BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-272P18
Chromosome12 (Build37)
Map Location 7,834,556 - 8,002,751
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668388
Upstream geneLOC668380
Downstream geneApob, 1110057K04Rik, Gdf7, Hs1bp3, BC106175, Rhob, Slc7a15, LOC100043154, Pum2, F730043H23, Sdc1, Laptm4a, Matn3, Wdr35
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-272P18.bB6Ng01-272P18.g
ACCGA074671GA074672
length1,1641,139
definitionB6Ng01-272P18.b B6Ng01-272P18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,834,556 - 7,835,738)(8,001,613 - 8,002,751)
sequence
gaattctacaggtaaccaatgcaacccagttaactaggtgacttccagat
ttagcattgagaatttcccagtgattcccgaagccctccgcatatttgct
gttattattattattattattattattgctaagatggttgtaaactgcag
aacagaaacctattttcactctaaactttagtgccaggtataaaaccaga
acatatttgcatgacctggcagagccaagggtggaatcagatactgaact
ctatttctaagcctcaacacaagcaaacaccttgctttgtttcagataag
tgacttttaatcccaaaattgtttacacgcaatgctaagtaacttcaccc
atttgttctttggttgaaaaataaataaaacatttaaagtaagcttaagt
ttccttgatagttaatactttaatctgatttaaaatataaaaattaatgg
ctggtgcattataatattatgactgtaagtattcactggattcttccctc
agaggatctcctggcactattgaaagggaagttatcaactgcaaaaggtt
aatcaactcaaactcaacaaaaggtctgactttaattgaaagtccaaatg
tcaaaatctgagacaggctttaaatttagaacaaaacaaatttaacatgt
gggatgctaaaaactctcattcgaatttgcatccccaaatctttgctggg
atgacagtacatattttgtgagaatgacagcagacactgtctgaaatgac
agcacacactttaaggataatttcaggccatgtacacaggaatgctggtc
tgcagtgttattatctcataaatgccactgtctagatttaggctggagct
gttgctagccccctgaaaagcaaagtgggagtgttcctctacttctttca
gtggaagagttcctgtagtgttgctggtttgtctgccatctgtgacctac
ccagtgaaacagggtttgggaattttaaggccattaacaggttttgagtt
ctgacttcatgtgtctgatggataatctctcgagtttctattcttcttga
gaactttctgaactttctgtcctccagaaacttaacatgtcagagtcatt
aagatttcactgatatcatattatcttccaataccagagaatctgatctc
cttgattccttgat
gaattcttaatgtaaggctggttcccataatcatgtgattatgaaattaa
acagaactccatagccacatagctactgactcaccagcagaggctaagtg
tgataaagagaggcataaaaatctttagtgaaatgtgtagagtcaaaagc
aatcttctcctgtttcccaggaacttgtgttacccaattgttgtctagcc
tggctaacttctgcagatccacacccaattcttccttttaaatatgccag
ctagacattgggaacagaattacctgccactgaacagcttgactggcctc
tttggagaaggaatgatgaccttcagctgcccagccttcagggccactcg
cgcctccaggcctgactcgtggaagaagttggtgttcatctggacactgc
tcttagcgaagtctgggatgatgatgcccatatttgtcacaaactccaag
gacacagagggctttgccactagctctgcctgtatctggaagtcagaagg
tgacctgttgagttttatgcagtgcctcggcaccctggtagacagcctca
gcccctcttcctgaaacctggcaaatgcctctgctaattttgaccacaag
gaccacaaatgtgcttttaggaagaaaagctgaaacattcatttcctcca
gagctatggtgcatttcctagggttaggaagagcctgaactaactttaag
cactatcagatataaagataactagggtcttcattcattgagagagcagc
tggtttctctttctattacggcatctcaagtagagatgttgagagatgat
atgtgctggtagaatcctaaaattcctcataaaaattagcaagaagattg
caatcatgatgctctttgccttgaagtggagcttgacatgtggtcaggaa
tccccacccccgaaggaaaagagacagtcattgatttgattgagatgaat
gcagagttcttacgttgggctaattcccagtcttacaccagcccttgatc
ccgggggtgaagacttcagacgagatacttgcagcttgtatccctgcctc
agtggggagctcaaaaggcatgtcatgagatgtatggagaaacagtcatt
tctttgacccttctctgatggcctgtaacctgaaatcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_7834556_7835738
seq2: B6Ng01-272P18.b_44_1207

seq1  GAATTCTACAGGTAACCAATGCAACCCAGTTAACTAGGTGACTTCCAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACAGGTAACCAATGCAACCCAGTTAACTAGGTGACTTCCAGAT  50

seq1  TTAGCATTGAGAATTTCCCAGTGATTCCCGAAGCCCTCCGCATATTTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCATTGAGAATTTCCCAGTGATTCCCGAAGCCCTCCGCATATTTGCT  100

seq1  GTTATTATTATTATTATTATTATTATTGCTAAGATGGTTGTAAACTGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTATTATTATTATTATTATTATTGCTAAGATGGTTGTAAACTGCAG  150

seq1  AACAGAAACCTATTTTCACTCTAAACTTTAGTGCCAGGTATAAAACCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAACCTATTTTCACTCTAAACTTTAGTGCCAGGTATAAAACCAGA  200

seq1  ACATATTTGCATGACCTGGCAGAGCCAAGGGTGGAATCAGATACTGAACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTTGCATGACCTGGCAGAGCCAAGGGTGGAATCAGATACTGAACT  250

seq1  CTATTTCTAAGCCTCAACACAAGCAAACACCTTGCTTTGTTTCAGATAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTCTAAGCCTCAACACAAGCAAACACCTTGCTTTGTTTCAGATAAG  300

seq1  TGACTTTTAATCCCAAAATTGTTTACACGCAATGCTAAGTAACTTCACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTTAATCCCAAAATTGTTTACACGCAATGCTAAGTAACTTCACCC  350

seq1  ATTTGTTCTTTGGTTGAAAAATAAATAAAACATTTAAAGTAAGCTTAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTCTTTGGTTGAAAAATAAATAAAACATTTAAAGTAAGCTTAAGT  400

seq1  TTCCTTGATAGTTAATACTTTAATCTGATTTAAAATATAAAAATTAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTGATAGTTAATACTTTAATCTGATTTAAAATATAAAAATTAATGG  450

seq1  CTGGTGCATTATAATATTATGACTGTAAGTATTCACTGGATTCTTCCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCATTATAATATTATGACTGTAAGTATTCACTGGATTCTTCCCTC  500

seq1  AGAGGATCTCCTGGCACTATTGAAAGGGAAGTTATCAACTGCAAAAGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATCTCCTGGCACTATTGAAAGGGAAGTTATCAACTGCAAAAGGTT  550

seq1  AATCAACTCAAACTCAACAAAAGGTCTGACTTTAATTGAAAGTCCAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAACTCAAACTCAACAAAAGGTCTGACTTTAATTGAAAGTCCAAATG  600

seq1  TCAAAATCTGAGACAGGCTTTAAATTTAGAACAAAACAAATTTAACATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATCTGAGACAGGCTTTAAATTTAGAACAAAACAAATTTAACATGT  650

seq1  GGGATGCTAAAAACTCTCATTCGAATTTGCATCCCCAAATCTTTGCTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGCTAAAAACTCTCATTCGAATTTGCATCCCCAAATCTTTGCTGGG  700

seq1  ATGACAGTACATATTTTGTGAGAATGACAGCAGACACTGTCTGAAATGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAGTACATATTTTGTGAGAATGACAGCAGACACTGTCTGAAATGAC  750

seq1  AGCACACACTTTAAGGATAATTTCAGGCCATGTACACAGGAATGCTGGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACACACTTTAAGGATAATTTCAGGCCATGTACACAGGAATGCTGGTC  800

seq1  TGCAGTGTTATTATCTCATAAATGCCACTGTCTAGATTTAGGCTGGAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGTTATTATCTCATAAATGCCACTGTCTAGATTTAGGCTGGAGCT  850

seq1  GTTGCTAGCCCCCTGAAAAGCAAAGTGGGAGTGTTCCTCTACTTCTTTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTAGCCCCCTGAAAAGCAAAGTGGGAGTGTTCCTCTACTTCTTTCA  900

seq1  GTGGAAGAGTTCCTGTAGTGTTGCTGGTTTGTTCTGCCATCTGTGACCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGAGTTCCTGTAGTGTTGCTGGTTTG-TCTGCCATCTGTGACCTA  949

seq1  CCCAGTGAAACAGGGTTT-GGAATTTT-AGGCCATTAACAGGTTTTGAGT  998
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGAAACAGGGTTTGGGAATTTTAAGGCCATTAACAGGTTTTGAGT  999

seq1  TCTGACTTCATTGTGTCTGATGGATAATCTCTTCGGGTTTTCTAATTCTT  1048
      |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||
seq2  TCTGACTTCA-TGTGTCTGATGGATAATCTC-TCGAG-TTTCT-ATTCTT  1045

seq1  CTTGAAGACATTTCCTGAACTTTCTGTCCTTCAAGAAACTTAACCATGTC  1098
      |||||  ||  || ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||
seq2  CTTGAGAAC--TTTCTGAACTTTCTGTCC-TCCAGAAACTTAA-CATGTC  1091

seq1  AAAGAGTCATAAAGATTTCCACTGTATAATTCATATTATCCTTTCCATAA  1148
        |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||  |||||  |
seq2  --AGAGTCATTAAGATTT-CACTG-ATA--TCATATTATC--TTCCAATA  1133

seq1  CCAAGAG-ATCTGGATTTCTTCCTTGATTCCTTGAT  1183
      || |||| |||| |||    ||||||||||||||||
seq2  CC-AGAGAATCT-GAT---CTCCTTGATTCCTTGAT  1164

seq1: chr12_8001613_8002751
seq2: B6Ng01-272P18.g_66_1204 (reverse)

seq1  TGGATTTTCAGGTTGTACAGGCCATCAGAGAAGGGTCAAAG-AATGACTT  49
      |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  TGGA-TTTCAGGT--TACAGGCCATCAGAGAAGGGTCAAAGAAATGAC-T  46

seq1  GTTTCTCCACTACATCTTCATGGACAATGCC-TTTGAGCTCCCCACTGGA  98
      ||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||  
seq2  GTTTCTCCA-TACATC-TCAT-GAC-ATGCCTTTTGAGCTCCCCACTGAG  92

seq1  GCAGGGTTAC-AGCTGCAAGTGTCCTCGTCTGGAGTCTTCACCCCCGGGA  147
      |||||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCAGGGATACAAGCTGCAAGTAT-CTCGTCTGAAGTCTTCACCCCCGGGA  141

seq1  TCAA-GGCTGGTGTAAGACT-GGAATTAG-CCAACGTAAG-ACTCTGCAT  193
      |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  TCAAGGGCTGGTGTAAGACTGGGAATTAGCCCAACGTAAGAACTCTGCAT  191

seq1  TCATCTCAATCAAATCAATGACTGTCTCTTTTCCTTCGGGG--TGGGATT  241
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
seq2  TCATCTCAATCAAATCAATGACTGTCTCTTTTCCTTCGGGGGTGGGGATT  241

seq1  CCTGACCACATGTCAAGCTCCACTTCAAGGCAAAGAGCATCATGATTGCA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACCACATGTCAAGCTCCACTTCAAGGCAAAGAGCATCATGATTGCA  291

seq1  ATCTTCTTGCTAATTTTTATGAGGAATTTTAGGATTCTACCAGCACATAT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTTGCTAATTTTTATGAGGAATTTTAGGATTCTACCAGCACATAT  341

seq1  CATCTCTCAACATCTCTACTTGAGATGCCGTAATAGAAAGAGAAACCAGC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTCAACATCTCTACTTGAGATGCCGTAATAGAAAGAGAAACCAGC  391

seq1  TGCTCTCTCAATGAATGAAGACCCTAGTTATCTTTATATCTGATAGTGCT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTCTCAATGAATGAAGACCCTAGTTATCTTTATATCTGATAGTGCT  441

seq1  TAAAGTTAGTTCAGGCTCTTCCTAACCCTAGGAAATGCACCATAGCTCTG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTAGTTCAGGCTCTTCCTAACCCTAGGAAATGCACCATAGCTCTG  491

seq1  GAGGAAATGAATGTTTCAGCTTTTCTTCCTAAAAGCACATTTGTGGTCCT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAATGAATGTTTCAGCTTTTCTTCCTAAAAGCACATTTGTGGTCCT  541

seq1  TGTGGTCAAAATTAGCAGAGGCATTTGCCAGGTTTCAGGAAGAGGGGCTG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCAAAATTAGCAGAGGCATTTGCCAGGTTTCAGGAAGAGGGGCTG  591

seq1  AGGCTGTCTACCAGGGTGCCGAGGCACTGCATAAAACTCAACAGGTCACC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTCTACCAGGGTGCCGAGGCACTGCATAAAACTCAACAGGTCACC  641

seq1  TTCTGACTTCCAGATACAGGCAGAGCTAGTGGCAAAGCCCTCTGTGTCCT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACTTCCAGATACAGGCAGAGCTAGTGGCAAAGCCCTCTGTGTCCT  691

seq1  TGGAGTTTGTGACAAATATGGGCATCATCATCCCAGACTTCGCTAAGAGC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTTGTGACAAATATGGGCATCATCATCCCAGACTTCGCTAAGAGC  741

seq1  AGTGTCCAGATGAACACCAACTTCTTCCACGAGTCAGGCCTGGAGGCGCG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCAGATGAACACCAACTTCTTCCACGAGTCAGGCCTGGAGGCGCG  791

seq1  AGTGGCCCTGAAGGCTGGGCAGCTGAAGGTCATCATTCCTTCTCCAAAGA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCCTGAAGGCTGGGCAGCTGAAGGTCATCATTCCTTCTCCAAAGA  841

seq1  GGCCAGTCAAGCTGTTCAGTGGCAGGTAATTCTGTTCCCAATGTCTAGCT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGTCAAGCTGTTCAGTGGCAGGTAATTCTGTTCCCAATGTCTAGCT  891

seq1  GGCATATTTAAAAGGAAGAATTGGGTGTGGATCTGCAGAAGTTAGCCAGG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATATTTAAAAGGAAGAATTGGGTGTGGATCTGCAGAAGTTAGCCAGG  941

seq1  CTAGACAACAATTGGGTAACACAAGTTCCTGGGAAACAGGAGAAGATTGC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACAACAATTGGGTAACACAAGTTCCTGGGAAACAGGAGAAGATTGC  991

seq1  TTTTGACTCTACACATTTCACTAAAGATTTTTATGCCTCTCTTTATCACA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACTCTACACATTTCACTAAAGATTTTTATGCCTCTCTTTATCACA  1041

seq1  CTTAGCCTCTGCTGGTGAGTCAGTAGCTATGTGGCTATGGAGTTCTGTTT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCCTCTGCTGGTGAGTCAGTAGCTATGTGGCTATGGAGTTCTGTTT  1091

seq1  AATTTCATAATCACATGATTATGGGAACCAGCCTTACATTAAGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCATAATCACATGATTATGGGAACCAGCCTTACATTAAGAATTC  1139