BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264E02
Chromosome12 (Build37)
Map Location 30,592,471 - 30,744,372
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyt1l, Pxdn, Tpo
Upstream gene4833405L11Rik, LOC629608, LOC100043496
Downstream geneSntg2, Tmem18, LOC100043055, Acp1, Sh3yl1, LOC629656
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264E02.bB6Ng01-264E02.g
ACCGA068206GA068207
length6461,152
definitionB6Ng01-264E02.b B6Ng01-264E02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,743,727 - 30,744,372)(30,592,471 - 30,593,633)
sequence
gaattcagatctagatctgtgtaccgaaggaggggctctgcagggtacgg
agcttggcaggattttcatctggcctctgagtgatctccctcagtttatt
acaactaattacctgatgggaggccttttagaggctggccaggagacaga
taatcatttcatctcaggctaccctgctgagggactgattcttaacacta
accaagtaaatccagtgggggggaatccttccaggagactgtctctttcc
cccaacagatagaagaaactgtctgtatggtgggcatcaccatggagaag
cgacaggagaaataatctctagggctacagggaaatgggtacctggaaga
aagggagccagtgagttgggtgggagtcttcgatgtgtacagcaataacc
agtgagtagaggctgagggaggctggaggttagcatggaccttgatgtta
tagactctataggtatgtgttaatggagaatggagtcctggaagtgttct
ttctctgcaggtgaaatgagtcaattcatgacagattaaagtatgtaaag
gcaggtttgttagaaaggcactctgggcaagttcactggtgccaaggaat
gaagccagggaagttaccatgagaagggagatggggggaggggaga

gaattctgggcagtgaatacctgagacctagactgaggccgtgtagccca
gaatgcatctggctttctcctaagaactacaaagagttaagaaggctgga
gctctacttcaggggtccttgaaccagctgctgatagacagagccgctgg
gcagcacttaatatctgttgtggtgaagcagtgtaggtcagacccgggaa
ctcactagaaaggggttctataatcctcatcggagagaaaacaggtaaaa
ctggagacattctcatgagtggaatccagatcagacattatgaaagcaca
atcttgagggagaaatgtcatctggtgtcatttttccccatcattgacta
catgcaattttaccaaagtctgcaaaagcactcttgagatccctggtgtg
gtgtgctcttggtctagaaagagcctgagatgcataggtgtgatgtctgg
ggatgtgatccctgagctgcaggtattcttgggttgagagcagcaacctg
agctgggtggagactgtgctggctggaggcttcctgaagcacatgcttct
atttaatagataatgaggtgagaaaagttgggtgctcaatacacagtgct
ggagcagaaatataagacctgagagtatcatgggtaaatgaagaaatgca
gagcggagacaccagtgtgcagaccttaagctgacagtgtggacatttag
gaaccatgggtcttgagctgaagaagtgatctggggtcccagaagcattg
cacaggatgtgtatggtttgttggattcagcccaagtaaagccctgcagc
tccattaagggacggacacatgggccccagggatggtgactgtgaaaaac
aacatgtagcttaggatccttcctgtggcaacagcccgggtacaatgtga
ggaaggcggcaggcctctggaacccagtcctccacattctgaagctctct
gcccaacttccccacctctgaaaatctgccgcaagagtgcccagagcttt
cctggggaaagaatagtggccatattttgggggatgcattctctgtggcc
tgggccagcctgagctgagcaaagtgctgttctgggaagcccagatctgg
atgttatgcaagaggccaacagctcccatgcccacagtcatgcccacttg
cc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_30743727_30744372
seq2: B6Ng01-264E02.b_48_693 (reverse)

seq1  TCTCCCCTCCCCCCATCTCCCTTCTCATGGTAACTTCCCTGGCTTCATTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCTCCCCCCATCTCCCTTCTCATGGTAACTTCCCTGGCTTCATTC  50

seq1  CTTGGCACCAGTGAACTTGCCCAGAGTGCCTTTCTAACAAACCTGCCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCACCAGTGAACTTGCCCAGAGTGCCTTTCTAACAAACCTGCCTTT  100

seq1  ACATACTTTAATCTGTCATGAATTGACTCATTTCACCTGCAGAGAAAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTTTAATCTGTCATGAATTGACTCATTTCACCTGCAGAGAAAGAA  150

seq1  CACTTCCAGGACTCCATTCTCCATTAACACATACCTATAGAGTCTATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCCAGGACTCCATTCTCCATTAACACATACCTATAGAGTCTATAAC  200

seq1  ATCAAGGTCCATGCTAACCTCCAGCCTCCCTCAGCCTCTACTCACTGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGTCCATGCTAACCTCCAGCCTCCCTCAGCCTCTACTCACTGGTT  250

seq1  ATTGCTGTACACATCGAAGACTCCCACCCAACTCACTGGCTCCCTTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGTACACATCGAAGACTCCCACCCAACTCACTGGCTCCCTTTCTT  300

seq1  CCAGGTACCCATTTCCCTGTAGCCCTAGAGATTATTTCTCCTGTCGCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTACCCATTTCCCTGTAGCCCTAGAGATTATTTCTCCTGTCGCTTC  350

seq1  TCCATGGTGATGCCCACCATACAGACAGTTTCTTCTATCTGTTGGGGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGTGATGCCCACCATACAGACAGTTTCTTCTATCTGTTGGGGGAA  400

seq1  AGAGACAGTCTCCTGGAAGGATTCCCCCCCACTGGATTTACTTGGTTAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGTCTCCTGGAAGGATTCCCCCCCACTGGATTTACTTGGTTAGT  450

seq1  GTTAAGAATCAGTCCCTCAGCAGGGTAGCCTGAGATGAAATGATTATCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGAATCAGTCCCTCAGCAGGGTAGCCTGAGATGAAATGATTATCTG  500

seq1  TCTCCTGGCCAGCCTCTAAAAGGCCTCCCATCAGGTAATTAGTTGTAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGGCCAGCCTCTAAAAGGCCTCCCATCAGGTAATTAGTTGTAATA  550

seq1  AACTGAGGGAGATCACTCAGAGGCCAGATGAAAATCCTGCCAAGCTCCGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGGGAGATCACTCAGAGGCCAGATGAAAATCCTGCCAAGCTCCGT  600

seq1  ACCCTGCAGAGCCCCTCCTTCGGTACACAGATCTAGATCTGAATTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGCAGAGCCCCTCCTTCGGTACACAGATCTAGATCTGAATTC  646


seq1: chr12_30592471_30593633
seq2: B6Ng01-264E02.g_65_1216

seq1  GAATTCTGGGCAGTGAATACCTGAGACCTAGACTGAGGCCGTGTAGCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCAGTGAATACCTGAGACCTAGACTGAGGCCGTGTAGCCCA  50

seq1  GAATGCATCTGGCTTTCTCCTAAGAACTACAAAGAGTTAAGAAGGCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCATCTGGCTTTCTCCTAAGAACTACAAAGAGTTAAGAAGGCTGGA  100

seq1  GCTCTACTTCAGGGGTCCTTGAACCAGCTGCTGATAGACAGAGCCGCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTACTTCAGGGGTCCTTGAACCAGCTGCTGATAGACAGAGCCGCTGG  150

seq1  GCAGCACTTAATATCTGTTGTGGTGAAGCAGTGTAGGTCAGACCCGGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCACTTAATATCTGTTGTGGTGAAGCAGTGTAGGTCAGACCCGGGAA  200

seq1  CTCACTAGAAAGGGGTTCTATAATCCTCATCGGAGAGAAAACAGGTAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTAGAAAGGGGTTCTATAATCCTCATCGGAGAGAAAACAGGTAAAA  250

seq1  CTGGAGACATTCTCATGAGTGGAATCCAGATCAGACATTATGAAAGCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGACATTCTCATGAGTGGAATCCAGATCAGACATTATGAAAGCACA  300

seq1  ATCTTGAGGGAGAAATGTCATCTGGTGTCATTTTTCCCCATCATTGACTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGAGGGAGAAATGTCATCTGGTGTCATTTTTCCCCATCATTGACTA  350

seq1  CATGCAATTTTACCAAAGTCTGCAAAAGCACTCTTGAGATCCCTGGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAATTTTACCAAAGTCTGCAAAAGCACTCTTGAGATCCCTGGTGTG  400

seq1  GTGTGCTCTTGGTCTAGAAAGAGCCTGAGATGCATAGGTGTGATGTCTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCTCTTGGTCTAGAAAGAGCCTGAGATGCATAGGTGTGATGTCTGG  450

seq1  GGATGTGATCCCTGAGCTGCAGGTATTCTTGGGTTGAGAGCAGCAACCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGATCCCTGAGCTGCAGGTATTCTTGGGTTGAGAGCAGCAACCTG  500

seq1  AGCTGGGTGGAGACTGTGCTGGCTGGAGGCTTCCTGAAGCACATGCTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGTGGAGACTGTGCTGGCTGGAGGCTTCCTGAAGCACATGCTTCT  550

seq1  ATTTAATAGATAATGAGGTGAGAAAAGTTGGGTGCTCAATACACAGTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATAGATAATGAGGTGAGAAAAGTTGGGTGCTCAATACACAGTGCT  600

seq1  GGAGCAGAAATATAAGACCTGAGAGTATCATGGGTAAATGAAGAAATGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAGAAATATAAGACCTGAGAGTATCATGGGTAAATGAAGAAATGCA  650

seq1  GAGCGGAGACACCAGTGTGCAGACCTTAAGCTGACAGTGTGGACATTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGGAGACACCAGTGTGCAGACCTTAAGCTGACAGTGTGGACATTTAG  700

seq1  GAACCATGGGTCTTGAGCTGAAGAAGTGATCTGGGGTCCCAGAAGCATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCATGGGTCTTGAGCTGAAGAAGTGATCTGGGGTCCCAGAAGCATTG  750

seq1  CACAGGATGTGTATGGTTTGTTGGATTCAGCCCAAGTAAAGCCCTGCAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGATGTGTATGGTTTGTTGGATTCAGCCCAAGTAAAGCCCTGCAGC  800

seq1  TCCATTAAGGGACGGACACATGGGCCCCAGGGATGGTGACTGTGAAAAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTAAGGGACGGACACATGGGCCCCAGGGATGGTGACTGTGAAAAAC  850

seq1  AACATGTAGCTTAGGATCCTTCCTGTGGCAACAGCCCGGGTACAATGTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGTAGCTTAGGATCCTTCCTGTGGCAACAGCCCGGGTACAATGTGA  900

seq1  GGAAGGGCGGCAGGCCTCTGGAACCCAGTCCTCCACATTCTGAAGCTCTC  950
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAA-GGCGGCAGGCCTCTGGAACCCAGTCCTCCACATTCTGAAGCTCTC  949

seq1  TGCCCAACTTCCCCACCTCTGAAAATCTGCCGCAAGAGTGGCCAGAGGCT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  TGCCCAACTTCCCCACCTCTGAAAATCTGCCGCAAGAGTGCCCAGA-GCT  998

seq1  TTCCTGGGAAAGGAATAGTGGCCATATTTTGGGGGATGCATTCTCTGTGG  1050
      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTCCTGGGGAAAGAATAGTGGCCATATTTTGGGGGATGCATTCTCTGT-G  1047

seq1  GGCTGGGCCAGGCCTGAGGCTGGAGCAAAGTGCTGTTCTGGGAAGCCCAG  1100
      | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGCCA-GCCTGA-GCT-GAGCAAAGTGCTGTTCTGGGAAGCCCAG  1094

seq1  ATCTGGGAATG-TATGCAGGAGGCTCAACCAGCTCCCCATGCCCACAGTC  1149
      ||||||  ||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||
seq2  ATCTGG--ATGTTATGCAAGAGGC-CAA-CAGCT-CCCATGCCCACAGTC  1139

seq1  ATGCCCAACTTGCC  1163
      |||||| |||||||
seq2  ATGCCC-ACTTGCC  1152


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |