BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186I11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,967,094 - 23,128,667
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2410018L13Rik, LOC77114
Upstream geneEG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660, EG668662, LOC668664
Downstream geneEG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903, LOC100043440, EG668518
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186I11.bB6Ng01-186I11.g
ACCGA011346GA011347
length1,1891,117
definitionB6Ng01-186I11.b B6Ng01-186I11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,127,465 - 23,128,667)(22,967,094 - 22,968,217)
sequence
gaattcagttgtttactacagttccttcaaagaagtatacattccctgca
cttctgtactcatctagcagaaacaggaagtgtaccgctttaaactgcac
cattagtaaaactttactggcaatcaaggcacatttaatggaccaatgga
cagatgaaaatattagtaatataagtgttgaacataaagagcaacataag
gcaggagagagctataactcagctgtggaaagctcttgctggtcttccag
ataacagtggtcaatactagcattcacgtgacccatggctttatgaacag
gagttctgagtccaccttcaaacaaaactaacgatgaagcacacatgata
ttcatattcacgcatacaagcaaaacacccctatttatttaaaaatttca
aaacaaacacaagagtttggggaaatatcaatacccagaatccaatgact
ctgaagcctcaggcagtattgatgtcatgagcatatgccatcctaaaaaa
cagactacaacctatgtgcccacggggtacacagggggccccaaccccac
tcaaaaaagaaacagaggagattgggaggagggaatctgtgagggcaggg
acctagagtagggacagtgatcagggtgataatgaatatctaaattatag
gataaacaaaaaaaaaagtaaagaaagaaaaaggaaatttttgagtgtat
atacactttcatcttaaccaagatgaatctagaaaggctcctgcactgtt
caaatgtctaaagtctctgctgacactcaagacaatatcttgacagctac
atcagaaagcaaagttgcaaaatcaaacagcaagttatatctttccaaca
taaactggcactgaataccccttcccattccaatcaataggaatgtgcac
acagggagagaagattggacaaaggcaagaaaaacagcaggcaaacacca
aatcctatagcttgtctcaaacacattggacttcaattgcttaaggcata
gatggtgctcttcctgtaacttctcataacatctctcagtttgggtactt
catctcctgtaagcatctcttccatgcagatttcttcaatgcgttagttc
ttcccacacctgtgtcacaaaatgcactcaagcatcaacctacggactaa
tgcagactctcccagaacttctgaatctgactctgtcaa
gaattcatcaggtagactgaagtggaagtcagccctagtggatgaaaggt
tggttggtttctgttaagcacagaagaccatgtggtaatctgggttcaag
gcattcgttttggattttgttttctcgagacagagtctcactatgtagcc
ctggctgacctggaactcactatggagatcaggctggcctcaaactcaca
gagatctacctgccactgcctctcatgtgctgggattcaagacatgtacc
actatgcctggatttcaaaatgttctttcatttccaatcagggagatact
ttgaaaatgcaaaccttcttgaagtggtttggtgactttccatgagcaga
caacaggagtttgatcctttgacctaaatcatggaaagatagagcatcca
attcctgcaagttgccctctgacctcatgctagggcaaatgcacactccc
ttatatgtatgctccttccccccttcccaaacactaattgtgtaatgata
aataaagcaggaactggggatggagagatggctcagtggttaaaagcagt
gactgctcttccaggggtcctgagttcaatttccagcaaccacatggtgg
cttgcaaccatctgtaatggggtctgatgctctcttctagtgtgtatgaa
gacagctacattgtactcgtatacatacaatatatagatacaccttaaaa
aaaataaagcaggaactgaatgaggaaatgcctgagtcaatagactatgg
ttcaatctctgggtacaagcaaggttggaggagaagtgaggcagcacagt
caggcattctgggccatgaaggatctcttagagcatattgaagaatttag
ggtttattcgtagactgtagggagaccctggaaaatattgagcacttaaa
actgcatttgcttttagaacgatctctatgggaacgagtctggcacccag
taaacagggttgattggaaaggttgattaacccagagatggaagatttta
ttaataaataacacttgcagatggaggagagacctaatgaataaggcaca
gtgggaaaatgaggctcaagatcagtgccgcgataataaactggaaattc
tattcaatgaccttgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_23127465_23128667
seq2: B6Ng01-186I11.b_44_1232 (reverse)

seq1  TTGACAGAGTCAGGATCCCAGGGAAGACTCTGTGAGAGTTCCTTGCATTT  50
      |||||||||||||  ||     ||||  |||| ||||||    |||||| 
seq2  TTGACAGAGTCAGATTC----AGAAG-TTCTGGGAGAGT---CTGCATT-  41

seq1  AAGTCGTGAGGTTGATGCTTGAGTTGCATTTTGTGACCACAGGTTGTGGA  100
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| 
seq2  -AGTCCGTAGGTTGATGCTTGAG-TGCATTTTGTGA-CACAGG-TGTGGG  87

seq1  GAAAACTAACGCATTG-AGAAATCTGCCATGG-AGAGATGCTTACAGGGA  148
       | ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||
seq2  AAGAACTAACGCATTGAAGAAATCTG-CATGGAAGAGATGCTTACA-GGA  135

seq1  GATGAAGTACCCAAACTGAGAGATG-TATGAGAAGTTACAGGAAGAGCAC  197
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGTACCCAAACTGAGAGATGTTATGAGAAGTTACAGGAAGAGCAC  185

seq1  CATCTATGCCTTAAGCAATTGAAGTCCAATGTGTTTGAGACAAAGCTATA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CATCTATGCCTTAAGCAATTGAAGTCCAATGTGTTTGAGAC-AAGCTATA  234

seq1  GGATTTGGTGTTTGCCCTGCTGTTTTTCTTGCCTTTGTCCAATCTTCTCT  297
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGGTGTTTG-CCTGCTGTTTTTCTTGCCTTTGTCCAATCTTCTCT  283

seq1  CCCTGTGTGCACATTCCTATTGATTGGAATGGGAAGGGGTATTCAGTGCC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGTGCACATTCCTATTGATTGGAATGGGAAGGGGTATTCAGTGCC  333

seq1  AGTTTATGTTGGAAAGATATAACTTGCTGTTTGATTTTGCAACTTTGCTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTATGTTGGAAAGATATAACTTGCTGTTTGATTTTGCAACTTTGCTT  383

seq1  TCTGATGTAGCTGTCAAGATATTGTCTTGAGTGTCAGCAGAGACTTTAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATGTAGCTGTCAAGATATTGTCTTGAGTGTCAGCAGAGACTTTAGA  433

seq1  CATTTGAACAGTGCAGGAGCCTTTCTAGATTCATCTTGGTTAAGATGAAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGAACAGTGCAGGAGCCTTTCTAGATTCATCTTGGTTAAGATGAAA  483

seq1  GTGTATATACACTCAAAAATTTCCTTTTTCTTTCTTTACTTTTTTTTTTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATATACACTCAAAAATTTCCTTTTTCTTTCTTTACTTTTTTTTTTG  533

seq1  TTTATCCTATAATTTAGATATTCATTATCACCCTGATCACTGTCCCTACT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCCTATAATTTAGATATTCATTATCACCCTGATCACTGTCCCTACT  583

seq1  CTAGGTCCCTGCCCTCACAGATTCCCTCCTCCCAATCTCCTCTGTTTCTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTCCCTGCCCTCACAGATTCCCTCCTCCCAATCTCCTCTGTTTCTT  633

seq1  TTTTGAGTGGGGTTGGGGCCCCCTGTGTACCCCGTGGGCACATAGGTTGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAGTGGGGTTGGGGCCCCCTGTGTACCCCGTGGGCACATAGGTTGT  683

seq1  AGTCTGTTTTTTAGGATGGCATATGCTCATGACATCAATACTGCCTGAGG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTTTTTTAGGATGGCATATGCTCATGACATCAATACTGCCTGAGG  733

seq1  CTTCAGAGTCATTGGATTCTGGGTATTGATATTTCCCCAAACTCTTGTGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGAGTCATTGGATTCTGGGTATTGATATTTCCCCAAACTCTTGTGT  783

seq1  TTGTTTTGAAATTTTTAAATAAATAGGGGTGTTTTGCTTGTATGCGTGAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGAAATTTTTAAATAAATAGGGGTGTTTTGCTTGTATGCGTGAA  833

seq1  TATGAATATCATGTGTGCTTCATCGTTAGTTTTGTTTGAAGGTGGACTCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATATCATGTGTGCTTCATCGTTAGTTTTGTTTGAAGGTGGACTCA  883

seq1  GAACTCCTGTTCATAAAGCCATGGGTCACGTGAATGCTAGTATTGACCAC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCCTGTTCATAAAGCCATGGGTCACGTGAATGCTAGTATTGACCAC  933

seq1  TGTTATCTGGAAGACCAGCAAGAGCTTTCCACAGCTGAGTTATAGCTCTC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATCTGGAAGACCAGCAAGAGCTTTCCACAGCTGAGTTATAGCTCTC  983

seq1  TCCTGCCTTATGTTGCTCTTTATGTTCAACACTTATATTACTAATATTTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCCTTATGTTGCTCTTTATGTTCAACACTTATATTACTAATATTTT  1033

seq1  CATCTGTCCATTGGTCCATTAAATGTGCCTTGATTGCCAGTAAAGTTTTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTCCATTGGTCCATTAAATGTGCCTTGATTGCCAGTAAAGTTTTA  1083

seq1  CTAATGGTGCAGTTTAAAGCGGTACACTTCCTGTTTCTGCTAGATGAGTA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGGTGCAGTTTAAAGCGGTACACTTCCTGTTTCTGCTAGATGAGTA  1133

seq1  CAGAAGTGCAGGGAATGTATACTTCTTTGAAGGAACTGTAGTAAACAACT  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTGCAGGGAATGTATACTTCTTTGAAGGAACTGTAGTAAACAACT  1183

seq1  GAATTC  1203
      ||||||
seq2  GAATTC  1189

seq1: chr12_22967094_22968217
seq2: B6Ng01-186I11.g_64_1180

seq1  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTCAGCCCTAGTGGATGAAAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTCAGCCCTAGTGGATGAAAGGT  50

seq1  TGGTTGGTTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGTTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100

seq1  GCATTCGTTTTGGATTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTATGTAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTCGTTTTGGATTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTATGTAGCC  150

seq1  CTGGCTGACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAACTCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAACTCACA  200

seq1  GAGATCTACCTGCCACTGCCTCTCATGTGCTGGGATTCAAGACATGTACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTACCTGCCACTGCCTCTCATGTGCTGGGATTCAAGACATGTACC  250

seq1  ACTATGCCTGGATTTCAAAATGTTCTTTCATTTCCAATCAGGGAGATACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCCTGGATTTCAAAATGTTCTTTCATTTCCAATCAGGGAGATACT  300

seq1  TTGAAAATGCAAACCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATGAGCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATGCAAACCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATGAGCAGA  350

seq1  CAACAGGAGTTTGATCCTTTGACCTAAATCATGGAAAGATAGAGCATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGAGTTTGATCCTTTGACCTAAATCATGGAAAGATAGAGCATCCA  400

seq1  ATTCCTGCAAGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCAAATGCACACTCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGCAAGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCAAATGCACACTCCC  450

seq1  TTATATGTATGCTCCTTCCCCCCTTCCCAAACACTAATTGTGTAATGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTATGCTCCTTCCCCCCTTCCCAAACACTAATTGTGTAATGATA  500

seq1  AATAAAGCAGGAACTGGGGATGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAAAGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGCAGGAACTGGGGATGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAAAGCAGT  550

seq1  GACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACATGGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACATGGTGG  600

seq1  CTTGCAACCATCTGTAATGGGGTCTGATGCTCTCTTCTAGTGTGTATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAACCATCTGTAATGGGGTCTGATGCTCTCTTCTAGTGTGTATGAA  650

seq1  GACAGCTACATTGTACTCGTATACATACAATATATAGATACACCTTAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTACATTGTACTCGTATACATACAATATATAGATACACCTTAAAA  700

seq1  AAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAGACTATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAGACTATGG  750

seq1  TTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCAGCACAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCAGCACAGT  800

seq1  CAGGCATTCTGGGCCATGAAGGATCTCTTAGAGCATATTGAAGAATTTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCATTCTGGGCCATGAAGGATCTCTTAGAGCATATTGAAGAATTTAG  850

seq1  GGTTTATTCGTAGACTGTAGGGAGACCCTGGAAAATATTGAGCCACTTAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGTTTATTCGTAGACTGTAGGGAGACCCTGGAAAATATTGAG-CACTTAA  899

seq1  AACTGCATTTGCTTTTTAGAACGATCTCTATGGGAACGAGTCTGGCACCC  950
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCATTTGC-TTTTAGAACGATCTCTATGGGAACGAGTCTGGCACCC  948

seq1  AGTAAACAGGG-TGATTGGAAA-GTTGATTAACCCAGAGATGGGAAGA-T  997
      ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
seq2  AGTAAACAGGGTTGATTGGAAAGGTTGATTAACCCAGAGAT-GGAAGATT  997

seq1  TTATTATAAAATAACACTTGCAGAT-GAGGAGAGACCTAAATGGATAAGG  1046
      ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |
seq2  TTATTAATAAATAACACTTGCAGATGGAGGAGAGACCT-AATGAATAA-G  1045

seq1  GCACAGTGGG-AAATGAGGGCTCAGGACCACAGTGCCCGCGGATAATAAA  1095
      |||||||||| |||||| |||||| ||   ||||| |||| |||||||||
seq2  GCACAGTGGGAAAATGA-GGCTCAAGA--TCAGTG-CCGC-GATAATAAA  1090

seq1  CTGAAATATCCAATCCAATGACACTTGGA  1124
      ||| || || | || ||||||| ||||||
seq2  CTGGAA-ATTCTATTCAATGAC-CTTGGA  1117