BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206L21
Chromosome12 (Build37)
Map Location 13,984,773 - 14,147,009
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG668473, LOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481
Downstream geneAW125753, LOC100043256, Map1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206L21.bB6Ng01-206L21.g
ACCGA026082GA026083
length1,0791,022
definitionB6Ng01-206L21.b B6Ng01-206L21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,984,773 - 13,985,851)(14,145,984 - 14,147,009)
sequence
gaattctaccccctacctcctctcttgcccagatcttctccccttctgtt
tccattcagataagagcaggcccccaagagacaacaaacacacacaacaa
aataggggacagcaagacaaggcacaagcctgcaaattgaggctggtcaa
gtcaactcaacaggagaaagagcatcatcacaagagcagacaaaagagtt
agagacacacctctctcactgttaggagtcccacaaaaccatcatatcct
agaggcagaggacctggtatagacctgtgctcaaagcgttatcctccgtg
atctcatactacttgaccgagggcttgaactctaacccagtctgtagtca
ataagatcttttggcaatggagcctatggttctatcgcttatatctgata
ttcatccttctgatataaaaacatttcagggtaatttggagcttaggcaa
ccctttatctggctcttggtgcactaaattctgaatactaaggtctcaaa
aactcttagaagccaccaaagccatcctgagccagtggtttttgctatct
tacctcacagattctgaaatgaaattatgaccacagaggctgtgtttcag
agagaaatttgttacagattcataggggaccataagaggagggaacatag
gccatgggtagcagaaggagcccttgggaataggtatcattgagctgctt
gcctggagcctttttgaaggacttacattagataagatgaactatgggta
gaggatctagtcaaactgcttagtctaatgatgaggagtccaggtgtctc
ctctctatttcagtaatgtccgaacagggaagagataacaagaaagcact
atctggctctctcttctggagtacttttcttccagtgaggacattcttag
agaggttgctttgggactcactgctctctctggtaagtttctatttcctg
ttatcattttcatgggagccttcacctgcctttacctatagcttcctctg
ctttggctttttatctttgacttagacactatatacatttacatatacat
atacgtattacatatacgtatacatatac
gaattcatggcaaggttgtgttttacatacaacatttccattgcatattt
gaactcacagcacctgtggctacccacacaagattggtgcaagataaagt
gggttaaaaatttcagcttaaatggtctgctaaaagaagctgctattggc
aatagttgggggggcatagtcacttttctttagcagtgtagagactggta
gattcctcatgcccttatggatggcctaatacctgtattcatatgaatgg
cactaattggactctctgaggttaatttattaattagaatgagatctgtg
caaggaagcaggaacatcattacccttaatccactacagcctagaatata
gctaattatcagagtatcattattttttaattctatagtgtctaagaaga
aaagcatacattaaaggcattgactggcatggaagatctgaatgagattt
ctaaaatagtcacacctttctgatgaatttttaatagtttagaggaatcg
aaatattttattctctttactcaaacataatagtctatcatcggtcatta
ctatgtaaaagtctatttgtagggtaagtttgaccctaaaatagcttaga
aggaagatttatatgtgcagaggcaaagcccttttgccgttgaactatta
caattagcatgctatcaagcacataatttaccaatcagtttaccatacac
tgtagacaggatctttgattgatggtccatgtagattggtctattaagac
ttagttcactgggataagttccatagtagaaagatgtgcaaatattgagg
tttcatggagtttgctgagcccagagcagttatgaactacaaagggataa
cctcattcaaggggagacagaaggacacagacacgggatgtggcagacac
tgttaactgggtcagatgcaccatacaaaagtcatttagcatcaaatttt
ttaacccaagtagaatcatttctaagtggggtagttgctagccagaacta
gccactatgagaagtgatattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_13984773_13985851
seq2: B6Ng01-206L21.b_49_1127

seq1  GAATTCTACCCCCTACCTCCTCTCTTGCCCAGATCTTCTCCCCTTCTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACCCCCTACCTCCTCTCTTGCCCAGATCTTCTCCCCTTCTGTT  50

seq1  TCCATTCAGATAAGAGCAGGCCCCCAAGAGACAACAAACACACACAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTCAGATAAGAGCAGGCCCCCAAGAGACAACAAACACACACAACAA  100

seq1  AATAGGGGACAGCAAGACAAGGCACAAGCCTGCAAATTGAGGCTGGTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGGGACAGCAAGACAAGGCACAAGCCTGCAAATTGAGGCTGGTCAA  150

seq1  GTCAACTCAACAGGAGAAAGAGCATCATCACAAGAGCAGACAAAAGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACTCAACAGGAGAAAGAGCATCATCACAAGAGCAGACAAAAGAGTT  200

seq1  AGAGACACACCTCTCTCACTGTTAGGAGTCCCACAAAACCATCATATCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACACACCTCTCTCACTGTTAGGAGTCCCACAAAACCATCATATCCT  250

seq1  AGAGGCAGAGGACCTGGTATAGACCTGTGCTCAAAGCGTTATCCTCCGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGAGGACCTGGTATAGACCTGTGCTCAAAGCGTTATCCTCCGTG  300

seq1  ATCTCATACTACTTGACCGAGGGCTTGAACTCTAACCCAGTCTGTAGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATACTACTTGACCGAGGGCTTGAACTCTAACCCAGTCTGTAGTCA  350

seq1  ATAAGATCTTTTGGCAATGGAGCCTATGGTTCTATCGCTTATATCTGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATCTTTTGGCAATGGAGCCTATGGTTCTATCGCTTATATCTGATA  400

seq1  TTCATCCTTCTGATATAAAAACATTTCAGGGTAATTTGGAGCTTAGGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCTTCTGATATAAAAACATTTCAGGGTAATTTGGAGCTTAGGCAA  450

seq1  CCCTTTATCTGGCTCTTGGTGCACTAAATTCTGAATACTAAGGTCTCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTATCTGGCTCTTGGTGCACTAAATTCTGAATACTAAGGTCTCAAA  500

seq1  AACTCTTAGAAGCCACCAAAGCCATCCTGAGCCAGTGGTTTTTGCTATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTAGAAGCCACCAAAGCCATCCTGAGCCAGTGGTTTTTGCTATCT  550

seq1  TACCTCACAGATTCTGAAATGAAATTATGACCACAGAGGCTGTGTTTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCACAGATTCTGAAATGAAATTATGACCACAGAGGCTGTGTTTCAG  600

seq1  AGAGAAATTTGTTACAGATTCATAGGGGACCATAAGAGGAGGGAACATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAATTTGTTACAGATTCATAGGGGACCATAAGAGGAGGGAACATAG  650

seq1  GCCATGGGTAGCAGAAGGAGCCCTTGGGAATAGGTATCATTGAGCTGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGGTAGCAGAAGGAGCCCTTGGGAATAGGTATCATTGAGCTGCTT  700

seq1  GCCTGGAGCCTTTTTGAAGGACTTACATTAGATAAGATGAACTATGGGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGAGCCTTTTTGAAGGACTTACATTAGATAAGATGAACTATGGGTA  750

seq1  GAGGATCTAGTCAAACTGCTTAGTCTAATGATGAGGAGTCCAGGTGTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCTAGTCAAACTGCTTAGTCTAATGATGAGGAGTCCAGGTGTCTC  800

seq1  CTCTCTATTTCAGTAATGTCCGAACAGGGAAGAGATAACAAGAAAGCACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTATTTCAGTAATGTCCGAACAGGGAAGAGATAACAAGAAAGCACT  850

seq1  ATCTGGCTCTCTCTTCTGGAGTACTTTTCTTCCAGTGAGGACATTCTTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGCTCTCTCTTCTGGAGTACTTTTCTTCCAGTGAGGACATTCTTAG  900

seq1  AGAGGTTGCTTT-GGACTCACTGCTCTCTCTGGTAAGTTTCTATTTCCTG  949
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTGCTTTGGGACTCACTGCTCTCTCTGGTAAGTTTCTATTTCCTG  950

seq1  TTATCATTTTCATGGGAGCCTTCACCTGCCTTTACCTATAGCTTTCCTCT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTATCATTTTCATGGGAGCCTTCACCTGCCTTTACCTATAGC-TTCCTCT  999

seq1  GCTTTGGCTTTTTATCTTTGACTTAGAACACTATATACATATACATATAC  1049
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTTTGGCTTTTTATCTTTGACTTAG-ACACTATATACATTTACATATAC  1048

seq1  ATATACATA-TACATATACATATACATATAC  1079
      |||||| || ||||||||| |||||||||||
seq2  ATATACGTATTACATATACGTATACATATAC  1079

seq1: chr12_14145984_14147009
seq2: B6Ng01-206L21.g_62_1083 (reverse)

seq1  CAATATCACTTCTCATAGTGGCTAGTTCTGGCTTAGCAACTACCCCACCT  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  
seq2  CAATATCACTTCTCATAGTGGCTAGTTCTGGC-TAGCAACTACCCCAC--  47

seq1  TAAGAAATGATTCTACTTTGGTTAAAAAATTTTGATGCTAAATGACTTTT  100
      | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  TTAGAAATGATTCTACTTGGGTTAAAAAA-TTTGATGCTAAATGAC-TTT  95

seq1  TGTATGGTGCATCTGA-CCAGTTAACAGTGTCTGCCACATCCCGTGTCTG  149
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGGTGCATCTGACCCAGTTAACAGTGTCTGCCACATCCCGTGTCTG  145

seq1  TGTCCTTCTGTCTCCCCTTGAATGAGGTTATCCCTTTGTAGTTCATAACT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTCTGTCTCCCCTTGAATGAGGTTATCCCTTTGTAGTTCATAACT  195

seq1  GCTCTGGGCTCAGCAAACTCCATGAAACCTCAATATTTGCACATCTTTCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGGGCTCAGCAAACTCCATGAAACCTCAATATTTGCACATCTTTCT  245

seq1  ACTATGGAACTTATCCCAGTGAACTAAGTCTTAATAGACCAATCTACATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGAACTTATCCCAGTGAACTAAGTCTTAATAGACCAATCTACATG  295

seq1  GACCATCAATCAAAGATCCTGTCTACAGTGTATGGTAAACTGATTGGTAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATCAATCAAAGATCCTGTCTACAGTGTATGGTAAACTGATTGGTAA  345

seq1  ATTATGTGCTTGATAGCATGCTAATTGTAATAGTTCAACGGCAAAAGGGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTGCTTGATAGCATGCTAATTGTAATAGTTCAACGGCAAAAGGGC  395

seq1  TTTGCCTCTGCACATATAAATCTTCCTTCTAAGCTATTTTAGGGTCAAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTCTGCACATATAAATCTTCCTTCTAAGCTATTTTAGGGTCAAAC  445

seq1  TTACCCTACAAATAGACTTTTACATAGTAATGACCGATGATAGACTATTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCTACAAATAGACTTTTACATAGTAATGACCGATGATAGACTATTA  495

seq1  TGTTTGAGTAAAGAGAATAAAATATTTCGATTCCTCTAAACTATTAAAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGAGTAAAGAGAATAAAATATTTCGATTCCTCTAAACTATTAAAAA  545

seq1  TTCATCAGAAAGGTGTGACTATTTTAGAAATCTCATTCAGATCTTCCATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCAGAAAGGTGTGACTATTTTAGAAATCTCATTCAGATCTTCCATG  595

seq1  CCAGTCAATGCCTTTAATGTATGCTTTTCTTCTTAGACACTATAGAATTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCAATGCCTTTAATGTATGCTTTTCTTCTTAGACACTATAGAATTA  645

seq1  AAAAATAATGATACTCTGATAATTAGCTATATTCTAGGCTGTAGTGGATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAATGATACTCTGATAATTAGCTATATTCTAGGCTGTAGTGGATT  695

seq1  AAGGGTAATGATGTTCCTGCTTCCTTGCACAGATCTCATTCTAATTAATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTAATGATGTTCCTGCTTCCTTGCACAGATCTCATTCTAATTAATA  745

seq1  AATTAACCTCAGAGAGTCCAATTAGTGCCATTCATATGAATACAGGTATT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAACCTCAGAGAGTCCAATTAGTGCCATTCATATGAATACAGGTATT  795

seq1  AGGCCATCCATAAGGGCATGAGGAATCTACCAGTCTCTACACTGCTAAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATCCATAAGGGCATGAGGAATCTACCAGTCTCTACACTGCTAAAG  845

seq1  AAAAGTGACTATGCCCCCCCAACTATTGCCAATAGCAGCTTCTTTTAGCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGACTATGCCCCCCCAACTATTGCCAATAGCAGCTTCTTTTAGCA  895

seq1  GACCATTTAAGCTGAAATTTTTAACCCACTTTATCTTGCACCAATCTTGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATTTAAGCTGAAATTTTTAACCCACTTTATCTTGCACCAATCTTGT  945

seq1  GTGGGTAGCCACAGGTGCTGTGAGTTCAAATATGCAATGGAAATGTTGTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTAGCCACAGGTGCTGTGAGTTCAAATATGCAATGGAAATGTTGTA  995

seq1  TGTAAAACACAACCTTGCCATGAATTC  1026
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAACACAACCTTGCCATGAATTC  1022