BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244D22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,756,534 - 22,893,405
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668662
Upstream gene6030426L16Rik, LOC434693, EG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660
Downstream geneLOC668664, 2410018L13Rik, LOC77114, EG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244D22.bB6Ng01-244D22.g
ACCGA053428GA053429
length1,115718
definitionB6Ng01-244D22.b B6Ng01-244D22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,756,534 - 22,757,635)(22,892,688 - 22,893,405)
sequence
gaattctaatataaatatttttggagatagaagtgtactgaaaaagttat
cccttaggttgagaactgataaatttgccttgctcccgttggggctagtt
tctccatctttagacctgtcaagagttcaggctcttgacaattgtcatct
tgagcaatcgacactgagaatagacccaaagtccagacccataatcctgg
ccaggatcctttcccggcagaaaaatcacctggcattgcccccagtgggc
tgggcacctaccttacagggtagccctatggtggacacagggtttgtctt
cgtaggtaatgtcctcctcttttgtggaaattttagataaactcagtgtc
tgaagacatgaagatttaaggagagcttgagaatgaaagacaagcagtct
ctagagagaccaggttctgtctggtcagaaccaactagccaaatctgatc
ctctgattccagagccagggctggctccaaaagtccactcagaacctctc
aggcattaggcaccagataagaggcctggagcaagcttccacggggccat
gtgataggggagtttggagtataaggacattttgtacctcagctgctttt
ctcacccacaactaggacacatgtgatgtatgtgttagcccacaagtcac
acaacttcccaaagctctgctccttcctttgtgaagtgagactaactaaa
cacatgcagtactaaaatccctcctctggggagacaaaatggtacagttc
cccctaaggtctcaacgtcaaatggaaacaagatttgccaaagttcattc
tgtaaagccaatgactttattgagcttcctcagagaacataaaggggagg
tgtttgcagtagtgtgggtgctcctcacccaaaaaggctgcacatagaaa
gcctttatcctgcagggaccatttcttctccatagccaatatggatgact
gaagccccaccccctagtctttttcagatgtcctggccattcttgaggtg
tttgtttaagcccagggttggggcagtcttcttcaacccaacagatgtgc
atgccttggatggcagggagattaaataagcaagcaaggtacaaccacac
cccttaactctctca
gaattcaggaccaaggcagtgatgggtttccttcaggccaagctagtttg
agaagtctgggggatatgtagagaggaaagggccggatttacaaacctca
gcttgaggtcaaaagaatggactggtcacagacacccaggcctacagatt
tctttacatttctgattttaatgtttttgcatgtgtatgcctatgcactg
tgcatgtgtgtttccatatgtatgggcacatgtgcatgtgtgggcagctc
aaggtagacattgggtgtctccctaccccactttccactgtattttttga
ggccaggtctcctgaactgtagcttgctgattccagctaagctagccagg
cagctggccctgaggatgtcccatctgtctctcagatgctgggattacag
gtaactgccatacctgcccagctattacatggttctagagatctgcattc
cagtcttcatgcctgcaccgtgcatgtttcatgtactaagccattgtctc
cccacagccctgtttaaaaaataaaataaaagttttgatgtttgagtaat
gacagacccaagggaagctgcagctgggtccatgcatctgtccttcaggt
tcagcccctggtcctgtcctgcacagctacagtgacattaaagtcaggga
tagggacactggtacgatccacacagcttagtcatatcgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_22756534_22757635
seq2: B6Ng01-244D22.b_45_1159

seq1  GAATTCTAATATAAATATTTTTGGAGATAGAAGTGTACTGAAAAAGTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAATATAAATATTTTTGGAGATAGAAGTGTACTGAAAAAGTTAT  50

seq1  CCCTTAGGTTGAGAACTGATAAATTTGCCTTGCTCCCGTTGGGGCTAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTAGGTTGAGAACTGATAAATTTGCCTTGCTCCCGTTGGGGCTAGTT  100

seq1  TCTCCATCTTTAGACCTGTCAAGAGTTCAGGCTCTTGACAATTGTCATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATCTTTAGACCTGTCAAGAGTTCAGGCTCTTGACAATTGTCATCT  150

seq1  TGAGCAATCGACACTGAGAATAGACCCAAAGTCCAGACCCATAATCCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAATCGACACTGAGAATAGACCCAAAGTCCAGACCCATAATCCTGG  200

seq1  CCAGGATCCTTTCCCGGCAGAAAAATCACCTGGCATTGCCCCCAGTGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATCCTTTCCCGGCAGAAAAATCACCTGGCATTGCCCCCAGTGGGC  250

seq1  TGGGCACCTACCTTACAGGGTAGCCCTATGGTGGACACAGGGTTTGTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCACCTACCTTACAGGGTAGCCCTATGGTGGACACAGGGTTTGTCTT  300

seq1  CGTAGGTAATGTCCTCCTCTTTTGTGGAAATTTTAGATAAACTCAGTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGGTAATGTCCTCCTCTTTTGTGGAAATTTTAGATAAACTCAGTGTC  350

seq1  TGAAGACATGAAGATTTAAGGAGAGCTTGAGAATGAAAGACAAGCAGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGACATGAAGATTTAAGGAGAGCTTGAGAATGAAAGACAAGCAGTCT  400

seq1  CTAGAGAGACCAGGTTCTGTCTGGTCAGAACCAACTAGCCAAATCTGATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGAGACCAGGTTCTGTCTGGTCAGAACCAACTAGCCAAATCTGATC  450

seq1  CTCTGATTCCAGAGCCAGGGCTGGCTCCAAAAGTCCACTCAGAACCTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATTCCAGAGCCAGGGCTGGCTCCAAAAGTCCACTCAGAACCTCTC  500

seq1  AGGCATTAGGCACCAGATAAGAGGCCTGGAGCAAGCTTCCACGGGGCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTAGGCACCAGATAAGAGGCCTGGAGCAAGCTTCCACGGGGCCAT  550

seq1  GTGATAGGGGAGTTTGGAGTATAAGGACATTTTGTACCTCAGCTGCTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGGGGAGTTTGGAGTATAAGGACATTTTGTACCTCAGCTGCTTTT  600

seq1  CTCACCCACAACTAGGACACATGTGATGTATGTGTTAGCCCACAAGTCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCCACAACTAGGACACATGTGATGTATGTGTTAGCCCACAAGTCAC  650

seq1  ACAACTTCCCAAAGCTCTGCTCCTTCCTTTGTGAAGTGAGACTAACTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTCCCAAAGCTCTGCTCCTTCCTTTGTGAAGTGAGACTAACTAAA  700

seq1  CACATGCAGTACTAAAATCCCTCCTCTGGGGAGACAAAATGGTACAGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCAGTACTAAAATCCCTCCTCTGGGGAGACAAAATGGTACAGTTC  750

seq1  CCCCTAAGGTCTCAACGTCAAATGGAAACAAGATTTGCCAAAGTTCATTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTAAGGTCTCAACGTCAAATGGAAACAAGATTTGCCAAAGTTCATTC  800

seq1  TGTAAAGCCAATGACTTTATTGAGCTTCCTCAGAGAACATAAGGGGGAGG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGTAAAGCCAATGACTTTATTGAGCTTCCTCAGAGAACATAAAGGGGAGG  850

seq1  TGTTTGCAGTAGTGTGGGTGCTCCTCACCC-AAAAGGCTGCACATAGAAA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGCAGTAGTGTGGGTGCTCCTCACCCAAAAAGGCTGCACATAGAAA  900

seq1  GCCTTTATCCTGCAGGGACCATTTCTTCTCCATAGCC-ATATGGATGACT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCCTTTATCCTGCAGGGACCATTTCTTCTCCATAGCCAATATGGATGACT  950

seq1  G-AGCCCCA-CCCCTAGTC-TTTTCAGATGTCCTGGCCATCTTGGAGGGT  995
      | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||
seq2  GAAGCCCCACCCCCTAGTCTTTTTCAGATGTCCTGGCCATTCTTGA-GGT  999

seq1  GTTTGTTTAAG-CCAGGG-TGGGGCAGTCTTCCTCAAACCCACAGATGTG  1043
      ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||
seq2  GTTTGTTTAAGCCCAGGGTTGGGGCAGTCTTCTTCAACCCAACAGATGTG  1049

seq1  CA-GGCTTGGAT-GCA-GGAGAT--AAAGAGCAAGCAGGGACCAACCACA  1088
      || | ||||||| ||| ||||||  ||  |||||||| ||  ||||||||
seq2  CATGCCTTGGATGGCAGGGAGATTAAATAAGCAAGCAAGGTACAACCACA  1099

seq1  CCC--TAACTCTCTCA  1102
      |||  |||||||||||
seq2  CCCCTTAACTCTCTCA  1115

seq1: chr12_22892688_22893405
seq2: B6Ng01-244D22.g_67_784 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACGATATGACTAAGCTGTGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACGATATGACTAAGCTGTGTGG  50

seq1  ATCGTACCAGTGTCCCTATCCCTGACTTTAATGTCACTGTAGCTGTGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTACCAGTGTCCCTATCCCTGACTTTAATGTCACTGTAGCTGTGCAG  100

seq1  GACAGGACCAGGGGCTGAACCTGAAGGACAGATGCATGGACCCAGCTGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGACCAGGGGCTGAACCTGAAGGACAGATGCATGGACCCAGCTGCA  150

seq1  GCTTCCCTTGGGTCTGTCATTACTCAAACATCAAAACTTTTATTTTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCCTTGGGTCTGTCATTACTCAAACATCAAAACTTTTATTTTATTT  200

seq1  TTTAAACAGGGCTGTGGGGAGACAATGGCTTAGTACATGAAACATGCACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACAGGGCTGTGGGGAGACAATGGCTTAGTACATGAAACATGCACG  250

seq1  GTGCAGGCATGAAGACTGGAATGCAGATCTCTAGAACCATGTAATAGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGCATGAAGACTGGAATGCAGATCTCTAGAACCATGTAATAGCTG  300

seq1  GGCAGGTATGGCAGTTACCTGTAATCCCAGCATCTGAGAGACAGATGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGTATGGCAGTTACCTGTAATCCCAGCATCTGAGAGACAGATGGGA  350

seq1  CATCCTCAGGGCCAGCTGCCTGGCTAGCTTAGCTGGAATCAGCAAGCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTCAGGGCCAGCTGCCTGGCTAGCTTAGCTGGAATCAGCAAGCTAC  400

seq1  AGTTCAGGAGACCTGGCCTCAAAAAATACAGTGGAAAGTGGGGTAGGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAGGAGACCTGGCCTCAAAAAATACAGTGGAAAGTGGGGTAGGGAG  450

seq1  ACACCCAATGTCTACCTTGAGCTGCCCACACATGCACATGTGCCCATACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAATGTCTACCTTGAGCTGCCCACACATGCACATGTGCCCATACA  500

seq1  TATGGAAACACACATGCACAGTGCATAGGCATACACATGCAAAAACATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAAACACACATGCACAGTGCATAGGCATACACATGCAAAAACATTA  550

seq1  AAATCAGAAATGTAAAGAAATCTGTAGGCCTGGGTGTCTGTGACCAGTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGAAATGTAAAGAAATCTGTAGGCCTGGGTGTCTGTGACCAGTCC  600

seq1  ATTCTTTTGACCTCAAGCTGAGGTTTGTAAATCCGGCCCTTTCCTCTCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTTGACCTCAAGCTGAGGTTTGTAAATCCGGCCCTTTCCTCTCTA  650

seq1  CATATCCCCCAGACTTCTCAAACTAGCTTGGCCTGAAGGAAACCCATCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCCCCCAGACTTCTCAAACTAGCTTGGCCTGAAGGAAACCCATCAC  700

seq1  TGCCTTGGTCCTGAATTC  718
      ||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTGGTCCTGAATTC  718