BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322K10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 23,322,196 - 23,450,343
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668670, LOC668680
Upstream geneLOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660, EG668662, LOC668664, 2410018L13Rik, LOC77114, EG668669
Downstream geneLOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903, LOC100043440, EG668518, LOC100043445, LOC668697, LOC100042923, LOC677338, EG668701
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322K10.bB6Ng01-322K10.g
ACCGA111439GA111440
length9481,116
definitionB6Ng01-322K10.b B6Ng01-322K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,449,400 - 23,450,343)(23,322,196 - 23,323,325)
sequence
gaattcataagcctctgagcagttcagagtagtttcctttgggacttggg
tagaggagactcacccacactagttcttctacacatttcaaaaataacag
agctattgcaggtgtgatactgtgaaagaaagaaaccaaaattgaggtag
ggaagtgaacgagcattaatgtccagtggccaatcactgcaggatctcac
acttgggccttgtgggagactgcagtggggtgtgctggccaatgaagcac
agtcctgaatttccaagggggctgtttcagctggtaacattcacatcgac
atttaccgaaaattgatgcaattctagatctccctggcagaacaatatct
cataggcataatagagagtggggactcccataaggttcccagatgtctct
tctagggttaaaacagcatggcatgtgctggtaacttctaccagtattgt
atggagggggacagggaggtcttgggggatctagaagccccctgtcaaca
tgattcaaagctttaatacctggttccccatgaaaccctacttacccaga
ttaacccagaaatctgggtaagaatggggttttaaaatgtcattcataaa
attagggctgctgataaatgaaattgaacttttgaagggccaaagccatg
ttccttgttctctggtatcatccctgagtccactcaagatgggtgtcaac
ctagttctaaatttaccctagctgtgttagctaaataatgtgaaccacga
gcatccacctacacaggcaagatttatttactatgcaacatcagcaaatt
gtatctgtgacaaggaaacaaacacacacaccgagtcccccatgaaaaaa
agaactagctgttcaaagccaaaagtcagcatttggtccatgagacccct
tggccccaagctgaaaaagctgaggggttgtcttcatcctgaatcttg
gaattctaagtagcagcttgataccagggaggaggcaaaggctgggcaga
ggcacagccctgtgttctgaagctcccacctctgaaatatttgataagga
gcagatcttcaagccattgggaagggagtgggaaataagggaaacgatgc
ctctcctccaacagctccaaggctgtctgcactgcagcctcctcctggta
gatatctgcagagcaggtacaaggagtttggcattctagtagcatctgtt
agatgataaatcacagacacagcagtgatgtgtgttcagtgaggtgagtg
gatgctgcgtgcatgacctggaaaacaagggtctgtggcaagactgtggg
gtgcagggctgttgatcataaagaggagccacaagcacaggtctagctat
ggtggcaatgcagctgtttccacattgccctctctgggactgtcatacca
gcacaatcccaaagctgggtatccttgagtcagatcctggctcacatagg
agaggttctgcagctctctgatggtcagttttctggttagcaagatgtat
ctgatgggtgacatttctaactggacctcaggccagagacacgttgtaag
tctccctgtgtgaatagttcaatggtgagggccttggagctacatggctt
cattgggtcttggtttttttctctccaatactagtatttgagcaggggac
cccacaccaaccatcttggtccaacctggcttctctaccttttacccgct
accaccccaaactctgccctcttttctggggtcccctgctcaccttgttt
cacagttttgtctcctgtctgagggcctcaagagtgcctgcctctgattg
taacatcctagtagccacctcctgggctcaactcattgtcccttcctcaa
ggtactccagttcccttctccctcccctcccctccttttccctctccctc
attcttccttccttcctccttctttcttcttcctcctcccctctttcctc
ccttctttccatcgatatccctggatgtcccagagcaagctctgtcctaa
tcctgtcctgaagcacttcaagcagccttaactttatagtgttctatcaa
ctcagaggttgttaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_23449400_23450343
seq2: B6Ng01-322K10.b_46_993 (reverse)

seq1  CAAGAGTCAGGATTGAGACAAACCCCTCAGC-TCTTCAGCTTGGGGCAAA  49
      ||||| |||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||
seq2  CAAGATTCAGGATGAAGAC-AACCCCTCAGCTTTTTCAGCTTGGGGCCAA  49

seq1  GGGGTCTCATGGACCCAATGCTGACTCTTCGCTTTGAACAGCTAGTTCTT  99
      ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTCTCATGGACCAAATGCTGACTTTTGGCTTTGAACAGCTAGTTCTT  99

seq1  TTTCTCATGGGGGACTCGGTGTGTGTGTTTGTTTCCTTGTCACAGATAC-  148
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTTTCATGGGGGACTCGGTGTGTGTGTTTGTTTCCTTGTCACAGATACA  149

seq1  ATTTGCTGATGTTGCATAGTAAATAAATCTTGCCTGTGTAGGTGGATGCT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTGATGTTGCATAGTAAATAAATCTTGCCTGTGTAGGTGGATGCT  199

seq1  CGTGGTTCACATT-CTTAGCTAACACAGCTAGGGTAAATTTAGAACTAGG  247
      |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTTCACATTATTTAGCTAACACAGCTAGGGTAAATTTAGAACTAGG  249

seq1  TTGACACCCATCTTGAGTGGACTCAGGGATGATACCAGAGAAC-AGGAAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTGACACCCATCTTGAGTGGACTCAGGGATGATACCAGAGAACAAGGAAC  299

seq1  ATGGCTTTGGCCCTTC-AAAGTTCAATTTCATTTATCAGCAGCCCTAATT  345
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTTGGCCCTTCAAAAGTTCAATTTCATTTATCAGCAGCCCTAATT  349

seq1  TTATGAATGACATTTTAAAACCCCATTCTTACCCAGATTTCTGGGTTAAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAATGACATTTTAAAACCCCATTCTTACCCAGATTTCTGGGTTAAT  399

seq1  CTGGGTAAGTAGGGTTTCATGGGGAACCAGGTATTAAAGCTTTGAATCAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTAAGTAGGGTTTCATGGGGAACCAGGTATTAAAGCTTTGAATCAT  449

seq1  GTTGACAGGGGGCTTCTAGATCCCCCAAGACCTCCCTGTCCCCCTCCATA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACAGGGGGCTTCTAGATCCCCCAAGACCTCCCTGTCCCCCTCCATA  499

seq1  CAATACTGGTAGAAGTTACCAGCACATGCCATGCTGTTTTAACCCTAGAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACTGGTAGAAGTTACCAGCACATGCCATGCTGTTTTAACCCTAGAA  549

seq1  GAGACATCTGGGAACCTTATGGGAGTCCCCACTCTCTATTATGCCTATGA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATCTGGGAACCTTATGGGAGTCCCCACTCTCTATTATGCCTATGA  599

seq1  GATATTGTTCTGCCAGGGAGATCTAGAATTGCATCAATTTTCGGTAAATG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGTTCTGCCAGGGAGATCTAGAATTGCATCAATTTTCGGTAAATG  649

seq1  TCGATGTGAATGTTACCAGCTGAAACAGCCCCCTTGGAAATTCAGGACTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATGTGAATGTTACCAGCTGAAACAGCCCCCTTGGAAATTCAGGACTG  699

seq1  TGCTTCATTGGCCAGCACACCCCACTGCAGTCTCCCACAAGGCCCAAGTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCATTGGCCAGCACACCCCACTGCAGTCTCCCACAAGGCCCAAGTG  749

seq1  TGAGATCCTGCAGTGATTGGCCACTGGACATTAATGCTCGTTCACTTCCC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATCCTGCAGTGATTGGCCACTGGACATTAATGCTCGTTCACTTCCC  799

seq1  TACCTCAATTTTGGTTTCTTTCTTTCACAGTATCACACCTGCAATAGCTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCAATTTTGGTTTCTTTCTTTCACAGTATCACACCTGCAATAGCTC  849

seq1  TGTTATTTTTGAAATGTGTAGAAGAACTAGTGTGGGTGAGTCTCCTCTAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTTTTGAAATGTGTAGAAGAACTAGTGTGGGTGAGTCTCCTCTAC  899

seq1  CCAAGTCCCAAAGGAAACTACTCTGAACTGCTCAGAGGCTTATGAATTC  944
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCCCAAAGGAAACTACTCTGAACTGCTCAGAGGCTTATGAATTC  948

seq1: chr12_23322196_23323325
seq2: B6Ng01-322K10.g_66_1181

seq1  GAATTCTAAGTAGCAGCTTGATACCAGGGAGGAGGCAAAGGCTGGGCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGTAGCAGCTTGATACCAGGGAGGAGGCAAAGGCTGGGCAGA  50

seq1  GGCACAGCCCTGTGTTCTGAAGCTCCCACCTCTGAAATATTTGATAAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGCCCTGTGTTCTGAAGCTCCCACCTCTGAAATATTTGATAAGGA  100

seq1  GCAGATCTTCAAGCCATTGGGAAGGGAGTGGGAAATAAGGGAAACGATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATCTTCAAGCCATTGGGAAGGGAGTGGGAAATAAGGGAAACGATGC  150

seq1  CTCTCCTCCAACAGCTCCAAGGCTGTCTGCACTGCAGCCTCCTCCTGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCTCCAACAGCTCCAAGGCTGTCTGCACTGCAGCCTCCTCCTGGTA  200

seq1  GATATCTGCAGAGCAGGTACAAGGAGTTTGGCATTCTAGTAGCATCTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCTGCAGAGCAGGTACAAGGAGTTTGGCATTCTAGTAGCATCTGTT  250

seq1  AGATGATAAATCACAGACACAGCAGTGATGTGTGTTCAGTGAGGTGAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGATAAATCACAGACACAGCAGTGATGTGTGTTCAGTGAGGTGAGTG  300

seq1  GATGCTGCGTGCATGACCTGGAAAACAAGGGTCTGTGGCAAGACTGTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGCGTGCATGACCTGGAAAACAAGGGTCTGTGGCAAGACTGTGGG  350

seq1  GTGCAGGGCTGTTGATCATAAAGAGGAGCCACAAGCACAGGTCTAGCTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGGCTGTTGATCATAAAGAGGAGCCACAAGCACAGGTCTAGCTAT  400

seq1  GGTGGCAATGCAGCTGTTTCCACATTGCCCTCTCTGGGACTGTCATACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCAATGCAGCTGTTTCCACATTGCCCTCTCTGGGACTGTCATACCA  450

seq1  GCACAATCCCAAAGCTGGGTATCCTTGAGTCAGATCCTGGCTCACATAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAATCCCAAAGCTGGGTATCCTTGAGTCAGATCCTGGCTCACATAGG  500

seq1  AGAGGTTCTGCAGCTCTCTGATGGTCAGTTTTCTGGTTAGCAAGATGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTCTGCAGCTCTCTGATGGTCAGTTTTCTGGTTAGCAAGATGTAT  550

seq1  CTGATGGGTGACATTTCTAACTGGACCTCAGGCCAGAGACACGTTGTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGGTGACATTTCTAACTGGACCTCAGGCCAGAGACACGTTGTAAG  600

seq1  TCTCCCTGTGTGAATAGTTCAATGGTGAGGGCCTTGGAGCTACATGGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTGTGTGAATAGTTCAATGGTGAGGGCCTTGGAGCTACATGGCTT  650

seq1  CATTGGGTCTTGGTTTTTTTCTCTCCAATACTAGTATTTGAGCAGGGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGGTCTTGGTTTTTTTCTCTCCAATACTAGTATTTGAGCAGGGGAC  700

seq1  CCCACACCAACCATCTTGGTCCAACCTGGCTTCTCTACCTTTTACCCGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACCAACCATCTTGGTCCAACCTGGCTTCTCTACCTTTTACCCGCT  750

seq1  ACCACCCCAAACTCTGCCCTCTTTTCTGGGGTCCCCTGCTCACCTTGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCCCAAACTCTGCCCTCTTTTCTGGGGTCCCCTGCTCACCTTGTTT  800

seq1  CACAGTTTTGTCTCCTGTCTGAGGGCCTCAAGAGTGCCTGCCTCTGATTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTTTGTCTCCTGTCTGAGGGCCTCAAGAGTGCCTGCCTCTGATTG  850

seq1  TAACATCCTAGTAGCCACCTCCTGGGCTCAACTCATTGTCCCTTCCTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCCTAGTAGCCACCTCCTGGGCTCAACTCATTGTCCCTTCCTCAA  900

seq1  GGTACTCCAGTTCCCTTCTCCCTCCCCTCCCCTCCTTTTCCCTCTCCCTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTCCAGTTCCCTTCTCCCTCCCCTCCCCTCCTTTTCCCTCTCCCTC  950

seq1  ATTTCTTCCTTCCTTCCCTCCTTCTTTTCTTCCTTCCTCCTCCCCTCTTT  1000
      | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||
seq2  A-TTCTTCCTTCCTT-CCTCCTTC-TTTCTT-CTTCCTCCTCCCCTCTTT  996

seq1  CCTCCCTTCCTTTTCCATCGATATTCCTGGATTGTCCCCAGAGCCAAGGC  1050
      |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  | ||
seq2  CCTCCCTTC--TTTCCATCGATATCCCTGGA-TGT-CCCAGAGC--AAGC  1040

seq1  TCTGTCTCTATTTCTTGTTCCTGAAGCCACCTCAGGCAGGCCTTAAC-TT  1099
      |||||| ||| | ||   |||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||
seq2  TCTGTC-CTAATCCT--GTCCTGAAG-CACTTCAAGCA-GCCTTAACTTT  1085

seq1  ATAGTGTTCTATCAACTCAGAGGTTGTTAGA  1130
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTTCTATCAACTCAGAGGTTGTTAGA  1116