BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-212I07
Chromosome12 (Build37)
Map Location 90,341,688 - 90,470,031
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrxn3
Upstream geneLOC546543, EG667388, LOC627971, LOC667395, LOC100039315, EG638008, EG666862, EG435337, LOC100039154, LOC633093, LOC667440, LOC100039383, EG266459, LOC667475, LOC620915, LOC435314, Adck1, LOC100039261, EG666915
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-212I07.bB6Ng01-212I07.g
ACCGA030292GA030293
length1,0351,148
definitionB6Ng01-212I07.b B6Ng01-212I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,468,991 - 90,470,031)(90,341,688 - 90,342,844)
sequence
gaattcagcaatcaccagtccgaaatcctatgcattttctggtcctttaa
ctttctgtcaagcaagcttcaactctctgcaactcagctctctaaaattg
ctttgcattatctcttactctcttatcataacttattatgtttcctttcc
taacagaatttgcatcagtgtttgtttataatttatattttcttactttt
ttccacctactgaaatgaaagcagagaatttcattgttattgttatcatc
taaatttttagatctaggctctgctccccccccaaaaaggcatcaaacta
gaagaaaacaaaaacaagagtcctgcaaacccccacaatccacagtttca
ctccccttagaatcaagagttctattgggaagtcagagtccacggagggt
ttttaaaatgcctggatcattgagtttgttaacttaacttctttgggtca
catgcttgtatacttaggagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgta
ctactttaacaaaaagaagtagatgctaccaattgagtttttcagcatgg
ggaaagagctcttttccctcacacttcctctctctgccttccccaaccat
gcctttcaagtcccactctttttcggtgctttatatttctgctactgtaa
aggattcatgtatatttctatttatatttgtgaatgaatgctctttgggc
agagccctgaaattcctgagaagtctgaattaagtcttttattcccaaag
agaactctgaacacatcccagaaaaaaattaatacattgaaaaataagag
cttgcacaggtgccaagaaaaggtactcaccataccacagtccagccact
cataagtaaatatatttgcaaatcatgccagagaagaaaaaataaattat
ttatcaatgaaatttactgagtgaacactgtgtgccaggaattgcttcac
agtagacacagcaaggtctttttccacatggttttatggtctaagtggat
agggttatgagaagtaattatcattatgtcagaga
gaattcaagacccagaaacaatacaaagtgacaggcatgatggagcatgc
aagtatcccaggactggaaagttagggatggttagaaccgtgggctcact
agcctgctggtccagcatgatcaatgattcccaggtctcagtgggagaaa
atccaagttattatctcaaaaaaacaaagtggatgtttcctgaagaataa
ccttagaggttgacctctggcctttatatgcatattcataagcacatacc
cattcataaaataatatacaaatttatatgcaaacatacaaattcatatg
caaacacacatggaaaggtatataaagtacatgaacacatacacacacag
agttttgtttgttttttaacaacaaggatggattatctaggcccatccct
tgagaagtaactatatcccagttaatgctagttattaagcctagttaatg
tgctttaatctcttaccatgtttcctctacagtagcataaaatggaactt
actaagatacactgacagatattttccttccctttcctgtccagcccatc
tgacttcacagaattattgccatatccagcaataagaccccagaattttg
tgaagaatacataagagcaaagagaactagagtgagtgccttctctttca
tctgccctttggtgttctcagtcccaacagagagactgttaacagagttg
ggtagctgtaggtcctaggctgtggacaggtgctaatactgagtgagagt
ggccataggcctgtgtgtctgacctatgtgggccagggctcaggagctga
gaggaggaagctgagctgcagggcatttccatctgtgaaaatgactttta
cctttgaggcagcagccgcgacagcaatatttcatgtcctccatggtgtc
tcctacctttaaatgtcagtcttcgaaggcaccttatctcctgtagcaca
cttcaattaggtattccaaatcacgcttctttcttttgggacaaatatgc
cagaggtgatatttactatcagtagcatttttatgctcatgggagaaaag
actgtgacatcagctcccttcttctaataggacccatgaatgaagacatc
agtctggcctttgagacggtacctgatgacttaggtgcctaacctcgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_90468991_90470031
seq2: B6Ng01-212I07.b_42_1076 (reverse)

seq1  TCTCTGACATAATGATAAATTACCTTCTTCATAAACCCTATCCACTTAGA  50
      |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||
seq2  TCTCTGACATAATGAT-AATTA-CTTC-TCAT-AACCCTATCCACTTAGA  46

seq1  CATTAAAACCCATGT-GAAAAAGACCTTGCTGTGTCTACTGTGAAGCAAT  99
      |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAAA-CCATGTGGAAAAAGACCTTGCTGTGTCTACTGTGAAGCAAT  95

seq1  TCCTGGCACACAGTGTTCACTCAGTAAATTTTCATTGATTAAATAATTTA  149
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  TCCTGGCACACAGTGTTCACTCAGTAAA-TTTCATTGA-TAAATAATTTA  143

seq1  TTTTTTCTTCTCTGGCATGATTTGCAAATATATTTACTTATGAGTGGCTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCTTCTCTGGCATGATTTGCAAATATATTTACTTATGAGTGGCTG  193

seq1  GACTGTGGTATGGTGAGTACCTTTTCTTGGCACCTGTGCAAGCTCTTATT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGGTATGGTGAGTACCTTTTCTTGGCACCTGTGCAAGCTCTTATT  243

seq1  TTTCAATGTATTAATTTTTTTCTGGGATGTGTTCAGAGTTCTCTTTGGGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAATGTATTAATTTTTTTCTGGGATGTGTTCAGAGTTCTCTTTGGGA  293

seq1  ATAAAAGACTTAATTCAGACTTCTCAGGAATTTCAGGGCTCTGCCCAAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGACTTAATTCAGACTTCTCAGGAATTTCAGGGCTCTGCCCAAAG  343

seq1  AGCATTCATTCACAAATATAAATAGAAATATACATGAATCCTTTACAGTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCATTCACAAATATAAATAGAAATATACATGAATCCTTTACAGTA  393

seq1  GCAGAAATATAAAGCACCGAAAAAGAGTGGGACTTGAAAGGCATGGTTGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAATATAAAGCACCGAAAAAGAGTGGGACTTGAAAGGCATGGTTGG  443

seq1  GGAAGGCAGAGAGAGGAAGTGTGAGGGAAAAGAGCTCTTTCCCCATGCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGCAGAGAGAGGAAGTGTGAGGGAAAAGAGCTCTTTCCCCATGCTG  493

seq1  AAAAACTCAATTGGTAGCATCTACTTCTTTTTGTTAAAGTAGTACACACA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTCAATTGGTAGCATCTACTTCTTTTTGTTAAAGTAGTACACACA  543

seq1  CACACACACACACACACACACACTCCTAAGTATACAAGCATGTGACCCAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACTCCTAAGTATACAAGCATGTGACCCAA  593

seq1  AGAAGTTAAGTTAACAAACTCAATGATCCAGGCATTTTAAAAACCCTCCG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTAAGTTAACAAACTCAATGATCCAGGCATTTTAAAAACCCTCCG  643

seq1  TGGACTCTGACTTCCCAATAGAACTCTTGATTCTAAGGGGAGTGAAACTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTCTGACTTCCCAATAGAACTCTTGATTCTAAGGGGAGTGAAACTG  693

seq1  TGGATTGTGGGGGTTTGCAGGACTCTTGTTTTTGTTTTCTTCTAGTTTGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTGTGGGGGTTTGCAGGACTCTTGTTTTTGTTTTCTTCTAGTTTGA  743

seq1  TGCCTTTTTGGGGGGGGAGCAGAGCCTAGATCTAAAAATTTAGATGATAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTTTGGGGGGGGAGCAGAGCCTAGATCTAAAAATTTAGATGATAA  793

seq1  CAATAACAATGAAATTCTCTGCTTTCATTTCAGTAGGTGGAAAAAAGTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAACAATGAAATTCTCTGCTTTCATTTCAGTAGGTGGAAAAAAGTAA  843

seq1  GAAAATATAAATTATAAACAAACACTGATGCAAATTCTGTTAGGAAAGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATATAAATTATAAACAAACACTGATGCAAATTCTGTTAGGAAAGGA  893

seq1  AACATAATAAGTTATGATAAGAGAGTAAGAGATAATGCAAAGCAATTTTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAATAAGTTATGATAAGAGAGTAAGAGATAATGCAAAGCAATTTTA  943

seq1  GAGAGCTGAGTTGCAGAGAGTTGAAGCTTGCTTGACAGAAAGTTAAAGGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCTGAGTTGCAGAGAGTTGAAGCTTGCTTGACAGAAAGTTAAAGGA  993

seq1  CCAGAAAATGCATAGGATTTCGGACTGGTGATTGCTGAATTC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAATGCATAGGATTTCGGACTGGTGATTGCTGAATTC  1035

seq1: chr12_90341688_90342844
seq2: B6Ng01-212I07.g_65_1212

seq1  GAATTCAAGACCCAGAAACAATACAAAGTGACAGGCATGATGGAGCATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACCCAGAAACAATACAAAGTGACAGGCATGATGGAGCATGC  50

seq1  AAGTATCCCAGGACTGGAAAGTTAGGGATGGTTAGAACCGTGGGCTCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATCCCAGGACTGGAAAGTTAGGGATGGTTAGAACCGTGGGCTCACT  100

seq1  AGCCTGCTGGTCCAGCATGATCAATGATTCCCAGGTCTCAGTGGGAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCTGGTCCAGCATGATCAATGATTCCCAGGTCTCAGTGGGAGAAA  150

seq1  ATCCAAGTTATTATCTCAAAAAAACAAAGTGGATGTTTCCTGAAGAATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAGTTATTATCTCAAAAAAACAAAGTGGATGTTTCCTGAAGAATAA  200

seq1  CCTTAGAGGTTGACCTCTGGCCTTTATATGCATATTCATAAGCACATACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGAGGTTGACCTCTGGCCTTTATATGCATATTCATAAGCACATACC  250

seq1  CATTCATAAAATAATATACAAATTTATATGCAAACATACAAATTCATATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATAAAATAATATACAAATTTATATGCAAACATACAAATTCATATG  300

seq1  CAAACACACATGGAAAGGTATATAAAGTACATGAACACATACACACACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACACATGGAAAGGTATATAAAGTACATGAACACATACACACACAG  350

seq1  AGTTTTGTTTGTTTTTTAACAACAAGGATGGATTATCTAGGCCCATCCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTGTTTGTTTTTTAACAACAAGGATGGATTATCTAGGCCCATCCCT  400

seq1  TGAGAAGTAACTATATCCCAGTTAATGCTAGTTATTAAGCCTAGTTAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGTAACTATATCCCAGTTAATGCTAGTTATTAAGCCTAGTTAATG  450

seq1  TGCTTTAATCTCTTACCATGTTTCCTCTACAGTAGCATAAAATGGAACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAATCTCTTACCATGTTTCCTCTACAGTAGCATAAAATGGAACTT  500

seq1  ACTAAGATACACTGACAGATATTTTCCTTCCCTTTCCTGTCCAGCCCATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGATACACTGACAGATATTTTCCTTCCCTTTCCTGTCCAGCCCATC  550

seq1  TGACTTCACAGAATTATTGCCATATCCAGCAATAAGACCCCAGAATTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTCACAGAATTATTGCCATATCCAGCAATAAGACCCCAGAATTTTG  600

seq1  TGAAGAATACATAAGAGCAAAGAGAACTAGAGTGAGTGCCTTCTCTTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAATACATAAGAGCAAAGAGAACTAGAGTGAGTGCCTTCTCTTTCA  650

seq1  TCTGCCCTTTGGTGTTCTCAGTCCCAACAGAGAGACTGTTAACAGAGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCTTTGGTGTTCTCAGTCCCAACAGAGAGACTGTTAACAGAGTTG  700

seq1  GGTAGCTGTAGGTCCTAGGCTGTGGACAGGTGCTAATACTGAGTGAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGCTGTAGGTCCTAGGCTGTGGACAGGTGCTAATACTGAGTGAGAGT  750

seq1  GGCCATAGGCCTGTGTGTCTGACCTATGTGGGCCAGGGCTCAGGAGCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATAGGCCTGTGTGTCTGACCTATGTGGGCCAGGGCTCAGGAGCTGA  800

seq1  GAGGAGGAAGCTGAGCTGCAGGGCATTTCCATCTGTGAAAATGACTTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGAAGCTGAGCTGCAGGGCATTTCCATCTGTGAAAATGACTTTTA  850

seq1  CCTTTGAGGCAGCAGCCGCGACAGCAATATTTCATGTCCTCCATGGTGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGAGGCAGCAGCCGCGACAGCAATATTTCATGTCCTCCATGGTGTC  900

seq1  TCCTACCTTTAAATGTCAGTCTTCGAAGGCACCTTATCTCCTGTAGCACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACCTTTAAATGTCAGTCTTCGAAGGCACCTTATCTCCTGTAGCACA  950

seq1  CTTCAATTAGGTATTCCAAATCACGCTTCTTTCTTTTGGGACAAATATGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAATTAGGTATTCCAAATCACGCTTCTTTCTTTTGGGACAAATATGC  1000

seq1  CAGAGGTGATATTTACTATTCCAGTAGCATTTTTAATGCTCATGGGAGAA  1050
      |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |
seq2  CAGAGGTGATATTTACTAT--CAGTAGCATTTTT-ATGCTCATGGGAG-A  1046

seq1  AAAGACCTTGTGAACATCAGCTCCCTTCTTCTAATAAGACCCATGGATGA  1100
      ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  AAAGAC--TGTG-ACATCAGCTCCCTTCTTCTAATAGGACCCATGAATGA  1093

seq1  GGACATCCAGTCTGG-CTTTGAGGACAGTAACTGGATGACTTAAGTGGCT  1149
       ||||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||| ||
seq2  AGACAT-CAGTCTGGCCTTTGA-GACGGTACCT-GATGACTTAGGTGCCT  1140

seq1  AACCTCGG  1157
      ||||||||
seq2  AACCTCGG  1148