BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337H11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 14,060,019 - 14,192,674
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAW125753
Upstream geneLOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481
Downstream geneLOC100043256, Map1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337H11.bB6Ng01-337H11.g
ACCGA122084GA122085
length1,1351,127
definitionB6Ng01-337H11.b B6Ng01-337H11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,191,550 - 14,192,674)(14,060,019 - 14,061,138)
sequence
gaattcaaatcatggctttggttttgtatagctctctacttcaatcagcc
atttaacttgtctatagaagcaggggtgataaagtcctggggatgctaac
agggacatatatcaataaagtaatgaagggactaggaagatggctaggtg
gataagaccacttggtttgcaagcaggagaaacagagtttgctgccttga
cactatggaaaaagcctgccatggctgcaaatgctcagacaaaatcatct
ggactctgacaaagctttcctgaagtccaaactaaggtttgacagccagt
ataaccccagtactaaggatcagagacaggcagatcctcagtgatccctg
gtcagcgaactatgctgaaagtgtgaacttcttgtacagtgagtgacatt
gactcaaacaaagcaagaagatggagggctatagaagacacctaccatcc
tgttctggccatcctgtgcaattacaaaggtgcatacaacttctgactct
caacatatcatgtcgtgcacgcacacacacacacacacacacacacacac
acacatggggtgtgggagggggcacattctcatgactgttcaactgtgcc
taagtcaaactctctaaccaaaacaagctgtcacaattgaggtgacttct
gctaagtatctaaacatggaatggcatggaaactcatcttttgcagatca
cttgcgtgatgactctgtaaataatgagttatttccctgatgtggagatg
agaaaggaatttgactactgatcacagtgacagatgctggggtctggagc
caactcagcttgctttctggaaagcataacaaacaaaagccatgtttgct
atgacagagattaacatcagaaagatgtatgtgaaaaacatggtcatttt
gagagaggtataagcctgactctgttgcagcctggaaagtgaagtagttg
ggacagaccacaaccacacagcccatctatacagaaacatatgggatggg
ctttcatgccctgggcacagcaggaaagcctgggaggcaggagagtcata
gatgattccaattgctgcctccttaatccctcagtgaaagaataaaagcc
acagctcagccctccttctattttgaatgtccttc

gaattctccattgaggaatcttgaatggctaagaagaggaacattcttcc
attactgagggagtggagggattcgtggagtggagactgggaacggagct
aacatttgaaatgtaacaaataaaatggttaataaaaaattttcaagcta
gtcaatccataaaattaaacattgagatagaaagattccccaagtccaca
cggtgaaatatatggaccaagactcatatgaatggtagggagatgctctg
aaagtgtgctgtgtaaaagagatggttcatatgagaaggcagtgggtatt
gggcaaggactttcagtttggctgagtctctgagtctaagagaaacagcc
tcttagttattctcttggctttcctaaattaacttcatcgttttctcagc
ataactaaggtctgaattttgctgtggaaagttatggatggtagtagcag
ccctctctcctttccaggatgctattggacattagtgactgaggaagaag
gaacacaaatgccgcctcagggctacagggaaaagactgggggcctcttt
ctataagaagcattatttttggaagctccgaggcatgatggagagataaa
tgtcttggaaagttaacagcagcacatctatcacactggaaatatttagc
aacatagggaaatggaggctacccaagcatcctgagtctcatgtgttcac
tgaagtaactttaaatagacacattaagcacagaagtcagaatgcagcac
aacgtcattttgcccgcaatgctgggtataaaatgccaggacctccattg
ggagctttagatgtctggggacaactggggacatctttgtaacattcctc
tcatcttggactcaaaatagttcaaagcctcattgcagcactgtcccata
aaaatactgaacaattaaaccatgactttgggttgttgttaatatgttgg
caatgatcactacctaagccttcaaaaagaaccctaaagtgggaaaatta
aattcaaaataatctatgtacgtctgtgtttgcttattgagtctgcctat
attttctacacagcctaaccatgtatatgataatcagaactggtagagca
gggcatctcacattcatggacaagaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_14191550_14192674
seq2: B6Ng01-337H11.b_46_1180 (reverse)

seq1  GAAGGACATTTAAAAATAGAA-GAGGCTTGAGCTGTTGGCTTTTA-TCTT  48
      |||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||
seq2  GAAGGACA-TTCAAAATAGAAGGAGGGCTGAGCTG-TGGCTTTTATTCTT  48

seq1  T-AATTAAGGATTAAG--AGCAGCATTTGAAATTCATCTATGAACTCT-C  94
      | | | | ||||||||   |||||| ||| || ||||||||| ||||| |
seq2  TCACTGAGGGATTAAGGAGGCAGCAATTGGAA-TCATCTATG-ACTCTCC  96

seq1  TGCCTCC--AGCTTCCCTGCCTTGTGCCCA-GGCATGAA--GCCAT-CCA  138
      |||||||   |||| |||||  |||||||| ||||||||   |||| |||
seq2  TGCCTCCCAGGCTTTCCTGC--TGTGCCCAGGGCATGAAAGCCCATCCCA  144

seq1  TATGTTTCTGTATAGAT-GGCTGTGT-GTTGT-GTCTGTCCCAACTACTT  185
      ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  TATGTTTCTGTATAGATGGGCTGTGTGGTTGTGGTCTGTCCCAACTACTT  194

seq1  CAC-TTCCAGGCTGCAACAGAGTCAGGCTTATACCTCTCTCAAAATGACC  234
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCCAGGCTGCAACAGAGTCAGGCTTATACCTCTCTCAAAATGACC  244

seq1  ATGTTTTTCACATACATCTTTCTGATGTTAATCTCTGTCATAGCAAACAT  284
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTTCACATACATCTTTCTGATGTTAATCTCTGTCATAGCAAACAT  294

seq1  GGCTTTTGTTTGTTATGCTTTCCAGAAAGCAAGCTGAGTTGGCTCCAGAC  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTTGTTTGTTATGCTTTCCAGAAAGCAAGCTGAGTTGGCTCCAGAC  344

seq1  CCCAGCATCTGTCACTGTGATCAGTAGTCAAATTCCTTTCTCATCTCCAC  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCATCTGTCACTGTGATCAGTAGTCAAATTCCTTTCTCATCTCCAC  394

seq1  ATCAGGGAAATAACTCATTATTTACAGAGTCATCACGCAAGTGATCTGCA  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGGAAATAACTCATTATTTACAGAGTCATCACGCAAGTGATCTGCA  444

seq1  AAAGATGAGTTTCCATGCCATTCCATGTTTAGATACTTAGCAGAAGTCAC  484
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGAGTTTCCATGCCATTCCATGTTTAGATACTTAGCAGAAGTCAC  494

seq1  CTCAATTGTGACAGCTTGTTTTGGTTAGAGAGTTTGACTTAGGCACAGTT  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATTGTGACAGCTTGTTTTGGTTAGAGAGTTTGACTTAGGCACAGTT  544

seq1  GAACAGTCATGAGAATGTGCCCCCTCCCACACCCCATGTGTGTGTGTGTG  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTCATGAGAATGTGCCCCCTCCCACACCCCATGTGTGTGTGTGTG  594

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCACGACATGATATGTTGAGAGTCAGA  634
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCACGACATGATATGTTGAGAGTCAGA  644

seq1  AGTTGTATGCACCTTTGTAATTGCACAGGATGGCCAGAACAGGATGGTAG  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTATGCACCTTTGTAATTGCACAGGATGGCCAGAACAGGATGGTAG  694

seq1  GTGTCTTCTATAGCCCTCCATCTTCTTGCTTTGTTTGAGTCAATGTCACT  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTCTATAGCCCTCCATCTTCTTGCTTTGTTTGAGTCAATGTCACT  744

seq1  CACTGTACAAGAAGTTCACACTTTCAGCATAGTTCGCTGACCAGGGATCA  784
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTACAAGAAGTTCACACTTTCAGCATAGTTCGCTGACCAGGGATCA  794

seq1  CTGAGGATCTGCCTGTCTCTGATCCTTAGTACTGGGGTTATACTGGCTGT  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGATCTGCCTGTCTCTGATCCTTAGTACTGGGGTTATACTGGCTGT  844

seq1  CAAACCTTAGTTTGGACTTCAGGAAAGCTTTGTCAGAGTCCAGATGATTT  884
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCTTAGTTTGGACTTCAGGAAAGCTTTGTCAGAGTCCAGATGATTT  894

seq1  TGTCTGAGCATTTGCAGCCATGGCAGGCTTTTTCCATAGTGTCAAGGCAG  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGAGCATTTGCAGCCATGGCAGGCTTTTTCCATAGTGTCAAGGCAG  944

seq1  CAAACTCTGTTTCTCCTGCTTGCAAACCAAGTGGTCTTATCCACCTAGCC  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCTGTTTCTCCTGCTTGCAAACCAAGTGGTCTTATCCACCTAGCC  994

seq1  ATCTTCCTAGTCCCTTCATTACTTTATTGATATATGTCCCTGTTAGCATC  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCCTAGTCCCTTCATTACTTTATTGATATATGTCCCTGTTAGCATC  1044

seq1  CCCAGGACTTTATCACCCCTGCTTCTATAGACAAGTTAAATGGCTGATTG  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGACTTTATCACCCCTGCTTCTATAGACAAGTTAAATGGCTGATTG  1094

seq1  AAGTAGAGAGCTATACAAAACCAAAGCCATGATTTGAATTC  1125
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGAGAGCTATACAAAACCAAAGCCATGATTTGAATTC  1135


seq1: chr12_14060019_14061138
seq2: B6Ng01-337H11.g_65_1191

seq1  GAATTCTCCATTGAGGAATCTTGAATGGCTAAGAAGAGGAACATTCTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATTGAGGAATCTTGAATGGCTAAGAAGAGGAACATTCTTCC  50

seq1  ATTACTGAGGGAGTGGAGGGATTCGTGGAGTGGAGACTGGGAACGGAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTGAGGGAGTGGAGGGATTCGTGGAGTGGAGACTGGGAACGGAGCT  100

seq1  AACATTTGAAATGTAACAAATAAAATGGTTAATAAAAAATTTTCAAGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTGAAATGTAACAAATAAAATGGTTAATAAAAAATTTTCAAGCTA  150

seq1  GTCAATCCATAAAATTAAACATTGAGATAGAAAGATTCCCCAAGTCCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATCCATAAAATTAAACATTGAGATAGAAAGATTCCCCAAGTCCACA  200

seq1  CGGTGAAATATATGGACCAAGACTCATATGAATGGTAGGGAGATGCTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGAAATATATGGACCAAGACTCATATGAATGGTAGGGAGATGCTCTG  250

seq1  AAAGTGTGCTGTGTAAAAGAGATGGTTCATATGAGAAGGCAGTGGGTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGCTGTGTAAAAGAGATGGTTCATATGAGAAGGCAGTGGGTATT  300

seq1  GGGCAAGGACTTTCAGTTTGGCTGAGTCTCTGAGTCTAAGAGAAACAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGGACTTTCAGTTTGGCTGAGTCTCTGAGTCTAAGAGAAACAGCC  350

seq1  TCTTAGTTATTCTCTTGGCTTTCCTAAATTAACTTCATCGTTTTCTCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGTTATTCTCTTGGCTTTCCTAAATTAACTTCATCGTTTTCTCAGC  400

seq1  ATAACTAAGGTCTGAATTTTGCTGTGGAAAGTTATGGATGGTAGTAGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTAAGGTCTGAATTTTGCTGTGGAAAGTTATGGATGGTAGTAGCAG  450

seq1  CCCTCTCTCCTTTCCAGGATGCTATTGGACATTAGTGACTGAGGAAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCTCCTTTCCAGGATGCTATTGGACATTAGTGACTGAGGAAGAAG  500

seq1  GAACACAAATGCCGCCTCAGGGCTACAGGGAAAAGACTGGGGGCCTCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACAAATGCCGCCTCAGGGCTACAGGGAAAAGACTGGGGGCCTCTTT  550

seq1  CTATAAGAAGCATTATTTTTGGAAGCTCCGAGGCATGATGGAGAGATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAGAAGCATTATTTTTGGAAGCTCCGAGGCATGATGGAGAGATAAA  600

seq1  TGTCTTGGAAAGTTAACAGCAGCACATCTATCACACTGGAAATATTTAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTGGAAAGTTAACAGCAGCACATCTATCACACTGGAAATATTTAGC  650

seq1  AACATAGGGAAATGGAGGCTACCCAAGCATCCTGAGTCTCATGTGTTCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGGGAAATGGAGGCTACCCAAGCATCCTGAGTCTCATGTGTTCAC  700

seq1  TGAAGTAACTTTAAATAGACACATTAAGCACAGAAGTCAGAATGCAGCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAACTTTAAATAGACACATTAAGCACAGAAGTCAGAATGCAGCAC  750

seq1  AACGTCATTTTGCCCGCAATGCTGGGTATAAAATGCCAGGACCTCCATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTCATTTTGCCCGCAATGCTGGGTATAAAATGCCAGGACCTCCATTG  800

seq1  GGAGCTTTAGATGTCTGGGGACAACTGGGGACATCTTTGTAACATTCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTAGATGTCTGGGGACAACTGGGGACATCTTTGTAACATTCCTC  850

seq1  TCATCTTGGACTCAAAATAGTTCAAAGCCTCATTGCAGCACTGTCCCAT-  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCATCTTGGACTCAAAATAGTTCAAAGCCTCATTGCAGCACTGTCCCATA  900

seq1  AAAATACTGAACAATTAAACCATGACTTTGGGTTGTTGTTTAATATGTTG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAAATACTGAACAATTAAACCATGACTTTGGGTTGTTG-TTAATATGTTG  949

seq1  GCAATGATCACTACCTAAGCCTTCAAAAAGAA-CCTAAAGTGGGAAAATT  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCAATGATCACTACCTAAGCCTTCAAAAAGAACCCTAAAGTGGGAAAATT  999

seq1  AAATTCAAAAT-ATCTATGTACGTCTGTGTTTGCTTA-TGAGTCTGCCTA  1046
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATTCAAAATAATCTATGTACGTCTGTGTTTGCTTATTGAGTCTGCCTA  1049

seq1  TA-TTTCTACACAGCCTAA-CATGTATATGATAATCAG-ACT-GTAGAGC  1092
      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||
seq2  TATTTTCTACACAGCCTAACCATGTATATGATAATCAGAACTGGTAGAGC  1099

seq1  AGGGGATCTCACATTCATGACAAAGAAA  1120
      |||| ||||||||||||||   ||||||
seq2  AGGGCATCTCACATTCATGGACAAGAAA  1127


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |