BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-242J14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 101,985,934 - 102,136,130
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9030617O03Rik, EG667148, Gpr68
Upstream gene2610021K21Rik, Tdp1, LOC100040041, Kcnk13, Psmc1, BC002230, Calm1, Ttc7b, Rps6ka5, LOC100040123
Downstream gene0610010D24Rik, LOC100040184, Smek1, 4930463M05Rik, Mylf-ps, 4932415G16Rik, Mtac2d1, Fbln5, Trip11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-242J14.bB6Ng01-242J14.g
ACCGA052199GA052200
length8081,081
definitionB6Ng01-242J14.b B6Ng01-242J14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,135,323 - 102,136,130)(101,985,934 - 101,986,985)
sequence
gaattcccctccccaccctctctctgctgcagcttcttgttgaaaggcac
acaaaaggaagagatttatcggacagggactagagtcagaaggactgtta
agctgagatctccaggggcttagcatccaaattcctgtttcagctggtgg
accccagccaatgtactttccctctctgaaccttcatatattgcagggaa
atagagatgacaatacttacttgatagagtgaataaaaataaataaaatt
aaataaccctgcaaatgagtccagtacatggtagaccctaaagtgttttg
ggagataagaatactaatgttcccactagccactgtggcagagcaaacca
ctttaaatgtgtgagctccagctaggagcagttgatggcttctgtgggag
gaagactcagtcttctttaagggggtgacccatgcgtgataggtcaactc
tgatccacacatagaagtggggctcatactattcctatagatctgaatgg
ctcctttttttccctggggagtaagcaacaacgtgtggaataaatccaaa
tcccggaagagttaaaatgtatacctctgggtggccgaagaatcagaata
actgttgataggggatagcaagattgaagaaggttgaattcaaatccttc
atcagttgacagtatagtagtccctgcagctaatgctggaagacacagga
gtaaagggcagcttcaataagacagcacaaattgcattcaatagggcaca
gagaaatgagggcaggaacctggaggagagataggtaggtggagatggat
ctggaaag
gaattcccctcaaaaccaaatttaataactttgaactcttttgtcggtaa
atgacttggatgtctgcttttgtcctaaaaatgaaagctggtggtttagg
aacttaagtttttatggtgaagttgttgtggaggaaaatgaaagggtttt
tttcccctagagtgaggctcaattcttggagttcttttctccctcagccc
tctcatttattcatttactgaattggacagtctgtctttttgtggagaat
gctttaaagatgttggcttgacctccacaactaatattaaaaggacagtg
gtcacaaaagaagatggtggactagagacatagttctagagttttagtcg
ttctggtacttgggtgcttacctaacctgcacaaagcccaccacagcatc
acagataactaggcatggcagttctagggaggtggaggcaaaaggactag
gaatttaaggtcatcttcagctttgtagtgagttagaagccagtctagac
tatgtgagacttttctcatccaatcaatgatgacctaccccaaataagta
agagctacgtcacaatgaactttcggggttgttacaaatactacagtgaa
cactgatgtacaaatttctgcttgggtcctcgctttcagttcttgtagtt
atctgctgaagagtagaactattggatcatatcacaattctatgtttaag
atttgaggaaactctagggaccagaatttgaaatttggatggtacatata
caaaatataaaagggatttctgtctatagacataaattcaaagtccttgg
taacccatcaaaagaatagcaaaatgaggggctgggagggatggcaccag
tttactgggagattctgatgctctctactttgtctccatgggtactagac
attgcactttggttcatgggattccccttggaactgaagatggctattaa
ctgccaatgtagttgcttgggaattaaagccttaggtcccaacacagaaa
caagtaagttgtcctttaaactgatttggagccatatcttccaatctctt
tgaacacatgggcttttatggtttaagctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_102135323_102136130
seq2: B6Ng01-242J14.b_46_853 (reverse)

seq1  CCTTCCAGATCCATCTCCACCTACCTATCTCTCCTCCAGGTTCCTGCCCT  50
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAGATCCATCTCCACCTACCTATCTCTCCTCCAGGTTCCTGCCCT  50

seq1  CATTTCTCTGTGCCCTATTGAATGCAATTTGTGCTGTCTTATTGAAGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTCTGTGCCCTATTGAATGCAATTTGTGCTGTCTTATTGAAGCTG  100

seq1  CCCTTTACTCCTGTGTCTTCCAGCATTAGCTGCAGGGACTACTATACTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTACTCCTGTGTCTTCCAGCATTAGCTGCAGGGACTACTATACTGT  150

seq1  CAACTGATGAAGGATTTGAATTCAACCTTCTTCAATCTTGCTATCCCCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGATGAAGGATTTGAATTCAACCTTCTTCAATCTTGCTATCCCCTA  200

seq1  TCAACAGTTATTCTGATTCTTCGGCCACCCAGAGGTATACATTTTAACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGTTATTCTGATTCTTCGGCCACCCAGAGGTATACATTTTAACTC  250

seq1  TTCCGGGATTTGGATTTATTCCACACGTTGTTGCTTACTCCCCAGGGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGGGATTTGGATTTATTCCACACGTTGTTGCTTACTCCCCAGGGAAA  300

seq1  AAAAGGAGCCATTCAGATCTATAGGAATAGTATGAGCCCCACTTCTATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAGCCATTCAGATCTATAGGAATAGTATGAGCCCCACTTCTATGT  350

seq1  GTGGATCAGAGTTGACCTATCACGCATGGGTCACCCCCTTAAAGAAGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATCAGAGTTGACCTATCACGCATGGGTCACCCCCTTAAAGAAGACT  400

seq1  GAGTCTTCCTCCCACAGAAGCCATCAACTGCTCCTAGCTGGAGCTCACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTCCTCCCACAGAAGCCATCAACTGCTCCTAGCTGGAGCTCACAC  450

seq1  ATTTAAAGTGGTTTGCTCTGCCACAGTGGCTAGTGGGAACATTAGTATTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAGTGGTTTGCTCTGCCACAGTGGCTAGTGGGAACATTAGTATTC  500

seq1  TTATCTCCCAAAACACTTTAGGGTCTACCATGTACTGGACTCATTTGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTCCCAAAACACTTTAGGGTCTACCATGTACTGGACTCATTTGCAG  550

seq1  GGTTATTTAATTTTATTTATTTTTATTCACTCTATCAAGTAAGTATTGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATTTAATTTTATTTATTTTTATTCACTCTATCAAGTAAGTATTGTC  600

seq1  ATCTCTATTTCCCTGCAATATATGAAGGTTCAGAGAGGGAAAGTACATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTATTTCCCTGCAATATATGAAGGTTCAGAGAGGGAAAGTACATTG  650

seq1  GCTGGGGTCCACCAGCTGAAACAGGAATTTGGATGCTAAGCCCCTGGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGGTCCACCAGCTGAAACAGGAATTTGGATGCTAAGCCCCTGGAGA  700

seq1  TCTCAGCTTAACAGTCCTTCTGACTCTAGTCCCTGTCCGATAAATCTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCTTAACAGTCCTTCTGACTCTAGTCCCTGTCCGATAAATCTCTT  750

seq1  CCTTTTGTGTGCCTTTCAACAAGAAGCTGCAGCAGAGAGAGGGTGGGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTGTGCCTTTCAACAAGAAGCTGCAGCAGAGAGAGGGTGGGGAG  800

seq1  GGGAATTC  808
      ||||||||
seq2  GGGAATTC  808

seq1: chr12_101985934_101986985
seq2: B6Ng01-242J14.g_66_1145

seq1  GAATTCCCCTCAAAACCAAATTTAATAACTTTGAACTCTTTTGTCGGTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCTCAAAACCAAATTTAATAACTTTGAACTCTTTTGTCGGTAA  50

seq1  ATGACTTGGATGTCTGCTTTTGTCCTAAAAATGAAAGCTGGTGGTTTAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTGGATGTCTGCTTTTGTCCTAAAAATGAAAGCTGGTGGTTTAGG  100

seq1  AACTTAAGTTTTTATGGTGAAGTTGTTGTGGAGGAAAATGAAAGGGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAGTTTTTATGGTGAAGTTGTTGTGGAGGAAAATGAAAGGGTTTT  150

seq1  TTTCCCCTAGAGTGAGGCTCAATTCTTGGAGTTCTTTTCTCCCTCAGCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTAGAGTGAGGCTCAATTCTTGGAGTTCTTTTCTCCCTCAGCCC  200

seq1  TCTCATTTATTCATTTACTGAATTGGACAGTCTGTCTTTTTGTGGAGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTTATTCATTTACTGAATTGGACAGTCTGTCTTTTTGTGGAGAAT  250

seq1  GCTTTAAAGATGTTGGCTTGACCTCCACAACTAATATTAAAAGGACAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAAAGATGTTGGCTTGACCTCCACAACTAATATTAAAAGGACAGTG  300

seq1  GTCACAAAAGAAGATGGTGGACTAGAGACATAGTTCTAGAGTTTTAGTCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAAAAGAAGATGGTGGACTAGAGACATAGTTCTAGAGTTTTAGTCG  350

seq1  TTCTGGTACTTGGGTGCTTACCTAACCTGCACAAAGCCCACCACAGCATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTACTTGGGTGCTTACCTAACCTGCACAAAGCCCACCACAGCATC  400

seq1  ACAGATAACTAGGCATGGCAGTTCTAGGGAGGTGGAGGCAAAAGGACTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATAACTAGGCATGGCAGTTCTAGGGAGGTGGAGGCAAAAGGACTAG  450

seq1  GAATTTAAGGTCATCTTCAGCTTTGTAGTGAGTTAGAAGCCAGTCTAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTAAGGTCATCTTCAGCTTTGTAGTGAGTTAGAAGCCAGTCTAGAC  500

seq1  TATGTGAGACTTTTCTCATCCAATCAATGATGACCTACCCCAAATAAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAGACTTTTCTCATCCAATCAATGATGACCTACCCCAAATAAGTA  550

seq1  AGAGCTACGTCACAATGAACTTTCGGGGTTGTTACAAATACTACAGTGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTACGTCACAATGAACTTTCGGGGTTGTTACAAATACTACAGTGAA  600

seq1  CACTGATGTACAAATTTCTGCTTGGGTCCTCGCTTTCAGTTCTTGTAGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATGTACAAATTTCTGCTTGGGTCCTCGCTTTCAGTTCTTGTAGTT  650

seq1  ATCTGCTGAAGAGTAGAACTATTGGATCATATCACAATTCTATGTTTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTGAAGAGTAGAACTATTGGATCATATCACAATTCTATGTTTAAG  700

seq1  ATTTGAGGAAACTCTAGGGACCAGAATTTGAAATTTGGATGGTACATATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAGGAAACTCTAGGGACCAGAATTTGAAATTTGGATGGTACATATA  750

seq1  CAAAATATAAAAGGGATTTCTGTCTATAGACATAAATTCAAAGTCCTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATATAAAAGGGATTTCTGTCTATAGACATAAATTCAAAGTCCTTGG  800

seq1  TAACCCATCAAAAGAATAGC-AAATGAGGGGCT-GGAGGGATGGCACCAG  848
      |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAACCCATCAAAAGAATAGCAAAATGAGGGGCTGGGAGGGATGGCACCAG  850

seq1  -TTACT-GGAGA-TCTGATGCTCTCTAC-TTGTCTCCATGGGTACTAGAC  894
       ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGGGAGATTCTGATGCTCTCTACTTTGTCTCCATGGGTACTAGAC  900

seq1  A-TGCACTT--GGTCATGGGAT--CCCCTGGAACTGAAGATGGTTATTAA  939
      | |||||||  | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  ATTGCACTTTGGTTCATGGGATTCCCCTTGGAACTGAAGATGGCTATTAA  950

seq1  CTGCC-ATGTAGGTGC-TGGGAATTAAA--CCTAGGTCCGCAACA-AGAA  984
      ||||| |||||| ||| |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||
seq2  CTGCCAATGTAGTTGCTTGGGAATTAAAGCCTTAGGTCC-CAACACAGAA  999

seq1  --CAGTAAG-TGTCCTT--AACT-ATT--GAGCCATATCT--CCATC-CC  1023
         |||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||  | ||| | 
seq2  ACAAGTAAGTTGTCCTTTAAACTGATTTGGAGCCATATCTTCCAATCTCT  1049

seq1  TTGAACACAT--GCTTTTATGTTTTAAGCTC  1052
      ||||||||||  ||||||||| |||||||||
seq2  TTGAACACATGGGCTTTTATGGTTTAAGCTC  1080