BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-286C22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 76,456,600 - 76,616,844
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRhoj, Gphb5, Ppp2r5e
Upstream geneKcnh5
Downstream geneWdr89, LOC665931, Sgpp1, Syne2, Esr2, LOC665957, Tex21, Mthfd1, Akap5, Zbtb25, Zbtb1, Hspa2, Gm70, LOC100041694
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-286C22.bB6Ng01-286C22.g
ACCGA084444GA084445
length9201,091
definitionB6Ng01-286C22.b B6Ng01-286C22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,456,600 - 76,457,520)(76,615,752 - 76,616,844)
sequence
gaattcaccaaaccaatgcatacccaactcactgggctttcagggaagtg
aggctgacaagagggcagccctgggaatcttcccacagcaacaggaggga
gaccatgctctgtaaagaactatcactgagcaaatgccatatgttccagg
ctgctggcctccagcagggatttagaggtgaaacgttttgtgtcctattc
accaatactttgattcatgccatacctaagatattcatctttatttataa
agctcaggacttctgatgaatttaacaagagccgctgaaagttaaagtgt
ttgcaaggatggtggtttcctcaattaatcacgatgtaattttcaccatg
tagaactgggcaatcgaaatggcagattctcagctccattcaggatatac
cccttctcaactctgcctccatgtaaagctggctagaggaaaatacagag
ctgcactctaactccatgttaatagaaacactcttttctgtcttgttttc
caccttgaatgctggacttaacttgaacctcacacttgatacctcctcga
tcagctattgctctaattcggtggtttgtcaaccttgtttgtacagagga
gtcacttggggagctttagtgactgtcaatgtctgggtctaatggatttt
gttgtagtgggtatagccaaggccaaaagagcttctgagaacgtctaaga
aatagaaatgcatttcctagtaaacatgcccagctttgcacaggcaacta
acttagacagtggaaatcttcctagcatcatatcaaatgaaatggggcat
gaagtagcatccaagagcagagatagatagagatagagatagagatagag
atagagatagagatagagatagagatagagatagagatagagatagagat
agagatagagatatagatag
gaattcctgttgcctagaaattgatgacagacttacaccatttcctcttt
tttccttagacgttccaacctcagagcagcctgaactgttcctaaagaaa
cttcagcagtgctgtgtcatttttgacttcatggacacgctatctgatct
taaaatgaaagaatacaagcgctccactcttaatgaactggtggactaca
ttacaataagcagaggctgtctgacagagcagacttaccctgaagtagtt
agaatggtgagtttcctttttcgccgctgacactttaagcatcttccata
gccactcatgggtgtattgattgcagtgaggtcaccgaggtctcctccac
aaacaaaaaccagcctcctgagagctagatgccagcagtcagcgcagcac
taggatttgaagagcacgatttcatgacgaagaaacccagaccaccccac
cgactgcagcattgaaggagtggcctcagagcatgaagctgagggccagg
gtgccatggatttctgcaaagacacaagagaatcaaccagttttagatct
gagtgaaacgattcaagcctgttgagtatcttaaccgcaccacctgtaca
ttgtggcatattagaaatggcatcgtatttaataaaattatgacgcagag
gatctggttaaggtctctcttggctttataatgaatctttctctttgtaa
tttccttgaaattaggagtaatgccttttatggtgttagaacaatagcac
tgtgtgtggtccttaggaattgcaggaagaaacattatttgtttaatgca
agcaattatgttcgtgctgtgtcaataatttacattagctttttaaaaat
tgagctgaaatctgaccattaggcttctgtgatgtggttgccttccttag
catccttagaagattatagattgagaggctgtttgtttttgggaaggacg
tcaggaggatggaggaggcaatgcaactacagaggttaggggctgagcat
ttaatggctgaccatcattgagagccattagaggacaaggcacaggatgc
ctgctcaccatctgcaggacttgaggagatgaggccttgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_76456600_76457520
seq2: B6Ng01-286C22.b_46_965

seq1  GAATTCACCAAACCAATGCATACCCAACTCACTGGGCTTTCAGGGAAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAAACCAATGCATACCCAACTCACTGGGCTTTCAGGGAAGTG  50

seq1  AGGCTGACAAGAGGGCAGCCCTGGGAATCTTCCCACAGCAACAGGAGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGACAAGAGGGCAGCCCTGGGAATCTTCCCACAGCAACAGGAGGGA  100

seq1  GACCATGCTCTGTAAAGAACTATCACTGAGCAAATGCCATATGTTCCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATGCTCTGTAAAGAACTATCACTGAGCAAATGCCATATGTTCCAGG  150

seq1  CTGCTGGCCTCCAGCAGGGATTTAGAGGTGAAACGTTTTGTGTCCTATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGCCTCCAGCAGGGATTTAGAGGTGAAACGTTTTGTGTCCTATTC  200

seq1  ACCAATACTTTGATTCATGCCATACCTAAGATATTCATCTTTATTTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATACTTTGATTCATGCCATACCTAAGATATTCATCTTTATTTATAA  250

seq1  AGCTCAGGACTTCTGATGAATTTAACAAGAGCCGCTGAAAGTTAAAGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGGACTTCTGATGAATTTAACAAGAGCCGCTGAAAGTTAAAGTGT  300

seq1  TTGCAAGGATGGTGGTTTCCTCAATTAATCACGATGTAATTTTCACCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAGGATGGTGGTTTCCTCAATTAATCACGATGTAATTTTCACCATG  350

seq1  TAGAACTGGGCAATCGAAATGGCAGATTCTCAGCTCCATTCAGGATATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTGGGCAATCGAAATGGCAGATTCTCAGCTCCATTCAGGATATAC  400

seq1  CCCTTCTCAACTCTGCCTCCATGTAAAGCTGGCTAGAGGAAAATACAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCTCAACTCTGCCTCCATGTAAAGCTGGCTAGAGGAAAATACAGAG  450

seq1  CTGCACTCTAACTCCATGTTAATAGAAACACTCTTTTCTGTCTTGTTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACTCTAACTCCATGTTAATAGAAACACTCTTTTCTGTCTTGTTTTC  500

seq1  CACCTTGAATGCTGGACTTAACTTGAACCTCACACTTGATACCTCCTCGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGAATGCTGGACTTAACTTGAACCTCACACTTGATACCTCCTCGA  550

seq1  TCAGCTATTGCTCTAATTCGGTGGTTTGTCAACCTTGTTTGTACAGAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTATTGCTCTAATTCGGTGGTTTGTCAACCTTGTTTGTACAGAGGA  600

seq1  GTCACTTGGGGAGCTTTAGTGACTGTCAATGTCTGGGTCTAATGGATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTGGGGAGCTTTAGTGACTGTCAATGTCTGGGTCTAATGGATTTT  650

seq1  GTTGTAGTGGGTATAGCCAAGGCCAAAAGAGCTTCTGAGAACGTCTAAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTAGTGGGTATAGCCAAGGCCAAAAGAGCTTCTGAGAACGTCTAAGA  700

seq1  AATAGAAATGCATTTCCTAGTAAACATGCCCAGCTTTGCACAGGCAACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAAATGCATTTCCTAGTAAACATGCCCAGCTTTGCACAGGCAACTA  750

seq1  ACTTAGACAGTGGAAATCTTCCTAGCATCATATCAAATGAAATGGGGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGACAGTGGAAATCTTCCTAGCATCATATCAAATGAAATGGGGCAT  800

seq1  GAAGTAGCATCCAAGAGCAAGAGATAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGA  850
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGCATCCAAGAGC-AGAGATAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGA  849

seq1  GATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGA  899

seq1  TAGAGATAGAGATATAGATAG  921
      |||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGATAGAGATATAGATAG  920

seq1: chr12_76615752_76616844
seq2: B6Ng01-286C22.g_69_1159 (reverse)

seq1  TACAAG--CTCATCTCTCAAAGTCCTTGCAGATGGTGAGCAGGCATTCCT  48
      ||||||  ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||  | 
seq2  TACAAGGCCTCATCTCCTCAAGTCC-TGCAGATGGTGAGCAGGCAT--CC  47

seq1  TGTGCCTGTTCCTCTAATGGGCTCTCAATGATGGTCAGCCCCTTAAATGC  98
      |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||
seq2  TGTGCCTTGTCCTCTAAT-GGCTCTCAATGATGGTCAG-CCATTAAATGC  95

seq1  TCAGCCCCTTAAACCTCTGTAGTTGCATTGCCTCCTCCATTCCTCCTGAC  148
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCAGCCCCT--AACCTCTGTAGTTGCATTGCCTCCTCCA-TCCTCCTGAC  142

seq1  GTCCTTCCCAAAA--CAACAGCCTCTCAATCTATAATCTTCT-AGGATGC  195
      |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GTCCTTCCCAAAAACAAACAGCCTCTCAATCTATAATCTTCTAAGGATGC  192

seq1  TAAGGAAGGCAACCACATCACAGAAGCCTAATGGTCAGATTTCAGCTCAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAAGGCAACCACATCACAGAAGCCTAATGGTCAGATTTCAGCTCAA  242

seq1  TTTTTAAAAAGCTAATGT-AATTATTGACACAGCACGAACATAATTGCTT  294
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAAGCTAATGTAAATTATTGACACAGCACGAACATAATTGCTT  292

seq1  GCATTAAACAAATAATGTTTCTTCCTGCAATTCCTAAGGACCACACACAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTAAACAAATAATGTTTCTTCCTGCAATTCCTAAGGACCACACACAG  342

seq1  TGCTATTGTTCTAACACCATAAAAGGCATTACTCCTAATTTCAAGGAAAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATTGTTCTAACACCATAAAAGGCATTACTCCTAATTTCAAGGAAAT  392

seq1  TACAAAGAGAAAGATTCATTATAAAGCCAAGAGAGACCTTAACCAGATCC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAGAGAAAGATTCATTATAAAGCCAAGAGAGACCTTAACCAGATCC  442

seq1  TCTGCGTCATAATTTTATTAAATACGATGCCATTTCTAATATGCCACAAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCGTCATAATTTTATTAAATACGATGCCATTTCTAATATGCCACAAT  492

seq1  GTACAGGTGGTGCGGTTAAGATACTCAACAGGCTTGAATCGTTTCACTCA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGGTGGTGCGGTTAAGATACTCAACAGGCTTGAATCGTTTCACTCA  542

seq1  GATCTAAAACTGGTTGATTCTCTTGTGTCTTTGCAGAAATCCATGGCACC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAAAACTGGTTGATTCTCTTGTGTCTTTGCAGAAATCCATGGCACC  592

seq1  CTGGCCCTCAGCTTCATGCTCTGAGGCCACTCCTTCAATGCTGCAGTCGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCCTCAGCTTCATGCTCTGAGGCCACTCCTTCAATGCTGCAGTCGG  642

seq1  TGGGGTGGTCTGGGTTTCTTCGTCATGAAATCGTGCTCTTCAAATCCTAG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGGTCTGGGTTTCTTCGTCATGAAATCGTGCTCTTCAAATCCTAG  692

seq1  TGCTGCGCTGACTGCTGGCATCTAGCTCTCAGGAGGCTGGTTTTTGTTTG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCGCTGACTGCTGGCATCTAGCTCTCAGGAGGCTGGTTTTTGTTTG  742

seq1  TGGAGGAGACCTCGGTGACCTCACTGCAATCAATACACCCATGAGTGGCT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAGACCTCGGTGACCTCACTGCAATCAATACACCCATGAGTGGCT  792

seq1  ATGGAAGATGCTTAAAGTGTCAGCGGCGAAAAAGGAAACTCACCATTCTA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGATGCTTAAAGTGTCAGCGGCGAAAAAGGAAACTCACCATTCTA  842

seq1  ACTACTTCAGGGTAAGTCTGCTCTGTCAGACAGCCTCTGCTTATTGTAAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTCAGGGTAAGTCTGCTCTGTCAGACAGCCTCTGCTTATTGTAAT  892

seq1  GTAGTCCACCAGTTCATTAAGAGTGGAGCGCTTGTATTCTTTCATTTTAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCCACCAGTTCATTAAGAGTGGAGCGCTTGTATTCTTTCATTTTAA  942

seq1  GATCAGATAGCGTGTCCATGAAGTCAAAAATGACACAGCACTGCTGAAGT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGATAGCGTGTCCATGAAGTCAAAAATGACACAGCACTGCTGAAGT  992

seq1  TTCTTTAGGAACAGTTCAGGCTGCTCTGAGGTTGGAACGTCTAAGGAAAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAGGAACAGTTCAGGCTGCTCTGAGGTTGGAACGTCTAAGGAAAA  1042

seq1  AAGAGGAAATGGTGTAAGTCTGTCATCAATTTCTAGGCAACAGGAATTC  1093
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAAATGGTGTAAGTCTGTCATCAATTTCTAGGCAACAGGAATTC  1091