BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334P21
Chromosome12 (Build37)
Map Location 70,214,820 - 70,428,217
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665967, LOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2, Klhdc1, Klhdc2, Sdccag1
Upstream geneLOC100040696
Downstream geneArf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71, Sos2, LOC100040879, L2hgdh, Atp5s, Cdkl1, Map4k5, Spg3a, EG622339, Sav1, LOC100040999, Nin, ENSMUSG00000056391, Gm804, Pygl, Trim9
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334P21.bB6Ng01-334P21.g
ACCGA120359GA120360
length1,1321,005
definitionB6Ng01-334P21.b B6Ng01-334P21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,427,082 - 70,428,217)(70,214,820 - 70,215,825)
sequence
gaattcactttgtagaccaggttggcctcaaactcagatccgcctgcctc
tgcttcctgagggctgggattaaaggtatgcaccaacaccaaaaatttta
aagctaccatgttgaataaaataacaggtattggtaagatttgaataaag
agccaaatgacgagggtaacctatggagttctgctgggtagagaatgatc
tactagtgactgaaatgttgaactaaaaataccttttcctattcatcttg
gttagaagtttctgaattctcttttgcctttccagaaagcaagcataact
tgtgttttatgttttcacttggttttagtaattgcccttctttctgttta
atgctgttctgttttgccgtactggagattgcacttagagacctgcgttc
tgagcaagtgtccttggcccgttgttgtgagatctaagtttttctagctg
gtattgaactcacttttttttttttttaagatttatttatttattatatg
taagtacactgtagctgtcctcagatactccagaagagggcatcagattt
cattacggatggttgtgagccaccatgtatgtagttgctgggatttgaac
tcaggaccttcgggagagcagtcggcgctcttaaccactgagccatctca
ccagccctgaactcactttatatcccacacaggacttgaattctcagtcc
tgttacctcagtcatccaggtccctggaccacaggcttgtgccaccaagt
ccagctgttagtgctctttgatattaatccattttggatttgacttccca
cttaaaggagatccacattttcaagaaattatagctgataatgatgtatt
aaattctacaagaaaaaatcaatttcattatcatcccttgagatttgttt
cattttatgttatttgctgttctgtgatgtggttttaggaaattaataat
gttataactccactataaagtgatttcctgtttagaactaaaaaggatac
tcttcaaattacagtatcacaatgtgtaaaatctttggaataggctcttt
tattgttaacactaaattttttaaaggttctgtatctattcctaggaaaa
gatgtttttagatggctggaagggtggctaat
gaattcatactgtcatggtaaaacacccagacaatgaacagtggttgctg
gaaagcaaaggaagctggtgctgtgttgatgactaggagccggggtggct
tctgagttatagaggagacccaggaagagaggccggagctttgcctgata
tcgtgaggcaagagattacagagctctcaagtttgcactggaagcataca
tgtcccctgacactatatatgacaggaggctggaagcatgataataggtg
atacattaggatttaagaaaaaaatgaaaaagaatattcatgaacctaat
tttcaagcagttccactaagatttaaaaaaaaaaaaaggcagacagtcaa
ggtgcgactagaactgtgggactccacttgagtatacttctgagtcaaca
gtaagatcatcttgcaggggtcttaaggagcccaagcctttgaattgggt
tttaatagaaaagaggtcaggtctcttctgcattcaatagttctattggc
ctctttgatctctgaaaaagtcaagtaacagattttttttccttcagtca
aaagctttccacgggtgatttcttgggagtcttgaatactgctttggctg
gtgtgtggtgcccagaaggaaaccccaagggtctaggaataagccaggtg
gtaggcagagagacggtagcaggaagccaggtcccacagcttcagaaacc
tcttctgaaaagaggaaggtacaagagtctaaactcagaggagaagcaag
gcaagtgaaaggagtgatgagcaccttagaaaacagagtaggatggagaa
gctaggagtgaactgagaaagtgaaagaaaggagtgagaacagtgtcagg
actcttcagaacttacagaatgactatagatagatagatagatagataga
tagatagatagatagatagatagacagattgataggtaaatttaattgat
agattgatatgatagatagatatgatagataatatgattaatagattgaa
ttaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_70427082_70428217
seq2: B6Ng01-334P21.b_48_1179 (reverse)

seq1  ATGAGCCA-CCTCCCAGCCA-CT-AAAACACTTTTTCCTAGGAAATAAGG  47
      || ||||| ||| ||||||| || ||||||  |||||||||| ||||  |
seq2  ATTAGCCACCCTTCCAGCCATCTAAAAACATCTTTTCCTAGG-AATA--G  47

seq1  ATAACAGAA-CTTTAAAAAATATAGTTGTTAAAACAAAATAAAGAGCCTA  96
      || |||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||| | ||||||||||
seq2  AT-ACAGAACCTTTAAAAAATTTAG-TGTT--AACAATA-AAAGAGCCTA  92

seq1  TTCCAAAGATTTTACACATTTGTGATTACTCTAAATTTGAGAGTAT-CTT  145
      |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||||||| |||
seq2  TTCCAAAGATTTTACACA-TTGTGA-TACTGTAATTTGAAGAGTATCCTT  140

seq1  TTTAGTTCTAAACAGAAAACCACTTTAATAGTGGAGTTATAAACATTATT  195
      ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTAGTTCTAAACAGGAAATCACTTT-ATAGTGGAGTTAT-AACATTATT  188

seq1  AATTTCCTAAAACCACATCACAGAACAGCAAATAACATAAAATGAAACAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCTAAAACCACATCACAGAACAGCAAATAACATAAAATGAAACAA  238

seq1  ATCTCAA-GGATGATAATGAAATTGATTTTTTCTTGTAGAA-TTAATACA  293
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATCTCAAGGGATGATAATGAAATTGATTTTTTCTTGTAGAATTTAATACA  288

seq1  TCATTATCAGCTATAA-TTCTTGAAAATGTGGATCTCCTTTAAGTGGGAA  342
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATCAGCTATAATTTCTTGAAAATGTGGATCTCCTTTAAGTGGGAA  338

seq1  GTCAAATCCAAAATGGATTAATATCAAAGAGCACTAACAGCTGGACTTGG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAATCCAAAATGGATTAATATCAAAGAGCACTAACAGCTGGACTTGG  388

seq1  TGGCACAAGCCTGTGGTCCAGGGACCTGGATGACTGAGGTAACAGGACTG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACAAGCCTGTGGTCCAGGGACCTGGATGACTGAGGTAACAGGACTG  438

seq1  AGAATTCAAGTCCTGTGTGGGATATAAAGTGAGTTCAGGGCTGGTGAGAT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCAAGTCCTGTGTGGGATATAAAGTGAGTTCAGGGCTGGTGAGAT  488

seq1  GGCTCAGTGGTTAAGAGCGCCGACTGCTCTCCCGAAGGTCCTGAGTTCAA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGTGGTTAAGAGCGCCGACTGCTCTCCCGAAGGTCCTGAGTTCAA  538

seq1  ATCCCAGCAACTACATACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAATGAAATCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGCAACTACATACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAATGAAATCT  588

seq1  GATGCCCTCTTCTGGAGTATCTGAGGACAGCTACAGTGTACTTACATATA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCCTCTTCTGGAGTATCTGAGGACAGCTACAGTGTACTTACATATA  638

seq1  ATAAATAAATAAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGTGAGTTCAATACCAGCTA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAATAAATCTTAAAAAAAAAAAAAAGTGAGTTCAATACCAGCTA  688

seq1  GAAAAACTTAGATCTCACAACAACGGGCCAAGGACACTTGCTCAGAACGC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACTTAGATCTCACAACAACGGGCCAAGGACACTTGCTCAGAACGC  738

seq1  AGGTCTCTAAGTGCAATCTCCAGTACGGCAAAACAGAACAGCATTAAACA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTCTAAGTGCAATCTCCAGTACGGCAAAACAGAACAGCATTAAACA  788

seq1  GAAAGAAGGGCAATTACTAAAACCAAGTGAAAACATAAAACACAAGTTAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAGGGCAATTACTAAAACCAAGTGAAAACATAAAACACAAGTTAT  838

seq1  GCTTGCTTTCTGGAAAGGCAAAAGAGAATTCAGAAACTTCTAACCAAGAT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTTTCTGGAAAGGCAAAAGAGAATTCAGAAACTTCTAACCAAGAT  888

seq1  GAATAGGAAAAGGTATTTTTAGTTCAACATTTCAGTCACTAGTAGATCAT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGGAAAAGGTATTTTTAGTTCAACATTTCAGTCACTAGTAGATCAT  938

seq1  TCTCTACCCAGCAGAACTCCATAGGTTACCCTCGTCATTTGGCTCTTTAT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTACCCAGCAGAACTCCATAGGTTACCCTCGTCATTTGGCTCTTTAT  988

seq1  TCAAATCTTACCAATACCTGTTATTTTATTCAACATGGTAGCTTTAAAAT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCTTACCAATACCTGTTATTTTATTCAACATGGTAGCTTTAAAAT  1038

seq1  TTTTGGTGTTGGTGCATACCTTTAATCCCAGCCCTCAGGAAGCAGAGGCA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGTGTTGGTGCATACCTTTAATCCCAGCCCTCAGGAAGCAGAGGCA  1088

seq1  GGCGGATCTGAGTTTGAGGCCAACCTGGTCTACAAAGTGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGATCTGAGTTTGAGGCCAACCTGGTCTACAAAGTGAATTC  1132

seq1: chr12_70214820_70215825
seq2: B6Ng01-334P21.g_66_1070

seq1  GAATTCATACTGTCATGGTAAAACACCCAGACAATGAACAGTGGTTGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATACTGTCATGGTAAAACACCCAGACAATGAACAGTGGTTGCTG  50

seq1  GAAAGCAAAGGAAGCTGGTGCTGTGTTGATGACTAGGAGCCGGGGTGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAAGGAAGCTGGTGCTGTGTTGATGACTAGGAGCCGGGGTGGCT  100

seq1  TCTGAGTTATAGAGGAGACCCAGGAAGAGAGGCCGGAGCTTTGCCTGATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTTATAGAGGAGACCCAGGAAGAGAGGCCGGAGCTTTGCCTGATA  150

seq1  TCGTGAGGCAAGAGATTACAGAGCTCTCAAGTTTGCACTGGAAGCATACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGAGGCAAGAGATTACAGAGCTCTCAAGTTTGCACTGGAAGCATACA  200

seq1  TGTCCCCTGACACTATATATGACAGGAGGCTGGAAGCATGATAATAGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCTGACACTATATATGACAGGAGGCTGGAAGCATGATAATAGGTG  250

seq1  ATACATTAGGATTTAAGAAAAAAATGAAAAAGAATATTCATGAACCTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTAGGATTTAAGAAAAAAATGAAAAAGAATATTCATGAACCTAAT  300

seq1  TTTCAAGCAGTTCCACTAAGATTTAAAAAAAAAAAAAGGCAGACAGTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGCAGTTCCACTAAGATTTAAAAAAAAAAAAAGGCAGACAGTCAA  350

seq1  GGTGCGACTAGAACTGTGGGACTCCACTTGAGTATACTTCTGAGTCAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCGACTAGAACTGTGGGACTCCACTTGAGTATACTTCTGAGTCAACA  400

seq1  GTAAGATCATCTTGCAGGGGTCTTAAGGAGCCCAAGCCTTTGAATTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGATCATCTTGCAGGGGTCTTAAGGAGCCCAAGCCTTTGAATTGGGT  450

seq1  TTTAATAGAAAAGAGGTCAGGTCTCTTCTGCATTCAATAGTTCTATTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATAGAAAAGAGGTCAGGTCTCTTCTGCATTCAATAGTTCTATTGGC  500

seq1  CTCTTTGATCTCTGAAAAAGTCAAGTAACAGATTTTTTTTCCTTCAGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGATCTCTGAAAAAGTCAAGTAACAGATTTTTTTTCCTTCAGTCA  550

seq1  AAAGCTTTCCACGGGTGATTTCTTGGGAGTCTTGAATACTGCTTTGGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTTTCCACGGGTGATTTCTTGGGAGTCTTGAATACTGCTTTGGCTG  600

seq1  GTGTGTGGTGCCCAGAAGGAAACCCCAAGGGTCTAGGAATAAGCCAGGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGGTGCCCAGAAGGAAACCCCAAGGGTCTAGGAATAAGCCAGGTG  650

seq1  GTAGGCAGAGAGACGGTAGCAGGAAGCCAGGTCCCACAGCTTCAGAAACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCAGAGAGACGGTAGCAGGAAGCCAGGTCCCACAGCTTCAGAAACC  700

seq1  TCTTCTGAAAAGAGGAAGGTACAAGAGTCTAAACTCAGAGGAGAAGCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGAAAAGAGGAAGGTACAAGAGTCTAAACTCAGAGGAGAAGCAAG  750

seq1  GCAAGTGAAAGGAGTGATGAGCACCTTAGAAAACAGAGTAGGATGGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTGAAAGGAGTGATGAGCACCTTAGAAAACAGAGTAGGATGGAGAA  800

seq1  GCTAGGAGTGAACTGAGAAAGTGAAAGAAAGGAGTGAGAACAGTGTCAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGAGTGAACTGAGAAAGTGAAAGAAAGGAGTGAGAACAGTGTCAGG  850

seq1  ACTCTTCAGAACTTACAGAATGACTATAGATAGATAGATAGATAGATAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCAGAACTTACAGAATGACTATAGATAGATAGATAGATAGATAGA  900

seq1  TAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATATGATAGGTAAATTTAATTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGAT-TGATAGGTAAATTTAATTGA  949

seq1  TAGATTGATATGATAGATAGATATGATAGATAAATATGATTAATAGATTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAGATTGATATGATAGATAGATATGATAGAT-AATATGATTAATAGATTG  998

seq1  -ATTAGA  1006
       ||||||
seq2  AATTAGA  1005