BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049H24.T7 (MSMg01no049_h24.b1) | MSMg01-049H24.TJ (MSMg01no049_h24.g1) |
ACC | AG278928 | AG278929 |
length | 1,286 | 1,286 |
length of high quality (start - end) | 77 (184 - 260) | 367 (78 - 444) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h24.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_h24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h24.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_h24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTTTC
CAAAGTTTCACATCCTTAAAACATTTAATCATCTCATTGTCCAGCCGTTA
TTACCTTTTTGTATTTGCCGGGGTTGTAGAGATGGCTCTGTGGTTAAGAG
CACTGACTGCTCTTCCAGAACCGCTGCGTTTAATTCCCAGCTCCCACACC
GTGGATCACCCCATCTCTAACTTGCGTTCCAGGAGACTGCATGCCCTTCT
TCTGGCCTTCATCGGCACTGCATGCATATGCCGCGCTGACACATATGCAG
GCCAAAATTACAGATTAATTTTCCTTCATAAGTCCTTACATAAGCCCGTC
AGGAACAAATGAAATGTTCTTCCACCCATCCTTCTACTTCTGATAGCTGT
TACTATTAAATTTTATTCTTTAGAATTATTTTCAAGACTGTTTACAACCA
TTTCTGATTTTAGTACAGAGGGAGGGTCCCATAGTGAAATGCTCTGCATT
ACAGTAGCTCTGATTCTGGTAGAGCTGCATATACATAAGGACATATTTGG
CTAAGAGCCCAGTGTCACCACATGATTCCCTTATGTCTCATGAGCACTGC
AGTCTGATAGCAGTTTTCTGTTGAATTCAACACTGTTGCGTTTGAAAGTC
TCATAGTTCTATGTGAGACTTCACCGTTGTTGCTTCAAAGACCACCTCAC
TTTTCATCCTGGATTTTTCAGGTTCAGCATTTCCTCTGTGTCTTATGTTA
GTTACAAAACTCGGTACTTCCAAATTTATTTTTTAATTTTTTTTTGAACT
ATTCCCACATTTAATAACTACTTGCTTTTTAACTTTTTTTATTTCTTCTA
TTACTAATATCCATCCTCTATTTCACCATACTGTTTTCGGGTTCATTCCC
CTCTTTATTTTTCTATAATCTTTTATAATTTAACATCTTTTTACTTCCCT
TTATTCTTCTCTCTTCTATCGTTTGAAATTATTGCCGCTTCCTCTTTTAT
TCTTTTGCTCGTTCCTTATTTTTATTCCCTATTCCTTTACGTTTTTCCCT
CTTCTTTTTTATTTCCTCCTTTATCTCTTTCTCTCTTATCTCCTTTTATT
ATTTACCTCGTCTGTAGATTTTCTCTTTTCTTTTATTACTTTCGTATCAT
TTCTTTATATATCTCATGTACTACTTTTAATTTATCCTACTTATTTACCC
TCACTACCCTTACTCTATCTTTACTATGTACTCTTATCTCTCTCTTACTA
TATTGTTACANTCTTATACTTCTCCTTCCCGTCTTG
| NTTAACAGTGGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAATTCCTTTCATCTTTAACTTTGGCAAATA
GGAATTGCATTTATCTACCACCCCTTGAGTATTACATTCCTTTATTTAAC
AATTTATTTATTTACATATATTGAAATATTTATCATTTCATACATGATTA
GCCTGTCATTTATACCTTTTGGCGATTAATTTGCAATCATTTACTTATTC
TCAGTCATTAAAGATAGGAGTTTTTCCTCCCTAAACAGCCTACCTAGCAT
TTTTAGATCATAAAATCCTGCGATTATATTTAATGGTATTTTGTTTTCAG
ACCTGATATTAAAATATCTGCCCTAGACAGAAATTAAACTTGAGCAAGCG
ATTTCTCTGGAATTATTAACCTGGGATTGCTCTTAGCTTAATATTCCTTT
TGTGTATGTGTGTATGTTCACGGGGGAAGGGCATACTGACAATACTAATT
CAATTAGAAAACCCAATTTCGGCCTGTTGTTAAGAATTCTCAGGGCACAC
TTCATCCTTTTCTTTTGATAGACAATTCAGACAAAGGCCGTCTACTGTGT
TTATGTCTGTGCTGCACAGAATATGTATTAATTTCTGTATTCGTAGAGCC
GATACCAAACTCTTGATACTTTCTCTGTGTTCAGTAAATACGTGCAAGCT
ATGTTTAGCACTGTGCATTCAAGTCATGTAAAGAAAATTGTATTCTTGAC
CGAATACTGATAATGTGCTTGACTCACAAAAGTTCCTAATCCTTCATTAA
GACTCCCTCTACAGTTTAATTTTTGCTAGTCTTAAAGTCGATAAAAAACT
GGTTTCCCTTCTTTAATAACCCTGGTCGTTGTTATTTTGCGGTTTTACAT
TACCTCCTTCATATATTTCTCTATCTTATATATTATTCCCTTTTTTTATC
TGGAACGGTTTCCTGAATCTAAAATTGTATATTTCCCCATTTAGCTAAAA
ATTTCTATTATTCTTCTCTTCTAAAGAAATTCTCATTTTTTTATATAACT
CTTTGAACTATAACTTACCTTGTGTTTCTCTCTCCTTACATCACCTTATA
TTTACAATTCCATTCTTTTTCTTAGTTTATTTCCCCCCCCCAAAATACAN
TTATCGTTCACTCATTTCTCTCCTCATATCTTCTGACTACCCACATTTTC
TTCTAGCCCCTCTCGTGGTATTATATATAAACTATTGTCTCTATCCAANA
GATACATCTTCTCTATCTTTGTTCTCTCTATCATAC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 10 14 11 9 9 10 10 8 8 10 8 8 15 10 15 19 15 12 14 17 17 24 26 29 33 28 34 31 30 25 17 20 20 21 12 12 27 24 16 23 16 28 28 39 32 28 20
20 20 21 28 28 59 30 37 34 19 13 8 6 6 6 6 8 8 11 11 16 12 15 15 21 23 19 23 31 34 37 43 39 39 36 43 34 33 32 32 33 26 25 20 11 11 11 11 12 16
14 17 11 11 11 11 24 24 32 33 32 32 32 32 28 23 21 11 11 11 11 12 12 12 18 13 14 14 14 29 32 39 42 20 21 26 14 21 21 23 10 10 10 15 16 18 15 18 20 20
15 15 12 15 19 27 34 44 57 48 48 44 44 25 24 20 24 19 17 13 10 10 10 30 18 18 18 24 24 28 22 14 14 14 18 34 44 59 57 48 47 47 43 43 35 43 36 27 10 10
8 15 15 35 24 38 18 27 27 44 44 43 43 43 57 57 50 50 37 37 37 44 44 52 52 52 52 50 57 43 43 32 28 29 29 44 44 57 43 43 34 31 33 33 38 38 32 35 33 43
43 43 43 24 22 13 13 26 28 24 14 12 12 15 18 17 19 18 38 16 14 14 16 13 11 11 11 13 13 11 11 11 24 33 43 62 62 62 43 43 34 26 17 17 24 24 38 29 26 23
23 23 23 20 23 23 27 26 38 23 19 19 23 23 43 43 24 24 11 15 18 43 43 52 43 43 43 26 20 28 14 14 14 32 38 43 43 43 35 31 27 27 26 23 17 24 34 43 43 43
43 26 24 24 35 35 39 35 32 29 24 12 12 12 15 26 43 32 34 32 26 26 13 13 17 34 32 35 39 43 43 52 59 44 35 35 35 44 44 57 44 44 22 18 12 12 12 11 11 11
12 11 15 15 38 41 41 31 31 31 43 43 52 57 57 57 57 57 57 32 32 12 12 11 15 15 22 23 43 43 43 43 43 43 35 42 38 43 38 35 35 27 27 12 11 11 18 13 19 21
24 27 28 20 26 23 32 19 19 16 32 17 32 38 38 20 20 18 32 24 22 22 22 36 24 24 12 13 19 26 23 26 10 10 11 11 11 16 16 23 37 44 40 44 41 32 27 32 32 47
39 36 36 18 18 14 14 14 32 32 48 47 47 47 47 32 32 20 20 20 28 28 24 25 22 23 21 22 23 11 12 11 18 12 13 13 18 17 10 10 11 11 11 23 24 35 34 36 32 28
19 18 12 9 9 11 15 10 15 14 14 10 10 18 10 10 10 17 13 15 17 19 24 28 28 28 40 28 32 30 33 25 22 22 31 22 24 28 20 20 18 25 21 22 22 12 12 11 11 9
12 12 15 19 28 28 14 17 17 22 22 11 11 11 11 13 13 13 19 15 17 16 21 24 15 15 10 10 10 13 16 12 12 12 16 15 15 12 12 9 8 8 11 13 13 19 12 12 12 12
12 11 11 11 16 20 15 11 7 7 8 8 15 15 18 16 11 11 11 12 12 10 13 10 10 10 10 15 10 10 10 10 12 11 12 11 11 11 10 11 11 15 12 12 11 11 11 11 15 12
12 12 10 8 8 10 15 10 12 16 10 10 13 16 21 21 19 12 13 8 8 8 11 12 12 8 8 10 10 13 15 15 13 10 10 10 12 18 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 11 8 8 8 17 15 10 9 9 14 14 9 9 8 13 8 9 12 12 10 10 11 11 10 10 10 10 10 19 19 9 9 10 10 10 10
10 10 10 10 9 9 13 10 10 10 10 7 6 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 10 10 10 11 15 15 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 8 10 10 12 15 12 10 8 8 8
8 13 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 13 13 8 8 8 8 8 6 6 8 7 7 8 8 9 9 11 9 9 9 9 12 9 9 9 15 15 26 15
11 9 9 8 15 10 11 11 10 13 9 9 10 9 9 9 9 9 10 15 17 10 9 11 11 11 11 9 10 12 9 8 8 6 8 7 7 8 15 19 15 10 8 8 8 8 8 11 12 11
13 12 11 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 16 15 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10
9 10 13 16 9 9 8 8 8 10 12 10 11 9 9 8 8 8 8 10 8 8 7 8 10 10 13 13 12 10 10 9 6 8 6 7 10 8 8 8 6 6 10 8 9 9 9 9 8 8
6 6 8 10 19 22 20 9 12 9 7 8 8 8 8 11 8 10 10 8 10 6 6 8 8 10 12 9 10 9 9 9 13 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 7 6 8 8 9 12 13 13 15 14 10 10 9 9 8 8 11 12 12 8 8 7 9 9 8 8 8 8 10
10 7 6 8 8 11 8 8 6 6 10 8 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 7 10 8 11 11 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 13 7 7 6 10 8 10 8 9 9 9 14 9 9 9 9 8 11 8 7 8 8 9 8 8 6 6 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 6 7 7 6 8
8 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 8 8 6 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 10 15 11 9 9 13 8 10 8 11 8 9 9 9 12 9 8 8 8 8 9 10 10 15 17 10 10 10 20 21 24 33 36 32 34 31 32 32
32 32 39 30 39 37 37 26 30 28 23 23 9 9 11 11 8 8 8 8 9 10 16 19 25 23 23 12 22 24 35 35 30 35 32 35 37 37 36 23 25 20 11 11 16 27 34 37 37 30
30 25 23 12 11 9 9 9 9 10 17 23 28 30 30 27 17 15 11 11 11 11 10 12 16 34 30 30 28 33 33 33 32 30 17 17 20 32 32 39 30 28 28 28 33 28 24 20 20 19
24 25 25 36 31 42 42 42 48 48 42 42 43 42 47 47 32 36 31 37 39 46 46 48 48 39 32 28 23 20 25 28 36 37 48 48 32 32 18 17 13 24 13 19 18 36 30 30 24 13
13 28 32 44 32 32 32 32 32 43 43 44 30 25 11 11 11 24 24 30 18 14 14 14 18 24 28 43 43 52 59 50 52 52 59 52 52 52 57 52 52 52 43 43 43 52 37 43 43 22
19 18 19 18 27 27 34 34 34 14 14 14 16 18 23 20 18 16 16 20 34 43 57 57 57 57 57 57 59 57 43 43 35 31 31 35 43 35 35 35 47 43 57 57 57 47 62 43 43 24
24 31 44 44 52 52 45 52 43 62 43 43 35 35 15 15 10 10 10 10 11 13 14 26 26 35 35 35 35 57 44 39 28 28 34 38 35 43 44 43 43 43 35 35 35 43 43 44 35 35
35 42 42 44 44 43 43 39 36 34 18 18 20 20 44 44 52 52 57 43 43 39 43 32 18 12 12 12 15 24 32 23 27 27 28 41 27 31 31 43 44 44 41 38 20 23 19 18 12 12
13 18 21 38 41 43 43 43 27 27 29 32 35 43 43 43 43 32 32 32 44 32 20 15 24 14 27 27 39 42 37 37 24 32 18 30 37 32 32 20 18 18 15 19 12 10 10 10 12 10
17 13 19 21 24 15 24 15 17 15 23 20 20 23 34 32 43 43 43 40 32 24 20 20 18 15 12 20 16 11 11 11 12 12 17 24 26 28 20 20 17 17 17 22 11 11 11 24 17 15
8 8 8 12 16 15 12 12 20 12 17 22 30 32 35 30 21 27 13 13 11 13 15 23 32 30 25 24 25 28 24 27 20 20 20 32 32 48 46 32 30 12 11 10 10 10 21 19 27 23
28 19 28 28 37 37 39 39 39 34 34 43 43 43 39 37 37 24 24 20 23 23 31 23 28 28 24 26 16 16 9 9 9 10 16 22 12 11 11 11 17 20 19 19 24 30 25 39 35 24
24 24 24 28 31 24 28 37 23 23 14 23 24 21 21 15 20 20 19 15 10 10 10 19 11 14 15 28 30 30 30 28 32 28 21 18 11 11 12 13 14 12 12 12 12 12 12 11 11 11
9 9 11 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 15 22 25 33 25 28 28 39 37 37 18 18 9 9 9 18 18 25 19 15 14 10 10 10 12 16 16 10 10 8 10 8 8 8 8 11 12
19 15 14 9 8 8 8 9 11 12 12 12 12 12 10 13 10 10 10 10 9 9 9 9 9 11 11 10 9 8 8 8 10 9 13 12 11 9 9 8 8 8 8 8 11 16 13 12 10 10
10 8 8 8 10 10 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 19 24 24 22 21 12 12 12 12 13 12 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 13 13 10 12 12 12 12 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 9 12 11 11 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 10 10 11 11 12
8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 11 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 8 10 9 10 10 10 10 10 9 11 9 9 8 8
6 7 10 8 10 10 13 17 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 8 8 10 9 9 9 11 12 12
12 10 8 8 8 8 9 11 11 13 11 12 11 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 9 9 9 9 9 9 9 10 9 16 15 16 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 9 9 9 9
9 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 11 15 10 11 8 8 10 10 10 8 10 8 8 6 6
8 13 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 7 6 8 8 9 11 11 11
8 10 12 18 12 10 9 10 13 10 10 10 10 10 13 22 20 14 9 7 7 6 8 8 11 8 10 7 7 10 8 10 10 17 24 28 19 11 10 8 8 8 12 11 11 9 8 8 3 0
3 9 8 9 9 7 7 7 8 8 7 7 8 8 8 8 8 12 10 10 15 13 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 6 8 10 10 8 8 6 6 7 6 8 6 6 8 6 10 8
8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 10 8 8 9 13 12 12 10 10 10 10 10 9 9 9 12 10 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3
6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 9 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 |