BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-319G11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 9,285,348 - 9,427,699
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1110057K04Rik, Gdf7, Hs1bp3, BC106175, Rhob, Slc7a15, LOC100043154, Pum2, F730043H23, Sdc1, Laptm4a, Matn3, Wdr35, Ttc32
Downstream geneLOC633030, LOC100042238, Osr1, LOC382567, Nt5c1b, Rdh14
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-319G11.bB6Ng01-319G11.g
ACCGA109043GA109044
length1,0161,010
definitionB6Ng01-319G11.b B6Ng01-319G11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,426,679 - 9,427,699)(9,285,348 - 9,286,361)
sequence
gaattctatactactcgctaatagcattctgttaataattctagtttaaa
ttctttctacaccaaagcagcatatggtatgtgaattcagttctttgcaa
tccgttgagctttgttcaatggtcccaaagcaagttcatgtcagtgaagt
ctctgctcaggtttgagaagtcctgtgctctatgatggtaggtaaaggct
ctatagagtcaagtcactgatgttggttgcttagatgccatgctgtttgc
catgccgttctaggtgactctggccttgctaaatttctgtctatgttctt
ttggttactgagtgagaagtgatgagagatggaattgtaagtttgtttct
ctgttcagtccattttttcatatattttaaaatcttactgttaatatgag
ctttcctaagtacattaaattcctaaaataaattactttgtctctaaaag
aaagccatattctactgccaaatgacaaaatttaccaccagtcaaaatct
gacatatgaatttcaaaaatgttttgcaaaatgtatgtcatgtttcctca
aattctgtttctattaaaatgactatcaacagacatagtttttaggaatc
tctctctctctctccctctctctctctctctctcttctctccctccctcc
ttcccccctccccctccttataaaacaaacaaggttttatattaaacagt
aaactcataagtattagcataaaactaaggtgaaggtgattggatacaat
acaaagaattaagacacaaattattgctggatgttatggctcatgccttt
agttccagctttcagggaacaaaataaagctctgtgagtttgagcctaac
ctggtctagatggcatgttccaggcagccagatctgcatggtgacaccct
gactcagaacaaagacacagttcccaccaggcctgtggatttgggaatag
cttaagttaatttaaatagtttacactcaatttgtacactgacttcctca
aaggtaaatggctgtg
gaattctacaaagacatgacctgtgaggagtttctggtgatgagaggatc
atcacacccacctgaaagggaaagtcattcaggttggatgctgggcatca
gctaacccagaacataccttcaagtctctgaggagagtcactgtgcccat
aggactgtaggggagggagagcaggagccttggcaagctgtgtggatggc
tcagagagcccaatacctgtaaaagttggaagtgccatccagatggggaa
ttcagcaagagcaggaaattgaagtcagaggaatcccctaagatattgga
agtgtcctgctgtttgtggctgaggcattcaaagggctgcgatttaaatc
tcaatggatagtgcttagccactggaggactcgagtgcatagctgagatg
tgagccaagggataataaataattcaccaccttccacttttgctcctcca
cacactccatgtgcggaatgttttatagttatcacagttcattcacatcc
atctcattttgagccttccagcaggtacggaaggaatttgtcacgttcca
tcactgagaaagcctgggactcagtggaagtagtttgtaggttactgcca
cagtgtggttggtagcttgactatagaatgccactgctgtggtggggttg
ggatattggtggtcaggctggaagtctcactagctctgaggaattcctcc
tgctctgagcttggtggtcctgtaacaactgcagagccctgtggtgcagg
ggagcctacttttttgtgtttgaagacttgcttttaaagatgagatcctg
acagttgttctcctgcccctttctctctcttttcttttgttttctcatct
tcgtctttcttatttcccaatttgctcattttcatcacttctcacatctt
taacatctctgtttaactctttgatagatttatttctgcaaagttatttc
tgtgaatacacataaaaatgttccttacaattgtcattagctgttgttca
gtttttatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_9426679_9427699
seq2: B6Ng01-319G11.b_47_1062 (reverse)

seq1  CACAGCCATTTTACCTTTGAGGAAAGTCAGTTGTACAAATTGAGTGTAAA  50
      |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CACAGCCA-TTTACCTTTGAGG-AAGTCAG-TGTACAAATTGAGTGTAAA  47

seq1  CTATTTTAAATTTAACTTAAGCTATTCCCAAATCCACAGGCCTGGTGGGA  100
      ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTT--AAATTAACTTAAGCTATTCCCAAATCCACAGGCCTGGTGGGA  95

seq1  ACTGTGTCTTTGTTCTGAGTCAGGGTGTCACCATGCAGATCTGGCTGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTCTTTGTTCTGAGTCAGGGTGTCACCATGCAGATCTGGCTGCCT  145

seq1  GGAACATGCCATCTAGACCAGGTTAGGCTCAAACTCACAGAGCTTTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATGCCATCTAGACCAGGTTAGGCTCAAACTCACAGAGCTTTATTT  195

seq1  TGTTCCCTGAAAGCTGGAACTAAAGGCATGAGCCATAACATCCAGCAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCCTGAAAGCTGGAACTAAAGGCATGAGCCATAACATCCAGCAATA  245

seq1  ATTTGTGTCTTAATTCTTTGTATTGTATCCAATCACCTTCACCTTAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGTCTTAATTCTTTGTATTGTATCCAATCACCTTCACCTTAGTTT  295

seq1  TATGCTAATACTTATGAGTTTACTGTTTAATATAAAACCTTGTTTGTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTAATACTTATGAGTTTACTGTTTAATATAAAACCTTGTTTGTTTT  345

seq1  ATAAGGAGGGGGAGGGGGGAAGGAGGGAGGGAGAGAAGAGAGAGAGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGAGGGGGAGGGGGGAAGGAGGGAGGGAGAGAAGAGAGAGAGAGAG  395

seq1  AGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGATTCCTAAAAACTATGTCTGTTGATAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGATTCCTAAAAACTATGTCTGTTGATAGT  445

seq1  CATTTTAATAGAAACAGAATTTGAGGAAACATGACATACATTTTGCAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAATAGAAACAGAATTTGAGGAAACATGACATACATTTTGCAAAA  495

seq1  CATTTTTGAAATTCATATGTCAGATTTTGACTGGTGGTAAATTTTGTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTTGAAATTCATATGTCAGATTTTGACTGGTGGTAAATTTTGTCAT  545

seq1  TTGGCAGTAGAATATGGCTTTCTTTTAGAGACAAAGTAATTTATTTTAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGTAGAATATGGCTTTCTTTTAGAGACAAAGTAATTTATTTTAGG  595

seq1  AATTTAATGTACTTAGGAAAGCTCATATTAACAGTAAGATTTTAAAATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAATGTACTTAGGAAAGCTCATATTAACAGTAAGATTTTAAAATAT  645

seq1  ATGAAAAAATGGACTGAACAGAGAAACAAACTTACAATTCCATCTCTCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAAATGGACTGAACAGAGAAACAAACTTACAATTCCATCTCTCAT  695

seq1  CACTTCTCACTCAGTAACCAAAAGAACATAGACAGAAATTTAGCAAGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTCACTCAGTAACCAAAAGAACATAGACAGAAATTTAGCAAGGCC  745

seq1  AGAGTCACCTAGAACGGCATGGCAAACAGCATGGCATCTAAGCAACCAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCACCTAGAACGGCATGGCAAACAGCATGGCATCTAAGCAACCAAC  795

seq1  ATCAGTGACTTGACTCTATAGAGCCTTTACCTACCATCATAGAGCACAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTGACTTGACTCTATAGAGCCTTTACCTACCATCATAGAGCACAGG  845

seq1  ACTTCTCAAACCTGAGCAGAGACTTCACTGACATGAACTTGCTTTGGGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCAAACCTGAGCAGAGACTTCACTGACATGAACTTGCTTTGGGAC  895

seq1  CATTGAACAAAGCTCAACGGATTGCAAAGAACTGAATTCACATACCATAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAACAAAGCTCAACGGATTGCAAAGAACTGAATTCACATACCATAT  945

seq1  GCTGCTTTGGTGTAGAAAGAATTTAAACTAGAATTATTAACAGAATGCTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTTGGTGTAGAAAGAATTTAAACTAGAATTATTAACAGAATGCTA  995

seq1  TTAGCGAGTAGTATAGAATTC  1021
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCGAGTAGTATAGAATTC  1016

seq1: chr12_9285348_9286361
seq2: B6Ng01-319G11.g_66_1075

seq1  GAATTCTACAAAGACATGACCTGTGAGGAGTTTCTGGTGATGAGAGGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACAAAGACATGACCTGTGAGGAGTTTCTGGTGATGAGAGGATC  50

seq1  ATCACACCCACCTGAAAGGGAAAGTCATTCAGGTTGGATGCTGGGCATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACACCCACCTGAAAGGGAAAGTCATTCAGGTTGGATGCTGGGCATCA  100

seq1  GCTAACCCAGAACATACCTTCAAGTCTCTGAGGAGAGTCACTGTGCCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACCCAGAACATACCTTCAAGTCTCTGAGGAGAGTCACTGTGCCCAT  150

seq1  AGGACTGTAGGGGAGGGAGAGCAGGAGCCTTGGCAAGCTGTGTGGATGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTGTAGGGGAGGGAGAGCAGGAGCCTTGGCAAGCTGTGTGGATGGC  200

seq1  TCAGAGAGCCCAATACCTGTAAAAGTTGGAAGTGCCATCCAGATGGGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGCCCAATACCTGTAAAAGTTGGAAGTGCCATCCAGATGGGGAA  250

seq1  TTCAGCAAGAGCAGGAAATTGAAGTCAGAGGAATCCCCTAAGATATTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCAAGAGCAGGAAATTGAAGTCAGAGGAATCCCCTAAGATATTGGA  300

seq1  AGTGTCCTGCTGTTTGTGGCTGAGGCATTCAAAGGGCTGCGATTTAAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCTGCTGTTTGTGGCTGAGGCATTCAAAGGGCTGCGATTTAAATC  350

seq1  TCAATGGATAGTGCTTAGCCACTGGAGGACTCGAGTGCATAGCTGAGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGATAGTGCTTAGCCACTGGAGGACTCGAGTGCATAGCTGAGATG  400

seq1  TGAGCCAAGGGATAATAAATAATTCACCACCTTCCACTTTTGCTCCTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCAAGGGATAATAAATAATTCACCACCTTCCACTTTTGCTCCTCCA  450

seq1  CACACTCCATGTGCGGAATGTTTTATAGTTATCACAGTTCATTCACATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCCATGTGCGGAATGTTTTATAGTTATCACAGTTCATTCACATCC  500

seq1  ATCTCATTTTGAGCCTTCCAGCAGGTACGGAAGGAATTTGTCACGTTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATTTTGAGCCTTCCAGCAGGTACGGAAGGAATTTGTCACGTTCCA  550

seq1  TCACTGAGAAAGCCTGGGACTCAGTGGAAGTAGTTTGTAGGTTACTGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGAAAGCCTGGGACTCAGTGGAAGTAGTTTGTAGGTTACTGCCA  600

seq1  CAGTGTGGTTGGTAGCTTGACTATAGAATGCCACTGCTGTGGTGGGGTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGGTTGGTAGCTTGACTATAGAATGCCACTGCTGTGGTGGGGTTG  650

seq1  GGATATTGGTGGTCAGGCTGGAAGTCTCACTAGCTCTGAGGAATTCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTGGTGGTCAGGCTGGAAGTCTCACTAGCTCTGAGGAATTCCTCC  700

seq1  TGCTCTGAGCTTGGTGGTCCTGTAACAACTGCAGAGCCCTGTGGTGCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTGAGCTTGGTGGTCCTGTAACAACTGCAGAGCCCTGTGGTGCAGG  750

seq1  GGAGCCTAC-TTTTTGTGTTTGAAGACTTGCTTTTAAAGATGAGATCCTG  799
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCTACTTTTTTGTGTTTGAAGACTTGCTTTTAAAGATGAGATCCTG  800

seq1  ACAGTTGTTCTCCTGCCCCTTTCTCTCTCTTTTTCTTTGTTTTCTCATCT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
seq2  ACAGTTGTTCTCCTGCCCCTTTCTCTCTCTTTTCTTTTGTTTTCTCATCT  850

seq1  TCGTCTTTCCTATTTCCCAATTTGCTCATTTTCATCCACTTCTCACATCT  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCGTCTTTCTTATTTCCCAATTTGCTCATTTTCAT-CACTTCTCACATCT  899

seq1  TTAACATCTCTGTTTTAACTCTTTTGATAGATTTATTTCTGCAAAGTTTA  949
      |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTAACATCTCTG-TTTAACTC-TTTGATAGATTTATTTCTGCAAAG-TTA  946

seq1  TTTCTGTGAATACACATAAAAATGTTCCTACCATTTGTCATAAGCTGTTT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| 
seq2  TTTCTGTGAATACACATAAAAATGTTCCTTACAATTGTCATTAGCTGTT-  995

seq1  GTTTCAG-TTTTATAC  1014
        ||||| ||||||||
seq2  -GTTCAGTTTTTATAC  1010