BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264B04
Chromosome12 (Build37)
Map Location 30,211,140 - 30,340,063
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyt1l, LOC100043496
Upstream gene1110015M06Rik, Allc, Colec11, Rps7, Rnaseh1, Adi1, Ttc15, Tssc1, 4833405L11Rik, LOC629608
Downstream genePxdn, Tpo, Sntg2, Tmem18
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264B04.bB6Ng01-264B04.g
ACCGA068075GA068076
length1281,140
definitionB6Ng01-264B04.b B6Ng01-264B04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,211,140 - 30,211,267)(30,338,929 - 30,340,063)
sequence
ccatttttttttctattgaccgaatgattcctattctttgcttcagagaa
catccgatatggtacccaatcagctgaaaaggctgcacatacgtcattag
ttctgggggtggggaggagagatggagg
gaattcatattagcctcccactgtctattcagcgtggctctgctctcagc
ccaccgcttgcacacaggtcctcatgtgtgtatatgtgcacatgcatgca
tatatgcacacacaggcacgcaaacattcacaagcacatggagacttata
cacttctttgactgaagctaagcacataggcatcactactgacgtgcaga
actgggtgaatcgtaattggtaacatcatgtccttcattagcaggtgaga
agggcaggtggatctgcgtctctgcactctggaagggcctgtgttcattg
ctgaaggacacctgggtataacaccatctgaacccctatttagaggatgt
cctgtcctctggggcatactactctagggcatactactgtgtagcatact
ctcaggactgctgagacaaagacagcattaaataccatgtctccattttt
ttttatctgactgttgccatgtcaggtatgcatgaaggtgagctggggct
ggaatgtccagctcagtgccatctagaggagtcctggtccctatgtatgc
tggcaatgagcaagctacacaaatcaagaaaagatgaacctccctcgtca
caaaccaggatccttaggaatgcaggccatgctcagagcagtgcaaacag
ttgcctaagccataatccactctctctgccttgatctgcagagaagctag
ggagatagtaagggctgatggtgtagcacacgactgtaaagaacgtgtcc
agctgacagcgctggcttttccaccttagtgagttccagtagctttacat
ctcacatgcagtaataaggtgtgtgctcctgactctcagtgaccaactgt
actgaccacacatagctgggctatggctgtacccataagtgtcacagaaa
ctaaatcactaacttcacgtataagcaattggcaagtgctgccaccatct
acaaattactcttgggattcaccagttgtaggccaggactggtgaagaag
ccagagtcttcttcatgggaagctgttggctaattggaaagatgatcgcg
gagcagaagggaaatgtccctccacaggctcatgcattaacaggtgcttc
aatgtccttgcctgcctatgttgggggttttttggaacct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_30211140_30211267
seq2: B6Ng01-264B04.b_54_181

seq1  CCATTTTTTTTTCTATTGACCGAATGATTCCTATTCTTTGCTTCAGAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTTTTTTCTATTGACCGAATGATTCCTATTCTTTGCTTCAGAGAA  50

seq1  CATCCGATATGGTACCCAATCAGCTGAAAAGGCTGCACATACGTCATTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCGATATGGTACCCAATCAGCTGAAAAGGCTGCACATACGTCATTAG  100

seq1  TTCTGGGGGTGGGGAGGAGAGATGGAGG  128
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGGGTGGGGAGGAGAGATGGAGG  128

seq1: chr12_30338929_30340063
seq2: B6Ng01-264B04.g_67_1206 (reverse)

seq1  AGGTTCCAAAAACCTCCCCACATA-GCA-GCAA-GACATGAAAAGGCACT  47
      |||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| |||||  ||  |||| 
seq2  AGGTTCCAAAAAACCCCCAACATAGGCAGGCAAGGACATTGAA--GCACC  48

seq1  GGTTAAATGCATGAGCCTGTGGA-GGACATTTCCC-TCTGCTCCGCGATC  95
       ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGTT-AATGCATGAGCCTGTGGAGGGACATTTCCCTTCTGCTCCGCGATC  97

seq1  ATCTTTCC-ATTGGCC-ACAGCTT-CCATGAGAAGGACCTCTGGCTTCTC  142
      |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||  | || ||||||||||| 
seq2  ATCTTTCCAATTAGCCAACAGCTTCCCATGAAGAAGA-CTCTGGCTTCTT  146

seq1  CA-CAGTCCTGGCCTAC-ACTGGTGAATCCCAAGAGTAATTTGTAGATGG  190
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGTCCTGGCCTACAACTGGTGAATCCCAAGAGTAATTTGTAGATGG  196

seq1  TGGCAGCAACTTGCCAATTGCTTATACGTGAAGTTAGTGATTTAGTTTCT  240
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGC-ACTTGCCAATTGCTTATACGTGAAGTTAGTGATTTAGTTTCT  245

seq1  GTGACACTTATGGGTACAGCCATAGCCCAGCTATGTGTGGTCAGTACAGT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACTTATGGGTACAGCCATAGCCCAGCTATGTGTGGTCAGTACAGT  295

seq1  TGGTCACTGAGAGTCAGGAGCACACACCTTATTACTGCATGTGAGATGTA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCACTGAGAGTCAGGAGCACACACCTTATTACTGCATGTGAGATGTA  345

seq1  AAGCTACTGGAACTCACTAAGGTGGAAAAGCCAGCGCTGTCAGCTGGACA  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTACTGGAACTCACTAAGGTGGAAAAGCCAGCGCTGTCAGCTGGACA  395

seq1  CGTTCTTTACAGTCGTGTGCTACACCATCAGCCCTTACTATCTCCCTAGC  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCTTTACAGTCGTGTGCTACACCATCAGCCCTTACTATCTCCCTAGC  445

seq1  TTCTCTGCAGATCAAGGCAGAGAGAGTGGATTATGGCTTAGGCAACTGTT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGCAGATCAAGGCAGAGAGAGTGGATTATGGCTTAGGCAACTGTT  495

seq1  TGCACTGCTCTGAGCATGGCCTGCATTCCTAAGGATCCTGGTTTGTGACG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGCTCTGAGCATGGCCTGCATTCCTAAGGATCCTGGTTTGTGACG  545

seq1  AGGGAGGTTCATCTTTTCTTGATTTGTGTAGCTTGCTCATTGCCAGCATA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGTTCATCTTTTCTTGATTTGTGTAGCTTGCTCATTGCCAGCATA  595

seq1  CATAGGGACCAGGACTCCTCTAGATGGCACTGAGCTGGACATTCCAGCCC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGGACCAGGACTCCTCTAGATGGCACTGAGCTGGACATTCCAGCCC  645

seq1  CAGCTCACCTTCATGCATACCTGACATGGCAACAGTCAGATAAAAAAAAA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCACCTTCATGCATACCTGACATGGCAACAGTCAGATAAAAAAAAA  695

seq1  TGGAGACATGGTATTTAATGCTGTCTTTGTCTCAGCAGTCCTGAGAGTAT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGACATGGTATTTAATGCTGTCTTTGTCTCAGCAGTCCTGAGAGTAT  745

seq1  GCTACACAGTAGTATGCCCTAGAGTAGTATGCCCCAGAGGACAGGACATC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACACAGTAGTATGCCCTAGAGTAGTATGCCCCAGAGGACAGGACATC  795

seq1  CTCTAAATAGGGGTTCAGATGGTGTTATACCCAGGTGTCCTTCAGCAATG  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAATAGGGGTTCAGATGGTGTTATACCCAGGTGTCCTTCAGCAATG  845

seq1  AACACAGGCCCTTCCAGAGTGCAGAGACGCAGATCCACCTGCCCTTCTCA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGGCCCTTCCAGAGTGCAGAGACGCAGATCCACCTGCCCTTCTCA  895

seq1  CCTGCTAATGAAGGACATGATGTTACCAATTACGATTCACCCAGTTCTGC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTAATGAAGGACATGATGTTACCAATTACGATTCACCCAGTTCTGC  945

seq1  ACGTCAGTAGTGATGCCTATGTGCTTAGCTTCAGTCAAAGAAGTGTATAA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCAGTAGTGATGCCTATGTGCTTAGCTTCAGTCAAAGAAGTGTATAA  995

seq1  GTCTCCATGTGCTTGTGAATGTTTGCGTGCCTGTGTGTGCATATATGCAT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCATGTGCTTGTGAATGTTTGCGTGCCTGTGTGTGCATATATGCAT  1045

seq1  GCATGTGCACATATACACACATGAGGACCTGTGTGCAAGCGGTGGGCTGA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGCACATATACACACATGAGGACCTGTGTGCAAGCGGTGGGCTGA  1095

seq1  GAGCAGAGCCACGCTGAATAGACAGTGGGAGGCTAATATGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAGCCACGCTGAATAGACAGTGGGAGGCTAATATGAATTC  1140