BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248E01
Chromosome12 (Build37)
Map Location 104,886,424 - 105,084,143
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpina6, Gm46, Serpina1f, EG435316, Serpina1b, Serpina1d, LOC667951, LOC628801
Upstream geneItpk1, Moap1, D230037D09Rik, 5730410I19Rik, Btbd7, EG634678, Cox8c, 9030205A07Rik, LOC667269, Prima1, EG544888, Asb2, Otub2, Ddx24, D12Ertd647e, Ifi27, 1810023F06Rik, 8430415E04Rik, Serpina10
Downstream geneSerpina1a, LOC667954, Serpina1c, Serpina1e, Serpina11, Serpina9, Serpina12, Serpina4-ps1, Serpina5, Serpina3a, Serpina3b, Serpina3c, LOC435318, LOC628883, Serpina3f, LOC667997, Serpina3g, Serpina3h, EG628900, EG238395, Serpina3k, EG628916, Serpina3m, Serpina3n, Gsc, Dicer1, Clmn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248E01.bB6Ng01-248E01.g
ACCGA056376GA056377
length1,1301,067
definitionB6Ng01-248E01.b B6Ng01-248E01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,886,424 - 104,887,548)(105,083,074 - 105,084,143)
sequence
gaattcagaatatcaagctgaagaccgaaacatgaaattgagtagaaggc
ctggtatgatattaatgagaccttcaccctgtcttctgtttctttttgcc
aggggttgctctcacttctgtcatgacaactctgttttccaacgtccatc
ctctgtgaggattcatgggattggtagctgttcatcccatggtagccaag
atggctgtaactctccctagtcattagctttctgtgtggttgttttcttg
ctggacctggggttttcccacttgggacctatgggacctttaacaaatgg
gatgtgttgcttactattaagatttttagtgtagattttggagaaaggct
cccaagacacttaccgttaatgtcaagggagtgtctttggtggtgtctgc
gaaatcagattggttggtgaacaaatccttaatgcccacatctgccagca
catcttgaaggtcataggtatcagacatggagaatttggggatgtacagg
ttcatctgcctgtccagagtgaagcaaaagaagttagagggttcaaggct
aggcctggcagtagacagcagcatatcctttcccagacagatgtttactt
ctctgtgggatcccaccagcgattgtaccaccagcctgactcactcatta
gggatacagggaaagtatcccctggatgatccctttcaagagaacattag
ttattacttgctgaatttactcaggtttacaggtagagataccaaaaaca
tcagaacagaaatatacagtttgtcaacaaaagtaacttctcctggataa
ctatcctgaggatcagatgggtttagataaaagtgatcatattttgttaa
ggaggttaacatttgttaacaagaaaccaggaaatctaccctggggataa
cagaaaagagtgagtaaaagttcccactcactcatcaagagctctaaatc
atcacttgaaacgatagtagtaccctgaaatacagagctttcaagaatac
ctgtaagaaaaattgctgcctagaatgtatctttttaaagtatcagacaa
caaagcatacatcttgtggttccaagggaatggtgtctacctgcagcaga
acttggcatcatcacatttgtagaattttg
gaattcctgggaaactaattatttagagtccattgtttcaataatttaat
aacacaagtctttttcttctaaatttcttgtctcctgtcagtttgggtac
aatgtgtacctactgccttctctgagccacagtttccatgacgatacctt
ccactttactttcaggtcttgtggcgctaattggttggttgcaacgacag
ccaggccctcaagttatagcattgcatggcatagttccatggccagcccc
aaaatcagccccaggctctccccaaaagtccctaccacatcccctcccct
gaaatccgcttgtaagtgtccggggaaagacctcaagggacagccagggt
tacacacccagcctgtaacattcctgctggcctcagataactctacgcag
taggtccttcaccttcctcctctcgagtcctcagggtgggcattgccagc
ctccatctcctgggctcaatatcccattcataccaaggcagccagctcag
ctactatggacaacagtcaggagaacaaaggtcttgctttatgtatcagc
acacagtaggcccacagtgtgtgctgggaaggtaactggcttctggtctt
tgatctcttgccttttcctgttctctgcttagagagacaagaagctatct
tgggcaagcttacctcctgccaggcacatgacctgtttcagtgattctcc
ttagggttaccattctgagccagaaaatcagccatgggcttggtgactca
ttctatgaacatgtactcctccaactaccttacaggagataggagacttt
tcagctctggattttcagaggtaaattacagagtagagtctgcgtccttg
ttcctcttcctttaagctcactttcctcaacagggacacacacccttgat
ctcctagtgagaactcctaaacctcaaaaggagcactaacacttagaata
gctgccccactctgccccctctttttttctttgggtcatcagtcctggtt
agtcctaatttgtaacagttgtaaacctcacaaccccactccccatgacc
tcctgagttgtatttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_104886424_104887548
seq2: B6Ng01-248E01.b_48_1177

seq1  GAATTCAGAATATCAAGCTGAAGACCGAAACATGAAATTGAGTAGAAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAATATCAAGCTGAAGACCGAAACATGAAATTGAGTAGAAGGC  50

seq1  CTGGTATGATATTAATGAGACCTTCACCCTGTCTTCTGTTTCTTTTTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATGATATTAATGAGACCTTCACCCTGTCTTCTGTTTCTTTTTGCC  100

seq1  AGGGGTTGCTCTCACTTCTGTCATGACAACTCTGTTTTCCAACGTCCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTTGCTCTCACTTCTGTCATGACAACTCTGTTTTCCAACGTCCATC  150

seq1  CTCTGTGAGGATTCATGGGATTGGTAGCTGTTCATCCCATGGTAGCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGAGGATTCATGGGATTGGTAGCTGTTCATCCCATGGTAGCCAAG  200

seq1  ATGGCTGTAACTCTCCCTAGTCATTAGCTTTCTGTGTGGTTGTTTTCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTGTAACTCTCCCTAGTCATTAGCTTTCTGTGTGGTTGTTTTCTTG  250

seq1  CTGGACCTGGGGTTTTCCCACTTGGGACCTATGGGACCTTTAACAAATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCTGGGGTTTTCCCACTTGGGACCTATGGGACCTTTAACAAATGG  300

seq1  GATGTGTTGCTTACTATTAAGATTTTTAGTGTAGATTTTGGAGAAAGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTTGCTTACTATTAAGATTTTTAGTGTAGATTTTGGAGAAAGGCT  350

seq1  CCCAAGACACTTACCGTTAATGTCAAGGGAGTGTCTTTGGTGGTGTCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGACACTTACCGTTAATGTCAAGGGAGTGTCTTTGGTGGTGTCTGC  400

seq1  GAAATCAGATTGGTTGGTGAACAAATCCTTAATGCCCACATCTGCCAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAGATTGGTTGGTGAACAAATCCTTAATGCCCACATCTGCCAGCA  450

seq1  CATCTTGAAGGTCATAGGTATCAGACATGGAGAATTTGGGGATGTACAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGAAGGTCATAGGTATCAGACATGGAGAATTTGGGGATGTACAGG  500

seq1  TTCATCTGCCTGTCCAGAGTGAAGCAAAAGAAGTTAGAGGGTTCAAGGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTGCCTGTCCAGAGTGAAGCAAAAGAAGTTAGAGGGTTCAAGGCT  550

seq1  AGGCCTGGCAGTAGACAGCAGCATATCCTTTCCCAGACAGATGTTTACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGGCAGTAGACAGCAGCATATCCTTTCCCAGACAGATGTTTACTT  600

seq1  CTCTGTGGGATCCCACCAGCGATTGTACCACCAGCCTGACTCACTCATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGGGATCCCACCAGCGATTGTACCACCAGCCTGACTCACTCATTA  650

seq1  GGGATACAGGGAAAGTATCCCCTGGATGATCCCTTTCAAGAGAACATTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATACAGGGAAAGTATCCCCTGGATGATCCCTTTCAAGAGAACATTAG  700

seq1  TTATTACTTGCTGAATTTACTCAGGTTTACAGGTAGAGATACCAAAAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTACTTGCTGAATTTACTCAGGTTTACAGGTAGAGATACCAAAAACA  750

seq1  TCAGAACAGAAATATACAGTTTGTCAACAAAAGTAACTTCTCCTGGATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACAGAAATATACAGTTTGTCAACAAAAGTAACTTCTCCTGGATAA  800

seq1  CTATCCTGAGGATCAGATGGGTTTAGAT-AAAGTGATCATATTTTTGTTA  849
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  CTATCCTGAGGATCAGATGGGTTTAGATAAAAGTGATCATA-TTTTGTTA  849

seq1  AGGAGGTTAACA-TTGTTAACAAGAAACCAGGAAATCTACCCT-GGGATA  897
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGGAGGTTAACATTTGTTAACAAGAAACCAGGAAATCTACCCTGGGGATA  899

seq1  ACAGAAAAGAGTGAGTAAAAGTTCCCACTCACTCATCAAGAGCTCTAAAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAAGAGTGAGTAAAAGTTCCCACTCACTCATCAAGAGCTCTAAAT  949

seq1  CATCACTTGAAACGATAGTAGTA-CCTGAAATAACAGAGCTTTCAAG-AT  995
      ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
seq2  CATCACTTGAAACGATAGTAGTACCCTGAAAT-ACAGAGCTTTCAAGAAT  998

seq1  ACCTGTAAG-AAAATTGCTGCCTAGAAAGGTATCTTTT--AAGTATCAGA  1042
      ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||
seq2  ACCTGTAAGAAAAATTGCTGCCTAG-AATGTATCTTTTTAAAGTATCAGA  1047

seq1  CACAAAGGCATACATC-TGTGGTT-CAAGGG-ATGGTGTCTCAACCTGGC  1089
      ||  || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||| ||
seq2  CAACAAAGCATACATCTTGTGGTTCCAAGGGAATGGTGTCT--ACCT-GC  1094

seq1  AGCAGAACCTGGCATCATCCACA-TTGTAGAATTTTG  1125
      |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||
seq2  AGCAGAACTTGGCATCAT-CACATTTGTAGAATTTTG  1130

seq1: chr12_105083074_105084143
seq2: B6Ng01-248E01.g_64_1130 (reverse)

seq1  TCAAATACAACCTCAGGGAAGTTCATGGGGGAAGTGGGGTTGTGAGTTTA  50
      |||||||||| ||||||  || ||||||||  |||||||||||||| || 
seq2  TCAAATACAA-CTCAGG--AGGTCATGGGG--AGTGGGGTTGTGAGGTTT  45

seq1  ACAAACTGTTAACAATTAGGACTAACCAGGACTGATGAACCCAAAAGAAA  100
      || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || | |||
seq2  AC-AACTGTTACAAATTAGGACTAACCAGGACTGATGACCCAAAGAAAAA  94

seq1  AAGAGGGGGCAGAGTGGGGCAGCTATTCTAAGTGTTAGTGCTCC-TTTGA  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAGAGGGGGCAGAGTGGGGCAGCTATTCTAAGTGTTAGTGCTCCTTTTGA  144

seq1  GGTTTAGGAGTTCTCACTAGGAGATCAA-GGTGTGTGTCCCTGTTGAGGA  198
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAGGAGTTCTCACTAGGAGATCAAGGGTGTGTGTCCCTGTTGAGGA  194

seq1  AAGTGAGCTTAAAGGAAGAGGAACAAGGACGCAGACTCTACTCTGTAATT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAGCTTAAAGGAAGAGGAACAAGGACGCAGACTCTACTCTGTAATT  244

seq1  TACCTCTGAAAATCCAGAGCTG-AAAGTCTCCTATCTCCTGTAAGGTAGT  297
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTGAAAATCCAGAGCTGAAAAGTCTCCTATCTCCTGTAAGGTAGT  294

seq1  TGGAGGAGTACATGTTCATAGAATGAGTCACCAAGCCCATGGCTGATTTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAGTACATGTTCATAGAATGAGTCACCAAGCCCATGGCTGATTTT  344

seq1  CTGGCTCAGAATGGTAACCCTAAGGAGAATCACTGAAACAGGTCATGTGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCAGAATGGTAACCCTAAGGAGAATCACTGAAACAGGTCATGTGC  394

seq1  CTGGCAGGAGGTAAGCTTGCCCAAGATAGCTTCTTGTCTCTCTAAGCAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGGAGGTAAGCTTGCCCAAGATAGCTTCTTGTCTCTCTAAGCAGA  444

seq1  GAACAGGAAAAGGCAAGAGATCAAAGACCAGAAGCCAGTTACCTTCCCAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGGAAAAGGCAAGAGATCAAAGACCAGAAGCCAGTTACCTTCCCAG  494

seq1  CACACACTGTGGGCCTACTGTGTGCTGATACATAAAGCAAGACCTTTGTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACTGTGGGCCTACTGTGTGCTGATACATAAAGCAAGACCTTTGTT  544

seq1  CTCCTGACTGTTGTCCATAGTAGCTGAGCTGGCTGCCTTGGTATGAATGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGACTGTTGTCCATAGTAGCTGAGCTGGCTGCCTTGGTATGAATGG  594

seq1  GATATTGAGCCCAGGAGATGGAGGCTGGCAATGCCCACCCTGAGGACTCG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGAGCCCAGGAGATGGAGGCTGGCAATGCCCACCCTGAGGACTCG  644

seq1  AGAGGAGGAAGGTGAAGGACCTACTGCGTAGAGTTATCTGAGGCCAGCAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGGAAGGTGAAGGACCTACTGCGTAGAGTTATCTGAGGCCAGCAG  694

seq1  GAATGTTACAGGCTGGGTGTGTAACCCTGGCTGTCCCTTGAGGTCTTTCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTTACAGGCTGGGTGTGTAACCCTGGCTGTCCCTTGAGGTCTTTCC  744

seq1  CCGGACACTTACAAGCGGATTTCAGGGGAGGGGATGTGGTAGGGACTTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGACACTTACAAGCGGATTTCAGGGGAGGGGATGTGGTAGGGACTTTT  794

seq1  GGGGAGAGCCTGGGGCTGATTTTGGGGCTGGCCATGGAACTATGCCATGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGAGCCTGGGGCTGATTTTGGGGCTGGCCATGGAACTATGCCATGC  844

seq1  AATGCTATAACTTGAGGGCCTGGCTGTCGTTGCAACCAACCAATTAGCGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTATAACTTGAGGGCCTGGCTGTCGTTGCAACCAACCAATTAGCGC  894

seq1  CACAAGACCTGAAAGTAAAGTGGAAGGTATCGTCATGGAAACTGTGGCTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGACCTGAAAGTAAAGTGGAAGGTATCGTCATGGAAACTGTGGCTC  944

seq1  AGAGAAGGCAGTAGGTACACATTGTACCCAAACTGACAGGAGACAAGAAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGGCAGTAGGTACACATTGTACCCAAACTGACAGGAGACAAGAAA  994

seq1  TTTAGAAGAAAAAGACTTGTGTTATTAAATTATTGAAACAATGGACTCTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGAAAAAGACTTGTGTTATTAAATTATTGAAACAATGGACTCTA  1044

seq1  AATAATTAGTTTCCCAGGAATTC  1070
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTAGTTTCCCAGGAATTC  1067