BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328D13
Chromosome12 (Build37)
Map Location 104,475,195 - 104,633,666
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrima1, EG544888, Asb2, Otub2
Upstream geneSlc24a4, Rin3, Lgmn, Golga5, Chga, Itpk1, Moap1, D230037D09Rik, 5730410I19Rik, Btbd7, EG634678, Cox8c, 9030205A07Rik, LOC667269
Downstream geneDdx24, D12Ertd647e, Ifi27, 1810023F06Rik, 8430415E04Rik, Serpina10, Serpina6, Gm46, Serpina1f, EG435316, Serpina1b, Serpina1d, LOC667951, LOC628801, Serpina1a, LOC667954, Serpina1c, Serpina1e, Serpina11, Serpina9, Serpina12, Serpina4-ps1, Serpina5, Serpina3a, Serpina3b, Serpina3c, LOC435318, LOC628883, Serpina3f, LOC667997, Serpina3g, Serpina3h, EG628900, EG238395, Serpina3k, EG628916, Serpina3m
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328D13.bB6Ng01-328D13.g
ACCGA115545GA115546
length1,1801,037
definitionB6Ng01-328D13.b B6Ng01-328D13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,475,195 - 104,476,370)(104,632,654 - 104,633,666)
sequence
gaattccagtgcccctgcaacttccgccagcctgccattgcaattgggga
ccctagagtccctctactatgtgagagaggcttccaatgtgcttggtggc
acaacagctgcatagtggatgtcagggtggcaatgagaggacaaggctct
ttgggaccacctcttagcatttttaaagcaccgctgactatgtttctgac
cctggaaacagtcctgtctcccaaggtaaagctacggtgctcagaatatg
agcttccttcttcattcctgtagagacacaactcgattgtcagagtcagg
gtaaacaggccagacacttgccatatgtctgagcccatcccccagccagg
cctgactcctgccctgctctggatcatcattgcctaagactctgagctca
aacacacccagacaaagccattccttccccagtctcccagacactctgaa
cacaacagagttcatgagcagcacattggtttgacctggcctgacaaaat
ggccttttttttttttccgagaggacacaagagtgacgatctatctacaa
gagtgtttttaatatgatcaaatggcagacaagaagatggggaccaagtt
ttggggctgaaggaggaagaagtgaaggagttcgttgcatcctagaaatc
aatagatcctggtctctctcatgcataggctccactgagacccaagggaa
caactgctcaagaatctgttctcacgggagggccaagaaggactgtcctt
cttgcccagggctgggttctggccagggtcccactggagttcctataggt
tagttgtgcataagcctatgattgataagcctcgctccattgacccctta
cccatcagtaggcttctcttcgcccttcaaagcccttttctttacacaat
catctgggataagctgtccctacagcccaacttgagcttcttggcctcat
tgctgcttcttcacttggaaatattcctctttgaggcaagttccctgctg
tttaatactatctgtcccctcacaggagctgtagtgtctgggcagacaag
tagatggtgaagcgttgtattcatctgagcaggacaacggtgttgaaagc
taatagaaagcttattaggcatacgacaagccaagaacaaggggttcaac
aagccttaaatgatgtacccagcatccaac
gaattcactgcttaagcataaggccccaagttttgtaacacagcaactgt
gtaacctgcccctgccatgcacccatacctcagcactggacggagattta
gagacagccagctctccggactggtgactggccaatccagccagtgagtg
agctgcaggttcagtggagagacaccatctcggaaattagacgagttagg
gagaggcctcagtgagcaaggcgcttgctccccaagggagacaagagttc
agatccccagaacggatgtgtggcagctacctgtaaacttagccctcagg
aggcagagatggatccctgcagccagctagctagctagaccacccagaat
cgacaacctccaggctcagcaagagaccctgtctaaataagcagagaaca
aggaagacacccagtgtcaccacctcctgacatccgcatgcagaaacaca
tgtgcatgcaaatccacatacatgtgtgcccacctacttaggaggcaggt
tcatatgcatacctcacacacatgcatgcgctaaatttttaaaagaaaaa
cgatagaggaaggtatatgatgtcaatgtctggcctctacactcgtgcac
aggttggtacaatcctctattatgaacacatacatacacagggatacaca
acacacatacacccaaatctctctctctctctctcattctctctctctct
ctatatatatatatacatatatatatacacacatatacatatatacacac
atatatgaattacatataaacatatatatatatatacatgtatgcatgta
tatatgtataaacataaatttgtatatatgtatatatgaatattcagata
tggatattcatatatgaatatatgtatatatacatatatatacacttaca
tatgcatccatatatatatatacatacacacatatgcacacatatatatg
tgtaatatatatatgggtaatatatatcagttatatacacacacatatat
gtgtgtgtgtatatatatatgtatatataaatatgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_104475195_104476370
seq2: B6Ng01-328D13.b_49_1228

seq1  GAATTCCAGTGCCCCTGCAACTTCCGCCAGCCTGCCATTGCAATTGGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTGCCCCTGCAACTTCCGCCAGCCTGCCATTGCAATTGGGGA  50

seq1  CCCTAGAGTCCCTCTACTATGTGAGAGAGGCTTCCAATGTGCTTGGTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGAGTCCCTCTACTATGTGAGAGAGGCTTCCAATGTGCTTGGTGGC  100

seq1  ACAACAGCTGCATAGTGGATGTCAGGGTGGCAATGAGAGGACAAGGCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAGCTGCATAGTGGATGTCAGGGTGGCAATGAGAGGACAAGGCTCT  150

seq1  TTGGGACCACCTCTTAGCATTTTTAAAGCACCGCTGACTATGTTTCTGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGACCACCTCTTAGCATTTTTAAAGCACCGCTGACTATGTTTCTGAC  200

seq1  CCTGGAAACAGTCCTGTCTCCCAAGGTAAAGCTACGGTGCTCAGAATATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAAACAGTCCTGTCTCCCAAGGTAAAGCTACGGTGCTCAGAATATG  250

seq1  AGCTTCCTTCTTCATTCCTGTAGAGACACAACTCGATTGTCAGAGTCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTTCTTCATTCCTGTAGAGACACAACTCGATTGTCAGAGTCAGG  300

seq1  GTAAACAGGCCAGACACTTGCCATATGTCTGAGCCCATCCCCCAGCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAGGCCAGACACTTGCCATATGTCTGAGCCCATCCCCCAGCCAGG  350

seq1  CCTGACTCCTGCCCTGCTCTGGATCATCATTGCCTAAGACTCTGAGCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACTCCTGCCCTGCTCTGGATCATCATTGCCTAAGACTCTGAGCTCA  400

seq1  AACACACCCAGACAAAGCCATTCCTTCCCCAGTCTCCCAGACACTCTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACCCAGACAAAGCCATTCCTTCCCCAGTCTCCCAGACACTCTGAA  450

seq1  CACAACAGAGTTCATGAGCAGCACATTGGTTTGACCTGGCCTGACAAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACAGAGTTCATGAGCAGCACATTGGTTTGACCTGGCCTGACAAAAT  500

seq1  GGCCTTTTTTTTTTTTCCGAGAGGACACAAGAGTGACGATCTATCTACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTTTTTTTTTTCCGAGAGGACACAAGAGTGACGATCTATCTACAA  550

seq1  GAGTGTTTTTAATATGATCAAATGGCAGACAAGAAGATGGGGACCAAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTTTTTAATATGATCAAATGGCAGACAAGAAGATGGGGACCAAGTT  600

seq1  TTGGGGCTGAAGGAGGAAGAAGTGAAGGAGTTCGTTGCATCCTAGAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGCTGAAGGAGGAAGAAGTGAAGGAGTTCGTTGCATCCTAGAAATC  650

seq1  AATAGATCCTGGTCTCTCTCATGCATAGGCTCCACTGAGACCCAAGGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATCCTGGTCTCTCTCATGCATAGGCTCCACTGAGACCCAAGGGAA  700

seq1  CAACTGCTCAAGAATCTGTTCTCACGGGAGGGCCAAGAAGGACTGTCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGCTCAAGAATCTGTTCTCACGGGAGGGCCAAGAAGGACTGTCCTT  750

seq1  CTTGCCCAGGGCTGGGTTCTGGCCAGGGTCCCACTGGAGTTCCTATAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCCAGGGCTGGGTTCTGGCCAGGGTCCCACTGGAGTTCCTATAGGT  800

seq1  TAGTTGTGCATAAGCCTATGATTGATAAGCCTCGCTCCATTGACCCCTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGTGCATAAGCCTATGATTGATAAGCCTCGCTCCATTGACCCCTTA  850

seq1  CCCATCAGTAGGCTTCTCTTCGCCCTTCAAAGCCCTTT--CTTACACAAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
seq2  CCCATCAGTAGGCTTCTCTTCGCCCTTCAAAGCCCTTTTCTTTACACAAT  900

seq1  CATCTGGGATAAGCTGTCCCTACAGCCCAACTTGAGCTTCTTGGCCTCAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGGATAAGCTGTCCCTACAGCCCAACTTGAGCTTCTTGGCCTCAT  950

seq1  TGCTGCTTCTTCACCTTGGAAATATTCCTCTTTGAGGCAAGTTCCCTGCT  998
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTTCTTCA-CTTGGAAATATTCCTCTTTGAGGCAAGTTCCCTGCT  999

seq1  GTTTTATACTATCTGTCCCCTCACAGGAGCTGTAGGTGTCTGGGGCAGAC  1048
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  GTTTAATACTATCTGTCCCCTCACAGGAGCTGTA-GTGTCT-GGGCAGAC  1047

seq1  AAGTAGATGGTG-AGCGTTGTATTCATCCTGAGCAGGGACACGGTGTTGA  1097
      |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||
seq2  AAGTAGATGGTGAAGCGTTGTATTCAT-CTGAGCAGGACAACGGTGTTGA  1096

seq1  CAGCT-ATAGGAAGCTTATTAGCCATACGAC-AGGCAAG-ACAAGGGG-T  1143
       |||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |
seq2  AAGCTAATAGAAAGCTTATTAGGCATACGACAAGCCAAGAACAAGGGGTT  1146

seq1  CAACAAG-CTTAAATGATGTACCCAGCATCCAAC  1176
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGCCTTAAATGATGTACCCAGCATCCAAC  1180

seq1: chr12_104632654_104633666
seq2: B6Ng01-328D13.g_91_1103 (reverse)

seq1  TTCATATATATATATACATATATATATACACACACACATATATGTGTGTG  50
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATATTTATATATACATATATATATACACACACACATATATGTGTGTG  50

seq1  TATATAACTGATATATATTACCCATATATATATTACACATATATATGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAACTGATATATATTACCCATATATATATTACACATATATATGTGT  100

seq1  GCATATGTGTGTATGTATATATATATATGGATGCATATGTAAGTGTATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGTGTGTATGTATATATATATATGGATGCATATGTAAGTGTATAT  150

seq1  ATATGTATATATACATATATTCATATATGAATATCCATATCTGAATATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATATATACATATATTCATATATGAATATCCATATCTGAATATTC  200

seq1  ATATATACATATATACAAATTTATGTTTATACATATATACATGCATACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATACATATATACAAATTTATGTTTATACATATATACATGCATACAT  250

seq1  GTATATATATATATATGTTTATATGTAATTCATATATGTGTGTATATATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATATATATATGTTTATATGTAATTCATATATGTGTGTATATATG  300

seq1  TATATGTGTGTATATATATATGTATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGTGTATATATATATGTATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGA  350

seq1  ATGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTGGGTGTATGTGTGTTGTGTATCCCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTGGGTGTATGTGTGTTGTGTATCCCTGT  400

seq1  GTATGTATGTGTTCATAATAGAGGATTGTACCAACCTGTGCACGAGTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTATGTGTTCATAATAGAGGATTGTACCAACCTGTGCACGAGTGTA  450

seq1  GAGGCCAGACATTGACATCATATACCTTCCTCTATCGTTTTTCTTTTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGACATTGACATCATATACCTTCCTCTATCGTTTTTCTTTTAAA  500

seq1  AATTTAGCGCATGCATGTGTGTGAGGTATGCATATGAACCTGCCTCCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGCGCATGCATGTGTGTGAGGTATGCATATGAACCTGCCTCCTAA  550

seq1  GTAGGTGGGCACACATGTATGTGGATTTGCATGCACATGTGTTTCTGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTGGGCACACATGTATGTGGATTTGCATGCACATGTGTTTCTGCAT  600

seq1  GCGGATGTCAGGAGGTGGTGACACTGGGTGTCTTCCTTGTTCTCTGCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGATGTCAGGAGGTGGTGACACTGGGTGTCTTCCTTGTTCTCTGCTTA  650

seq1  TTTAGACAGGGTCTCTTGCTGAGCCTGGAGGTTGTCGATTCTGGGTGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGACAGGGTCTCTTGCTGAGCCTGGAGGTTGTCGATTCTGGGTGGTC  700

seq1  TAGCTAGCTAGCTGGCTGCAGGGATCCATCTCTGCCTCCTGAGGGCTAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAGCTAGCTGGCTGCAGGGATCCATCTCTGCCTCCTGAGGGCTAAG  750

seq1  TTTACAGGTAGCTGCCACACATCCGTTCTGGGGATCTGAACTCTTGTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGGTAGCTGCCACACATCCGTTCTGGGGATCTGAACTCTTGTCTC  800

seq1  CCTTGGGGAGCAAGCGCCTTGCTCACTGAGGCCTCTCCCTAACTCGTCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGGGAGCAAGCGCCTTGCTCACTGAGGCCTCTCCCTAACTCGTCTA  850

seq1  ATTTCCGAGATGGTGTCTCTCCACTGAACCTGCAGCTCACTCACTGGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCGAGATGGTGTCTCTCCACTGAACCTGCAGCTCACTCACTGGCTG  900

seq1  GATTGGCCAGTCACCAGTCCGGAGAGCTGGCTGTCTCTAAATCTCCGTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGGCCAGTCACCAGTCCGGAGAGCTGGCTGTCTCTAAATCTCCGTCC  950

seq1  AGTGCTGAGGTATGGGTGCATGGCAGGGGCAGGTTACACAGTTGCTGTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGAGGTATGGGTGCATGGCAGGGGCAGGTTACACAGTTGCTGTGT  1000

seq1  TACAAAACTTGGG  1013
      |||||||||||||
seq2  TACAAAACTTGGG  1013