BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213J02
Chromosome12 (Build37)
Map Location 70,193,762 - 70,315,269
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665967, LOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2
Upstream geneLOC100040696
Downstream geneKlhdc1, Klhdc2, Sdccag1, Arf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71, Sos2, LOC100040879, L2hgdh, Atp5s, Cdkl1, Map4k5, Spg3a, EG622339, Sav1, LOC100040999, Nin, ENSMUSG00000056391, Gm804, Pygl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213J02.bB6Ng01-213J02.g
ACCGA031052GA031053
length1,0631,068
definitionB6Ng01-213J02.b B6Ng01-213J02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,193,762 - 70,194,823)(70,314,198 - 70,315,269)
sequence
gaattcacaaatgtgtaaataatgtgaacagtgaagcttattaaaactac
tttttcatccgcatgaccatagcacaatgagactggatttttaaatacac
gtacttcatgctaggtctgacggcaaactcggagatcctattatgtttag
gcaacagccgaatagaataaatgtggactgtcccctccctggggatctct
ttagaagacaggtgttttgataatttccagcagatgcatatatcaggaga
acaggtcataaaaggaaagagccaagaccacaatttacacgccgaggaca
atgacaaggtaatgttttgtcaggcccaaaagagacacataacttttgga
agggtaaaatatacaatagaattgcccccaaaaaagtgacaataaatcta
taaattgtaaaataatgtatataatgaaatacatttctgtgcaatacaga
aaatgaagcaaggactagggacaccacgagcgccatcttgaggtgaaagc
tatcattcgcaaccacttcaaaacctctgtgccatccacacctgtgtaga
aaggcagggccgagggatttgactcaccacaacataagcccaaaggagct
agttcacacctataatcctaacactcgggaggtaaaggccatctcagtta
tagatcaagttcaaaaccaaccttggatacgagagaccctatctaaacaa
ttacaggtattcccatgagccaagtggtagctatctaggagctagcaagc
agcaaattcagagaggccgctgagcctctctgacgtggggcctttcacat
tgcagatgacggagtggcagggtcatccattaagttccacgtgcacctgc
tatggactggcatgcgcctgccctgctcagcactttgctccatgacggta
gggactgaaggtcatctttaaaatagatgtacattttcccagctcagaaa
tagatgttcaataaacattaacattaagattctatcacttatgctgaacc
gggttgaatgattacctctgttcttaggaataaattgaatgtctaaagac
agcacatgattaa
gaattcactatgctgaggatgttagagactggaacagtcattctggatat
tgttcagactactgcttgggagtgtggtgctgcggacctgtgatcccagc
acgtagctggaggcaggagagtgagaattcaagctcaccttcagggctgt
attcagtccaaagctggcctggcttcactggactctgtttcaaaaaacag
aaactaacaaaaattaatgttcagtggtgacacacaaagaggacaactct
aaacttgctgattagtctttctactctaaggcacctgtatataatatgta
ctcaacacttatttttaagaaaattagaatatgcttttagtttttaagat
tttattctgttttattttagcttaaaactatagaaaccttactgggtagc
acaagcaaagttggtgacgtgatcgtcctggggatgataacccagctgaa
agaggtaagttaagggctggagagatggctcagcggttaagagcactgac
tgctcttccagaggtctgagttcaaatcccagcaaccacatggtggctca
caaccatccgtaacaagatctggcgccctcttctggagtgtctgaagaca
gctacagtgtacttacatataataaataaataaatctttaaaaaaaaaaa
aagaggtaagttaagtttgacgagctttgccttttatttttggactcgag
ttggtgatgcgttgctgcggtaatgctttttcatagaaaacacaggaaca
tattttcacagaaaacatagccagcgatggcctcgtcatctgtgtccggg
ttctgcggtgttggtgggaaagactgtccaggtgttagtttgcatagccc
ccaggtagacccctagtgacctctgcttgaactgactctgggttctgaat
aagcaactgctgaccacatcctggtggcctgaggtactggttattctctt
agccaaaggcatctggtgagacgagcgggcagcagcctgggcctttcctt
tactacctgtggtttgcagcagtgtttccttatgtcagtgatctgggtaa
gtgagtgagtatgtctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_70193762_70194823
seq2: B6Ng01-213J02.b_45_1107

seq1  GAATTCACAAATGTGTAAATAATGTGAACAGTGAAGCTTATTAAAACTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAATGTGTAAATAATGTGAACAGTGAAGCTTATTAAAACTAC  50

seq1  TTTTTCATCCGCATGACCATAGCACAATGAGACTGGATTTTTAAATACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCATCCGCATGACCATAGCACAATGAGACTGGATTTTTAAATACAC  100

seq1  GTACTTCATGCTAGGTCTGACGGCAAACTCGGAGATCCTATTATGTTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTCATGCTAGGTCTGACGGCAAACTCGGAGATCCTATTATGTTTAG  150

seq1  GCAACAGCCGAATAGAATAAATGTGGACTGTCCCCTCCCTGGGGATCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACAGCCGAATAGAATAAATGTGGACTGTCCCCTCCCTGGGGATCTCT  200

seq1  TTAGAAGACAGGTGTTTTGATAATTTCCAGCAGATGCATATATCAGGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAGACAGGTGTTTTGATAATTTCCAGCAGATGCATATATCAGGAGA  250

seq1  ACAGGTCATAAAAGGAAAGAGCCAAGACCACAATTTACACGCCGAGGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTCATAAAAGGAAAGAGCCAAGACCACAATTTACACGCCGAGGACA  300

seq1  ATGACAAGGTAATGTTTTGTCAGGCCCAAAAGAGACACATAACTTTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAAGGTAATGTTTTGTCAGGCCCAAAAGAGACACATAACTTTTGGA  350

seq1  AGGGTAAAATATACAATAGAATTGCCCCCAAAAAAGTGACAATAAATCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAAAATATACAATAGAATTGCCCCCAAAAAAGTGACAATAAATCTA  400

seq1  TAAATTGTAAAATAATGTATATAATGAAATACATTTCTGTGCAATACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGTAAAATAATGTATATAATGAAATACATTTCTGTGCAATACAGA  450

seq1  AAATGAAGCAAGGACTAGGGACACCACGAGCGCCATCTTGAGGTGAAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAGCAAGGACTAGGGACACCACGAGCGCCATCTTGAGGTGAAAGC  500

seq1  TATCATTCGCAACCACTTCAAAACCTCTGTGCCATCCACACCTGTGTAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTCGCAACCACTTCAAAACCTCTGTGCCATCCACACCTGTGTAGA  550

seq1  AAGGCAGGGCCGAGGGATTTGACTCACCACAACATAAGCCCAAAGGAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGGGCCGAGGGATTTGACTCACCACAACATAAGCCCAAAGGAGCT  600

seq1  AGTTCACACCTATAATCCTAACACTCGGGAGGTAAAGGCCATCTCAGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCACACCTATAATCCTAACACTCGGGAGGTAAAGGCCATCTCAGTTA  650

seq1  TAGATCAAGTTCAAAACCAACCTTGGATACGAGAGACCCTATCTAAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCAAGTTCAAAACCAACCTTGGATACGAGAGACCCTATCTAAACAA  700

seq1  TTACAGGTATTCCCATGAGCCAAGTGGTAGCTATCTAGGAGCTAGCAAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGTATTCCCATGAGCCAAGTGGTAGCTATCTAGGAGCTAGCAAGC  750

seq1  AGCAAATTCAGAGAGGCCGCTGAGCCTCTCTGACGTGGGGCCTTTCACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAATTCAGAGAGGCCGCTGAGCCTCTCTGACGTGGGGCCTTTCACAT  800

seq1  TGCAGATGACGGAGTGGCAGGGTCATCCATTAAGTTCCACGTGCACCTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGATGACGGAGTGGCAGGGTCATCCATTAAGTTCCACGTGCACCTGC  850

seq1  TATGGACTGGCATGCGCCTGCCCTGCTCAGCACTTTGCTCCATGACGGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGACTGGCATGCGCCTGCCCTGCTCAGCACTTTGCTCCATGACGGTA  900

seq1  GGGACTGAAGGTCATCTTTAAAATAGATGTACA-TTTCCCAGCTCAGAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGGACTGAAGGTCATCTTTAAAATAGATGTACATTTTCCCAGCTCAGAAA  950

seq1  TAGATGTTCAATAAACATTAACATTAAGATTCTATCACTTATGCTGAACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGTTCAATAAACATTAACATTAAGATTCTATCACTTATGCTGAACC  1000

seq1  GGGTTGAATGATTACCTCTGTTCTTAGG-ATAAATTGAATGTCTAAAGAC  1048
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGAATGATTACCTCTGTTCTTAGGAATAAATTGAATGTCTAAAGAC  1050

seq1  AGCCACATGATTAA  1062
      || |||||||||||
seq2  AG-CACATGATTAA  1063

seq1: chr12_70314198_70315269
seq2: B6Ng01-213J02.g_65_1132 (reverse)

seq1  TCAGAC-TACTCACTCACTTACCCGAGACTCACTGACACTAAGGAACAAC  49
      |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||
seq2  TCAGACATACTCACTCACTTACCC-AGA-TCACTGACA-TAAGGAAACAC  47

seq1  TGCTGCAAACCACAGGGTAGTAA--GGAAGGCCCAGGCTGCTTGCCGCTC  97
      |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||| 
seq2  TGCTGCAAACCACA-GGTAGTAAAGGAAAGGCCCAGGCTGCTGCCCGCT-  95

seq1  CGTCTCACCAGATGCCTTTGGCTAAGAGAATAACCAGTACCTCAGGCCAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTCACCAGATGCCTTTGGCTAAGAGAATAACCAGTACCTCAGGCCAC  145

seq1  CAGGATGTGGTCAGCAGTTTGCTTATTCAGAAACCCAGAGTCAGTTCAAG  197
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGTGGTCAGCAG-TTGCTTATTCAG-AACCCAGAGTCAGTTCAAG  193

seq1  CAGAGGTCACTAGGGGTCTACCTGGGGGCTATGCAAACTAACACCTGGAC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTCACTAGGGGTCTACCTGGGGGCTATGCAAACTAACACCTGGAC  243

seq1  AGTCTTTCCCACCAACACCGCAGAACCCGGACACAGATGACGAGGCCATC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTCCCACCAACACCGCAGAACCCGGACACAGATGACGAGGCCATC  293

seq1  GCTGGCTATGTTTTCTGTGAAAATATGTTCCTGTGTTTTCTATGAAAAAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCTATGTTTTCTGTGAAAATATGTTCCTGTGTTTTCTATGAAAAAG  343

seq1  CATTACCGCAGCAACGCATCACCAACTCGAGTCCAAAAATAAAAGGCAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACCGCAGCAACGCATCACCAACTCGAGTCCAAAAATAAAAGGCAAA  393

seq1  GCTCGTCAAACTTAACTTACCTCTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGTCAAACTTAACTTACCTCTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTAT  443

seq1  TTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGAGGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGAGGG  493

seq1  CGCCAGATCTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCAGATCTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAT  543

seq1  TTGAACTCAGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTCAGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCCA  593

seq1  TCTCTCCAGCCCTTAACTTACCTCTTTCAGCTGGGTTATCATCCCCAGGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCAGCCCTTAACTTACCTCTTTCAGCTGGGTTATCATCCCCAGGA  643

seq1  CGATCACGTCACCAACTTTGCTTGTGCTACCCAGTAAGGTTTCTATAGTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCACGTCACCAACTTTGCTTGTGCTACCCAGTAAGGTTTCTATAGTT  693

seq1  TTAAGCTAAAATAAAACAGAATAAAATCTTAAAAACTAAAAGCATATTCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCTAAAATAAAACAGAATAAAATCTTAAAAACTAAAAGCATATTCT  743

seq1  AATTTTCTTAAAAATAAGTGTTGAGTACATATTATATACAGGTGCCTTAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCTTAAAAATAAGTGTTGAGTACATATTATATACAGGTGCCTTAG  793

seq1  AGTAGAAAGACTAATCAGCAAGTTTAGAGTTGTCCTCTTTGTGTGTCACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAAAGACTAATCAGCAAGTTTAGAGTTGTCCTCTTTGTGTGTCACC  843

seq1  ACTGAACATTAATTTTTGTTAGTTTCTGTTTTTTGAAACAGAGTCCAGTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACATTAATTTTTGTTAGTTTCTGTTTTTTGAAACAGAGTCCAGTG  893

seq1  AAGCCAGGCCAGCTTTGGACTGAATACAGCCCTGAAGGTGAGCTTGAATT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGGCCAGCTTTGGACTGAATACAGCCCTGAAGGTGAGCTTGAATT  943

seq1  CTCACTCTCCTGCCTCCAGCTACGTGCTGGGATCACAGGTCCGCAGCACC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTCTCCTGCCTCCAGCTACGTGCTGGGATCACAGGTCCGCAGCACC  993

seq1  ACACTCCCAAGCAGTAGTCTGAACAATATCCAGAATGACTGTTCCAGTCT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCCCAAGCAGTAGTCTGAACAATATCCAGAATGACTGTTCCAGTCT  1043

seq1  CTAACATCCTCAGCATAGTGAATTC  1072
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACATCCTCAGCATAGTGAATTC  1068