BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-222A06
Chromosome12 (Build37)
Map Location 70,069,088 - 70,228,944
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040696, LOC665967
Upstream geneLOC100040681
Downstream geneLOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2, Klhdc1, Klhdc2, Sdccag1, Arf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71, Sos2, LOC100040879, L2hgdh, Atp5s, Cdkl1, Map4k5, Spg3a, EG622339, Sav1, LOC100040999, Nin, ENSMUSG00000056391
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-222A06.bB6Ng01-222A06.g
ACCGA037153GA037154
length1,0241,136
definitionB6Ng01-222A06.b B6Ng01-222A06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,227,920 - 70,228,944)(70,069,088 - 70,070,229)
sequence
gaattccagtgtttctgccacactaatgctagtgtgggcagtgcctctgg
tctgtatctttgcattttcctatgactcattactttgcccccccctctcc
cttgttgttgttgaaagccggacatgatatattggctttatttgtgattt
tagaatcaggcagcactccagttcataaaacaaaacaggtgttccaatga
gctgagctgaggagattgcttttctagggagaaaagggctgaaggaggca
gaaatgaacaaacaggggagcactcatttcaaagttgctctcctttcaag
gaagccgctgggagaaaggaggatggaaaaaaaccccgactggctgacat
taggttattttgggctaaagttttcttaagtattctactggaagaaggtc
tttagttattcttctaacggaaatgagcctgttgaggggagatttggttc
cctccccttattggagcaaagctaggtgacagctcagtttctgtttggtg
atgtggaacttcagcttgagtagacaccatctgaaattttcctcaggttt
attggggcctagtggagaagcacacttgcaaatactgccctctgctgggc
atactggtgcatacctctaatcccaacacttggagtggcggcagaggcag
gtggatctctgagcattcgaggccagcctgagctacatagtgagttttca
ggacagccataactacatagtgagatcgtgtctcaagaaaccctgtctcg
aaaaaaccaaaaccaaaccaaaccaaaccaaccaaaccaaaccaaaacat
cctcttaacaggggtaaaaatgctaatactttaaccatttgtgatgtggc
attaaaggtgttttttatgacttgaatctcaatgtttctcattaagctca
tgctttggatatttaatactcattttgaaggtactacttataacgtggag
cctgatagaagtagttttcattgacgggttttggtttgtttttgagaacg
atcctatgtagctcttgtgtcctg
gaattcatttctaccatcccttgaaaacaacccactttgccaggacaccc
tttcctgttctgtattgcctaggtctcatcagagagacaccctctaagac
gctccctgtacatcaagacccttcctctacctggtgctccttgctagtcc
ccctgctcctggctggtctcccacacacagaatcaagattactttattga
ttattcattttctcggacccaacaccgggctgtgagctccttaagcacag
gggttgtacctaacttggtaagtgtttgtggaatccatcaaatccaaata
ccttcctcatgtcactttaaaaatatattgagttcctaaagggagaaagt
taaaattatgagtcctagaagaagcctcaaagatgtgaagtgggctgggc
agtaaacctggtcatcttacttacactaaggattgagcctgagataatgg
tgatagccttgcaatagaccaaccactgcacaaaagctggattcaaagtt
taaaatctagcctccctacctgggcaatgtagagagtggatgagaggaga
gctggccctgtcctttacctgggcaacatgggagagctgactgaagaggt
tatgagggtgagagagctgactgaagagatcatgagggtgggagagctga
ctgcagaagtcatgagggtgggagaactgactgaagaggtcatgagggtg
ggagagctgactgaaaaggtcatgagagtgggagagctgattgcagaatt
catgagggtgggaaagctaactgaagaggtcatgagggtgggaaagctga
ctgaagaggtcatgagagtgggaaagctgactgaagaggtcatgagggtg
ggcgagctgaggcctcctccctgctggccatttggtaacaggagtgtggg
agagatcttccaaccccctgcctgtggcatgtgagagaactggcccagtc
ccctcacctaggcagtgctggagagctgacccggattatatgagtgcaga
gagccagttctgtcttctgctgctgccacagcagaaaactgaccccaccc
ctcactgcacaattcaggagctggcctagtgcatgggtttcagagcactt
ggcagcttgaacaacacagtcatcagccaggctcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_70227920_70228944
seq2: B6Ng01-222A06.b_47_1070 (reverse)

seq1  CAGGACAACAAGAGCTACATAGACTCTGTCTCAAAAACAAAACAAAAACC  50
      |||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||
seq2  CAGGAC-ACAAGAGCTACATAGGATCGTTCTCAAAAAC-AAACCAAAACC  48

seq1  CGTCAATGGAAACTTACTTCTGTCAGGCTCCACCTTATAAAGTAGTACCT  100
      |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  CGTCAATGAAAAC-TACTTCTATCAGGCTCCACGTTAT-AAGTAGTACCT  96

seq1  TCAAAATGAGTATT-AATATTCAAAGCATGAGCTT-ATGAGAAACATTTG  148
      |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  TCAAAATGAGTATTAAATATCCAAAGCATGAGCTTAATGAGAAACA-TTG  145

seq1  AGATTCAAGTCATAAAATACACC-TTAATGCCACATCACAAATGGTT-AA  196
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGATTCAAGTCATAAAAAACACCTTTAATGCCACATCACAAATGGTTAAA  195

seq1  GTATTAGCATTTTTACCCCTGTTAAGAGGATGTTTTGGTTTGGTTTGGTT  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTATTAGCATTTTTACCCCTGTTAAGAGGATGTTTTGGTTTGGTTTGG-T  244

seq1  TGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTGGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTTGAGA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTGGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTTGAGA  294

seq1  CACGATCTCACTATGTAGTTATGGCTGTCCTG-AAACTCACTATGTAGCT  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CACGATCTCACTATGTAGTTATGGCTGTCCTGAAAACTCACTATGTAGCT  344

seq1  CAGGCTGGCCTCGAATGCTCAGAGATCCACCTGCCTCTGCCGCCACTCCA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCCTCGAATGCTCAGAGATCCACCTGCCTCTGCCGCCACTCCA  394

seq1  AGTGTTGGGATTAGAGGTATGCACCAGTATGCCCAGCAGAGGGCAGTATT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGGGATTAGAGGTATGCACCAGTATGCCCAGCAGAGGGCAGTATT  444

seq1  TGCAAGTGTGCTTCTCCACTAGGCCCCAATAAACCTGAGGAAAATTTCAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGTGTGCTTCTCCACTAGGCCCCAATAAACCTGAGGAAAATTTCAG  494

seq1  ATGGTGTCTACTCAAGCTGAAGTTCCACATCACCAAACAGAAACTGAGCT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGTCTACTCAAGCTGAAGTTCCACATCACCAAACAGAAACTGAGCT  544

seq1  GTCACCTAGCTTTGCTCCAATAAGGGGAGGGAACCAAATCTCCCCTCAAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTAGCTTTGCTCCAATAAGGGGAGGGAACCAAATCTCCCCTCAAC  594

seq1  AGGCTCATTTCCGTTAGAAGAATAACTAAAGACCTTCTTCCAGTAGAATA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCATTTCCGTTAGAAGAATAACTAAAGACCTTCTTCCAGTAGAATA  644

seq1  CTTAAGAAAACTTTAGCCCAAAATAACCTAATGTCAGCCAGTCGGGGTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGAAAACTTTAGCCCAAAATAACCTAATGTCAGCCAGTCGGGGTTT  694

seq1  TTTTCCATCCTCCTTTCTCCCAGCGGCTTCCTTGAAAGGAGAGCAACTTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCATCCTCCTTTCTCCCAGCGGCTTCCTTGAAAGGAGAGCAACTTT  744

seq1  GAAATGAGTGCTCCCCTGTTTGTTCATTTCTGCCTCCTTCAGCCCTTTTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGAGTGCTCCCCTGTTTGTTCATTTCTGCCTCCTTCAGCCCTTTTC  794

seq1  TCCCTAGAAAAGCAATCTCCTCAGCTCAGCTCATTGGAACACCTGTTTTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAGAAAAGCAATCTCCTCAGCTCAGCTCATTGGAACACCTGTTTTG  844

seq1  TTTTATGAACTGGAGTGCTGCCTGATTCTAAAATCACAAATAAAGCCAAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGAACTGGAGTGCTGCCTGATTCTAAAATCACAAATAAAGCCAAT  894

seq1  ATATCATGTCCGGCTTTCAACAACAACAAGGGAGAGGGGGGGGCAAAGTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCATGTCCGGCTTTCAACAACAACAAGGGAGAGGGGGGGGCAAAGTA  944

seq1  ATGAGTCATAGGAAAATGCAAAGATACAGACCAGAGGCACTGCCCACACT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTCATAGGAAAATGCAAAGATACAGACCAGAGGCACTGCCCACACT  994

seq1  AGCATTAGTGTGGCAGAAACACTGGAATTC  1025
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTAGTGTGGCAGAAACACTGGAATTC  1024

seq1: chr12_70069088_70070229
seq2: B6Ng01-222A06.g_68_1203

seq1  GAATTCATTTCTACCATCCCTTGAAAACAACCCACTTTGCCAGGACACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCTACCATCCCTTGAAAACAACCCACTTTGCCAGGACACCC  50

seq1  TTTCCTGTTCTGTATTGCCTAGGTCTCATCAGAGAGACACCCTCTAAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGTTCTGTATTGCCTAGGTCTCATCAGAGAGACACCCTCTAAGAC  100

seq1  GCTCCCTGTACATCAAGACCCTTCCTCTACCTGGTGCTCCTTGCTAGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTGTACATCAAGACCCTTCCTCTACCTGGTGCTCCTTGCTAGTCC  150

seq1  CCCTGCTCCTGGCTGGTCTCCCACACACAGAATCAAGATTACTTTATTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCTCCTGGCTGGTCTCCCACACACAGAATCAAGATTACTTTATTGA  200

seq1  TTATTCATTTTCTCGGACCCAACACCGGGCTGTGAGCTCCTTAAGCACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCATTTTCTCGGACCCAACACCGGGCTGTGAGCTCCTTAAGCACAG  250

seq1  GGGTTGTACCTAACTTGGTAAGTGTTTGTGGAATCCATCAAATCCAAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTACCTAACTTGGTAAGTGTTTGTGGAATCCATCAAATCCAAATA  300

seq1  CCTTCCTCATGTCACTTTAAAAATATATTGAGTTCCTAAAGGGAGAAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTCATGTCACTTTAAAAATATATTGAGTTCCTAAAGGGAGAAAGT  350

seq1  TAAAATTATGAGTCCTAGAAGAAGCCTCAAAGATGTGAAGTGGGCTGGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTATGAGTCCTAGAAGAAGCCTCAAAGATGTGAAGTGGGCTGGGC  400

seq1  AGTAAACCTGGTCATCTTACTTACACTAAGGATTGAGCCTGAGATAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAACCTGGTCATCTTACTTACACTAAGGATTGAGCCTGAGATAATGG  450

seq1  TGATAGCCTTGCAATAGACCAACCACTGCACAAAAGCTGGATTCAAAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCCTTGCAATAGACCAACCACTGCACAAAAGCTGGATTCAAAGTT  500

seq1  TAAAATCTAGCCTCCCTACCTGGGCAATGTAGAGAGTGGATGAGAGGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCTAGCCTCCCTACCTGGGCAATGTAGAGAGTGGATGAGAGGAGA  550

seq1  GCTGGCCCTGTCCTTTACCTGGGCAACATGGGAGAGCTGACTGAAGAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCCCTGTCCTTTACCTGGGCAACATGGGAGAGCTGACTGAAGAGGT  600

seq1  TATGAGGGTGAGAGAGCTGACTGAAGAGATCATGAGGGTGGGAGAGCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGGGTGAGAGAGCTGACTGAAGAGATCATGAGGGTGGGAGAGCTGA  650

seq1  CTGCAGAAGTCATGAGGGTGGGAGAACTGACTGAAGAGGTCATGAGGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAAGTCATGAGGGTGGGAGAACTGACTGAAGAGGTCATGAGGGTG  700

seq1  GGAGAGCTGACTGAAAAGGTCATGAGAGTGGGAGAGCTGATTGCAGAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGCTGACTGAAAAGGTCATGAGAGTGGGAGAGCTGATTGCAGAATT  750

seq1  CATGAGGGTGGGAAAGCTAACTGAAGAGGTCATGAGGGTGGGAAAGCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGGGTGGGAAAGCTAACTGAAGAGGTCATGAGGGTGGGAAAGCTGA  800

seq1  CTGAAGAGGTCATGAGAGTGGGAAAGCTGACTGAAGAGGTCATGAGGGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAGGTCATGAGAGTGGGAAAGCTGACTGAAGAGGTCATGAGGGTG  850

seq1  GGCGAGCTGAGGCCTCCTCCCTGCTGGCCATTTGGTAACAGGAGTGTGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAGCTGAGGCCTCCTCCCTGCTGGCCATTTGGTAACAGGAGTGTGGG  900

seq1  AGAGATCTTCCAACCCCCTGCCTGTGGCATGTGAGAGAACTGGCCCAGTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATCTTCCAACCCCCTGCCTGTGGCATGTGAGAGAACTGGCCCAGTC  950

seq1  CCCTCACCTAGGCAGTGCTGGAGAGCTGACCCGGA-TATATGAGTGCAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  CCCTCACCTAGGCAGTGCTGGAGAGCTGACCCGGATTATATGAGTGC-AG  999

seq1  AGAGCCAGTTCTGTCTCTTGCCTGCTGCCACAGGCAGGAAAACTGACCCC  1049
      ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  AGAGCCAGTTCTGTCTTCTG-CTGCTGCCACA-GCA-GAAAACTGACCCC  1046

seq1  ACCCCTCACCTGCACAAATCAGGGAGCTGGCCCTAGTGGCATGGGTTCAA  1099
      |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||  |
seq2  ACCCCTCA-CTGCACAATTCA-GGAGCTGG-CCTAGT-GCATGGGTTTCA  1092

seq1  GAGCAC-TGGCAGCCTGAACAACACAGCCACCAGCCAGGCTCAG  1142
      |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||
seq2  GAGCACTTGGCAGCTTGAACAACACAGTCATCAGCCAGGCTCAG  1136