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  GTATGAGTATGTATATGTATGTATGTATG-GTGTATGTATGTATG-GTGT  48

seq1  GTATATATGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGC  98

seq1  ATGCATGTATGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTATGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTATGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTATGTGTGT  148

seq1  ATGTATGTGTGTATGTATATATGTATGTATGTATATGTATGGGCATCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTGTGTATGTATATATGTATGTATGTATATGTATGGGCATCTTC  198

seq1  TTGCTCAGCAACTGTTTCCTTCCTGTTCTAATATGGCAGGTCCTCTTCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCAGCAACTGTTTCCTTCCTGTTCTAATATGGCAGGTCCTCTTCCT  248

seq1  TTCTAACTTTTACGTGTGTGTGAGTGCCACATATGTGTGGTGTTCACAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACTTTTACGTGTGTGTGAGTGCCACATATGTGTGGTGTTCACAGG  298

seq1  GGCC-AAAAGAGGGCATTGGGTCTCCTGGAACTGGAATTATAGGCAGGTA  349
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAAAAAGAGGGCATTGGGTCTCCTGGAACTGGAATTATAGGCAGGTA  348

seq1  TGAGCTGACCGAGGGTCTTGGGACCTGAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTGACCGAGGGTCTTGGGACCTGAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCA  398

seq1  GCTAGTGCCCTTAACCACTGAGCCATTGCTCGAACCTTTCTTCCTTCTCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTGCCCTTAACCACTGAGCCATTGCTCGAACCTTTCTTCCTTCTCC  448

seq1  GTTTTCAATTATTCTTCCTTTACCTTTTGGGAAATCTCTTTGATCTTATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAATTATTCTTCCTTTACCTTTTGGGAAATCTCTTTGATCTTATT  498

seq1  TGTTAATTAACATTAATTTACTTTTTGTGTATGAATGTTTTACCTGCATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATTAACATTAATTTACTTTTTGTGTATGAATGTTTTACCTGCATG  548

seq1  TCTGTATGTGATACACACATATTCACACAGGTTGGAAGAGGGCTCCCTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTATGTGATACACACATATTCACACAGGTTGGAAGAGGGCTCCCTCT  598

seq1  CTTCTCCCTCACCTCTGCTATTGTATATTTATTAGCCAGATGCATTGTAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCCCTCACCTCTGCTATTGTATATTTATTAGCCAGATGCATTGTAC  648

seq1  TTGCTCTGTGAATTGTGTCTGTGTTTACATTGATGGAGTCCAGCATCACG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCTGTGAATTGTGTCTGTGTTTACATTGATGGAGTCCAGCATCACG  698

seq1  GCTTCATCCAGGACTAGCTGGTGGAGCCACGGGGAATCCCAGCCCCCAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATCCAGGACTAGCTGGTGGAGCCACGGGGAATCCCAGCCCCCAGG  748

seq1  GGTCTGATTACCCTCGATGTGATCAGTGGTGCTGCCTGGATCCCTCAGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGATTACCCTCGATGTGATCAGTGGTGCTGCCTGGATCCCTCAGTC  798

seq1  CACTTTTACCCATGCAGCCATCAGCTCAGGCTCCCGCCACTCTCTAGAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTTACCCATGCAGCCATCAGCTCAGGCTCCCGCCACTCTCTAGAAC  848

seq1  ACTGATACCACCAAACGCCCATACTCAAAGTCACAGTTTCAAGGCTGCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATACCACCAAACGCCCATACTCAAAGTCACAGTTTCAAGGCTGCCT  898

seq1  TCACACCTAGCCATAGAGAGCTCCCTGAAGTAGTGGCACCCAGTAGGGTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACCTAGCCATAGAGAGCTCCCTGAAGTAGTGGCACCCAGTAGGGTG  948

seq1  CTGTAGGGAACAGTAGGCTCAGTGCTGAGATCTTTGGGTGACACATCTGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGGGAACAGTAGGCTCAGTGCTGAGTTCTTTGGGTGACACATCTGT  998

seq1  GCTAGGAATTC  1010
      |||||||||||
seq2  GCTAGGAATTC  1009

seq1: chr12_113189621_113190641
seq2: B6Ng01-170M10.g_70_1090

seq1  GAATTCTAGGCTGGGGCCCAGAATAGATGTGCTTAAACAGAGCTCTCTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGCTGGGGCCCAGAATAGATGTGCTTAAACAGAGCTCTCTCA  50

seq1  GAGTCTTGGCGGAGCAGCCAAGGCTGAGCGCTGGGACATTGAGAGACCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTGGCGGAGCAGCCAAGGCTGAGCGCTGGGACATTGAGAGACCCC  100

seq1  AGGGGAGGTGGAAGAGATGAGTTTACCTGGATCCGTTAAAGGACACTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGTGGAAGAGATGAGTTTACCTGGATCCGTTAAAGGACACTGGT  150

seq1  ATCTTTCCTCCAAGTTCCTTCCAGAGAATCAGCTGCTCCAGACAGGGACG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTCCTCCAAGTTCCTTCCAGAGAATCAGCTGCTCCAGACAGGGACG  200

seq1  AATCCCCCTAATGTCCCCTTCCCTACCTCCTCTTATAGGGTCTTGGCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCCCTAATGTCCCCTTCCCTACCTCCTCTTATAGGGTCTTGGCAGG  250

seq1  AAGAGAGCAATGCCTTCCTGTCTCCTTGATGACGTATCAGCCGTGTCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGCAATGCCTTCCTGTCTCCTTGATGACGTATCAGCCGTGTCAGC  300

seq1  CCCCCACCAGTGAGAGAAAAGGCCTGTGGGATATACCCATCTGCAAGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCAGTGAGAGAAAAGGCCTGTGGGATATACCCATCTGCAAGGGT  350

seq1  TAACTGAGACACCATGAGGATAAATGTTCCCTAGGCCTCAGCCAGCTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGAGACACCATGAGGATAAATGTTCCCTAGGCCTCAGCCAGCTGGA  400

seq1  TCCCGTGATCCAGAGCCTGGTGCTGGCACAGCCAGCAAACAAAGATGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGTGATCCAGAGCCTGGTGCTGGCACAGCCAGCAAACAAAGATGCTT  450

seq1  TGTTCATGTACGAGAATAAACACTTCCCCTGGATATTTACTCCCGGGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCATGTACGAGAATAAACACTTCCCCTGGATATTTACTCCCGGGCTC  500

seq1  AAGTGTAATATGGGGTGTAAGTTACTCTTTAACAGGCAATTGGATACTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTAATATGGGGTGTAAGTTACTCTTTAACAGGCAATTGGATACTGG  550

seq1  CTGTTGAGTTCTGAACTAATTTCCTGGAGGGAAGGGATGGCTACATCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGAGTTCTGAACTAATTTCCTGGAGGGAAGGGATGGCTACATCTGC  600

seq1  CCAGGGGATGACCAGCCTCAGGAGCGCCTATGGCTGGCCATTACCAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGATGACCAGCCTCAGGAGCGCCTATGGCTGGCCATTACCAGAAT  650

seq1  CTGAGAACAGACACAGTGGCCACTGCAGGCTTCTCCAAGAGGCAGGGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAACAGACACAGTGGCCACTGCAGGCTTCTCCAAGAGGCAGGGGAA  700

seq1  GCGGAATGAAATGGAGGCCCAGCAAAGGGGATGTTTATTTTGCCAAGGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGAATGAAATGGAGGCCCAGCAAAGGGGATGTTTATTTTGCCAAGGCA  750

seq1  AGGAACCTGCCTGTCCATTCCCCTGCATCCACACCAGCTGCTTGGGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCTGCCTGTCCATTCCCCTGCATCCACACCAGCTGCTTGGGAGAA  800

seq1  GGCAGTCATCGTGTGCTTTGGGTGGGAATAGGCTGTCCAGTGCCACGGTG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
seq2  GGCAGTCATCGTGTGCTTTGGGTGGGAATAAGCTGT-CAGTGCCACGGTG  849

seq1  CCCAGCCCCAAGCTCCATTCCCACCATTAACTGTTGCTAC-CCAAGTCTA  899
      | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||
seq2  CTCAGCCCCAAGCTCCATTCCCACCATT-ACTGTTGCTACTCCAGTTCTA  898

seq1  AGCCTAGTCTTCTAGATCAGAGGCAATGGCTGACATACCATGACCTGTCA  949
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||
seq2  AGCCTAGTCTTCTAGATCTGAGGCAATGGCTGACTTATCATGATCTGTCA  948

seq1  GTCTTTAGAACTTAAGTAAAACTGCACGGAGTGAGGCGTGGTGATTGCTG  999
      || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||
seq2  GTTTTTAGAACTTAAGTAAACCTGCACGGAGTAAGCCGTGGTGA-TGCTG  997

seq1  GCAGGG--TCCTTGTCTGGCATGT  1021
      ||| ||  || |||||||||||||
seq2  GCAAGGTTTCTTTGTCTGGCATGT  1021