BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214M23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 76,516,678 - 76,715,448
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGphb5, Ppp2r5e
Upstream geneKcnh5, Rhoj
Downstream geneWdr89, LOC665931, Sgpp1, Syne2, Esr2, LOC665957, Tex21, Mthfd1, Akap5, Zbtb25, Zbtb1, Hspa2, Gm70, LOC100041694, Plekhg3, Spnb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214M23.bB6Ng01-214M23.g
ACCGA031957GA031958
length1,132999
definitionB6Ng01-214M23.b B6Ng01-214M23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,516,678 - 76,517,814)(76,714,421 - 76,715,448)
sequence
gaattccctcacagcacagcccacaaaagtgtgcaggttcccactggagc
tgctgaggacagagtcagggccacccaggagaaggagggccactgcacca
aggacaaggtataccaacttcatgctatttcccaggaagaaaaggaaaca
aagttgaacataaccaactgctcacggtggtgctgcccaccactgtggtg
gcccctctcaaagaggccttgctcttagcactacaggaaaaaaaatgagc
ccaggaattgtccaactccaagagctccctaactagtggatagtcaatag
ttctctctagataccctaccctcaaagcagtctcaggctttcccttggtg
aactcctggagctgatttatacataaaaggaatttatcccgatgaaaaat
aagaggcacaccaaaagaaatgtagagcctgaaatagcacacatcccttc
tttttaccaggtccagcgtatgcaggtgtcacgttagagcttagcacata
tatgtgctttcagtgtcataaatgggcaatgaatgggagaggaagataag
tactaataatggcgtgtcctgggtgtgttgtggctaacccaacctaccat
acaggaggcattataaaacctggtgcctggtgtggtagccactcataaaa
tgttttctatgccccatagattacctctgccctgcgttatgcgaaatctc
aagctgtggctcagtttaaaagcaaacaatggaaagagcattacatcctc
ctatgaagtctgttcttgatcctttctggttagtagcacacgatgcttgc
ccactgcacagaacacacatggacgtcacatgtgtatcatgttccaagtc
agtgccactcaaggagagctatatttccaaagctgtaccttcagttccta
ctggtatgggatgctgtcatacagacaccatgggcttctgctcagagaag
acgtgagtgatggagagacacttacctgaccttgctggaatcaactcttc
ttggagagctgaccacttgtaccccaaggctttcaaagttgcaatgagtg
gaagaaagttcactctggtaagtgtctctcctttctgttattcagctggc
tgattatcaaattatagggaagtattgtcaat
gaattcttaacacctctataaaaagctagctgtggcatgtgtctgtgatt
gaaaacccaggggctgagacagatagacggatccgtggagggcatgtggc
cagctagtttagctaaactgtaagcttctgttgcagtgagagacccctcc
tcaaagcctggagtgcagagcaactgagaaagacatccaacatcaacttc
tggtctctgtgtatgcatacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacgcacacacacacacacacgcacacacac
gcacacacacgcgcgcacacacacacacggatatgtagacctatcccata
cgttatagtataatttccaccaagtaagctgttccagggcttacaccctt
tataaatccatgtgggttttttgtttttgtttttaaagatttatttattc
actatataaacagcagtctcctacatgtatgcctgaagaccagaagaggg
catcagatgccattacagatgattgtgagccaccatgtggttgctgggaa
ttgaactcaggacctctggaagagcagccagtgctcttaacctctgagcc
atctctccagccctccatgtgggttttaaaaatttcagtctaaatttatt
tatttatttatttttatttttattttattttatttttttggttttttgag
acagggtttctctgtgtagtcctggctgtcctggaactcactctgtagac
caggctggcctgaactcagaattcgcctgcctctgcctcccaaatgctgg
gatttaaggtgtaagccaccatcgcctggcctaatttaattttaagatta
tttatttatgtgttgggtgtctcactgcatgtatattgtactcacatcct
tggtactgagaggcagagagggtactgaagctctggactgagttacgata
ccatgagctgccctagcatgctagataacagtgctttactgctgagtca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_76516678_76517814
seq2: B6Ng01-214M23.b_49_1180

seq1  GAATTCCCTCACAGCACAGCCCACAAAAGTGTGCAGGTTCCCACTGGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTCACAGCACAGCCCACAAAAGTGTGCAGGTTCCCACTGGAGC  50

seq1  TGCTGAGGACAGAGTCAGGGCCACCCAGGAGAAGGAGGGCCACTGCACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGGACAGAGTCAGGGCCACCCAGGAGAAGGAGGGCCACTGCACCA  100

seq1  AGGACAAGGTATACCAACTTCATGCTATTTCCCAGGAAGAAAAGGAAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAAGGTATACCAACTTCATGCTATTTCCCAGGAAGAAAAGGAAACA  150

seq1  AAGTTGAACATAACCAACTGCTCACGGTGGTGCTGCCCACCACTGTGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGAACATAACCAACTGCTCACGGTGGTGCTGCCCACCACTGTGGTG  200

seq1  GCCCCTCTCAAAGAGGCCTTGCTCTTAGCACTACAGGAAAAAAAATGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCTCAAAGAGGCCTTGCTCTTAGCACTACAGGAAAAAAAATGAGC  250

seq1  CCAGGAATTGTCCAACTCCAAGAGCTCCCTAACTAGTGGATAGTCAATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAATTGTCCAACTCCAAGAGCTCCCTAACTAGTGGATAGTCAATAG  300

seq1  TTCTCTCTAGATACCCTACCCTCAAAGCAGTCTCAGGCTTTCCCTTGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTAGATACCCTACCCTCAAAGCAGTCTCAGGCTTTCCCTTGGTG  350

seq1  AACTCCTGGAGCTGATTTATACATAAAAGGAATTTATCCCGATGAAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTGGAGCTGATTTATACATAAAAGGAATTTATCCCGATGAAAAAT  400

seq1  AAGAGGCACACCAAAAGAAATGTAGAGCCTGAAATAGCACACATCCCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGCACACCAAAAGAAATGTAGAGCCTGAAATAGCACACATCCCTTC  450

seq1  TTTTTACCAGGTCCAGCGTATGCAGGTGTCACGTTAGAGCTTAGCACATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACCAGGTCCAGCGTATGCAGGTGTCACGTTAGAGCTTAGCACATA  500

seq1  TATGTGCTTTCAGTGTCATAAATGGGCAATGAATGGGAGAGGAAGATAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCTTTCAGTGTCATAAATGGGCAATGAATGGGAGAGGAAGATAAG  550

seq1  TACTAATAATGGCGTGTCCTGGGTGTGTTGTGGCTAACCCAACCTACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATAATGGCGTGTCCTGGGTGTGTTGTGGCTAACCCAACCTACCAT  600

seq1  ACAGGAGGCATTATAAAACCTGGTGCCTGGTGTGGTAGCCACTCATAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGGCATTATAAAACCTGGTGCCTGGTGTGGTAGCCACTCATAAAA  650

seq1  TGTTTTCTATGCCCCATAGATTACCTCTGCCCTGCGTTATGCGAAATCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCTATGCCCCATAGATTACCTCTGCCCTGCGTTATGCGAAATCTC  700

seq1  AAGCTGTGGCTCAGTTTAAAAGCAAACAATGGAAAGAGCATTACATCCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTGGCTCAGTTTAAAAGCAAACAATGGAAAGAGCATTACATCCTC  750

seq1  CTATGAAGTCTGTTCTTGATCCTTTCTGGTTAGTAGCACACGATGCTTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAAGTCTGTTCTTGATCCTTTCTGGTTAGTAGCACACGATGCTTGC  800

seq1  CCACTGCACAGAACACACATGGACGTCACATGTGTATCATGTTCCAAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCACAGAACACACATGGACGTCACATGTGTATCATGTTCCAAGTC  850

seq1  AGTGCCACTCAAGGAGAGCTATATTTCCAAAGCTGTACCTTCAGTTCCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCACTCAAGGAGAGCTATATTTCCAAAGCTGTACCTTCAGTTCCTA  900

seq1  CTGGTATGGGATGCTGTCATACAGACACCATGGGCTTCTGCTCAGGAGGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  
seq2  CTGGTATGGGATGCTGTCATACAGACACCATGGGCTTCTGCTCA-GAG--  947

seq1  AGGACGTGAGTGATGGAGAGACACTTACCTGACCTTGCTGGAATCAACTC  1000
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACGTGAGTGATGGAGAGACACTTACCTGACCTTGCTGGAATCAACTC  997

seq1  TTCTTGGAGAGCTGA-CACTTGTACCCC-AGGCTTTCAAAAGTTGCAATG  1048
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  TTCTTGGAGAGCTGACCACTTGTACCCCAAGGCTTTC-AAAGTTGCAATG  1046

seq1  AGTGG-AGAAAGTTCACTCTGGGTAAGTGTCTCTCCTTTCTGTTATCAGG  1097
      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |
seq2  AGTGGAAGAAAGTTCACTCT-GGTAAGTGTCTCTCCTTTCTGTTATTCAG  1095

seq1  CTGCCTGATTATTCAAATATATAGGGAAGGTATTGTCAAT  1137
      ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  CTGGCTGATTA-TCAAAT-TATAGGGAA-GTATTGTCAAT  1132

seq1: chr12_76714421_76715448
seq2: B6Ng01-214M23.g_67_1065 (reverse)

seq1  TGACTCAGCAGTTAAAAGCACTCGTTTAATTCCTAGCATGCTTAGGGCAG  50
      ||||||||||||  |||||||| |||  ||  ||||||||| ||||||||
seq2  TGACTCAGCAGT--AAAGCACT-GTT--AT--CTAGCATGC-TAGGGCAG  42

seq1  CTCATGGTTATCTGTAACTCCAGTTCCAGGGGCTCCAGTACCCTCTTCTT  100
      ||||||| |||| |||||| ||| |||| | ||| |||||||||| ||| 
seq2  CTCATGG-TATC-GTAACT-CAG-TCCA-GAGCTTCAGTACCCTC-TCT-  85

seq1  GGCCTCTTCAGGTACCAAGGATGTGGAGTACAAATATACATGCAGGTGAG  150
       ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||
seq2  -GCCTC-TCA-GTACCAAGGATGT-GAGTAC-AATATACATGCA-GTGAG  129

seq1  ACACCCAAACACATAAAATAAAATAAATCTTAAAAAATTAAATTTAGGCC  200
      |||||| ||||||| |||||||   ||||||  ||||||||| |||||||
seq2  ACACCC-AACACAT-AAATAAA--TAATCTT--AAAATTAAA-TTAGGCC  172

seq1  AGGCGATGGTGGCTTACACCTTAAATCCCAGCATTTGGGAGGCAGAGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGATGGTGGCTTACACCTTAAATCCCAGCATTTGGGAGGCAGAGGCA  222

seq1  GGCGAATTTCTGAGTTCAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGA  300
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAA-TTCTGAGTTCAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGA  271

seq1  CAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAAAAAATAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAAAAAATAAA  321

seq1  ATAAAATAAAAATAAAAATAAATAAATAAATAAATTTAGACTGAAATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAAAAATAAAAATAAATAAATAAATAAATTTAGACTGAAATTTT  371

seq1  TAAAACCCACATGGAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACCCACATGGAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTG  421

seq1  GCTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGC  471

seq1  TCACAATCATCTGTAATGGCATCTGATGCCCTCTTCTGGTCTTCAGGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAATCATCTGTAATGGCATCTGATGCCCTCTTCTGGTCTTCAGGCAT  521

seq1  ACATGTAGGAGACTGCTGTTTATATAGTGAATAAATAAATCTTTAAAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTAGGAGACTGCTGTTTATATAGTGAATAAATAAATCTTTAAAAAC  571

seq1  AAAAACAAAAAACCCACATGGATTTATAAAGGGTGTAAGCCCTGGAACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAAAACCCACATGGATTTATAAAGGGTGTAAGCCCTGGAACAG  621

seq1  CTTACTTGGTGGAAATTATACTATAACGTATGGGATAGGTCTACATATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTTGGTGGAAATTATACTATAACGTATGGGATAGGTCTACATATCC  671

seq1  GTGTGTGTGTGTGCGCGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGCGCGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGT  721

seq1  GTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  771

seq1  GTGTGTGTGTATGCATACACAGAGACCAGAAGTTGATGTTGGATGTCTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTATGCATACACAGAGACCAGAAGTTGATGTTGGATGTCTTT  821

seq1  CTCAGTTGCTCTGCACTCCAGGCTTTGAGGAGGGGTCTCTCACTGCAACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTTGCTCTGCACTCCAGGCTTTGAGGAGGGGTCTCTCACTGCAACA  871

seq1  GAAGCTTACAGTTTAGCTAAACTAGCTGGCCACATGCCCTCCACGGATCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTTACAGTTTAGCTAAACTAGCTGGCCACATGCCCTCCACGGATCC  921

seq1  GTCTATCTGTCTCAGCCCCTGGGTTTTCAATCACAGACACATGCCACAGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATCTGTCTCAGCCCCTGGGTTTTCAATCACAGACACATGCCACAGC  971

seq1  TAGCTTTTTATAGAGGTGTTAAGAATTC  1028
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTTTATAGAGGTGTTAAGAATTC  999