BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263L19
Chromosome12 (Build37)
Map Location 84,143,293 - 84,290,187
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRgs6
Upstream geneSipa1l1, LOC432675, EG666911
Downstream geneDpf3, Wdr21, Zfyve1, LOC626950, Rbm25, Psen1, Papln, Numb, LOC100042325
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263L19.bB6Ng01-263L19.g
ACCGA067826GA067827
length1,0011,023
definitionB6Ng01-263L19.b B6Ng01-263L19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,143,293 - 84,144,298)(84,289,150 - 84,290,187)
sequence
gaattcacagatttgcctgcctctgcccctgctaggattaaaggtgtgta
ccaccatacttagcaagaggctacttcttgcctctccactattgaaaata
aaaagtatttctttgtaaagcatatagaatgttctgtgagcttaaaatag
ttcagaaatgaatagtttgataactctcctttgtccaagatagcctaaag
ttaacacattatttccagaactgttctttttcatgtctgtatgtgcttat
atatgtgtgtgattaataaaataggaatttttctgctgtaaagaatatca
tttcaccctatatatttgtactggctagttttgtgtgtcaacttgacaca
ggctggagttatcacagagaaaggagcttccgttgaggaaatgcctccat
gacatccagctgtggagcattttctctgttggtgatcaaggaaggaggcc
ccactgtggttgggaccatccctgggctggtagtcttgggttctataaga
gagcaagctgagcaagccaggggaagaaagccagtaagaaacatccctcc
atggcctctgcatcagctcctgcttcctgacctgcttgagttccagtcct
gacttcctttagtgataaacagcaaggtggaagtgtaagctgaataaacc
atttcctccacaacttgcttcttggtcatgatgtgtgtgcaggaatagaa
accctggctaggacagtattcttggttgatgtggtattttccaatcagaa
tagtagttcaataaatatttattgcatgaatgagtcatggtttacttccc
tttcttgttagaagaattttatactgatgccctttccataaatatgttta
tatgtaaaagatacagtaggaagggcatactacagcacacatgagcacag
catgtactgctggtcataacattattcttacatacagggatacagtacgc
aagcagtgaagtctgagtacttctggtgtatgcatatcctgtattgggag
t
aattcaattcaatttaatttattcaattcaattcaattaatttatttatt
tatgtgtgtgtgtgtccacatgttggggcatggtgttcataaggaggtta
gtgcacaatggttctctccttctaccacctggcattcagggattaaactc
agatcttcaagtttggcagcaagcatccttattcaccggcccagtctctt
cttgatcaattatccctttctagctctcagtcggaattggaaaccatctg
gagtcagagcaagcaggggataagctgagaggaagagggagatgtgtact
gttaaactacgataggcgactatggcctctaagtcaccctgcgttctctt
aggaactgtggagggtctttgagacgtcctctgtattaatcaccgtttcc
ccctcgtggctgtgtaaagtgaacccaaggaagaaagattgtctactggc
ttacagtccgtcatggtgaggaaggcatggttgttggctatggctggtca
tgttgtgtccatagtttggaagcagagagagaagagcgcccatgctcagc
ttgctgtcttctttttaatccagtctggcttcctggtctctgggatggtg
tcctgcattcagggtgggtcttctctagtcacaccctcacagacacaccc
agacacaagtagcctaggtgatactaatctgatcaagtttatggtggaat
ttaaccgttccctctggtttaccccgtagctctcttgtgcaggtcatcac
tcctttgtcaccgtgtccaccacgttcacactgcttctccagatacagga
agcatctcagagtttctgccgaggactgctcatctttggaggtgaaactt
ttcatcagaaaccactaaggcttccctgttctcttttcaacactaccttg
gtgaggattcataggtcagttcaggatgagacatctcccttccatgtaga
agcagccagctagcagtctcctcctctcatttagatttctgctggatcag
ttaaggtatctattcactcttcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_84143293_84144298
seq2: B6Ng01-263L19.b_46_1046

seq1  GAATTCACAGATTTGCCTGCCTCTGCCCCTGCTAGGATTAAAGGTGTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGATTTGCCTGCCTCTGCCCCTGCTAGGATTAAAGGTGTGTA  50

seq1  CCACCATACTTAGCAAGAGGCTACTTCTTGCCTCTCCACTATTGAAAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATACTTAGCAAGAGGCTACTTCTTGCCTCTCCACTATTGAAAATA  100

seq1  AAAAGTATTTCTTTGTAAAGCATATAGAATGTTCTGTGAGCTTAAAATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTATTTCTTTGTAAAGCATATAGAATGTTCTGTGAGCTTAAAATAG  150

seq1  TTCAGAAATGAATAGTTTGATAACTCTCCTTTGTCCAAGATAGCCTAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAATGAATAGTTTGATAACTCTCCTTTGTCCAAGATAGCCTAAAG  200

seq1  TTAACACATTATTTCCAGAACTGTTCTTTTTCATGTCTGTATGTGCTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACATTATTTCCAGAACTGTTCTTTTTCATGTCTGTATGTGCTTAT  250

seq1  ATATGTGTGTGATTAATAAAATAGGAATTTTTCTGCTGTAAAGAATATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGTGTGATTAATAAAATAGGAATTTTTCTGCTGTAAAGAATATCA  300

seq1  TTTCACCCTATATATTTGTACTGGCTAGTTTTGTGTGTCAACTTGACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCCTATATATTTGTACTGGCTAGTTTTGTGTGTCAACTTGACACA  350

seq1  GGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCCGTTGAGGAAATGCCTCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCCGTTGAGGAAATGCCTCCAT  400

seq1  GACATCCAGCTGTGGAGCATTTTCTCTGTTGGTGATCAAGGAAGGAGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCCAGCTGTGGAGCATTTTCTCTGTTGGTGATCAAGGAAGGAGGCC  450

seq1  CCACTGTGGTTGGGACCATCCCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTGGTTGGGACCATCCCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAGA  500

seq1  GAGCAAGCTGAGCAAGCCAGGGGAAGAAAGCCAGTAAGAAACATCCCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGCTGAGCAAGCCAGGGGAAGAAAGCCAGTAAGAAACATCCCTCC  550

seq1  ATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCT  600

seq1  GACTTCCTTTAGTGATAAACAGCAAGGTGGAAGTGTAAGCTGAATAAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCTTTAGTGATAAACAGCAAGGTGGAAGTGTAAGCTGAATAAACC  650

seq1  ATTTCCTCCACAACTTGCTTCTTGGTCATGATGTGTGTGCAGGAATAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTCCACAACTTGCTTCTTGGTCATGATGTGTGTGCAGGAATAGAA  700

seq1  ACCCTGGCTAGGACAGTATTCTTGGTTGATGTGGTATTTTCCAATCAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGCTAGGACAGTATTCTTGGTTGATGTGGTATTTTCCAATCAGAA  750

seq1  TAGTAGTTCAATAAATATTTATTGCATGAATGAGTCATGGTTTACTT-CC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TAGTAGTTCAATAAATATTTATTGCATGAATGAGTCATGGTTTACTTCCC  800

seq1  TTTCTTGTTAGAAGAATTTTATACTGATGCCCTTTCAATAAATATGTTTA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTTCTTGTTAGAAGAATTTTATACTGATGCCCTTTCCATAAATATGTTTA  850

seq1  TATGTAAAAGATACAGTA-GAAAGGCATACTACAGCACACATGAAGCACA  898
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATGTAAAAGATACAGTAGGAAGGGCATACTACAGCACACATG-AGCACA  899

seq1  GCATGTAACTGCTGGTCATAAACATATTCTTACATACAGGGATACAGTAC  948
      |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGT-ACTGCTGGTCATAACATTATTCTTACATACAGGGATACAGTAC  948

seq1  GCAAGCAGTGGAAGGTTCTTGAGTAC-TCTGGTGTAATGCATATTCCTGT  997
      ||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||
seq2  GCAAGCAGT-GAAG--TC-TGAGTACTTCTGGTGT-ATGCATA-TCCTGT  992

seq1  ATTGTGAGT  1006
      |||| ||||
seq2  ATTGGGAGT  1001

seq1: chr12_84289150_84290187
seq2: B6Ng01-263L19.g_67_1089 (reverse)

seq1  GGAAGAGTGAATAGAATACCTACACTGGACTCCAGACAGGAAATCTTAAA  50
      |||||||||||||| ||||||  ||||   ||||| || |||||| ||||
seq2  GGAAGAGTGAATAG-ATACCTTAACTG--ATCCAG-CA-GAAATC-TAAA  44

seq1  GGAGAGGA-GAGACTGGCTAGCTGGCTGCTTCTACCATGGAAAGGGGAGA  99
       ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||
seq2  TGAGAGGAGGAGACT-GCTAGCTGGCTGCTTCTA-CATGGAA--GGGAGA  90

seq1  TGTTTCTTCAATCTTGGAACTGACCTATGAATTCTCACCAAGGTAGTGGT  149
      ||| ||    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  TGTCTC----ATCCT-GAACTGACCTATGAATCCTCACCAAGGTAGT-GT  134

seq1  TTGAGAGAGAACAGTGAAGCCTTAGTGGTTTCTGATGAAAAGTTTCACCT  199
      |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGAGAACAGGGAAGCCTTAGTGGTTTCTGATGAAAAGTTTCACCT  184

seq1  CCAAAGATGAGCAGTCCTCGGCAGAAACTCTGAGATGCTTCCTGTTATCT  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCAAAGATGAGCAGTCCTCGGCAGAAACTCTGAGATGCTTCCTG-TATCT  233

seq1  GGAGAAGCAGTGTGAACGT-GTGGACACGGTGACAAAGGAGTGATGACCT  298
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGCAGTGTGAACGTGGTGGACACGGTGACAAAGGAGTGATGACCT  283

seq1  GCACAAGAGAGCTACGGGGTAAACCAGAGGGAACGGTTAAATTCCACCAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAGAGAGCTACGGGGTAAACCAGAGGGAACGGTTAAATTCCACCAT  333

seq1  AAACTTGATCAGATTAGTATCACCTAGGCTACTTGTGTCTGGGTGTGTCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGATCAGATTAGTATCACCTAGGCTACTTGTGTCTGGGTGTGTCT  383

seq1  GTGAGGGTGTGACTAGAGAAGACCCACCCTGAATGCAGGACACCATCCCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGGTGTGACTAGAGAAGACCCACCCTGAATGCAGGACACCATCCCA  433

seq1  GAGACCAGGAAGCCAGACTGGATTAAAAAGAAGACAGCAAGCTGAGCATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCAGGAAGCCAGACTGGATTAAAAAGAAGACAGCAAGCTGAGCATG  483

seq1  GGCGCTCTTCTCTCTCTGCTTCCAAACTATGGACACAACATGACCAGCCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGCTCTTCTCTCTCTGCTTCCAAACTATGGACACAACATGACCAGCCA  533

seq1  TAGCCAACAACCATGCCTTCCTCACCATGACGGACTGTAAGCCAGTAGAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAACAACCATGCCTTCCTCACCATGACGGACTGTAAGCCAGTAGAC  583

seq1  AATCTTTCTTCCTTGGGTTCACTTTACACAGCCACGAGGGGGAAACGGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTCTTCCTTGGGTTCACTTTACACAGCCACGAGGGGGAAACGGTG  633

seq1  ATTAATACAGAGGACGTCTCAAAGACCCTCCACAGTTCCTAAGAGAACGC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATACAGAGGACGTCTCAAAGACCCTCCACAGTTCCTAAGAGAACGC  683

seq1  AGGGTGACTTAGAGGCCATAGTCGCCTATCGTAGTTTAACAGTACACATC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGACTTAGAGGCCATAGTCGCCTATCGTAGTTTAACAGTACACATC  733

seq1  TCCCTCTTCCTCTCAGCTTATCCCCTGCTTGCTCTGACTCCAGATGGTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTTCCTCTCAGCTTATCCCCTGCTTGCTCTGACTCCAGATGGTTT  783

seq1  CCAATTCCGACTGAGAGCTAGAAAGGGATAATTGATCAAGAAGAGACTGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTCCGACTGAGAGCTAGAAAGGGATAATTGATCAAGAAGAGACTGG  833

seq1  GCCGGTGAATAAGGATGCTTGCTGCCAAACTTGAAGATCTGAGTTTAATC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGTGAATAAGGATGCTTGCTGCCAAACTTGAAGATCTGAGTTTAATC  883

seq1  CCTGAATGCCAGGTGGTAGAAGGAGAGAACCATTGTGCACTAACCTCCTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAATGCCAGGTGGTAGAAGGAGAGAACCATTGTGCACTAACCTCCTT  933

seq1  ATGAACACCATGCCCCAACATGTGGACACACACACACATAAATAAATAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACACCATGCCCCAACATGTGGACACACACACACATAAATAAATAAA  983

seq1  TTAATTGAATTGAATTGAATAAATTAAATTGAATTGAATT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTGAATTGAATTGAATAAATTAAATTGAATTGAATT  1023