BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-250O10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 31,914,201 - 32,032,514
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1, Dld
Upstream geneSntg2, Tmem18, LOC100043055, Acp1, Sh3yl1, LOC629656, 9030611O19Rik, LOC668781
Downstream geneLOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4, LOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22, Hbp1, Prkar2b, Pik3cg
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-250O10.bB6Ng01-250O10.g
ACCGA058317GA058318
length1,0331,148
definitionB6Ng01-250O10.b B6Ng01-250O10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,914,201 - 31,915,222)(32,031,365 - 32,032,514)
sequence
gaattctcgaggtgaagtaaatgaataatggcatatttatctaatctggt
atgttaatatcttatcttagaaaagaagcagatggtctgttaagacttga
ggaaatgctgaacaggttgcagcaagctctaatgaccgcaggccaggcaa
ctcagtcctcacactgctgagataacaaacaaaaagaacaatgtggggca
ggtatgttatctcctccaacacaacctgaaatcaattctgaagctagaaa
cacaattggttttgcatatgagaatatcattcttaccccgcctgactgat
agaattgtaatgcagaaaccttgaggtgatattggtgtgattatgcactt
atttaacgttctacatcaatgctgataattttgttactgatagaattatg
caacggattattgtactatagaactcttcttttttttttttttttttttt
tttttaatccaagacagagtttttctgtgtgtagccctagctgtcctgga
actctctctgtagaccaggctggtctcaaactcagaaatcttcctgcctc
tgcctcccaagtgctgggattaaaggcatgcgccaaccctgggacagggt
taggtggatgcacatagtatatgctactgtcggcttaggacattaagact
cagagaagttatgtgactctcgggtccacacagctagtgaacagtactga
cttgtggacacagtttgagagttctgattgagaaataaacctgaaaagtc
gcaagccacactactaaacagggctcctggttacaaggtggcttatcctg
agtaaggctggaaggagatctcaggttggatgtctcagcagcaagccccg
ttcaaccatgggatgacacaagacgaagaaaggcttacccctcggtgtaa
tggatccttcaccttctgggacacacaggtggtccctccttacagaggac
agaagttgcctggggccccccaagtcctaagctgtatttacagaaacagg
catcctggaaagaaaaagcaggagtggaagaaa
gaattcttttgacacttgacccattgtttttattctgctttcgtagacgt
gtattggttgaccagcttgaggaaatcaaagcttgtataggatgtctgtt
tcaacacctaagagatgtttgaatattcttataaagcaaattcatcaggc
tgtgtgaggttctattcctattgataaggacgatgtagttcacttgtagc
agacacagattcgttgcagttacatcatattttcattcactgttttatta
tattcagtatctcaataagtatttaatttttgtgctaagttttttgtttt
gtgctgtttttttgttttgtgctaagttattaacagtgatctaaacagac
acaattaagcttctttgtatttcacagtcctcctgaggaagacagacatc
taacagatacttgtaatcatggtaaacagtccagtggctaaggataggga
tttatgaactctgtatgtggataggaaatggttacataattctttcttga
ggattttttgtttatatatgtaatgactgttgttaattgtcaacttgcct
gcatctggcatcgcctaggagaaaagtctggggacttacccatgaggtta
gattagcctttgaagatatcttgattacattaattgattgggaaaattca
ttttaattgtggaggggattactacctgggcagggaatcctagactgtat
aaactagagaaagtgagctgagatcgctgtttatggatgtgatgtcccca
gcttcttcaagctcctggtgtcccctgtcatgatggatttaaagtatctt
gaactgtggtcgatcccaaataaactcttttttaagtttactatgttttt
gtcacatcaacaagaaaagaaacccagacattgtctgaagagggatatgt
ggaaatgggtgactattgtaatatagaaagaagcatagtctattaaacta
ctaaaaagtcatagtgctgacacatcgaagtttgagagttgatttcccca
gataaggaagtttgcatcagtagtgtttaaagcagagccattcatagggt
ccaggtttatttttaatattcatgtgtttactggttggactttggtaatt
tttatttctcttaatcgaattataagaggccagtaattattgtgacta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_31914201_31915222
seq2: B6Ng01-250O10.b_52_1084

seq1  GAATTCTCGAGGTGAAGTAAATGAATAATGGCATATTTATCTAATCTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCGAGGTGAAGTAAATGAATAATGGCATATTTATCTAATCTGGT  50

seq1  ATGTTAATATCTTATCTTAGAAAAGAAGCAGATGGTCTGTTAAGACTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAATATCTTATCTTAGAAAAGAAGCAGATGGTCTGTTAAGACTTGA  100

seq1  GGAAATGCTGAACAGGTTGCAGCAAGCTCTAATGACCGCAGGCCAGGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATGCTGAACAGGTTGCAGCAAGCTCTAATGACCGCAGGCCAGGCAA  150

seq1  CTCAGTCCTCACACTGCTGAGATAACAAACAAAAAGAACAATGTGGGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTCCTCACACTGCTGAGATAACAAACAAAAAGAACAATGTGGGGCA  200

seq1  GGTATGTTATCTCCTCCAACACAACCTGAAATCAATTCTGAAGCTAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGTTATCTCCTCCAACACAACCTGAAATCAATTCTGAAGCTAGAAA  250

seq1  CACAATTGGTTTTGCATATGAGAATATCATTCTTACCCCGCCTGACTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATTGGTTTTGCATATGAGAATATCATTCTTACCCCGCCTGACTGAT  300

seq1  AGAATTGTAATGCAGAAACCTTGAGGTGATATTGGTGTGATTATGCACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTAATGCAGAAACCTTGAGGTGATATTGGTGTGATTATGCACTT  350

seq1  ATTTAACGTTCTACATCAATGCTGATAATTTTGTTACTGATAGAATTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACGTTCTACATCAATGCTGATAATTTTGTTACTGATAGAATTATG  400

seq1  CAACGGATTATTGTACTATAGAACTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGGATTATTGTACTATAGAACTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  450

seq1  TTTTTAATCCAAGACAGAGTTTTTCTGTGTGTAGCCCTAGCTGTCCTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAATCCAAGACAGAGTTTTTCTGTGTGTAGCCCTAGCTGTCCTGGA  500

seq1  ACTCTCTCTGTAGACCAGGCTGGTCTCAAACTCAGAAATCTTCCTGCCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCTCTGTAGACCAGGCTGGTCTCAAACTCAGAAATCTTCCTGCCTC  550

seq1  TGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCAACCCTGGGACAGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCAACCCTGGGACAGGGT  600

seq1  TAGGTGGATGCACATAGTATATGCTACTGTCGGCTTAGGACATTAAGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTGGATGCACATAGTATATGCTACTGTCGGCTTAGGACATTAAGACT  650

seq1  CAGAGAAGTTATGTGACTCTCGGGTCCACACAGCTAGTGAACAGTACTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAAGTTATGTGACTCTCGGGTCCACACAGCTAGTGAACAGTACTGA  700

seq1  CTTGTGGACACAGTTTGAGAGTTCTGATTGAG-AATAAACCTGAAAAGTC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTTGTGGACACAGTTTGAGAGTTCTGATTGAGAAATAAACCTGAAAAGTC  750

seq1  GCAAGCCACACTACTAAACAGGGCTCCTGGTTACAAGGTGGCTTATCCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCCACACTACTAAACAGGGCTCCTGGTTACAAGGTGGCTTATCCTG  800

seq1  AGTAAGGCTGGAAGGAGATCTCAGGTTGGATGTCTCAGCAGCAAGCCCCG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGGCTGGAAGGAGATCTCAGGTTGGATGTCTCAGCAGCAAGCCCCG  850

seq1  TTTCAACCATGGGATGACACAGGACGAAG-AAGGCTTAACCCCTCGGTGT  898
       |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  -TTCAACCATGGGATGACACAAGACGAAGAAAGGCTT-ACCCCTCGGTGT  898

seq1  AATGGATCCTTCACCTTCT-GGACAC-CATGT-GTCCCTCCTTACAGAGG  945
      ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||
seq2  AATGGATCCTTCACCTTCTGGGACACACAGGTGGTCCCTCCTTACAGAGG  948

seq1  TCAG-AGTTG-CTGGG--CCCCCAAGT-CTCAGCTGTATTTACAG-AACA  989
       ||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||
seq2  ACAGAAGTTGCCTGGGGCCCCCCAAGTCCTAAGCTGTATTTACAGAAACA  998

seq1  GGCATCCTGAGAAG-AAAAGCAGGAG-GGAAGAAA  1022
      |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||
seq2  GGCATCCTGGAAAGAAAAAGCAGGAGTGGAAGAAA  1033

seq1: chr12_32031365_32032514
seq2: B6Ng01-250O10.g_69_1216 (reverse)

seq1  TAGTCACAATAATTACCCTGCCTCTTATAATCTGATTAGAGAAAAATAAA  50
      ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||
seq2  TAGTCACAATAATTA-CTGGCCTCTTATAATTCGATTA-AGAGAAAT-AA  47

seq1  AAATTACCAAAGTCCAACCAGTAACCACAATGATATTTAAAATAAA-CTT  99
      |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| || 
seq2  AAATTACCAAAGTCCAACCAGTAAACACATGAATATTAAAAATAAACCTG  97

seq1  GACCCTATG-ATGGCTCTGCTTAAAACACCTTACTGATTCCAAACTTCC-  147
      ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| 
seq2  GACCCTATGAATGGCTCTGCTTTAAACAC--TACTGA-TGCAAACTTCCT  144

seq1  TATCT-GAGAAATCAACTCTCAAACTTCGATGTGTCAGCACTATGACTTT  196
      ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TATCTGGGGAAATCAACTCTCAAACTTCGATGTGTCAGCACTATGAC-TT  193

seq1  TTTAGTAGTTTAAATAGACTATGCTTCTTTCTATATTACAATAGTCACCC  246
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTAGTTT-AATAGACTATGCTTCTTTCTATATTACAATAGTCACCC  242

seq1  ATTTCCACATATCCCTCTTCAGACAATGTCTGGGTTTCTTTTCTTGTTGA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCACATATCCCTCTTCAGACAATGTCTGGGTTTCTTTTCTTGTTGA  292

seq1  TGTGAC-AAAACATAGT-AACTTAAAAAAGAGTTTATTTGGGATCGACCA  344
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAAAAACATAGTAAACTTAAAAAAGAGTTTATTTGGGATCGACCA  342

seq1  CAGTTCAAGATACTTTAAATCCATCATGACAGGGGACACCAGGAGCTTGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCAAGATACTTTAAATCCATCATGACAGGGGACACCAGGAGCTTGA  392

seq1  AGAAGCTGGGGACATCACATCCATAAACAGCGATCTCAGCTCACTTTCTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTGGGGACATCACATCCATAAACAGCGATCTCAGCTCACTTTCTC  442

seq1  TAGTTTATACAGTCTAGGATTCCCTGCCCAGGTAGTAATCCCCTCCACAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTATACAGTCTAGGATTCCCTGCCCAGGTAGTAATCCCCTCCACAA  492

seq1  TTAAAATGAATTTTCCCAATCAATTAATGTAATCAAGATATCTTCAAAGG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATGAATTTTCCCAATCAATTAATGTAATCAAGATATCTTCAAAGG  542

seq1  CTAATCTAACCTCATGGGTAAGTCCCCAGACTTTTCTCCTAGGCGATGCC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATCTAACCTCATGGGTAAGTCCCCAGACTTTTCTCCTAGGCGATGCC  592

seq1  AGATGCAGGCAAGTTGACAATTAACAACAGTCATTACATATATAAACAAA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCAGGCAAGTTGACAATTAACAACAGTCATTACATATATAAACAAA  642

seq1  AAATCCTCAAGAAAGAATTATGTAACCATTTCCTATCCACATACAGAGTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTCAAGAAAGAATTATGTAACCATTTCCTATCCACATACAGAGTT  692

seq1  CATAAATCCCTATCCTTAGCCACTGGACTGTTTACCATGATTACAAGTAT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATCCCTATCCTTAGCCACTGGACTGTTTACCATGATTACAAGTAT  742

seq1  CTGTTAGATGTCTGTCTTCCTCAGGAGGACTGTGAAATACAAAGAAGCTT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGATGTCTGTCTTCCTCAGGAGGACTGTGAAATACAAAGAAGCTT  792

seq1  AATTGTGTCTGTTTAGATCACTGTTAATAACTTAGCACAAAACAAAAAAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGTCTGTTTAGATCACTGTTAATAACTTAGCACAAAACAAAAAAA  842

seq1  CAGCACAAAACAAAAAACTTAGCACAAAAATTAAATACTTATTGAGATAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAAAACAAAAAACTTAGCACAAAAATTAAATACTTATTGAGATAC  892

seq1  TGAATATAATAAAACAGTGAATGAAAATATGATGTAACTGCAACGAATCT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATAATAAAACAGTGAATGAAAATATGATGTAACTGCAACGAATCT  942

seq1  GTGTCTGCTACAAGTGAACTACATCGTCCTTATCAATAGGAATAGAACCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGCTACAAGTGAACTACATCGTCCTTATCAATAGGAATAGAACCT  992

seq1  CACACAGCCTGATGAATTTGCTTTATAAGAATATTCAAACATCTCTTAGG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGCCTGATGAATTTGCTTTATAAGAATATTCAAACATCTCTTAGG  1042

seq1  TGTTGAAACAGACATCCTATACAAGCTTTGATTTCCTCAAGCTGGTCAAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAAACAGACATCCTATACAAGCTTTGATTTCCTCAAGCTGGTCAAC  1092

seq1  CAATACACGTCTACGAAAGCAGAATAAAAACAATGGGTCAAGTGTCAAAA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACACGTCTACGAAAGCAGAATAAAAACAATGGGTCAAGTGTCAAAA  1142

seq1  GAATTC  1150
      ||||||
seq2  GAATTC  1148