BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049E14.T7 (MSMg01no049_e14.b1) | MSMg01-049E14.TJ (MSMg01no049_e14.g1) |
ACC | AG278795 | AG278796 |
length | 1,307 | 1,278 |
length of high quality (start - end) | 289 (123 - 411) | 533 (77 - 609) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_e14.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_e14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_e14.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_e14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATCCTCTNNTTTACATTGGCCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGC
GGAATTCTTTTGCATATTAAAAGACCTTGAATGCTTGTGTCTCCTAAGAA
TTAAGAAGCTGACTCCTGTCGAACACCCGCAAGGACCCACACAGGATCCA
CCACGGGATCCTAAGACCTCTGGTGAGTGGAACACAGCACCTGCTACAAT
CCAATCGTGCAGGACCTGAGACTGCATTAATTAAGGAAGCAGGTAACCCG
GCCTGATACGGGGCTCAAGTCCCTTCCGGCTGGCCCACTGCAGCACCGAG
GTCCCTGGCCCGGGGAGTCTGTGGACACCCGCAAGAACCCACACAGGATC
TGCCAAGGGATCCTAAGTCCTAAGATCCTAAGTTGTGGTGAGTGGAATAG
AACTTCTGCCATGAGGCAGGTTCAAACACCAGATATCTGGGCACCTTCCC
TGCAAGAAGAGAGCTTGCATGCAGAGAGTACTCTGACACTGACACTAAGG
ATAGAGCTAGTCTCCCAGGTCTGCTGATAGAGGCTAACATAATCCCCCGA
GGAACAAGCTCTAACCAGAGACAACTATCACAACTAGCTCCAGAGAATAC
AAGATGTCAAAAGGCAAACATAAGAATCCTACTAACAGAAATCAAGACCG
CTCACCATCATCAGAACACAGCACTCCCACACCACCTAGTCCTGGCCACC
CCAACACAACCAAAAAGCTAGCACCCAGATTTACAAGCATCTCTCATGAT
CATGGTAGAGGACATCAAGAAGGACTTTATCAACTCACTTAAAGAACTAC
AGGAGAACACTGCTAAAGAGTTACAAGTCCTTTAAAGAAAAACCGGTAAA
ACACAACCCAACAGGTGATGGAAATGAACAAAACCCTTCCTTAAACCAAA
AAAGGGAAATTAGACCCTTTTATATAAACACCCCAAGTGAAGTTAACCCT
GGAAATAAAAATCCCTAAGGAAAAAAATCTGGAAACCATAGAATCCTAAG
CTTCTGCTTCTAAATCTAATAGAAGGTAAAAAAAAACTCTCAGTTACCGT
AAAATTCCTTTAAAGAACAATCCCCCTAACTATTTAAAAAAAATGGGAAA
ATGCAAAAAAAAATCTTATACTCCTAAATATTCCCGGAAAATCCCGGAAC
ACATGTTGAATATAATCCAACTCTTTTCTATAAATTTTAATGGTGGTGAA
TAATGCAAATATTCTCTCCTCTTTAAAGGTGGCCCCCAAAATCTTTCTTC
TCCTATATATTTATTAGCAATAAATACTTTTCCCAACATCTCAGATAAAC
GCTGACT
| TTTTTAACTATGGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTTAGTTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTGAGACCCGGTTTCTCCTCTGTCCAACAGCTCTGGCTCTGTAAACCAG
GCTGGGCTCAAATTCACAGAGATCCACCTGCCTTTGCCTCCCAAGTGCTG
GGACTAGAGGTATGTACCACCACCACCTCGCCATTTACTTTTTTAATTGA
TGTTTAAATTTTTTCACCGTTGGCCAAAGGATGTAAGTTTCTGTGTTCCT
TACACTTTCTTGTTCTTGTGAACAGATTCCTTGTTTGTGACACGTGATAG
CCCTTGCTTATCTTGTGTGTACCTTGTGTCAGCCTTTAATGAGACACTCA
TTTTCCCAGCCCTGGCTTCTATTATTTGAAACTAGCTTTAAAAAAATATC
CGAATGGAAGACTTGTCAGATGTTATTTATAGTAATAATACATCCTATCG
ATCTACTTTTCCAAGACTAACATTAGAAACATAAATTTGTGCAACAAATA
AAACTCCAATTTCTGATTTTATTTTTAAACTCACTTTTATATTATTTATG
GAAATCCACTACACTGCTCATATCTAAAATTAGGTTACTATCGACATGCC
AATACTTCTTTTCTTCCAGATGGTACAATTCACATTAAAAATTTCCAAGT
TCTGAAATAAAGAATATTAATAAACTCTTTAGCGTTTTCATATTACTTCA
CATACCCATATTAATCCCCTCAAATCTGTTACAGTCACAAACTCTGAAAC
ACTTTGGAACTGTGATTTGATGTGAAACCTGGAAATTCATGTTTTTCCTC
TTCCCTTGGTTAAAGGACTATAACCTCATATGTAAGCCAAACTCTTGCGG
AAACATGCATGGCATTTTTAAAAAATTTATCATACAAATGGTATTGGAAA
AAAATTTCCGAAGGAAGCTCTTATAAACTGTGTTTTATGAAATATAATAT
CCGGAATTTGTTTACCCCCCCCACCAATCAAATTATATATATTTTGCGCA
CAGGTTAGTTTCTGTACAAATAATAAATATTATTTCAATTCTCCTCTTCA
CATCATTCCCTATNATTCATTCTCTTCTATCAACTCTTCTTAAGTATATA
TCCTTAACTTTACATAATAATAATTTGATTAATTTATACTAATAATTCAA
TATTAATATAATTATAATGTACAATTTATCTTATCAATATATATCTAACC
ATTATCATATGTTATTATTCTGCATCAG
|
quality values | Open.Hide.11 11 12 9 11 9 3 0 0 3 9 8 8 6 7 15 7 6 8 8 8 13 8 8 8 8 8 15 19 20 20 15 12 8 8 8 15 19 26 14 19 16 22 22 29 43 47 47 43 43
43 43 43 43 43 48 48 48 50 34 24 12 11 11 26 26 37 37 37 23 23 10 9 9 9 11 11 13 12 12 9 9 11 18 17 20 17 24 28 29 31 36 47 53 53 53 50 50 57 47
47 57 57 48 48 48 37 33 33 33 33 33 18 17 11 11 11 9 9 11 11 11 11 23 23 43 43 43 43 43 46 47 47 47 50 50 53 57 57 57 57 59 57 57 48 54 57 57 59 57
57 57 57 43 43 39 36 35 43 42 47 42 42 32 37 41 44 44 57 57 57 57 47 46 57 46 44 44 46 46 54 59 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57
57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 68 68 57 57 52 52 52 57 59 57 54 54 52 57 57 68 68 57 57 57 52 52 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 52 52 57 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 43 43 43 57 57 57 57 57 59 43 43 43 52 57 57 59 57 52
52 52 52 57 57 50 43 43 43 43 59 59 54 52 52 43 46 47 57 57 57 57 57 54 50 50 48 48 57 48 48 48 47 44 42 42 42 37 42 37 42 42 44 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 54 54 47 57 43 43 43 48 44 48 47 43 43 43 47 47 48 47 46 40 40 39 43 43 48 47 47 43 47 47 47 43 46 47 43 40 40 43 43 43 40 31 32 16 16 16 29
32 44 44 42 47 47 59 26 21 10 10 10 10 10 12 12 23 25 28 12 13 12 30 30 59 59 59 59 59 43 37 37 37 43 43 59 59 37 34 28 29 29 39 42 48 48 57 59 59 57
48 43 43 43 43 32 32 30 30 28 32 23 30 30 44 44 39 35 35 32 32 32 31 30 28 36 28 37 37 43 44 44 57 57 57 44 37 37 44 57 57 48 48 48 47 50 43 35 35 43
50 27 32 12 12 12 32 38 50 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 43 43 43 38 38 50 50 57 57 37 37 37 52 52 57 52 52 43 43 23 25 23 22 23 20 20 20 38 32 43 43
57 57 43 43 37 37 37 39 44 44 59 57 47 46 42 42 35 42 42 37 32 37 37 39 39 32 32 15 15 12 21 21 37 36 41 30 28 28 40 44 43 37 43 37 37 37 44 44 44 30
30 30 30 37 37 26 26 24 16 14 23 26 29 28 33 33 39 39 35 35 29 23 18 9 9 11 22 24 35 39 47 34 41 22 19 19 24 24 19 13 13 18 25 24 25 25 18 22 11 11
11 12 16 28 28 35 37 35 35 31 28 28 30 32 25 25 30 33 32 31 35 30 35 39 43 43 39 39 35 35 35 39 39 28 28 16 13 10 12 12 19 21 30 23 15 15 12 21 21 34
32 37 36 33 28 34 32 36 28 25 22 14 13 16 16 19 15 15 13 19 15 21 20 23 21 18 14 22 10 15 15 8 8 6 8 8 8 10 10 9 11 11 22 23 29 34 22 19 11 8
8 8 15 11 24 28 24 24 14 12 12 17 18 18 25 17 9 8 8 8 10 10 15 14 14 16 16 17 12 10 10 10 10 10 11 8 9 8 8 8 8 8 13 12 10 7 7 8 8 10
10 8 13 10 10 10 15 15 15 14 13 9 9 10 12 9 9 9 10 11 11 11 11 11 21 19 21 19 18 18 23 28 30 18 14 10 10 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 13 13
12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 11 10 9 10 11 15 13 12 13 14 22 19 18 16 14 14 14 16 22 12 12 10 10 10 10 8 12 12 10 10 8 8 8 8 11
14 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 8 8 10 10 11 16 16 30 26 26 21 15 12 11 12 12 11 13 10 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8
9 8 8 8 10 10 8 11 10 10 10 10 8 9 11 10 8 8 9 10 11 11 13 14 14 12 12 10 10 10 10 10 10 16 10 10 10 8 8 8 11 11 13 10 8 8 8 6 6 8
8 8 10 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 10 12 11 11 10 10 8 8 11 10 10 10 13 16 13 18 8 8 8 9 8 8 10 9 9 9 9 10 8 6 6 6
6 8 6 10 15 10 12 9 9 9 9 11 12 11 11 6 8 6 6 8 10 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 9 10 15 16 18 19 34 30 22 15 12 12 11 10 12
10 11 11 11 9 9 9 10 10 10 12 12 10 10 10 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 11 11 8 8 6 6 7 7 8 6 8 8 8 11 11 12 12 13 11 9 9 9 9 9 9
9 10 10 10 11 11 12 10 9 9 9 9 9 7 6 6 6 6 6 10 8 6 6 10 8 10 10 10 9 10 10 9 10 10 10 10 10 11 11 11 11 11 10 8 7 8 7 8 8 6
6 6 8 10 10 9 9 11 11 6 6 8 6 7 6 8 8 8 8 8 9 9 10 9 7 7 7 7 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 10 6 8 8 9 10
15 10 10 10 10 15 11 11 10 13 12 9 9 9 9 7 8 8 8 7 7 6 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 12 10 13 6 6 6 7 10 10 6 6
6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 8 9 6 6 6 6 7 7 7 9 10 10 8 6 6 6 6 9 9 13 8 8 9 8 11 9 14 11 15 8 9 10 19 21 30 18 18 32 34 36 36 50 50 37 37 43 39
39 39 39 57 36 36 33 33 33 33 46 39 23 15 9 9 9 9 9 17 13 10 10 10 10 13 21 25 28 28 34 37 48 48 48 48 48 48 47 47 46 48 48 59 57 59 59 59 59 59
59 59 34 34 23 16 16 14 14 10 12 12 16 16 25 25 29 29 22 22 17 24 13 13 13 16 16 23 24 25 28 28 25 40 34 34 19 23 12 23 23 24 24 19 19 20 31 31 28 28
30 37 37 39 35 42 39 43 43 48 48 42 44 37 28 25 36 26 26 17 17 17 32 32 43 39 39 39 42 37 37 37 46 57 44 39 39 46 46 48 57 57 44 43 32 33 33 43 35 43
32 43 35 38 38 13 13 13 38 27 43 43 43 43 43 43 52 52 52 52 52 52 54 54 52 52 50 47 41 35 35 43 44 52 57 57 52 52 52 59 59 57 52 52 52 52 52 43 43 33
33 23 23 23 43 43 57 52 52 52 59 59 57 57 52 52 43 43 35 35 35 44 43 57 39 43 43 35 33 43 24 28 14 14 14 38 38 52 62 62 43 43 26 26 26 43 43 62 62 62
62 43 39 39 43 62 62 62 62 43 43 26 27 27 44 43 43 31 31 31 44 43 43 35 35 31 35 35 62 62 43 43 31 31 27 44 27 31 31 43 43 52 57 52 52 52 43 43 31 31
31 44 43 57 43 39 39 35 43 35 35 35 27 32 17 18 18 38 27 39 39 44 43 36 36 17 17 17 34 34 23 23 23 43 44 57 57 57 52 32 32 20 20 20 36 32 35 38 31 31
18 21 11 11 11 16 27 27 43 52 27 27 12 11 11 27 27 57 43 43 28 43 36 37 37 42 43 44 44 50 57 47 47 43 43 44 44 47 48 48 48 59 59 57 57 44 43 43 36 41
28 25 25 40 40 48 32 34 17 12 12 12 12 16 12 12 15 19 21 14 30 23 39 39 46 46 46 48 43 30 30 20 28 28 42 42 48 27 29 13 13 12 23 11 12 12 15 15 20 24
32 39 39 37 43 39 46 40 59 34 34 23 20 13 23 12 15 15 28 28 36 31 23 22 11 11 12 23 24 37 37 33 31 31 34 33 26 24 10 10 9 14 17 23 23 37 34 32 23 25
24 31 31 25 28 20 16 14 14 14 14 24 29 41 39 27 24 15 14 14 18 18 11 12 11 24 24 47 47 42 42 35 42 42 43 42 47 42 35 35 32 24 22 17 19 19 21 24 28 41
41 43 23 21 10 10 10 13 10 18 13 19 11 11 11 11 11 11 23 21 32 28 28 23 23 23 32 32 43 32 32 23 21 21 12 12 18 28 28 39 37 24 21 21 21 21 24 16 16 16
14 12 18 28 35 35 36 33 33 25 22 11 10 10 17 17 17 18 22 18 18 15 12 13 10 10 12 23 23 15 15 15 16 18 18 20 10 11 10 12 12 12 12 21 21 19 10 11 13 13
10 10 12 10 10 19 19 10 10 12 15 15 24 26 26 28 24 23 30 17 16 9 8 10 8 10 14 28 32 30 22 12 11 10 8 9 13 19 12 14 12 14 16 21 11 11 11 15 21 22
19 12 10 7 6 6 6 10 9 12 10 10 11 10 10 23 15 16 18 14 12 10 8 8 11 11 12 16 16 19 21 19 19 12 14 14 17 17 16 9 10 8 8 8 10 10 8 10 9 10
9 9 8 8 11 8 8 10 10 10 9 12 11 10 10 15 17 14 15 13 12 13 11 10 8 8 8 8 10 10 14 14 14 22 17 17 18 16 16 15 12 12 10 8 8 8 7 15 6 6
6 8 8 8 8 12 10 9 9 9 9 11 14 12 12 12 12 16 10 10 10 10 10 13 12 12 11 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10
17 10 10 10 10 10 10 10 11 8 9 8 8 8 8 15 15 30 15 14 14 14 13 14 9 9 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 6 8 11 8 8 8 10 9
9 14 9 10 9 19 15 15 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 10 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 11 8 10 8 10 9 9 11 12 9 7 8
8 8 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 19 12 15 11 9 9 9 9 12 12 15 12 12 8 8 6 6 11 8 10 9 8 8 10 13 10 8 10 8 6 7 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 11 8 8 6 6 8 10 12 10 8 8 8 8 13 16 15 15 9 9 10 9 9 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 12 9 9 12 11 11 3 0 3 8 10 8 8 9 10 10 10 9 10 11 11 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 10
10 8 8 9 8 8 10 10 8 8 6 8 6 6 6 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 10 13 8 8 6 6 8 6 8 10 9 9 9 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 12 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 8 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8
6 6 7 6 8 6 8 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 8 7 6 6 6 6 8 8 8 6 |