seq1: chr12_13465840_13466987
seq2: B6Ng01-294L01.b_46_1188 (reverse)
seq1 AGTTAATGCCTACTGT--AAACT-CAGGTGCGCTCAGAGGAATG-ACTGA 46
|||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| |||||
seq2 AGTTAATGCCTACTGTGAAAACTCCAGTTGGCGTCAAGAGAATGAACTGA 50
seq1 TTAATCTCCTGAGAACTTCAGCTTCCATATTTAATCAAGATGATAATGAA 96
|| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||
seq2 TT-ATCTCTGAAGAAC-TCAGC-TCCATATTT-ATC-AGATGAT-ATGAA 94
seq1 AATTAACCATCACAACCATGGCAACATCCTACTACATGCATAGTTCTGTA 146
| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 A--TAGCCATCACAGCCATGGCAACATCCTACTACATGCATAGTTCTGTA 142
seq1 CTGTACTTTCCTTGAATTTAAAAGAGTACAAAGCTCTCAGCCCACTCATC 196
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTACTTTCCTTGAATTT-AAAGAGTACAAAGCTCTCAGCCCACTCATC 191
seq1 ACTAACTATACCTGCTACACATTCACTCTGTCCTTTCCCATTGGATTTAA 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTAACTATACCTGCTACACATTCACTCTGTCCTTTCCCATTGGATTTAA 241
seq1 ACAAGCAAGATGCCTGACATCAGCGAGTTATCCATGTTCTTCTCATCTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAAGCAAGATGCCTGACATCAGCGAGTTATCCATGTTCTTCTCATCTGC 291
seq1 TTAAGACACTGTACAAGGTAGCTGAAAAGATGGCCCAGGGGTTAAGAGCA 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAAGACACTGTACAAGGTAGCTGAAAAGATGGCCCAGGGGTTAAGAGCA 341
seq1 TGTTTTTGCTGAGGACCTGAGGTGACCCAACACCTGCATGAGAAAGCTCT 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTTTTTGCTGAGGACCTGAGGTGACCCAACACCTGCATGAGAAAGCTCT 391
seq1 CAACCATTTGTAACTCCAGTTCTAACAGATCCAATGCCTTCTTTTGGCAG 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAACCATTTGTAACTCCAGTTCTAACAGATCCAATGCCTTCTTTTGGCAG 441
seq1 TTGTAGGCACACGTAATCCTGTGTGCATCCCTGTGTGTAGAGACACATGT 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTAGGCACACGTAATCCTGTGTGCATCCCTGTGTGTAGAGACACATGT 491
seq1 ATACATAATTTAAAAATAAAAATAAATCATTAAAAAGGGAGAAGAGAGGG 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATACATAATTTAAAAATAAAAATAAATCATTAAAAAGGGAGAAGAGAGGG 541
seq1 TATGTTGTGTGACCTGTGGTATGTAGGAACAGAAAGTTCGTGTGCACGGC 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATGTTGTGTGACCTGTGGTATGTAGGAACAGAAAGTTCGTGTGCACGGC 591
seq1 TGTGAACCACTGCTCCCTAGTCTCATTACAGATACTGTAATCAGTAGCTC 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGAACCACTGCTCCCTAGTCTCATTACAGATACTGTAATCAGTAGCTC 641
seq1 ACATCAACATCAGTTCTGTGCACTGGGTGCATACAAGACCAGTTCTGTCA 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACATCAACATCAGTTCTGTGCACTGGGTGCATACAAGACCAGTTCTGTCA 691
seq1 GCAGTCAGGAGATGGGAGGAGCTCTTGGGGCCCTTACCTCTGAACGGTTC 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAGTCAGGAGATGGGAGGAGCTCTTGGGGCCCTTACCTCTGAACGGTTC 741
seq1 TTTATCGGTAGATTCTAGGAGGGAGTCACCATCTTTAGTTGTGTACATTA 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATCGGTAGATTCTAGGAGGGAGTCACCATCTTTAGTTGTGTACATTA 791
seq1 TGCTGGCCTTCCATGCTTCAACTAATAACTCTAAACCCACTGCCACACAA 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTGGCCTTCCATGCTTCAACTAATAACTCTAAACCCACTGCCACACAA 841
seq1 ATGACATCACGTCCAAATACAAAACAGTGACTTGTAAGGGAGATCATGGG 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGACATCACGTCCAAATACAAAACAGTGACTTGTAAGGGAGATCATGGG 891
seq1 GAGAGGGAAGTGCTGACATAGAGGGAGTTAGGAAGGTCAGAGTGGTCAGT 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGAGGGAAGTGCTGACATAGAGGGAGTTAGGAAGGTCAGAGTGGTCAGT 941
seq1 ATGCAAAGCACACTTATATAAAAGTGTAAAAAGACGAAAGAAAACTCTTT 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGCAAAGCACACTTATATAAAAGTGTAAAAAGACGAAAGAAAACTCTTT 991
seq1 ACAGGATGGCTGCATAAGGTGTGGATCAGAGTACTGAATGCAACAGACAA 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGGATGGCTGCATAAGGTGTGGATCAGAGTACTGAATGCAACAGACAA 1041
seq1 GATCCAGTATATACTCTAAGTTACCGCTTTTAGAAGCCAGAAATCTTGTA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATCCAGTATATACTCTAAGTTACCGCTTTTAGAAGCCAGAAATCTTGTA 1091
seq1 ACAGAGCCACACATGGTCTGTTCTTAGTTTCAAAAATAGCTCTAATGAAT 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGAGCCACACATGGTCTGTTCTTAGTTTCAAAAATAGCTCTAATGAAT 1141
seq1 TC 1148
||
seq2 TC 1143
| seq1: chr9_7727403_7727487
seq2: B6Ng01-294L01.g_94_178 (reverse)
seq1 GGGTTCTATAAGAAAGCTGGCTGAGCAAGCCATGATGAGCAAGCCAGTAA 50
||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGTTCTATAAGAAAACAGGTTGAGCAAGCCATGATGAGCAAGCCAGTAA 50
seq1 GCAGCATCCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTA 85
|||||| ||||| || || ||||||||||| ||||
seq2 GCAGCACCCCTCTATTGCATCTGCATCAGCACCTA 85
|