BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-045E01.T7 (MSMg01no045_e01.b1) | MSMg01-045E01.TJ (MSMg01no045_e01.g1) |
ACC | AG275931 | AG275932 |
length | 666 | 685 |
length of high quality (start - end) | 385 (30 - 414) | 309 (72 - 380) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no045_e01.b1 PHD_FILE: MSMg01no045_e01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:05:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no045_e01.g1 PHD_FILE: MSMg01no045_e01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:05:10 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TGCGCCGCTAAACGACTCCTATACGGAGAGGATCCGCGGAATTCTTTCTT
TAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGCTATTTGTTTCTCTGGAGTCTAA
CTTCTTGAGTTCTTTGTACATATTGGATATGAGCCCTCTATGGGATGCAG
GATTAGTAAAGATCTTTTCCCAATCTGTTGGATGCCTTTTTGTCTTTGAC
AGTGTTCCTTGCCTTATAGAAGCTTTAAAATATTATGAGGTCCCTTTGTC
GATTCTTGATTTTACAACACAAGCCATTAGTGTTCTGTTCAGGTTTTTAC
ACTTCAAAAATCTTCAAAAACCTCAGTTTCTATTAAATAGTTACTGGCTT
CCTGGGAAAAGTGGCTTTTGCACAAGTCTGAAGTTCTGAGTTCAGATATG
CAGCCTGCATATAAAAGCTGGGTCTATAACCATAGTGCTAGTGAAGAGAC
CAGAGCCACTATGGTGCTTGCTGGCCCGATAATCTAACTGAAGAGATGAC
GGCAGGTACAGAAAAAGACTTGTCCTAAACAAATACTGGGAAAGCACTCC
GGGAAGACACTCCATATCAATTTCTCTAAAATTCCACTTAATGGCCCTTA
ATGGGGACAGCTCCCGAACCTATATGCTTAACCTTACACCCACTGGTCCT
ATAACACCATATGGCT
| ATGAAGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAAAATTATATTAGTAATTATTAAGCTT
TTTTTATAATAGAACTGCCATTAAGTCCTTTCTGATGTCAAAACTTCAAT
GAGAACTCTTCCAGTCTTCAAGTGTCACTAAATAGTTGCTTCTGAGGTAG
AAAGCAGGCATTTACAACTTACAGCACATTCTAAACATTTATAAAACCAT
TAACCAAAGGTCATAAAAAGGAAACTAAGGATTTATTGTACGTGCAAGGA
CAGAAGATAAAAGATTGACTGAGCTTATCTATACCAAGCTTTAATAATAA
CTTAGTTATGGTCTTTAACTCTCCATGGAACTGTAGAGCTAGTAACAGAT
AATGAATGCTTAACCTTAATGGATATATACGTAAACATTTCTTCCGTAAA
CATCTTATTCAACTTCTAATTTGAACATACGTTCGAACTTATAGTTTACT
TATATAAAACAGGAAGCTTGAAAAATGCATGTGATCCATACATATAGAGG
ATCTAGATTCCTCCTACAAGGTACCCAAGCTAGGATCCACATCTGAGATA
TGCTAGAATACCCTCACTGGGCGCCCCTATACCGATTACCCGCAACGATC
CCTTACCGCACCAATCCACTGGCCAATAGATGCAG
|
quality values | Open.Hide. 9 12 9 9 9 11 17 15 10 8 8 8 12 12 15 21 9 10 10 10 16 11 11 11 11 11 11 25 22 19 27 29 25 28 28 41 48 50 36 36 36 38 42 50 57 57 57 57 57 43
40 24 24 29 43 43 57 57 68 68 68 54 47 42 42 42 51 68 68 68 68 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 48 48 48 48 48 50 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 68 50 50 50 50 50 50 57 50
50 50 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 57 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 50 50 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 48 57 59 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 48
48 48 47 39 39 39 39 39 48 41 47 47 37 37 37 37 31 32 37 37 37 37 39 39 39 41 41 59 47 47 47 41 41 41 37 37 37 37 37 37 37 37 41 41 44 37 41 34 34 32
24 23 34 28 41 44 41 36 39 39 39 38 37 37 41 59 59 59 59 36 30 16 12 11 16 18 32 47 41 19 19 15 17 15 15 39 39 47 41 41 29 26 31 17 18 17 25 24 28 24
24 13 16 16 14 18 24 30 30 37 24 24 22 18 21 14 16 18 23 14 19 12 14 14 19 24 35 31 32 23 20 16 12 10 10 10 15 24 28 28 20 21 10 10 10 10 14 11 10 10
10 10 10 8 8 8 8 8 11 11 11 17 13 16 12 12 12 8 8 8 11 11 15 10 10 10 10 10 10 11 9 9 9 11 13 11 20 24 28 21 24 14 14 12 13 12 14 13 9 9
9 9 12 18 12 12 11 13 12 12 10 8 8 8 8 8 8 11 15 13 15 11 9 8 8 8 8 8 11 13 7 7 6 6 6 10 8 8 8 14 12 10 9 10 10 8 8 8 8 8
8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 12 15 12 17 12 11 13 11 9 9 10 8 8 8 10 10 11 9 9 10 10 10 10 10 11
10 9 9 9 9 9 10 11 12 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 9 6 8 6 6 9 7 8 10 13 9 9 10 13 17 12 8
8 7 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 11 9 9 | Open.Hide.12 15 13 9 9 8 10 6 6 6 8 11 12 14 11 14 10 10 10 13 21 18 11 18 18 21 16 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 15 17 18 20 20 37 37 33 36 33 33 28 34
30 35 35 53 23 27 9 9 12 10 16 11 15 15 15 13 16 24 23 42 30 28 28 18 32 34 57 68 57 57 54 54 44 44 30 30 30 37 44 57 57 57 57 59 30 30 17 17 17 32
41 59 68 68 68 68 68 68 43 43 28 28 22 34 29 33 24 29 17 19 19 30 28 37 37 28 33 37 43 43 42 42 42 36 36 36 37 37 36 36 36 37 37 29 23 19 14 14 19 22
39 36 39 34 32 32 40 43 43 43 43 39 39 39 43 43 28 28 13 13 13 28 30 40 37 25 25 25 37 40 43 48 48 43 39 37 34 32 33 43 43 43 36 37 31 28 20 20 20 23
34 43 39 43 28 26 13 13 18 18 28 34 37 37 30 30 31 32 22 21 10 10 10 15 15 30 24 24 30 37 28 32 28 37 37 39 39 39 39 48 48 59 43 43 33 39 32 32 43 43
43 40 28 19 19 18 18 29 30 29 28 28 29 37 42 47 47 43 47 47 47 47 39 39 35 28 32 23 23 32 32 32 35 37 37 34 34 19 15 12 12 12 24 25 27 27 25 30 36 39
32 36 29 31 34 31 33 40 25 30 18 16 16 19 19 23 32 32 35 26 30 22 29 28 37 37 37 37 37 37 23 24 15 10 10 12 15 16 33 33 37 41 48 48 48 48 39 39 35 35
35 28 28 17 25 15 15 24 28 29 33 25 24 25 31 31 43 43 43 43 46 36 36 28 28 21 18 18 14 18 18 31 22 21 13 13 18 23 15 18 15 19 19 28 28 32 23 22 24 24
24 22 25 28 28 31 30 30 30 22 28 16 16 11 14 18 28 30 37 37 37 30 30 30 30 30 37 37 39 39 35 32 30 26 18 18 18 19 32 30 25 21 16 12 12 9 13 13 28 24
30 30 30 33 36 43 43 47 32 32 13 12 11 16 11 11 11 11 26 28 34 18 23 23 25 25 36 25 18 11 10 8 8 8 10 15 18 12 16 18 15 9 8 8 8 8 8 18 24 29
32 21 21 14 14 14 15 10 19 22 18 12 12 21 22 12 10 10 16 10 11 11 10 10 14 10 11 11 10 12 12 12 19 19 19 8 8 8 8 8 8 8 13 10 13 10 15 15 9 8
8 8 10 10 10 13 19 21 15 12 10 10 9 6 6 6 6 6 8 8 10 11 11 8 8 8 8 9 8 10 10 10 9 9 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 7 9 9 11 10
10 13 13 14 10 8 8 8 7 12 10 8 8 8 8 10 11 13 10 10 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 10 10 10 11 11 8 8 6 6 8 10 9
12 13 10 12 13 11 8 8 8 10 8 9 8 8 6 8 6 6 9 10 10 10 13 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 |