BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-309O15
Chromosome12 (Build37)
Map Location 29,219,447 - 29,316,004
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1110015M06Rik, Allc, Colec11, Rps7
Upstream geneLOC100043009, LOC669327
Downstream geneRnaseh1, Adi1, Ttc15, Tssc1, 4833405L11Rik, LOC629608, Myt1l, LOC100043496
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-309O15.bB6Ng01-309O15.g
ACCGA102036GA102037
length1,0901,158
definitionB6Ng01-309O15.b B6Ng01-309O15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,314,916 - 29,316,004)(29,219,447 - 29,220,616)
sequence
gaattcccagagtttcagttgtaaagaaaatgactgaataaagtgtcatt
catagtatttggttgtagtaacttgtcaaaatctcagggccatgggtgca
cgacagcagtagcttcttgaatgaactgaagttttcaagaggtgcctgga
aggtgaaaaacacactgaagccagtcatgttgatatgggggcattctgct
gctgtgaaacagactggggttcacacccaccttgcgggattagaacttca
ctgccctccaacttctttctttgtaaacaactgtccacattttatgtcct
attctgtctttctttggaatgtggtctcactgtagtgcaagctggcctaa
agatggtctcctgggtttatggtccatggtcttcatcattcctgtgtccc
ctgtctgattctgcacaagttcagcaagttaggattagcaagtccccgtc
agggtaaatggaaacaggtgtgctctacaaggttaaggccttgagtgagg
aagctcccaatacagatgacagctgtgggtagctgctccattctcaagcc
ttaagctatggccttaattattgctagttaaaaaaggaacaggaggtatt
gaatgctgtgcgtggccctgggcaccttttatgtggagcagctcctgtgt
gcactggggcaggctttcaggcatttggtgtgtgactttactatgcttca
tgtccctggtggatatgtgggtgtgcaaagcatctgtacaggactctgtt
ccctgcctttttcctgtcgtctgccctccttgctatgggagctgcaactg
tggtattgtttcctctgctctgatacatcacctcctcagcttaccgcagt
cacagcagacatctgctcatggttctgcagtagctgtagatgcatgaggg
tgaatttggggctagccagtgttcatagaaggtcttaagccaaaatggag
ctgaagaggtggctcagtgcttggggtctctgggacgttcttccagagga
cctggattctactcctagtgatcacatggctcacaactgcatctgacttc
aagttcctgggaggaggcgacttatttctggcctctgagc
gaattctctcaaacatcataattctagatgcctagatcacagcccaaaaa
catgaacatgaacaactaagacaatatggctcctacactgacaggtgatg
tccttcccccaggcacatacctatccgagctttaccaatcaccaccactg
ttcctctgttagcacatacaatatgctacatgctggatgaagcactgagc
actcgggtaaacttttacaaatagctaacatcaccactctccaactgagg
aactgggtatcaaaaactgagtgttcctatggtcacaaagttcagatggt
agaaaacagatttgaccctgaagccctggctagaggctgtggtgctgacc
tgactcctttgaactcttctgccctgtataaggaaaacttcctcactttt
cttctatgtcttgtctagaagactgattcctgacatggtcccccaacttc
tgcagaccaccacagaccacaacacctcctctaactgctgctcactgagg
aagaggttctgggaaacaaggttccttattgccgttgctgctgctgctgc
tcttgttgttgttgttgtgtgcacaatgaggggtgcatgggtgctaccat
gcaagtgtgaaggcgggggagaactttgtggggtcagttctctcctacca
ccctcagaagggctccagtgatcaaactcaaatcatcaaacatgtacagc
aagcacttttcccactgagccatcttacctgaggcccttccttgcaaagc
cgtgccttctgcacagctcaatgtttgttgaatagattgactaataaaac
cagcttaaaataaaggtagaacacccagaacacgcctccaacccctaacc
cccacatgagggcaccttactttcgaactcctcctagagggaagactttt
tctccaatcatgggccagcacgctattccaatctgacaggctgaatttgg
gtataataacttttataggagggataaataatcttccatttgtgaaaacg
ctgtacggttaaaagaaaagcatcatactgccttaaatgagagggaacac
tgtattcgaagagagcacgatgtacttacagaatgcaaacatcctggatt
gactgaataaccttaacagtgcctggagtctacggagcagtcttctagtt
ccactaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_29314916_29316004
seq2: B6Ng01-309O15.b_50_1139 (reverse)

seq1  GCTCAGAGGCCAGAAAATTAGTCGGCTC--CCCAGGAACTTG-AGTCAGA  47
      ||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||
seq2  GCTCAGAGGCCAG-AAATAAGTCGCCTCCTCCCAGGAACTTGAAGTCAGA  49

seq1  TGCAGTTGTGAGCCATGTGATCACTAGGAGTAGAATCCAGGTCCTCTGGA  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTTGTGAGCCATGTGATCACTAGGAGTAGAATCCAGGTCCTCTGGA  99

seq1  AGAACGTCCCAGAGACCCCAAGCACTGAGCCACCTCTTCAGCTCCATTTT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACGTCCCAGAGACCCCAAGCACTGAGCCACCTCTTCAGCTCCATTTT  149

seq1  GGCTTAAGACCTTCTATGAACACTGGCTAGCCCCAAATTCACCCTCATGC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAAGACCTTCTATGAACACTGGCTAGCCCCAAATTCACCCTCATGC  199

seq1  ATCTACAGCCTACTGCAGAACCATGAGCAGATGTCTGCTGTGACTGCGGT  247
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACAG-CTACTGCAGAACCATGAGCAGATGTCTGCTGTGACTGCGGT  248

seq1  AAGCTGAGGAGGTGATGTATCAGAGCAGAGGAAACAATACCACAGTTGCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAGGAGGTGATGTATCAGAGCAGAGGAAACAATACCACAGTTGCA  298

seq1  GCTCCCATAGCAAGGAGGGCAGACGACAGGAAAAAGGCAGGGAACAGAGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCATAGCAAGGAGGGCAGACGACAGGAAAAAGGCAGGGAACAGAGT  348

seq1  CCTGTACAGATGCTTTGCACACCCACATATCCACCAGGGACATGAAGCAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTACAGATGCTTTGCACACCCACATATCCACCAGGGACATGAAGCAT  398

seq1  AGTAAAGTCACACACCAAATGCCTGAAAGCCTGCCCCAGTGCACACAGGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAGTCACACACCAAATGCCTGAAAGCCTGCCCCAGTGCACACAGGA  448

seq1  GCTGCTCCACATAAAAGGTGCCCAGGGCCACGCACAGCATTCAATACCTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTCCACATAAAAGGTGCCCAGGGCCACGCACAGCATTCAATACCTC  498

seq1  CTGTTCCTTTTTTAACTAGCAATAATTAAGGCCATAGCTTAAGGCTTGAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTTTTTAACTAGCAATAATTAAGGCCATAGCTTAAGGCTTGAG  548

seq1  AATGGAGCAGCTACCCACAGCTGTCATCTGTATTGGGAGCTTCCTCACTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGCAGCTACCCACAGCTGTCATCTGTATTGGGAGCTTCCTCACTC  598

seq1  AAGGCCTTAACCTTGTAGAGCACACCTGTTTCCATTTACCCTGACGGGGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCTTAACCTTGTAGAGCACACCTGTTTCCATTTACCCTGACGGGGA  648

seq1  CTTGCTAATCCTAACTTGCTGAACTTGTGCAGAATCAGACAGGGGACACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTAATCCTAACTTGCTGAACTTGTGCAGAATCAGACAGGGGACACA  698

seq1  GGAATGATGAAGACCATGGACCATAAACCCAGGAGACCATCTTTAGGCCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGATGAAGACCATGGACCATAAACCCAGGAGACCATCTTTAGGCCA  748

seq1  GCTTGCACTACAGTGAGACCACATTCCAAAGAAAGACAGAATAGGACATA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCACTACAGTGAGACCACATTCCAAAGAAAGACAGAATAGGACATA  798

seq1  AAATGTGGACAGTTGTTTACAAAGAAAGAAGTTGGAGGGCAGTGAAGTTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGGACAGTTGTTTACAAAGAAAGAAGTTGGAGGGCAGTGAAGTTC  848

seq1  TAATCCCGCAAGGTGGGTGTGAACCCCAGTCTGTTTCACAGCAGCAGAAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCCGCAAGGTGGGTGTGAACCCCAGTCTGTTTCACAGCAGCAGAAT  898

seq1  GCCCCCATATCAACATGACTGGCTTCAGTGTGTTTTTCACCTTCCAGGCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCATATCAACATGACTGGCTTCAGTGTGTTTTTCACCTTCCAGGCA  948

seq1  CCTCTTGAAAACTTCAGTTCATTCAAGAAGCTACTGCTGTCGTGCACCCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTGAAAACTTCAGTTCATTCAAGAAGCTACTGCTGTCGTGCACCCA  998

seq1  TGGCCCTGAGATTTTGACAAGTTACTACAACCAAATACTATGAATGACAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCTGAGATTTTGACAAGTTACTACAACCAAATACTATGAATGACAC  1048

seq1  TTTATTCAGTCATTTTCTTTACAACTGAAACTCTGGGAATTC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCAGTCATTTTCTTTACAACTGAAACTCTGGGAATTC  1090

seq1: chr12_29219447_29220616
seq2: B6Ng01-309O15.g_69_1226

seq1  GAATTCTCTCAAACATCATAATTCTAGATGCCTAGATCACAGCCCAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCAAACATCATAATTCTAGATGCCTAGATCACAGCCCAAAAA  50

seq1  CATGAACATGAACAACTAAGACAATATGGCTCCTACACTGACAGGTGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACATGAACAACTAAGACAATATGGCTCCTACACTGACAGGTGATG  100

seq1  TCCTTCCCCCAGGCACATACCTATCCGAGCTTTACCAATCACCACCACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCCCCAGGCACATACCTATCCGAGCTTTACCAATCACCACCACTG  150

seq1  TTCCTCTGTTAGCACATACAATATGCTACATGCTGGATGAAGCACTGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGTTAGCACATACAATATGCTACATGCTGGATGAAGCACTGAGC  200

seq1  ACTCGGGTAAACTTTTACAAATAGCTAACATCACCACTCTCCAACTGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGGGTAAACTTTTACAAATAGCTAACATCACCACTCTCCAACTGAGG  250

seq1  AACTGGGTATCAAAAACTGAGTGTTCCTATGGTCACAAAGTTCAGATGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGTATCAAAAACTGAGTGTTCCTATGGTCACAAAGTTCAGATGGT  300

seq1  AGAAAACAGATTTGACCCTGAAGCCCTGGCTAGAGGCTGTGGTGCTGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACAGATTTGACCCTGAAGCCCTGGCTAGAGGCTGTGGTGCTGACC  350

seq1  TGACTCCTTTGAACTCTTCTGCCCTGTATAAGGAAAACTTCCTCACTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCCTTTGAACTCTTCTGCCCTGTATAAGGAAAACTTCCTCACTTTT  400

seq1  CTTCTATGTCTTGTCTAGAAGACTGATTCCTGACATGGTCCCCCAACTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTATGTCTTGTCTAGAAGACTGATTCCTGACATGGTCCCCCAACTTC  450

seq1  TGCAGACCACCACAGACCACAACACCTCCTCTAACTGCTGCTCACTGAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGACCACCACAGACCACAACACCTCCTCTAACTGCTGCTCACTGAGG  500

seq1  AAGAGGTTCTGGGAAACAAGGTTCCTTATTGCCGTTGCTGCTGCTGCTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTTCTGGGAAACAAGGTTCCTTATTGCCGTTGCTGCTGCTGCTGC  550

seq1  TCTTGTTGTTGTTGTTGTGTGCACAATGAGGGGTGCATGGGTGCTACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTGTTGTTGTTGTGTGCACAATGAGGGGTGCATGGGTGCTACCAT  600

seq1  GCAAGTGTGAAGGCGGGGGAGAACTTTGTGGGGTCAGTTCTCTCCTACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTGTGAAGGCGGGGGAGAACTTTGTGGGGTCAGTTCTCTCCTACCA  650

seq1  CCCTCAGAAGGGCTCCAGTGATCAAACTCAAATCATCAAACATGTACAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGAAGGGCTCCAGTGATCAAACTCAAATCATCAAACATGTACAGC  700

seq1  AAGCACTTTTCCCACTGAGCCATCTTACCTGAGGCCCTTCCTTGCAAAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACTTTTCCCACTGAGCCATCTTACCTGAGGCCCTTCCTTGCAAAGC  750

seq1  CGTGCCTTCTGCACAGCTCAATGTTTGTTGAATAGATTGACTAATAAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCCTTCTGCACAGCTCAATGTTTGTTGAATAGATTGACTAATAAAAC  800

seq1  CAGCTTAAAATAAAGGTAGAACACCCAGAACACGCCTCCAACCCCTAACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTAAAATAAAGGTAGAACACCCAGAACACGCCTCCAACCCCTAACC  850

seq1  CCCACATGAGGGCACCTTACTTTCGAACTCCTCCTAGAGGGAAGACTTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATGAGGGCACCTTACTTTCGAACTCCTCCTAGAGGGAAGACTTTT  900

seq1  TCTCCAATCAT-GGCCAGCACGCTATTCCAATCTGACAGGCTGAATTTGG  949
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAATCATGGGCCAGCACGCTATTCCAATCTGACAGGCTGAATTTGG  950

seq1  GTATAATAACTTTTATAGGAGGGATAAATAATCTTCCATTTGTGAAAACG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATAACTTTTATAGGAGGGATAAATAATCTTCCATTTGTGAAAACG  1000

seq1  CTGTAAGGGTAAAAAGAAAAAGCATCATTACTGCCTTAAAATTGAGAGGG  1049
      ||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||  ||||||||
seq2  CTGTACGGTTAAAA--GAAAAGCATCA-TACTGCCTTAAA--TGAGAGGG  1045

seq1  AACACTGTATTCAAAAAAAAAAAACACAGATGTACTTACAGAAATGCAAA  1099
      ||||||||||||     || | | ||| ||||||||||||| |||||  |
seq2  AACACTGTATTC----GAAGAGAGCAC-GATGTACTTACAG-AATGC--A  1087

seq1  AACATTCT-GATAGACTGATTAACCCTTAACAGTGCGTGGAGTCCTACAG  1148
      ||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |
seq2  AACATCCTGGATTGACTGAATAA-CCTTAACAGTGCCTGGAGT-CTACGG  1135

seq1  AGCAGTCTTC-ATGTCCACTAAC  1170
      |||||||||| |  |||||||||
seq2  AGCAGTCTTCTAGTTCCACTAAC  1158