BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282L23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 14,060,019 - 14,192,674
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAW125753
Upstream geneLOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481
Downstream geneLOC100043256, Map1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282L23.bB6Ng01-282L23.g
ACCGA081885GA081886
length1,1601,105
definitionB6Ng01-282L23.b B6Ng01-282L23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,191,506 - 14,192,674)(14,060,019 - 14,061,126)
sequence
gaattcaaatcatggctttggttttgtatagctctctacttcaatcagcc
atttaacttgtctatagaagcaggggtgataaagtcctggggatgctaac
agggacatatatcaataaagtaatgaagggactaggaagatggctaggtg
gataagaccacttggtttgcaagcaggagaaacagagtttgctgccttga
cactatggaaaaagcctgccatggctgcaaatgctcagacaaaatcatct
ggactctgacaaagctttcctgaagtccaaactaaggtttgacagccagt
ataaccccagtactaaggatcagagacaggcagatcctcagtgatccctg
gtcagcgaactatgctgaaagtgtgaacttcttgtacagtgagtgacatt
gactcaaacaaagcaagaagatggagggctatagaagacacctaccatcc
tgttctggccatcctgtgcaattacaaaggtgcatacaacttctgactct
caacatatcatgtcgtgcacgcacacacacacacacacacacacacacac
acacatggggtgtgggagggggcacattctcatgactgttcaactgtgcc
taagtcaaactctctaaccaaaacaagctgtcacaattgaggtgacttct
gctaagtatctaaacatggaatggcatggaaactcatcttttgcagatca
cttgcgtgatgactctgtaaataatgagttatttccctgatgtggagatg
agaaaggaatttgactactgatcacagtgacagatgctggggtctggagc
caactcagcttgctttctggaaagcataacaacaaaagccatgtttgcta
tgacagagattaacatcagaaagatgtatgtgaaaaacatgggtcatttt
gagagaggtataagcctgactctgttgcagccctggaagtgaagtagttg
ggacagacacaacacacagccatctatacagaaacatatggatggctttc
atgcctgggcacaagcagggaagctggagcagagagtcatagatggattc
aattgctgcttctaattcctattaagaataaagcccacagctcaggctct
tctatataaatgtccttccgacttaccaaggtagtgagaaatctccaact
tcaggaatac

gaattctccattgaggaatcttgaatggctaagaagaggaacattcttcc
attactgagggagtggagggattcgtggagtggagactgggaacggagct
aacatttgaaatgtaacaaataaaatggttaataaaaaattttcaagcta
gtcaatccataaaattaaacattgagatagaaagattccccaagtccaca
cggtgaaatatatggaccaagactcatatgaatggtagggagatgctctg
aaagtgtgctgtgtaaaagagatggttcatatgagaaggcagtgggtatt
gggcaaggactttcagtttggctgagtctctgagtctaagagaaacagcc
tcttagttattctcttggctttcctaaattaacttcatcgttttctcagc
ataactaaggtctgaattttgctgtggaaagttatggatggtagtagcag
ccctctctcctttccaggatgctattggacattagtgactgaggaagaag
gaacacaaatgccgcctcagggctacagggaaaagactgggggcctcttt
ctataagaagcattatttttggaagctccgaggcatgatggagagataaa
tgtcttggaaagttaacagcagcacatctatcacactggaaatatttagc
aacatagggaaatggaggctacccaagcatcctgagtctcatgtgttcac
tgaagtaactttaaatagacacattaagcacagaagtcagaatgcagcac
aacgtcattttgcccgcaatgctgggtataaaatgccaggacctccattg
ggagctttagatgtctggggacaactggggacatctttgtaacattcctc
tcatcttggactcaaaatagttcaaagcctcattgcagcactgtcccata
aaatactgaacaattaaaccatgactttgggttgttgttaatatgttggc
aatgatcactacctaagccttcaaaagaacctaaagtggaaaattaaatc
aaaatatctatgtacgtctgtgtttgcttatgagtctgctatattttcta
cacagctacatgttatatgataatcagactgtagaagccaggggatctca
cattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_14191506_14192674
seq2: B6Ng01-282L23.b_44_1203 (reverse)

seq1  GTATTCTTG-AGTTGGAGATTTCTCCAACTCACTTGGTAATGTCTGAAGG  49
      |||||| || |||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||
seq2  GTATTCCTGAAGTTGGAGATTTCTC--ACTACCTTGGTAA-GTCGGAAGG  47

seq1  ACATTTAAAAATAGAAGAGGCTTGAGCTGTTGGCTTTTATCTTTAATTAA  99
      ||||||  | |||||||| || |||||||| ||||||  ||||  | || 
seq2  ACATTT--ATATAGAAGA-GCCTGAGCTGTGGGCTTTATTCTT--AATAG  92

seq1  GGATTAAGAGCAGCATTTGAAATTCATCTATGAACTCTCTGCCTCCAGCT  149
      | ||||  ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||
seq2  GAATTAGAAGCAGCAATTG-AATCCATCTATG-ACTCTCTG-CTCCAGCT  139

seq1  TCCCTGCCTTGTGCCCAGGCATG-AAGCCATCCATATGTTTCTGTATAGA  198
      |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTG-CTTGTGCCCAGGCATGAAAGCCATCCATATGTTTCTGTATAGA  188

seq1  TGGCTGTGTGTTGTGTCTGTCCCAACTACTTCACTTCCA-GGCTGCAACA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGGCTGTGTGTTGTGTCTGTCCCAACTACTTCACTTCCAGGGCTGCAACA  238

seq1  GAGTCAGGCTTATACCTCTCTCAAAATGA-CCATGTTTTTCACATACATC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGGCTTATACCTCTCTCAAAATGACCCATGTTTTTCACATACATC  288

seq1  TTTCTGATGTTAATCTCTGTCATAGCAAACATGGCTTTTGTTTGTTATGC  346
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTCTGATGTTAATCTCTGTCATAGCAAACATGGCTTTTG-TTGTTATGC  337

seq1  TTTCCAGAAAGCAAGCTGAGTTGGCTCCAGACCCCAGCATCTGTCACTGT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGAAAGCAAGCTGAGTTGGCTCCAGACCCCAGCATCTGTCACTGT  387

seq1  GATCAGTAGTCAAATTCCTTTCTCATCTCCACATCAGGGAAATAACTCAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGTAGTCAAATTCCTTTCTCATCTCCACATCAGGGAAATAACTCAT  437

seq1  TATTTACAGAGTCATCACGCAAGTGATCTGCAAAAGATGAGTTTCCATGC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTACAGAGTCATCACGCAAGTGATCTGCAAAAGATGAGTTTCCATGC  487

seq1  CATTCCATGTTTAGATACTTAGCAGAAGTCACCTCAATTGTGACAGCTTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCATGTTTAGATACTTAGCAGAAGTCACCTCAATTGTGACAGCTTG  537

seq1  TTTTGGTTAGAGAGTTTGACTTAGGCACAGTTGAACAGTCATGAGAATGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGTTAGAGAGTTTGACTTAGGCACAGTTGAACAGTCATGAGAATGT  587

seq1  GCCCCCTCCCACACCCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTCCCACACCCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  637

seq1  TGCGTGCACGACATGATATGTTGAGAGTCAGAAGTTGTATGCACCTTTGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGCACGACATGATATGTTGAGAGTCAGAAGTTGTATGCACCTTTGT  687

seq1  AATTGCACAGGATGGCCAGAACAGGATGGTAGGTGTCTTCTATAGCCCTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCACAGGATGGCCAGAACAGGATGGTAGGTGTCTTCTATAGCCCTC  737

seq1  CATCTTCTTGCTTTGTTTGAGTCAATGTCACTCACTGTACAAGAAGTTCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCTTGCTTTGTTTGAGTCAATGTCACTCACTGTACAAGAAGTTCA  787

seq1  CACTTTCAGCATAGTTCGCTGACCAGGGATCACTGAGGATCTGCCTGTCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCAGCATAGTTCGCTGACCAGGGATCACTGAGGATCTGCCTGTCT  837

seq1  CTGATCCTTAGTACTGGGGTTATACTGGCTGTCAAACCTTAGTTTGGACT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCCTTAGTACTGGGGTTATACTGGCTGTCAAACCTTAGTTTGGACT  887

seq1  TCAGGAAAGCTTTGTCAGAGTCCAGATGATTTTGTCTGAGCATTTGCAGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAAAGCTTTGTCAGAGTCCAGATGATTTTGTCTGAGCATTTGCAGC  937

seq1  CATGGCAGGCTTTTTCCATAGTGTCAAGGCAGCAAACTCTGTTTCTCCTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAGGCTTTTTCCATAGTGTCAAGGCAGCAAACTCTGTTTCTCCTG  987

seq1  CTTGCAAACCAAGTGGTCTTATCCACCTAGCCATCTTCCTAGTCCCTTCA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAAACCAAGTGGTCTTATCCACCTAGCCATCTTCCTAGTCCCTTCA  1037

seq1  TTACTTTATTGATATATGTCCCTGTTAGCATCCCCAGGACTTTATCACCC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTATTGATATATGTCCCTGTTAGCATCCCCAGGACTTTATCACCC  1087

seq1  CTGCTTCTATAGACAAGTTAAATGGCTGATTGAAGTAGAGAGCTATACAA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCTATAGACAAGTTAAATGGCTGATTGAAGTAGAGAGCTATACAA  1137

seq1  AACCAAAGCCATGATTTGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAAGCCATGATTTGAATTC  1160


seq1: chr12_14060019_14061126
seq2: B6Ng01-282L23.g_65_1169

seq1  GAATTCTCCATTGAGGAATCTTGAATGGCTAAGAAGAGGAACATTCTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATTGAGGAATCTTGAATGGCTAAGAAGAGGAACATTCTTCC  50

seq1  ATTACTGAGGGAGTGGAGGGATTCGTGGAGTGGAGACTGGGAACGGAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTGAGGGAGTGGAGGGATTCGTGGAGTGGAGACTGGGAACGGAGCT  100

seq1  AACATTTGAAATGTAACAAATAAAATGGTTAATAAAAAATTTTCAAGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTGAAATGTAACAAATAAAATGGTTAATAAAAAATTTTCAAGCTA  150

seq1  GTCAATCCATAAAATTAAACATTGAGATAGAAAGATTCCCCAAGTCCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATCCATAAAATTAAACATTGAGATAGAAAGATTCCCCAAGTCCACA  200

seq1  CGGTGAAATATATGGACCAAGACTCATATGAATGGTAGGGAGATGCTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGAAATATATGGACCAAGACTCATATGAATGGTAGGGAGATGCTCTG  250

seq1  AAAGTGTGCTGTGTAAAAGAGATGGTTCATATGAGAAGGCAGTGGGTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGCTGTGTAAAAGAGATGGTTCATATGAGAAGGCAGTGGGTATT  300

seq1  GGGCAAGGACTTTCAGTTTGGCTGAGTCTCTGAGTCTAAGAGAAACAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGGACTTTCAGTTTGGCTGAGTCTCTGAGTCTAAGAGAAACAGCC  350

seq1  TCTTAGTTATTCTCTTGGCTTTCCTAAATTAACTTCATCGTTTTCTCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGTTATTCTCTTGGCTTTCCTAAATTAACTTCATCGTTTTCTCAGC  400

seq1  ATAACTAAGGTCTGAATTTTGCTGTGGAAAGTTATGGATGGTAGTAGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTAAGGTCTGAATTTTGCTGTGGAAAGTTATGGATGGTAGTAGCAG  450

seq1  CCCTCTCTCCTTTCCAGGATGCTATTGGACATTAGTGACTGAGGAAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCTCCTTTCCAGGATGCTATTGGACATTAGTGACTGAGGAAGAAG  500

seq1  GAACACAAATGCCGCCTCAGGGCTACAGGGAAAAGACTGGGGGCCTCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACAAATGCCGCCTCAGGGCTACAGGGAAAAGACTGGGGGCCTCTTT  550

seq1  CTATAAGAAGCATTATTTTTGGAAGCTCCGAGGCATGATGGAGAGATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAGAAGCATTATTTTTGGAAGCTCCGAGGCATGATGGAGAGATAAA  600

seq1  TGTCTTGGAAAGTTAACAGCAGCACATCTATCACACTGGAAATATTTAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTGGAAAGTTAACAGCAGCACATCTATCACACTGGAAATATTTAGC  650

seq1  AACATAGGGAAATGGAGGCTACCCAAGCATCCTGAGTCTCATGTGTTCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGGGAAATGGAGGCTACCCAAGCATCCTGAGTCTCATGTGTTCAC  700

seq1  TGAAGTAACTTTAAATAGACACATTAAGCACAGAAGTCAGAATGCAGCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAACTTTAAATAGACACATTAAGCACAGAAGTCAGAATGCAGCAC  750

seq1  AACGTCATTTTGCCCGCAATGCTGGGTATAAAATGCCAGGACCTCCATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTCATTTTGCCCGCAATGCTGGGTATAAAATGCCAGGACCTCCATTG  800

seq1  GGAGCTTTAGATGTCTGGGGACAACTGGGGACATCTTTGTAACATTCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTAGATGTCTGGGGACAACTGGGGACATCTTTGTAACATTCCTC  850

seq1  TCATCTTGGACTCAAAATAGTTCAAAGCCTCATTGCAGCACTGTCCCATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTGGACTCAAAATAGTTCAAAGCCTCATTGCAGCACTGTCCCATA  900

seq1  AAATACTGAACAATTAAACCATGACTTTGGGTTGTTGTTTAATATGTTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATACTGAACAATTAAACCATGACTTTGGGTTGTTG-TTAATATGTTGG  949

seq1  CAATGATCACTACCTAAGCCTTCAAAAAGAACCTAAAGTGGGAAAATTAA  1000
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAATGATCACTACCTAAGCCTTC-AAAAGAACCTAAAGT-GGAAAATTAA  997

seq1  ATTCAAAATATCTATGTACGTCTGTGTTTGCTTATGAGTCTGCCTATA-T  1049
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  A-TCAAAATATCTATGTACGTCTGTGTTTGCTTATGAGTCTG-CTATATT  1045

seq1  TTCTACACAGCCTAACATG-TATATGATAATCAGACTGTAGA--GCAGGG  1096
      |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  TTCTACACAGC--TACATGTTATATGATAATCAGACTGTAGAAGCCAGGG  1093

seq1  GATCTCACATTC  1108
      ||||||||||||
seq2  GATCTCACATTC  1105


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |