BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296P12
Chromosome12 (Build37)
Map Location 9,172,450 - 9,353,764
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1110057K04Rik, Gdf7, Hs1bp3, BC106175, Rhob, Slc7a15, LOC100043154, Pum2, F730043H23, Sdc1, Laptm4a, Matn3, Wdr35, Ttc32
Downstream geneLOC633030, LOC100042238, Osr1, LOC382567
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296P12.bB6Ng01-296P12.g
ACCGA092445GA092446
length1,0251,117
definitionB6Ng01-296P12.b B6Ng01-296P12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,352,747 - 9,353,764)(9,172,450 - 9,173,555)
sequence
gaattccaggaaaacatcccagcctgctgtgctagcaaatcagttttaga
gagttaaggatatttggggttctgttggcataaaaagtgagaaatgtggt
atgtatccaagaagttcaaggtcgtgtgatcatttattcatttattccaa
gacattttctgaatgactggtttatgtctcatcatggtaaaatatagaag
aggattaaagatcgcctctggtaaggtaggttgagatttttatagaagat
tcttatagaacaaagactaaaagagctagcagtaccctaagtggagagga
cgttctgtgactacctccagatctgggctttgaagaaaagagaaaaataa
aggccagtcctgacagagaacccagactaagggacagactaaaggcaaat
caacacactgagtttgtttggtcaaactggatccacacagaggtttccca
aagtcacactgaatctcctttcactattccagatgttgctgggtaatggc
tttcaaactttcactttaggatcatggggttggggtggggagctgtgaag
cacacatgtcattcagtctgttccacatggctcctgattccaataagtga
aagagggagactggtttcccatgttgggagctacggagtgagatcgtgca
caacacttctgctgattggttctattctgaccggcactactcagtgcctt
cagcaagtacacgaatccctgaggttggatttcctcttgctaagtgtgag
gttcctacagtaaacacacacaacgattattaagatggattttagcttct
ttttagtcacagccacagatctcatttgagaatatcataatagctgtgga
tgttctggtcaacagacctcactggggctggagagatggctcagtggtta
ggaccactggctgctcttccagagattgttgagttcagttcccaacatcc
acatggaaggctcgcaaccatctagaacggggatctgatgcccctggcat
gcagtattacatgctgataatagca
gaattcttttgttaggtttatgccttgtttatgtcacacccctctttccc
actctataaatagccttccagaggagttgccatatttgagctgcccactt
accatctacatgcagtactctgctccagtactatttccaggccaagattg
attcggtggagttagacagagctgcctccctagtctctgtttatctttct
ccaaacaccattgaagctggttccatgagagatgaagggagaactttccc
actccatagagttgtctctctttcttttacatgatgggcccagtggggga
ctcctggtctaaggtttggcctctggaactcttagatagacttagacatt
gaggtttcttggagagcttcttgcacgctgaagaaagacttggagggccc
ctctctcttccaggattgggagttaggtggaatttttctagatgaaggtg
acagggtgactcttgcaggtaaggatgtctccacagcaggaagaagccag
atgactttaggctgtgactggcccagttcaagaaagactggaggtccgat
ggaggattaaagctatggcttcagctaccctgggtctttgtttcagggaa
ttgagggagtcacagggaaggctcttcgtgggtgcttgaaggtggctgat
agactcactcttgggatttgaccacaggaatggcacgaacaagtgtcttt
tctcttttgggtctggctatgggttggggtagggacagtgtccactagag
ggcactgtagcactgccttgggtggtgatagcagcccctctaccctgtgg
aggagctggcccagatgctgagccttatggttagctgagggagacagaga
ccagccagttttctaccgattgttcccctgtgcattaaatccagtggggc
tggatccttccagcaatgggttttgaacatgattctgactctcaggcacc
ctacaccttttattccacgtaggctccatgtgttcactgcttgccacacc
agttcggacaatccacttatactactcccggtgttgtgcatgctcacaca
cttctgatcagtcatatgacccttcacccctatcttccctccctccattg
cacacaccgcatgcctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_9352747_9353764
seq2: B6Ng01-296P12.b_48_1072 (reverse)

seq1  TGCTA-TATCAGCATGTATACCTGCATGCCA-GGGCATCAGAT-CCCGTT  47
      ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  TGCTATTATCAGCATGTAATACTGCATGCCAGGGGCATCAGATCCCCGTT  50

seq1  CTAGATGGTTGCGAGCC-TCCATGTGGATGTTGGGAACTGAACTC-ACAA  95
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTAGATGGTTGCGAGCCTTCCATGTGGATGTTGGGAACTGAACTCAACAA  100

seq1  TCTCTGGAAGAGCAGCCAGTGGTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCC  145
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGAAGAGCAGCCAGTGGTCCTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCC  150

seq1  CCAGTGAGGTCTGTTGACCAGAACATCCACAGCTATTATGATATTCTC-A  194
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCAGTGAGGTCTGTTGACCAGAACATCCACAGCTATTATGATATTCTCAA  200

seq1  ATGAGATCTGTGGCTGTGACTAAAAAGAAGCTAAAATCCATCTTAATAAT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATCTGTGGCTGTGACTAAAAAGAAGCTAAAATCCATCTTAATAAT  250

seq1  CGTTGTGTGTGTTTACTGTAGGAACCTCACACTTAGCAAGAGGAAATCCA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGTGTGTGTTTACTGTAGGAACCTCACACTTAGCAAGAGGAAATCCA  300

seq1  ACCTCAGGGATTCGTGTACTTGCTGAAGGCACTGAGTAGTGCCGGTCAGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCAGGGATTCGTGTACTTGCTGAAGGCACTGAGTAGTGCCGGTCAGA  350

seq1  ATAGAACCAATCAGCAGAAGTGTTGTGCACGATCTCACTCCGTAGCTCCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACCAATCAGCAGAAGTGTTGTGCACGATCTCACTCCGTAGCTCCC  400

seq1  AACATGGGAAACCAGTCTCCCTCTTTCACTTATTGGAATCAGGAGCCATG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGGAAACCAGTCTCCCTCTTTCACTTATTGGAATCAGGAGCCATG  450

seq1  TGGAACAGACTGAATGACATGTGTGCTTCACAGCTCCCCACCCCAACCCC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACAGACTGAATGACATGTGTGCTTCACAGCTCCCCACCCCAACCCC  500

seq1  ATGATCCTAAAGTGAAAGTTTGAAAGCCATTACCCAGCAACATCTGGAAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCCTAAAGTGAAAGTTTGAAAGCCATTACCCAGCAACATCTGGAAT  550

seq1  AGTGAAAGGAGATTCAGTGTGACTTTGGGAAACCTCTGTGTGGATCCAGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAGGAGATTCAGTGTGACTTTGGGAAACCTCTGTGTGGATCCAGT  600

seq1  TTGACCAAACAAACTCAGTGTGTTGATTTGCCTTTAGTCTGTCCCTTAGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCAAACAAACTCAGTGTGTTGATTTGCCTTTAGTCTGTCCCTTAGT  650

seq1  CTGGGTTCTCTGTCAGGACTGGCCTTTATTTTTCTCTTTTCTTCAAAGCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTTCTCTGTCAGGACTGGCCTTTATTTTTCTCTTTTCTTCAAAGCC  700

seq1  CAGATCTGGAGGTAGTCACAGAACGTCCTCTCCACTTAGGGTACTGCTAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTGGAGGTAGTCACAGAACGTCCTCTCCACTTAGGGTACTGCTAG  750

seq1  CTCTTTTAGTCTTTGTTCTATAAGAATCTTCTATAAAAATCTCAACCTAC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTTAGTCTTTGTTCTATAAGAATCTTCTATAAAAATCTCAACCTAC  800

seq1  CTTACCAGAGGCGATCTTTAATCCTCTTCTATATTTTACCATGATGAGAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCAGAGGCGATCTTTAATCCTCTTCTATATTTTACCATGATGAGAC  850

seq1  ATAAACCAGTCATTCAGAAAATGTCTTGGAATAAATGAATAAATGATCAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACCAGTCATTCAGAAAATGTCTTGGAATAAATGAATAAATGATCAC  900

seq1  ACGACCTTGAACTTCTTGGATACATACCACATTTCTCACTTTTTATGCCA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACCTTGAACTTCTTGGATACATACCACATTTCTCACTTTTTATGCCA  950

seq1  ACAGAACCCCAAATATCCTTAACTCTCTAAAACTGATTT-CTAGCACAGC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACAGAACCCCAAATATCCTTAACTCTCTAAAACTGATTTGCTAGCACAGC  1000

seq1  AGGCTGGGATGTTTTCCTGGAATTC  1018
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGGATGTTTTCCTGGAATTC  1025

seq1: chr12_9172450_9173555
seq2: B6Ng01-296P12.g_72_1188

seq1  GAATTCTTTTGTTAGGTTTATGCCTTGTTTATGTCACACCCCTCTTTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTTAGGTTTATGCCTTGTTTATGTCACACCCCTCTTTCCC  50

seq1  ACTCTATAAATAGCCTTCCAGAGGAGTTGCCATATTTGAGCTGCCCACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTATAAATAGCCTTCCAGAGGAGTTGCCATATTTGAGCTGCCCACTT  100

seq1  ACCATCTACATGCAGTACTCTGCTCCAGTACTATTTCCAGGCCAAGATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCTACATGCAGTACTCTGCTCCAGTACTATTTCCAGGCCAAGATTG  150

seq1  ATTCGGTGGAGTTAGACAGAGCTGCCTCCCTAGTCTCTGTTTATCTTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGGTGGAGTTAGACAGAGCTGCCTCCCTAGTCTCTGTTTATCTTTCT  200

seq1  CCAAACACCATTGAAGCTGGTTCCATGAGAGATGAAGGGAGAACTTTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACACCATTGAAGCTGGTTCCATGAGAGATGAAGGGAGAACTTTCCC  250

seq1  ACTCCATAGAGTTGTCTCTCTTTCTTTTACATGATGGGCCCAGTGGGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCATAGAGTTGTCTCTCTTTCTTTTACATGATGGGCCCAGTGGGGGA  300

seq1  CTCCTGGTCTAAGGTTTGGCCTCTGGAACTCTTAGATAGACTTAGACATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGGTCTAAGGTTTGGCCTCTGGAACTCTTAGATAGACTTAGACATT  350

seq1  GAGGTTTCTTGGAGAGCTTCTTGCACGCTGAAGAAAGACTTGGAGGGCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTTCTTGGAGAGCTTCTTGCACGCTGAAGAAAGACTTGGAGGGCCC  400

seq1  CTCTCTCTTCCAGGATTGGGAGTTAGGTGGAATTTTTCTAGATGAAGGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTTCCAGGATTGGGAGTTAGGTGGAATTTTTCTAGATGAAGGTG  450

seq1  ACAGGGTGACTCTTGCAGGTAAGGATGTCTCCACAGCAGGAAGAAGCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGTGACTCTTGCAGGTAAGGATGTCTCCACAGCAGGAAGAAGCCAG  500

seq1  ATGACTTTAGGCTGTGACTGGCCCAGTTCAAGAAAGACTGGAGGTCCGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTTAGGCTGTGACTGGCCCAGTTCAAGAAAGACTGGAGGTCCGAT  550

seq1  GGAGGATTAAAGCTATGGCTTCAGCTACCCTGGGTCTTTGTTTCAGGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGATTAAAGCTATGGCTTCAGCTACCCTGGGTCTTTGTTTCAGGGAA  600

seq1  TTGAGGGAGTCACAGGGAAGGCTCTTCGTGGGTGCTTGAAGGTGGCTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGGAGTCACAGGGAAGGCTCTTCGTGGGTGCTTGAAGGTGGCTGAT  650

seq1  AGACTCACTCTTGGGATTTGACCACAGGAATGGCACGAACAAGTGTCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCACTCTTGGGATTTGACCACAGGAATGGCACGAACAAGTGTCTTT  700

seq1  TCTCTTTTGGGTCTGGCTATGGGTTGGGGTAGGGACAGTGTCCACTAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTTGGGTCTGGCTATGGGTTGGGGTAGGGACAGTGTCCACTAGAG  750

seq1  GGCACTGTAGCACTGCCTTGGGTGGTGATAGCAGCCCCTCTACCCTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTGTAGCACTGCCTTGGGTGGTGATAGCAGCCCCTCTACCCTGTGG  800

seq1  AGGAGCTGGCCCAGATGCTGAGCCTTATGGTTAGCTGAGGGAGACAGAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCTGGCCCAGATGCTGAGCCTTATGGTTAGCTGAGGGAGACAGAGA  850

seq1  CCAGCCAG-TTTCTACCGATTG-TCCCCTGTGCAATTAAATCCAGTGGGG  898
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAGCCAGTTTTCTACCGATTGTTCCCCTGTGC-ATTAAATCCAGTGGGG  899

seq1  CTGGATCC-TCCAGCAATGGG-TTTGAACATGATTCTGACTCTCAGGCAC  946
      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATCCTTCCAGCAATGGGTTTTGAACATGATTCTGACTCTCAGGCAC  949

seq1  CCTACACCTTT--ATCCACGTAGGCTCCATGTGTTCACTGCT--GCACA-  991
      |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||| 
seq2  CCTACACCTTTTATTCCACGTAGGCTCCATGTGTTCACTGCTTGCCACAC  999

seq1  CAGTTC-GAC-ATCCACTTATACCTACTCCCGGTGTTGTGCATGCTCACA  1039
      |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCGGACAATCCACTTATA-CTACTCCCGGTGTTGTGCATGCTCACA  1048

seq1  CACTCTTGATCAGTCATATGACCC-TCACCCCTATC-TCCCTCCCTCCCA  1087
      ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  
seq2  CACTTCTGATCAGTCATATGACCCTTCACCCCTATCTTCCCTCCCTCCAT  1098

seq1  TGCACACACGCCATGCCTG  1106
      |||||||||  ||||||||
seq2  TGCACACACCGCATGCCTG  1117