BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-060M08.T7 (MSMg01no060_m08.b1) | MSMg01-060M08.TJ (MSMg01no060_m08.g1) |
ACC | AG287137 | AG287138 |
length | 715 | 727 |
length of high quality (start - end) | 117 (72 - 188) | 613 (74 - 686) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no060_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:03:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no060_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:03:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAAAATTTGCGGCGCTATACGACTCCTATTTCCAGAGATCCGCGGAATCA
TTATCTCCCCAACACATGGCGGCTCGTGCCTTTAATCAATAGTACTCAGG
AAGCAGAGGTGGATATCTCTGAATTCAAGGTCTGCCTGATTTATGGAGTC
CCAGGCCAGGCAGGACTCCACAGCGAGACTGTGTCTCACACAAGCAGACA
GATAGACAGACATACAGAATTCCTATCCAGCTGTGCTGAGGTCATTTGAG
GCAGCTGGCATCCCTGGCTGACTAGGTGAAGGTCCTCTGTAAAGACACAC
AGTCCATGGAAGCTCTTAGGAACATGACTATGTCTTGACTATGGAGACAG
GTTTTCTTGACCCCTCTGCGGGTTCCTCTGACACACAGCTAAACCTGTAC
AGTGGCCCAACCGCCCCTTCTGATATGTGGACCCCACGGGGCATACCGAA
GCTCTAGTGCGCCCTTAGCCACACACCGCCCGAGCCTTGCCCTTCTGAAC
CGCCTATTAATGAACGGCCTCTTTGTTCTCTGCCTCCTGCTTAACACCTT
GCCTTTGGTTCCATTTTGCACCCCTCTTCTCTTTTGCATTATCTCTCTCT
CCCCTCGACTACCCCTCACCCCTGCATCCTCACAACACCGCCACCGTGTT
ACCACGTGCCCCCTGTCTCAACTTTCACACCATCTCTACCTCGCGCTTAT
CGTTTTTCCACCTTG
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTAACAGTTAAAGAGTTGACTGATAA
CTTTATTACCTACATGTATAATATGCACATATAGATACATCTATTCATAT
ACATACACCACTTTTTATAATTACTTTTAGAAAAATCTATGATTCAGATT
TTTATCTAGAGAAAAATTATAAAAATTATTTCATTATAAAAAATAATAAA
TTCTAAAATATAATTATTCAAATAAATTATGCCATCAAAATCAGAAAAAA
AAACTTAGGGTATCTGTGAAGACATAGAGTGGCACCCAGCTCCCCTCATT
CTAACCTCAGTCTTGCTGTTAATCCCACGCTAGGAGACACATGTGTAAAT
AGCTTAGGCTGTGTGGCTGTCCGTCAGCCTTTCTGAATCTTTAAGGAGGA
CATGTCAGCAGAATTAGACAATGGTTTAGGTGCTTTAAGCTCAATGTCTT
TTTAATGCTATTTTAAACTTTCCTCCAAGACATTGAAATAATCTAAAATA
AAATGTTTCCGCTCCTTCAGAAGATACTTATATAAAAAACCTAAACATTA
CTTATAAGTGCCAAGATGAAAATGAGTTTTCTTGAGTATATTATCACAAT
CTATAAATTTGTTTGATACTTTTAAAAATCAGATTCCTGCTCAAATCTAT
TCAGTAGATTAGTCTGAGTATATTCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 9 12 12 12 18 12 10 10 14 19 16 19 14 14 14 19 24 23 19 13 12 12 15 15 7 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 13 16 32 32 34 27 22 17 17 17 14
14 15 15 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 14 20 18 15 11 11 11 26 27 20 32 28 37 37 43 41 43 43 47 47 30 30 21 21 21 29 32 42 42 31 37 32 32 30 30 43
42 48 41 41 29 29 26 21 23 15 14 12 16 11 11 16 19 40 40 46 42 37 32 21 22 24 28 36 36 30 29 16 24 24 42 42 33 33 30 33 37 42 42 48 42 42 42 43 43 39
40 39 32 28 28 34 23 32 26 34 23 23 28 28 37 39 37 37 31 31 22 23 11 11 11 22 22 16 16 16 27 24 30 33 37 19 14 10 9 9 9 9 9 10 14 28 25 15 12 12
12 22 22 22 22 23 23 23 19 23 12 11 11 11 18 19 23 24 33 36 40 40 28 28 28 32 32 15 15 17 26 26 20 20 20 31 32 39 31 30 27 27 19 19 19 28 29 32 25 17
13 14 14 13 13 10 10 10 10 10 18 26 40 24 24 13 18 11 11 18 12 12 12 12 12 12 15 15 19 15 18 18 16 11 13 13 19 19 13 12 15 21 19 15 19 15 15 15 15 11
11 19 22 33 34 30 28 20 20 15 15 11 10 11 11 11 21 16 23 20 29 16 16 11 12 18 24 32 39 40 40 28 28 19 25 24 28 28 37 37 28 21 13 13 13 13 14 15 12 10
8 8 8 8 8 8 9 9 10 16 32 34 39 25 23 9 8 7 8 8 10 12 15 19 19 28 28 25 19 13 9 8 8 8 8 8 12 15 14 14 11 11 11 17 11 11 11 17 19 15
15 12 21 12 12 12 16 11 11 10 10 9 9 9 12 9 13 10 12 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 13 12 13 10 10 10 10 10 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 9
11 11 20 15 12 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 12 9 8 8 8 8 8 10 15 23 23 19 12 9 9 9 9 9 9 11 8 8 9 8 8 8 8 8 11 10 8 10 12 12 11
10 10 10 10 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 10 10 9 10 9 9 9 8 10 13 10 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
9 11 13 13 13 12 12 12 12 8 13 9 10 12 12 10 11 11 13 13 10 9 9 9 9 9 18 15 21 15 12 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 10 13 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 10 10 10 10 13 13 10 8 8 8 8 6 7 8 8 9 8 8 8 8 8 12 11 7 6 8
8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 12 11 9 8 8 8 8 6 6 8 10 11 10 10 10 8 10 6 6 8 10 10 12 10 8 8 8 8 13 17 10 10 10 10 10 10 10 8 8
8 8 8 8 10 9 6 8 6 6 8 8 8 7 7 | Open.Hide.10 13 10 9 9 9 10 14 20 21 22 24 34 23 21 11 16 20 23 23 25 25 22 24 27 23 20 22 17 9 9 9 9 12 10 17 17 21 21 28 24 37 39 43 44 39 53 50 47 47
47 41 48 50 50 42 30 33 15 10 12 10 10 10 12 12 23 17 30 30 30 33 33 48 39 41 36 36 42 42 42 47 57 59 57 57 47 48 47 48 48 43 44 48 43 46 48 48 54 57
59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 48 48 57 41 41 44 47 54 57 57 57 39 39 37 32 28 40 42 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57 47 47 57 57 59
57 57 57 57 57 54 50 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 28 36 22 14 14 38 38 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62
62 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 45 45 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68
62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 44 39 39 39 43 44 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 62 62 44 44 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 45 43 43 39 62 62 62 59 52 52 62 52 52 62 52 52 54 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 62 62 62 62 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 52 52 43 44 35 35 20 38 35 43 39 35 35 42 44 35 35 43 44 57 52 52 57 57 57 45 52 52 44 44 57 57 57 59 59 57 57 57
57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 54 57 57 57 57 50 43 42 42 35 36 36 43 44 57 57 57 59 52 52 52 52 52 59 59 59 68 59 57 50 43 42 32 32 27 43 43 50 59
57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 43 44 44 48 48 48 42 42 30 30 42 44 57 54 54 57 57 59 57 57 57 57 48 44 35 35 37 35 44 43 54 54 54
43 43 28 29 28 28 28 31 31 39 32 30 30 33 32 26 28 23 28 28 37 37 57 43 46 43 48 46 46 46 43 59 44 44 37 39 39 39 39 34 31 39 37 39 39 36 36 36 43 43
48 48 48 40 40 37 37 30 30 28 22 22 28 28 37 37 41 41 37 35 37 36 36 33 37 35 31 27 34 32 36 36 32 32 32 43 43 37 37 33 40 40 32 32 19 19 19 24 24 29
18 20 17 28 28 39 37 38 21 24 14 14 14 28 28 28 28 28 31 33 37 39 39 37 39 40 39 31 32 31 28 28 19 24 21 22 22 31 21 17 8 6 6 7 8 12 19 31 31 19
19 12 12 11 20 12 20 16 22 22 30 30 18 18 27 25 22 22 29 22 24 22 18 18 18 18 15 |