BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328C06
Chromosome12 (Build37)
Map Location 43,754,481 - 43,755,668
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneImmp2l, EG638533
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328C06.bB6Ng01-328C06.g
ACCGA115483GA115484
length1,182233
definitionB6Ng01-328C06.b B6Ng01-328C06.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaagttgaagataatgacatggatttgatttagacacagataaa
tagatatggatagatacacaatttcacagagtcatgaattcacatgaata
tctatctagaaataaataatacatctctaagtaaatctgccattgttgtt
tcaagtggggcaaaagtttagtatagtatgatctcttcaaatctatttga
ttttatagaagggctgtaattatcagctttaatgcacattaacaatatct
tctggtatcacagtattatcaaaactttagttgaaatgtagccatccctg
tggtacctgctactgccaatcatttcatcctacagcatattcataaaaag
ttgcaatgttgcacaaaagactagaatactaaactttactaccaagactt
tgcaaagttgctatttgattttttgaaaatgatatataatacccttaatg
agtatccgtagatatcctaaaatttcattctgcttgaatttaaaaatctc
cagggcatgctgtcgagggaatgatatgtattctcaagcttcccagctta
cagcactgtctcccaacagtctactgacaaacatatgccgatagtagtac
atgtgttacaacttcataatgtggcatatcacttgttagcctaattgatg
acatgttttgttggcttttaccacacatgtgggattttgtaggccttcag
agcagactttaagtaatgatataataagctgagagactttataatatcta
ataggaaaatagccattaaacagataatcacacaattacttaattttgat
agccctaagtaataattaatacaaagaaatgtttagagcaagctctgtcc
atggaattatcagggcaaggagcgaaacatgcagatatttcccactccct
acatcctttgggattacctagcatgaggcctcatgtagtgacagctacaa
cactttcagtcactgggggagacttctgttaacttatttgaatttgaata
tttcctaattgagtaattgtttatggatgaatagggagagtattcttcct
ggacccaggagcattgtgtcattaaaatatcttgttataaaagtgaaaat
gatttattataatcttgcaacagcagaaaaaaaaaactactgaacatctg
catccttccagttttatcaaggaaaagtagca

caggaactgaaaactggagaagccagaatttagatacctagggtagacca
aaaaatgtttggtctttaaaaaaggatgggaggggtgatatcagtgaaat
gagttctaatgatattctgctatacttatagatcagtgtcttgtccagtt
atcagagagtctttctcctgtagcacacaggagctgatacagagactagt
agtcagatatgtgagagagagggggagagggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_43754481_43755668
seq2: B6Ng01-328C06.b_47_1228 (reverse)

seq1  TGCTACTTT--CTTGATAAAACTGGAAGGATGCCAGATGTTCAGTAGTTT  48
      |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  TGCTACTTTTCCTTGATAAAACTGGAAGGATG-CAGATGTTCAGTAG-TT  48

seq1  TTTTTTTTCTGCTTGTTTGCAAGATTATAATAAATCATTTTTCACTTTTA  98
      |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTGCT--GTTGCAAGATTATAATAAATCA-TTTTCACTTTTA  95

seq1  TAACAGATTATTTTAATGACACAATGCCTCCTGGGTCCAGGAAGAATACT  148
      |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  TAACAAGATATTTTAATGACACAATG-CTCCTGGGTCCAGGAAGAATAC-  143

seq1  TCTCCCTATTCATCCATAAACAATTACTCAATTAGGAAAATATTCAAATT  198
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCTCCCTATTCATCCATAAACAATTACTCAATTAGG-AAATATTCAAATT  192

seq1  CAAATAAGTTAACAGAAGTCTCCCCCAGTGACTGAAAGTGTTGTAGCTGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGTTAACAGAAGTCTCCCCCAGTGACTGAAAGTGTTGTAGCTGT  242

seq1  CACTACATGAGGCCTCATGCTAGGTAATCCCAAAGGATGTAGGGAGTGGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTACATGAGGCCTCATGCTAGGTAATCCCAAAGGATGTAGGGAGTGGG  292

seq1  AAATATCTGCATGTTTCGCTCCTTGCCCTGATAATTCCATGGACAGAGCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCTGCATGTTTCGCTCCTTGCCCTGATAATTCCATGGACAGAGCT  342

seq1  TGCTCTAAACATTTCTTTGTATTAATTATTACTTAGGGCTATCAAAATTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTAAACATTTCTTTGTATTAATTATTACTTAGGGCTATCAAAATTA  392

seq1  AGTAATTGTGTGATTATCTGTTTAATGGCTATTTTCCTATTAGATATTAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTGTGTGATTATCTGTTTAATGGCTATTTTCCTATTAGATATTAT  442

seq1  AAAGTCTCTCAGCTTATTATATCATTACTTAAAGTCTGCTCTGAAGGCCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTCTCAGCTTATTATATCATTACTTAAAGTCTGCTCTGAAGGCCT  492

seq1  ACAAAATCCCACATGTGTGGTAAAAGCCAACAAAACATGTCATCAATTAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATCCCACATGTGTGGTAAAAGCCAACAAAACATGTCATCAATTAG  542

seq1  GCTAACAAGTGATATGCCACATTATGAAGTTGTAACACATGTACTACTAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACAAGTGATATGCCACATTATGAAGTTGTAACACATGTACTACTAT  592

seq1  CGGCATATGTTTGTCAGTAGACTGTTGGGAGACAGTGCTGTAAGCTGGGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCATATGTTTGTCAGTAGACTGTTGGGAGACAGTGCTGTAAGCTGGGA  642

seq1  AGCTTGAGAATACATATCATTCCCTCGACAGCATGCCCTGGAGATTTTTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGAGAATACATATCATTCCCTCGACAGCATGCCCTGGAGATTTTTA  692

seq1  AATTCAAGCAGAATGAAATTTTAGGATATCTACGGATACTCATTAAGGGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAAGCAGAATGAAATTTTAGGATATCTACGGATACTCATTAAGGGT  742

seq1  ATTATATATCATTTTCAAAAAATCAAATAGCAACTTTGCAAAGTCTTGGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATATCATTTTCAAAAAATCAAATAGCAACTTTGCAAAGTCTTGGT  792

seq1  AGTAAAGTTTAGTATTCTAGTCTTTTGTGCAACATTGCAACTTTTTATGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAGTTTAGTATTCTAGTCTTTTGTGCAACATTGCAACTTTTTATGA  842

seq1  ATATGCTGTAGGATGAAATGATTGGCAGTAGCAGGTACCACAGGGATGGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTGTAGGATGAAATGATTGGCAGTAGCAGGTACCACAGGGATGGC  892

seq1  TACATTTCAACTAAAGTTTTGATAATACTGTGATACCAGAAGATATTGTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTCAACTAAAGTTTTGATAATACTGTGATACCAGAAGATATTGTT  942

seq1  AATGTGCATTAAAGCTGATAATTACAGCCCTTCTATAAAATCAAATAGAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGCATTAAAGCTGATAATTACAGCCCTTCTATAAAATCAAATAGAT  992

seq1  TTGAAGAGATCATACTATACTAAACTTTTGCCCCACTTGAAACAACAATG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGAGATCATACTATACTAAACTTTTGCCCCACTTGAAACAACAATG  1042

seq1  GCAGATTTACTTAGAGATGTATTATTTATTTCTAGATAGATATTCATGTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTTACTTAGAGATGTATTATTTATTTCTAGATAGATATTCATGTG  1092

seq1  AATTCATGACTCTGTGAAATTGTGTATCTATCCATATCTATTTATCTGTG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATGACTCTGTGAAATTGTGTATCTATCCATATCTATTTATCTGTG  1142

seq1  TCTAAATCAAATCCATGTCATTATCTTCAACTTTGAATTC  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAATCAAATCCATGTCATTATCTTCAACTTTGAATTC  1182


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |