BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-266J22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 99,868,967 - 99,933,027
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpata7, Ptpn21
Upstream geneLOC100039743, LOC667732, LOC628351, LOC100039770, LOC667746, Galc, Gpr65, Kcnk10
Downstream geneZc3h14, Eml5, LOC100039845, Ttc8, EG667779, Ches1, LOC100039892
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-266J22.bB6Ng01-266J22.g
ACCGA069971GA069972
length1,134993
definitionB6Ng01-266J22.b B6Ng01-266J22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,868,967 - 99,870,103)(99,932,039 - 99,933,027)
sequence
gaattctctttaaatatagtgtgtttagttgggtacattggtgtgtgcct
gtgattccaattgcttggatggctgaggcaggatcacttgagtccaggaa
ttcaagaccagctttagcctgggccgtatagtaagacctaatctcaaaag
aaaataatataataaatataactcaaaatatatattatctcaaaacaaaa
atccaatgtgtcagtagtgaacaaaatgaaatcattatatataaagtgac
ataaatgacctattgatcacttcagtaaaaataaagtctcaaagtaaacc
atcctgaaaataacttagtttgaaaacaattcagtggagagcacttgtca
ggcacagacctccaatacagacagtgcttcacataaaatagcttgttttc
ttaaaaaaaaaaaaaaagggggtgtgcacccatgtgtcggttgggagcta
aggtcaagtgtctccctggtgttctccgcctgtatcttaagacaaggcct
cccactattttatgcctgttctgtgatgaactatctcaatgggtattccc
caacagtgggagctcaaaggtctagatgcggcctaggcactccctcactg
agactcttcacaggtaattttaggttgtgtcaagttacaactaaaactgg
cagtgccttttgaagctcattggttcagctacagtagtttgtcacagagt
gtcagggacctatctgtgcccaccctatcccctccaaagctggagttaaa
agcatgtgctgccaggcctggctttttatgtggattccaaactcaggtct
ttccttggtgtgtatgtgacagccactttatcacctgagccatcctccca
acccttatttccttaaaaaaaaaaaatgttcaatctgtggtcataggatt
tttcctattagataaatttttgttggtagtaacataacaatgatttcctt
ttgagacagggtgctattatttagccctggctgggattggactttttata
tagaccaggtctagccttgaattcaaagatctacctgcctctgcctctga
acctgctggatcataggtatgcacaacatgccctagctgataaaggttca
gcaaccttattaaaataactgtgttctttttaaa
gaattcagaaatctgcctgcctctacctcctgagtgctggaactaaaggc
atgtgccaccacccttgactttgatgattttaaagctcagtttatctaga
tagagagccagtgatagactgaacacagagtccctttaaactgaggcttg
actgtggacagtgaccagaggcaaattcagtatcaaagtaatgaagatca
gagccttgtgcatacttaaggggtactctaaacagacccacatacaccct
gcaagcttgggcacttgacgtgatgttggaaacctagacgtacgtttgga
aaatagacacagctgcaccatagagccccaaagttcactgccaggaaaag
aaaggaagtgacttgagctgttctccgacttcccaggtatggggaaggga
gttgtttaaagaaattgcccagtaagtacataggaatcactggacatcca
agagttttcattttaaaggtcttgtaaaaatatgctgacatctggagtgt
aatgcagatgccattatcaaagtgctaagaataatgctagtttagaagac
aagagatttctttctggcacatttgctgggtcagtgagtttattttgttt
actttgtgatggcggagttttagtactggttcttagagtgctaacctatg
tcacagaatgtgtttgtaatcggttatgaatccctcaagctcttgagcca
ggagcagatggtaagttaaaatgcccttgacagaattatgggcattccca
acactagcaagaatctaatgcatcttcataccatacctactcacacttac
taaggaacacagatgcaaagagtctgtgcatgtgtgcgtgcgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtacttgtctgggaggtggtggagtcctacacaatgaag
ttgacaacgttcttctctaataaattatggcatgtcttgttctttttgtc
attagccgtaaatatacctgaactctctatcttttgttattgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_99868967_99870103
seq2: B6Ng01-266J22.b_48_1181

seq1  GAATTCTCTTTAAATATAGTGTGTTTAGTTGGGTACATTGGTGTGTGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTAAATATAGTGTGTTTAGTTGGGTACATTGGTGTGTGCCT  50

seq1  GTGATTCCAATTGCTTGGATGGCTGAGGCAGGATCACTTGAGTCCAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTCCAATTGCTTGGATGGCTGAGGCAGGATCACTTGAGTCCAGGAA  100

seq1  TTCAAGACCAGCTTTAGCCTGGGCCGTATAGTAAGACCTAATCTCAAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGACCAGCTTTAGCCTGGGCCGTATAGTAAGACCTAATCTCAAAAG  150

seq1  AAAATAATATAATAAATATAACTCAAAATATATATTATCTCAAAACAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAATATAATAAATATAACTCAAAATATATATTATCTCAAAACAAAA  200

seq1  ATCCAATGTGTCAGTAGTGAACAAAATGAAATCATTATATATAAAGTGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAATGTGTCAGTAGTGAACAAAATGAAATCATTATATATAAAGTGAC  250

seq1  ATAAATGACCTATTGATCACTTCAGTAAAAATAAAGTCTCAAAGTAAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGACCTATTGATCACTTCAGTAAAAATAAAGTCTCAAAGTAAACC  300

seq1  ATCCTGAAAATAACTTAGTTTGAAAACAATTCAGTGGAGAGCACTTGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGAAAATAACTTAGTTTGAAAACAATTCAGTGGAGAGCACTTGTCA  350

seq1  GGCACAGACCTCCAATACAGACAGTGCTTCACATAAAATAGCTTGTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGACCTCCAATACAGACAGTGCTTCACATAAAATAGCTTGTTTTC  400

seq1  TTAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGTGTGCACCCATGTGTCGGTTGGGAGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGTGTGCACCCATGTGTCGGTTGGGAGCTA  450

seq1  AGGTCAAGTGTCTCCCTGGTGTTCTCCGCCTGTATCTTAAGACAAGGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAAGTGTCTCCCTGGTGTTCTCCGCCTGTATCTTAAGACAAGGCCT  500

seq1  CCCACTATTTTATGCCTGTTCTGTGATGAACTATCTCAATGGGTATTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTATTTTATGCCTGTTCTGTGATGAACTATCTCAATGGGTATTCCC  550

seq1  CAACAGTGGGAGCTCAAAGGTCTAGATGCGGCCTAGGCACTCCCTCACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTGGGAGCTCAAAGGTCTAGATGCGGCCTAGGCACTCCCTCACTG  600

seq1  AGACTCTTCACAGGTAATTTTAGGTTGTGTCAAGTTACAACTAAAACTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCTTCACAGGTAATTTTAGGTTGTGTCAAGTTACAACTAAAACTGG  650

seq1  CAGTGCCTTTTGAAGCTCATTGGTTCAGCTACAGTAGTTTGTCACAGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCCTTTTGAAGCTCATTGGTTCAGCTACAGTAGTTTGTCACAGAGT  700

seq1  GTCAGGGACCTATCTGTGCCCACCCTATCCCCTCCAAAGCTGGAGTTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGGACCTATCTGTGCCCACCCTATCCCCTCCAAAGCTGGAGTTAAA  750

seq1  AGCATGTGCTGCCAGGCCTGGCTTTTTATGTGGATTCCAAACTCAGGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGTGCTGCCAGGCCTGGCTTTTTATGTGGATTCCAAACTCAGGTCT  800

seq1  TTCCTTGGTGTGTATGTGACAGCCACTTTATCACCTGAGCCATCCTCCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTGGTGTGTATGTGACAGCCACTTTATCACCTGAGCCATCCTCCCA  850

seq1  ACCCTTATTTCCTTAAAAAAAAAAAAATGTTCAATCTGTGGTCATAGGAT  900
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTATTTCCTT-AAAAAAAAAAAATGTTCAATCTGTGGTCATAGGAT  899

seq1  TTTTCCTATTAGATAAATTTTTGTTGGTAGTAACATAACAATGATTT-CT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTTCCTATTAGATAAATTTTTGTTGGTAGTAACATAACAATGATTTCCT  949

seq1  TTTGAGACAGGGTGCTATTATTTAGCCCTGGCTGGATTTGAACTTTTTAT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||
seq2  TTTGAGACAGGGTGCTATTATTTAGCCCTGGCTGGGATTGGACTTTTTAT  999

seq1  ATAGACCA-GTCTAGCCTGGAATTCAAAGATCTACCTGCCTCTGCCTCTG  1048
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACCAGGTCTAGCCTTGAATTCAAAGATCTACCTGCCTCTGCCTCTG  1049

seq1  AA-CTGCTGGGATTATAGGTATGCACCACCATG-CCTAGCTGAATAAAAG  1096
      || ||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||   ||||
seq2  AACCTGCT-GGATCATAGGTATGCA-CAACATGCCCTAGCTGA--TAAAG  1095

seq1  TTTCAGCAACTTTATTTAAAAATAAATGTGTTCTTTTTAAA  1137
       ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||
seq2  GTTCAGCAACCTTATT--AAAATAACTGTGTTCTTTTTAAA  1134

seq1: chr12_99932039_99933027
seq2: B6Ng01-266J22.g_67_1058 (reverse)

seq1  CAATAACAAAAAGATAGAGAG-TCAGGTATATTCTAAGGCAAATGAC-AA  48
      ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||
seq2  CAATAAC-AAAAGATAGAGAGTTCAGGTATATT-TACGGCTAATGACAAA  48

seq1  AAGGACAA-ACATGCCATAATTTA-TAGAGAAGAACGTTGTC-ACTTC-C  94
      ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  
seq2  AAGAACAAGACATGCCATAATTTATTAGAGAAGAACGTTGTCAACTTCAT  98

seq1  TGTGTAGGACTCCACCACCTCCCAGAACAAGTACACACACACACACACAC  144
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGGACTCCACCACCTCCCAG-ACAAGTACACACACACACACACAC  147

seq1  ACACGCACGCACACATGCACAGACTCTTTGCATCTGTGTTCCTTAGTAAG  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGCACGCACACATGCACAGACTCTTTGCATCTGTGTTCCTTAGTAAG  197

seq1  TGTGAGTAGGTATGGTATGAAGATGCATTAGATTCTTGCTAGTGTTGGGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTAGGTATGGTATGAAGATGCATTAGATTCTTGCTAGTGTTGGGA  247

seq1  ATGCCCATAATTCTGTCAAGGGCATTTTAACTTACCATCTGCTCCTGGCT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCATAATTCTGTCAAGGGCATTTTAACTTACCATCTGCTCCTGGCT  297

seq1  CAAGAGCTTGAGGGATTCATAACCGATTACAAACACATTCTGTGACATAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGCTTGAGGGATTCATAACCGATTACAAACACATTCTGTGACATAG  347

seq1  GTTAGCACTCTAAGAACCAGTACTAAAACTCCGCCATCACAAAGTAAACA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCACTCTAAGAACCAGTACTAAAACTCCGCCATCACAAAGTAAACA  397

seq1  AAATAAACTCACTGACCCAGCAAATGTGCCAGAAAGAAATCTCTTGTCTT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAACTCACTGACCCAGCAAATGTGCCAGAAAGAAATCTCTTGTCTT  447

seq1  CTAAACTAGCATTATTCTTAGCACTTTGATAATGGCATCTGCATTACACT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACTAGCATTATTCTTAGCACTTTGATAATGGCATCTGCATTACACT  497

seq1  CCAGATGTCAGCATATTTTTACAAGACCTTTAAAATGAAAACTCTTGGAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGTCAGCATATTTTTACAAGACCTTTAAAATGAAAACTCTTGGAT  547

seq1  GTCCAGTGATTCCTATGTACTTACTGGGCAATTTCTTTAAACAACTCCCT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGTGATTCCTATGTACTTACTGGGCAATTTCTTTAAACAACTCCCT  597

seq1  TCCCCATACCTGGGAAGTCGGAGAACAGCTCAAGTCACTTCCTTTCTTTT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATACCTGGGAAGTCGGAGAACAGCTCAAGTCACTTCCTTTCTTTT  647

seq1  CCTGGCAGTGAACTTTGGGGCTCTATGGTGCAGCTGTGTCTATTTTCCAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCAGTGAACTTTGGGGCTCTATGGTGCAGCTGTGTCTATTTTCCAA  697

seq1  ACGTACGTCTAGGTTTCCAACATCACGTCAAGTGCCCAAGCTTGCAGGGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTACGTCTAGGTTTCCAACATCACGTCAAGTGCCCAAGCTTGCAGGGT  747

seq1  GTATGTGGGTCTGTTTAGAGTACCCCTTAAGTATGCACAAGGCTCTGATC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTGGGTCTGTTTAGAGTACCCCTTAAGTATGCACAAGGCTCTGATC  797

seq1  TTCATTACTTTGATACTGAATTTGCCTCTGGTCACTGTCCACAGTCAAGC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTACTTTGATACTGAATTTGCCTCTGGTCACTGTCCACAGTCAAGC  847

seq1  CTCAGTTTAAAGGGACTCTGTGTTCAGTCTATCACTGGCTCTCTATCTAG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTTTAAAGGGACTCTGTGTTCAGTCTATCACTGGCTCTCTATCTAG  897

seq1  ATAAACTGAGCTTTAAAATCATCAAAGTCAAGGGTGGTGGCACATGCCTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTGAGCTTTAAAATCATCAAAGTCAAGGGTGGTGGCACATGCCTT  947

seq1  TAGTTCCAGCACTCAGGAGGTAGAGGCAGGCAGATTTCTGAATTC  989
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCCAGCACTCAGGAGGTAGAGGCAGGCAGATTTCTGAATTC  992