BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-187J10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 24,413,135 - 24,527,430
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668701, LOC668471
Upstream geneLOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903, LOC100043440, EG668518, LOC100043445, LOC668697, LOC100042923, LOC677338
Downstream geneLOC668703, LOC546534, 9030624G23Rik, EG668710, LOC100042945, EG668711, EG668714, LOC629364, Taf1b, Grhl1, EG629383, Klf11, Cys1, Rrm2, LOC668719, Mboat2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-187J10.bB6Ng01-187J10.g
ACCGA012127GA012128
length885714
definitionB6Ng01-187J10.b B6Ng01-187J10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,526,546 - 24,527,430)(24,413,135 - 24,413,848)
sequence
gaattcctccagagggatccagggacattaacaaaaactgagtccaaggc
tggattatttgctctttaagattagatttagccagaacagactgggtaac
ctgcagtgagtaatcttgttgcccccggaacacttagccattgggccagt
aatttctgagaacagaactctccttacaatggctgtatagctcccaggat
ccagacaccagtgagacagtcccttcccccagggatttcacagtctggtg
gagacaaacaaaggaccaaggaaaacataagcaagcaagcaatgaaagat
tctatagtaggctggatgagcttcagagggcatggaccatggtgaggatg
agggagcaaaggcagggaggctggaagagccagcaagattcaatagggaa
gatgcttgtgccatatagagagcacagattatagtttttagtccttggat
gaggtatggaagactgagggagtcaatgggcatccccagaacttcagggc
actctctaggagattcctgggatcctggctcagcctccatccaggtcatt
tttgctgtttactgacctgctccctccatctcccatcctactgataacag
tttgtcctttagaatgtgtcacctcagctctaagaggcagagatagggac
attccatagctctgttgccttggatgaacacagtgtctggaaggcaatgg
cctcaccgtgctctgcagtgttgtgaacaaatgtgtaagtaagtgaaaga
atgagcaagtgggtcagagaatggaaagtgcagtaagccatgcacagaca
cttgtgttattgtcccgattgttttagggagatgagatcacaggttgtcc
tgcttaggacaccatgacttggggaggaaagggtt
gaattcaggaccaaggcagtgatgggtttccttcaggccaagctagtttg
agaagtctgggggatatgtagagaggaaagggccggatttacaaacctca
gcttgaggtcaaaagaatggactggtcacagacacccaggcctacagatt
tctttacatttctgattttaatgtttttgcatgtgtatgcctatgcactg
tgcatgtgtgtttccatatgtatgggcacatgtgcatgtgtgggcagctc
aaggtagacattgggtgtctccctaccccactttccactgtattttttga
ggccaggtctcctgaactgtagcttgctgatttcagctaagctagccagg
cagctggccctgaggatgtcccatctgtctctcagatgctgggattacag
gtaactgccatacctgcccagctattacatggttctagagatctgcattc
cagtcttcatgcctacaccgtgcatgttttatgcactaagccattgtctc
cccacagccctgtttaaaaaataaaataaaagttttgatgtttgagtaat
gacagacccaagggaagctgcagctgggtccatgcatctgtccttcaggt
tcagcccctggtcctgtcctgcacagctacagtgacattaaagtcaggga
tagggacactggtacgatccacacagcttagtcatatcgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_24526546_24527430
seq2: B6Ng01-187J10.b_45_929 (reverse)

seq1  AACCCTTTCCTCCCCAAGTCATGGTGTCCTAAGCAGGACAACCTGTGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTCCTCCCCAAGTCATGGTGTCCTAAGCAGGACAACCTGTGATC  50

seq1  TCATCTCCCTAAAACAATCGGGACAATAACACAAGTGTCTGTGCATGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCCCTAAAACAATCGGGACAATAACACAAGTGTCTGTGCATGGCT  100

seq1  TACTGCACCTTCCATTCTCTGACCCACTTGCTCATTCTTTCACTTACTTA  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGCACTTTCCATTCTCTGACCCACTTGCTCATTCTTTCACTTACTTA  150

seq1  CACATTTGTTCACAACACTGCAGAGCACGGTGAGGCCATTGCCTTCCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTGTTCACAACACTGCAGAGCACGGTGAGGCCATTGCCTTCCAGA  200

seq1  CACTGTGTTCATCCAAGGCAACAGAGCTATGGAATGTCCCTATCTCTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGTTCATCCAAGGCAACAGAGCTATGGAATGTCCCTATCTCTGCC  250

seq1  TCTTAGAGCTGAGGTGACACATTCTAAAGGACAAACTGTTATCAGTAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGAGCTGAGGTGACACATTCTAAAGGACAAACTGTTATCAGTAGGA  300

seq1  TGGGAGATGGAGGGAGCAGGTCAGTAAACAGCAAAAATGACCTGGATGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGATGGAGGGAGCAGGTCAGTAAACAGCAAAAATGACCTGGATGGA  350

seq1  GGCTGAGCCAGGATCCCAGGAATCTCCTAGAGAGTGCCCTGAAGTTCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGCCAGGATCCCAGGAATCTCCTAGAGAGTGCCCTGAAGTTCTGG  400

seq1  GGATGCCCATTGACTCCCTCAGTCTTCCATACCTCATCCAAGGACTAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCCCATTGACTCCCTCAGTCTTCCATACCTCATCCAAGGACTAAAA  450

seq1  ACTATAATCTGTGCTCTCTATATGGCACAAGCATCTTCCCTATTGAATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAATCTGTGCTCTCTATATGGCACAAGCATCTTCCCTATTGAATCT  500

seq1  TGCTGGCTCTTCCAGCCTCCCTGCCTTTGCTCCCTCATCCTCACCATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCTCTTCCAGCCTCCCTGCCTTTGCTCCCTCATCCTCACCATGGT  550

seq1  CCATGCCCTCTGAAGCTCATCCAGCCTACTATAGAATCTTTCATTGCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCTCTGAAGCTCATCCAGCCTACTATAGAATCTTTCATTGCTTG  600

seq1  CTTGCTTATGTTTTCCTTGGTCCTTTGTTTGTCTCCACCAGACTGTGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTATGTTTTCCTTGGTCCTTTGTTTGTCTCCACCAGACTGTGAAA  650

seq1  TCCCTGGGGGAAGGGACTGTCTCACTGGTGTCTGGATCCTGGGAGCTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGGGGAAGGGACTGTCTCACTGGTGTCTGGATCCTGGGAGCTATA  700

seq1  CAGCCATTGTAAGGAGAGTTCTGTTCTCAGAAATTACTGGCCCAATGGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATTGTAAGGAGAGTTCTGTTCTCAGAAATTACTGGCCCAATGGCT  750

seq1  AAGTGTTCCGGGGGCAACAAGATTACTCACTGCAGGTTACCCAGTCTGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTCCGGGGGCAACAAGATTACTCACTGCAGGTTACCCAGTCTGTT  800

seq1  CTGGCTAAATCTAATCTTAAAGAGCAAATAATCCAGCCTTGGACTCAGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTAAATCTAATCTTAAAGAGCAAATAATCCAGCCTTGGACTCAGTT  850

seq1  TTTGTTAATGTCCCTGGATCCCTCTGGAGGAATTC  885
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTAATGTCCCTGGATCCCTCTGGAGGAATTC  885

seq1: chr12_24413135_24413848
seq2: B6Ng01-187J10.g_64_777

seq1  GAATTCAGGACCAAGGCAGTGATGGGTTTCCTTCAGGCCAAGCTAGTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGACCAAGGCAGTGATGGGTTTCCTTCAGGCCAAGCTAGTTTG  50

seq1  AGAAGTCTGGGGGATATGTAGAGAGGAAAGGGCCGGATTTACAAACCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCTGGGGGATATGTAGAGAGGAAAGGGCCGGATTTACAAACCTCA  100

seq1  GCTTGAGGTCAAAAGAATGGACTGGTCACAGACACCCAGGCCTACAGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGGTCAAAAGAATGGACTGGTCACAGACACCCAGGCCTACAGATT  150

seq1  TCTTTACATTTCTGATTTTAATGTTTTTGCATGTGTATGCCTATGCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACATTTCTGATTTTAATGTTTTTGCATGTGTATGCCTATGCACTG  200

seq1  TGCATGTGTGTTTCCATATGTATGGGCACATGTGCATGTGTGGGCAGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTGTGTTTCCATATGTATGGGCACATGTGCATGTGTGGGCAGCTC  250

seq1  AAGGTAGACATTGGGTGTCTCCCTACCCCACTTTCCACTGTATTTTTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGACATTGGGTGTCTCCCTACCCCACTTTCCACTGTATTTTTTGA  300

seq1  GGCCAGGTCTCCTGAACTGTAGCTTGCTGATTTCAGCTAAGCTAGCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGGTCTCCTGAACTGTAGCTTGCTGATTTCAGCTAAGCTAGCCAGG  350

seq1  CAGCTGGCCCTGAGGATGTCCCATCTGTCTCTCAGATGCTGGGATTACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGCCCTGAGGATGTCCCATCTGTCTCTCAGATGCTGGGATTACAG  400

seq1  GTAACTGCCATACCTGCCCAGCTATTACATGGTTCTAGAGATCTGCATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGCCATACCTGCCCAGCTATTACATGGTTCTAGAGATCTGCATTC  450

seq1  CAGTCTTCATGCCTACACCGTGCATGTTTTATGCACTAAGCCATTGTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTCATGCCTACACCGTGCATGTTTTATGCACTAAGCCATTGTCTC  500

seq1  CCCACAGCCCTGTTTAAAAAATAAAATAAAAGTTTTGATGTTTGAGTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAGCCCTGTTTAAAAAATAAAATAAAAGTTTTGATGTTTGAGTAAT  550

seq1  GACAGACCCAAGGGAAGCTGCAGCTGGGTCCATGCATCTGTCCTTCAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACCCAAGGGAAGCTGCAGCTGGGTCCATGCATCTGTCCTTCAGGT  600

seq1  TCAGCCCCTGGTCCTGTCCTGCACAGCTACAGTGACATTAAAGTCAGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCCCTGGTCCTGTCCTGCACAGCTACAGTGACATTAAAGTCAGGGA  650

seq1  TAGGGACACTGGTACGATCCACACAGCTTAGTCATATCGTGTGTGTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGACACTGGTACGATCCACACAGCTTAGTCATATCGTGTGTGTGTGT  700

seq1  GTGTGTGTGTGTGT  714
      ||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGT  714